RPS4X - RPS4X

RPS4X
Dostupné struktury
PDB	Lidské vyhledávání UniProt: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	4UG0, 4V6X, 5A2Q, 3J7R, 3J7P
Identifikátory
Aliasy	RPS4X, CCG2, DXS306, RPS4, S4, SCAR, SCR10, ribozomální protein S4, X-vázaný, ribozomální protein S4-X vázaný
Externí ID	OMIM: 312760 HomoloGene: 90857 Genové karty: RPS4X
Umístění genu (člověk)
Chr.	X chromozom (lidský)
Konec	72,277,248 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba rRNA; • strukturní složka ribozomu; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • Vazba RNA;
Buněčná složka	• cytoplazma; • polysome; • cytosol; • ribozom; • membrána; • ohnisková adheze; • intracelulární; • cytosolická malá ribozomální podjednotka; • malá ribozomální podjednotka; • cytoplazmatická ribonukleoproteinová granule; • extracelulární exosom; • extracelulární matrix; • nukleoplazma; • ribonukleoprotein; • synapse;
Biologický proces	• virová transkripce; • pozitivní regulace překladu; • SRP-dependentní kotranslační proteinové zacílení na membránu; • vývoj mnohobuněčných organismů; • pozitivní regulace buněčné proliferace; • překladová iniciace; • nukleárně transkribovaný katabolický proces mRNA, nesmysl zprostředkovaný rozpad; • zpracování rRNA; • biosyntéza bílkovin;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	6191
	n / a
	ENSG00000198034
	n / a
	P62701
	n / a
	NM_001007
	n / a
	NP_000998
	n / a
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka

40S ribozomální protein S4, X izoforma je protein že u lidí je kódován RPS4X gen.^[3]^[4]^[5]

Ribozomy, organely že katalyzovat proteosyntéza, se skládají z a malá 40S podjednotka a a velká podjednotka 60S. Společně se tyto podjednotky skládají ze 4 RNA druhů a přibližně 80 strukturně odlišných proteinů. Tento gen kóduje ribozomální protein S4, součást podjednotky 40S. Ribozomální protein S4 je jediný ribozomální protein, o kterém je známo, že je kódován více než jedním genem, konkrétně tímto genem a ribozomálním proteinem S4, Y-vázaným (RPS4Y). 2 izoformy kódované těmito geny nejsou totožné, ale jsou funkčně ekvivalentní. Ribozomální protein S4 patří do rodiny ribozomálních proteinů S4E. Tento gen nepodléhá X-inaktivace. Bylo navrženo, že haploinsufficiency genů ribozomálního proteinu S4 hraje roli v Turnerův syndrom; tato hypotéza je však kontroverzní. Jak je typické pro geny kódující ribozomální proteiny, existuje více zpracovaných pseudogeny tohoto genu se rozptýlilo v genomu.^[5]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000198034 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Watanabe M, Furuno N, Goebl M, Go M, Miyauchi K, Sekiguchi T, Basilico C, Nishimito T (duben 1992). „Molekulární klonování lidského genu, CCG2, které doplňuje teplotně citlivý mutant buněčného cyklu odvozený od BHK tsBN63: identita CCG2 s humánním X chromozomálním genem SCAR / RPS4X“. J Cell Sci. 100 (1): 35–43. PMID 1795030.
^ Zinn AR, Alagappan RK, Brown LG, Wool I, Page DC (duben 1994). "Struktura a funkce genů ribozomálního proteinu S4 na lidských a myších pohlavních chromozomech". Mol Cell Biol. 14 (4): 2485–92. doi:10,1128 / mcb.14.4.2485. PMC 358616. PMID 8139551.
^ ^A ^b „Entrez Gene: RPS4X ribozomální protein S4, X-vázaný“.

