EIF4B - EIF4B - Wikipedia

EIF4B
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1WI8, 2J76
Identifikátory
Aliasy	EIF4B, EIF-4B, PRO1843, eukaryotický iniciační faktor translace 4B
Externí ID	OMIM: 603928 MGI: 95304 HomoloGene: 83162 Genové karty: EIF4B
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 12 (lidský)
Konec	53,042,209 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 15 (myš)
Konec	102,097,173 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba nukleové kyseliny; • ribozomální vazba malé podjednotky; • GO: Aktivita helikázy 0008026; • Aktivita výměny řetězců RNA; • Žíhací aktivita řetězce RNA; • Vazba RNA; • aktivita faktoru iniciace translace;
Buněčná složka	• cytosol; • komplex iniciačního faktoru 4F pro eukaryotický překlad; • polysome;
Biologický proces	• zkrácení ocasu nukleární transkribované mRNA poly (A); • regulace iniciace translace; • vznik komplexu preiniciace translace; • eukaryotický překlad iniciační faktor 4F komplexní sestava; • biosyntéza bílkovin; • překladová iniciace; • cytoplazmatický překlad;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	1975
	75705
	ENSG00000063046
	ENSMUSG00000058655
	P23588
	Q8BGD9
	NM_001300821; NM_001417; NM_018507; NM_001330654
	NM_145625
	NP_001287750; NP_001317583; NP_001408
	NP_663600
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Eukaryotický iniciační faktor translace 4B je protein že u lidí je kódován EIF4B gen.^[5]

Interakce

eIF4B bylo prokázáno komunikovat a stimulují aktivitu eIF4A a vázat se na eIF3 komplex přes eIF3A podjednotka.^[6] Tato interakce vede k náboru eukaryotická malá ribozomální podjednotka (40S) k mRNA, která následně připraví půdu pro další kroky vedoucí k prodloužení.

Viz také

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000063046 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000058655 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Entrez Gene: EIF4B eukaryotický iniciační faktor translace 4B“.
^ Merrick WC (říjen 2015). „eIF4F: retrospektiva“. The Journal of Biological Chemistry. 290 (40): 24091–9. doi:10,1074 / jbc.R115,675280. PMC 4591800. PMID 26324716.

Další čtení

van Heugten HA, Kasperaitis MA, Thomas AA, Voorma HO (1991). „Důkaz, že eukaryotický iniciační faktor (eIF) 2 je protein vázající na čepici, který stimuluje rozpoznávání čepice pomocí eIF-4B a eIF-4F.“ J. Biol. Chem. 266 (11): 7279–84. PMID 2016328.
Milburn SC, Hershey JW, Davies MV, Kelleher K, Kaufman RJ (1990). "Klonování a exprese eukaryotického iniciačního faktoru 4B cDNA: stanovení sekvence identifikuje běžný motiv rozpoznávání RNA". EMBO J.. 9 (9): 2783–90. doi:10.1002 / j.1460-2075.1990.tb07466.x. PMC 551988. PMID 2390971.
Howe JG, Hershey JW (1984). "Translační iniciační faktor a asociace ribozomu s cytoskeletální strukturní frakcí z buněk HeLa". Buňka. 37 (1): 85–93. doi:10.1016/0092-8674(84)90303-9. PMID 6722878.
Maruyama K, Sugano S (1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Méthot N, Pause A, Hershey JW, Sonenberg N (1994). „Faktor iniciace translace eIF-4B obsahuje oblast vázající RNA, která je odlišná a nezávislá na shodné sekvenci ribonukleoproteinů.“. Mol. Buňka. Biol. 14 (4): 2307–16. doi:10,1128 / mcb.14.4.2307. PMC 358597. PMID 8139536.
Naranda T, Strong WB, Menaya J, Fabbri BJ, Hershey JW (1994). "Dvě strukturní domény iniciačního faktoru eIF-4B se účastní vazby na RNA". J. Biol. Chem. 269 (20): 14465–72. PMID 8182051.
Méthot N, Song MS, Sonenberg N (1996). „Oblast bohatá na kyselinu asparagovou, arginin, tyrosin a glycin (DRYG) zprostředkovává samo-asociaci eukaryotického iniciačního faktoru 4B (eIF4B) a interakci s eIF3“. Mol. Buňka. Biol. 16 (10): 5328–34. doi:10.1128 / MCB.16.10.5328. PMC 231531. PMID 8816444.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (1997). "Konstrukce a charakterizace knihovny cDNA obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Richter NJ, Rogers GW, Hensold JO, Merrick WC (1999). „Další biochemická a kinetická charakterizace lidského eukaryotického iniciačního faktoru 4H“. J. Biol. Chem. 274 (50): 35415–24. doi:10.1074 / jbc.274.50.35415. PMID 10585411.
Bushell M, Wood W, Clemens MJ, Morley SJ (2000). "Změny integrity a asociace iniciačních faktorů syntézy eukaryotických proteinů během apoptózy". Eur. J. Biochem. 267 (4): 1083–91. doi:10.1046 / j.1432-1327.2000.01101.x. PMID 10672017.
Bushell M, Wood W, Carpenter G, Pain VM, Morley SJ, Clemens MJ (2001). „Narušení interakce eukaryotického iniciačního faktoru 4B syntézy proteinů savců s proteinem vázajícím poly (A) štěpením zprostředkovaným kaspázou a virovou proteázou“. J. Biol. Chem. 276 (26): 23922–8. doi:10,1074 / jbc.M100384200. PMID 11274152.
Fleming K, Ghuman J, Yuan X, Simpson P, Szendröi A, Matthews S, Curry S (2003). "Struktura roztoku a RNA interakce motivu rozpoznávání RNA z eukaryotického iniciačního faktoru translace 4B". Biochemie. 42 (30): 8966–75. doi:10,1021 / bi034506g. PMID 12885229.
Raught B, Peiretti F, Gingras AC, Livingstone M, Shahbazian D, Mayeur GL, Polakiewicz RD, Sonenberg N, Hershey JW (2004). „Fosforylace eukaryotického iniciačního faktoru translace 4B Ser422 je modulována kinázami S6“. EMBO J.. 23 (8): 1761–9. doi:10.1038 / sj.emboj.7600193. PMC 394247. PMID 15071500.
Doepker RC, Hsu WL, Saffran HA, Smiley JR (2004). „Uzavírací protein viru viru herpes simplex virion je stimulován faktory iniciace translace eIF4B a eIF4H.“. J. Virol. 78 (9): 4684–99. doi:10.1128 / JVI.78.9.4684-4699.2004. PMC 387725. PMID 15078951.
Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D, Elias JE, Villén J, Li J, Cohn MA, Cantley LC, Gygi SP (2004). „Rozsáhlá charakterizace jaderných fosfoproteinů z buněk HeLa“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 101 (33): 12130–5. doi:10.1073 / pnas.0404720101. PMC 514446. PMID 15302935.
Suzuki Y, Yamashita R, Shirota M, Sakakibara Y, Chiba J, Mizushima-Sugano J, Nakai K, Sugano S (2004). „Porovnání sekvencí lidských a myších genů odhaluje homologní blokovou strukturu v promotorových oblastech“. Genome Res. 14 (9): 1711–8. doi:10,1101 / gr. 2435604. PMC 515316. PMID 15342556.
Shahbazian D, Roux PP, Mieulet V, Cohen MS, Raught B, Taunton J, Hershey JW, Blenis J, Pende M, Sonenberg N (2006). „Dráhy mTOR / PI3K a MAPK konvergují na eIF4B, aby řídily jeho fosforylaci a aktivitu“. EMBO J.. 25 (12): 2781–91. doi:10.1038 / sj.emboj.7601166. PMC 1500846. PMID 16763566.
Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, Macek B, Kumar C, Mortensen P, Mann M (2006). „Globální, in vivo a místně specifická dynamika fosforylace v signálních sítích“. Buňka. 127 (3): 635–48. doi:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID 17081983. S2CID 7827573.

Tento článek o gen na lidský chromozom 12 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000063046 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000058655 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[entrez-5] „Entrez Gene: EIF4B eukaryotický iniciační faktor translace 4B“.

[Merrick-6] Merrick WC (říjen 2015). „eIF4F: retrospektiva“. The Journal of Biological Chemistry. 290 (40): 24091–9. doi:10,1074 / jbc.R115,675280. PMC 4591800. PMID 26324716.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]