Další čtení

Wool IG, Chan YL, Glück A (1996). "Struktura a vývoj savčích ribozomálních proteinů". Biochem. Cell Biol. 73 (11–12): 933–947. doi:10.1139 / o95-101. PMID 8722009.
Fisher EM, Beer-Romero P, Brown LG a kol. (1991). "Homologní ribozomální proteinové geny na lidských X a Y chromozomech: únik z inaktivace X a možné důsledky pro Turnerův syndrom". Buňka. 63 (6): 1205–1218. doi:10.1016 / 0092-8674 (90) 90416-C. PMID 2124517.
Wiles MV, Alexander CM, Goodfellow PN (1988). "Izolace hojně exprimované sekvence z lidského chromozomu X diferenčním screeningem". Somat. Cell Mol. Genet. 14 (1): 31–39. doi:10.1007 / BF01535047. PMID 2829364.
Matoba R, Okubo K, Hori N a kol. (1994). "Přidání 5'-kódujících informací do 3'-směrované cDNA knihovny zlepšuje analýzu genové exprese." Gen. 146 (2): 199–207. doi:10.1016/0378-1119(94)90293-3. PMID 8076819.
Maruyama K, Sugano S (1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–174. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Watanabe M, Zinn AR, Page DC, Nishimoto T (1993). "Funkční ekvivalence lidských X a Y kódovaných izoforem ribozomálního proteinu S4 v souladu s rolí v Turnerově syndromu". Nat. Genet. 4 (3): 268–271. doi:10.1038 / ng0793-268. PMID 8358435.
Geerkens C, Just W, Held KR, Vogel W (1996). „Ullrich-Turnerův syndrom není způsoben haploinsufficiencí RPS4X“. Hučení. Genet. 97 (1): 39–44. doi:10.1007 / bf00218830. PMID 8557258.
Vladimirov SN, Ivanov AV, Karpova GG a kol. (1996). "Charakterizace lidských malých ribozomálních podjednotkových proteinů N-terminálním a interním sekvenováním a hmotnostní spektrometrií". Eur. J. Biochem. 239 (1): 144–149. doi:10.1111 / j.1432-1033.1996.0144u.x. PMID 8706699.
Omoe K, Endo A (1996). „Vztah mezi monotypickým fenotypem X a Y-vázaným ribozomálním proteinem S4 (Rps4) u několika druhů savců: molekulární evoluční analýza homologů Rps4“. Genomika. 31 (1): 44–50. doi:10.1006 / geno.1996.0007. PMID 8808278.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K a kol. (1997). "Konstrukce a charakterizace knihovny cDNA obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–156. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Kenmochi N, Kawaguchi T, Rozen S a kol. (1998). „Mapa 75 genů lidského ribozomálního proteinu“. Genome Res. 8 (5): 509–23. doi:10,1101 / gr. 8.509. PMID 9582194.
Uechi T, Tanaka T, Kenmochi N (2001). „Kompletní mapa genů lidského ribozomálního proteinu: přiřazení 80 genů cytogenetické mapě a důsledky pro lidské poruchy“. Genomika. 72 (3): 223–230. doi:10,1006 / geno.2000.6470. PMID 11401437.
Robinson RC, Turbedsky K, Kaiser DA a kol. (2001). "Krystalová struktura komplexu Arp2 / 3". Věda. 294 (5547): 1679–1684. doi:10.1126 / science.1066333. PMID 11721045.
Andersen JS, Lyon CE, Fox AH a kol. (2002). "Řízená proteomická analýza lidského nukleolu". Curr. Biol. 12 (1): 1–11. doi:10.1016 / S0960-9822 (01) 00650-9. PMID 11790298.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–16903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Achát RJ, Choe M, Arnold AP (2004). „Pohlavní rozdíly ve struktuře a expresi genů pohlavních chromozomů CHD1Z a CHD1W v zebřích pěnkavách“. Mol. Biol. Evol. 21 (2): 384–396. doi:10.1093 / molbev / msh027. PMID 14660691.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–45. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.

Tento článek o gen na člověka X chromozom a / nebo související protein je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000198034 - Ensembl, Květen 2017

[2] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid1795030-3] Watanabe M, Furuno N, Goebl M, Go M, Miyauchi K, Sekiguchi T, Basilico C, Nishimito T (duben 1992). „Molekulární klonování lidského genu, CCG2, které doplňuje teplotně citlivý mutant buněčného cyklu odvozený od BHK tsBN63: identita CCG2 s humánním X chromozomálním genem SCAR / RPS4X“. J Cell Sci. 100 (1): 35–43. PMID 1795030.

[pmid8139551-4] Zinn AR, Alagappan RK, Brown LG, Wool I, Page DC (duben 1994). "Struktura a funkce genů ribozomálního proteinu S4 na lidských a myších pohlavních chromozomech". Mol Cell Biol. 14 (4): 2485–92. doi:10,1128 / mcb.14.4.2485. PMC 358616. PMID 8139551.

[entrez-5] A ^b „Entrez Gene: RPS4X ribozomální protein S4, X-vázaný“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]