EIF4G2 - EIF4G2

EIF4G2
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	3D3M, 3L6A, 4IUL
Identifikátory
Aliasy	EIF4G2, AAG1, DAP5, NAT1, P97, eukaryotický iniciační faktor translace 4 gama 2
Externí ID	OMIM: 602325 MGI: 109207 HomoloGene: 37477 Genové karty: EIF4G2
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 11 (lidský)
Konec	10,808,940 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 7 (myš)
Konec	111,083,030 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita translačního faktoru, vazba RNA; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita faktoru iniciace translace; • Vazba RNA; • kadherinová vazba; • mRNA vazba;
Buněčná složka	• cytosol; • komplex iniciačního faktoru 4F pro eukaryotický překlad; • membrána;
Biologický proces	• překladová iniciace; • buněčná smrt; • biosyntéza bílkovin; • zástava buněčného cyklu; • regulace překladu; • regulace iniciace translace; • negativní regulace autofagie; • pozitivní regulace buněčného růstu; • proces biosyntézy buněčných makromolekul;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	1982
	13690
	ENSG00000110321
	ENSMUSG00000005610
	P78344
	Q62448
	NM_001418; NM_001042559; NM_001172705
	NM_001040131; NM_013507
	NP_001036024; NP_001166176; NP_001409
	NP_001035221; NP_038535
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Eukaryotický iniciační faktor translace 4 gama 2 (také zvaný p97, NAT1, a DAP-5) je protein že u lidí je kódován EIF4G2 gen.^[5]^[6]

Funkce

Zahájení translace je zprostředkováno specifickým rozpoznáním struktury čepice eukaryotickým iniciačním faktorem translace 4F (eIF4F), což je proteinový komplex vázající čepičku, který se skládá ze tří podjednotek: eIF4A, eIF4E a eIF4G. Protein kódovaný genem eIF4G2 sdílí podobnost s C-koncovou oblastí eIF4G1, která obsahuje vazebná místa pro eIF4A a eIF3. eIF4G2 dále obsahuje vazebné místo pro eIF4E na N-konci. Na rozdíl od eIF4G1, který podporuje cap-dependentní a nezávislou translaci, funguje genový produkt eIF4G2 jako obecný represor translace vytvářením translačně neaktivních komplexů. Studie in vitro a in vivo naznačují, že translace této mRNA iniciuje výhradně na kodonu, který není AUG (GUG). Alternativně byly popsány sestřihové varianty transkriptu kódující různé izoformy tohoto genu.^[7]

Interakce

EIF4G2 bylo prokázáno komunikovat s EIF3A.^[8]^[9]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000110321 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000005610 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Yamanaka S, Poksay KS, Arnold KS, Innerarity TL (březen 1997). „Nová translační represorová mRNA je značně upravována v játrech obsahujících nádory způsobené transgenní expresí apoB mRNA-editujícího enzymu“. Genes Dev. 11 (3): 321–33. doi:10.1101 / gad.11.3.321. PMID 9030685.
^ Levy-Strumpf N, Deiss LP, Berissi H, Kimchi A (březen 1997). „DAP-5, nový homolog eukaryotického iniciačního faktoru translace 4G izolovaného jako domnělý modulátor programované buněčné smrti indukované gama interferonem“. Mol. Buňka. Biol. 17 (3): 1615–25. doi:10.1128 / mcb.17.3.1615. PMC 231887. PMID 9032289.
^ „Entrez Gene: EIF4G2 eukaryotický iniciační faktor translace 4 gama, 2“.
^ Gradi A, Imataka H, Svitkin YV, Rom E, Raught B, Morino S, Sonenberg N (leden 1998). „Nový funkční lidský eukaryotický iniciační faktor translace 4G“. Mol. Buňka. Biol. 18 (1): 334–42. doi:10,1128 / mcb.18.1.334. PMC 121501. PMID 9418880.
^ Henis-Korenblit S, Strumpf NL, Goldstaub D, Kimchi A (leden 2000). „Nová forma proteinu DAP5 se hromadí v apoptotických buňkách v důsledku štěpení kaspázy a interního translace zprostředkovaného vstupem ribozomu“. Mol. Buňka. Biol. 20 (2): 496–506. doi:10.1128 / MCB.20.2.496-506.2000. PMC 85113. PMID 10611228.

Další čtení

Maruyama K, Sugano S (1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Shaughnessy JD, Jenkins NA, Copeland NG (1997). „klonování cDNA, analýza exprese a chromozomální lokalizace genu s vysokou homologií s pšeničným eIF- (iso) 4F a savčím eIF-4G“. Genomika. 39 (2): 192–7. doi:10.1006 / geno.1996.4502. PMID 9027506.
Imataka H, Olsen HS, Sonenberg N (1997). "Nový translační regulátor s homologií k eukaryotickému iniciačnímu faktoru translace 4G". EMBO J.. 16 (4): 817–25. doi:10.1093 / emboj / 16.4.817. PMC 1169682. PMID 9049310.
Imataka H, Sonenberg N (1997). „Lidský eukaryotický translační iniciační faktor 4G (eIF4G) má dvě samostatná a nezávislá vazebná místa pro eIF4A.“. Mol. Buňka. Biol. 17 (12): 6940–7. doi:10,1128 / mcb.17.12.6940. PMC 232551. PMID 9372926.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (1997). "Konstrukce a charakterizace cDNA knihovny obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Pyronnet S, Imataka H, Gingras AC, Fukunaga R, Hunter T, Sonenberg N (1999). „Lidský eukaryotický translační iniciační faktor 4G (eIF4G) rekrutuje mnk1 k fosforylaci eIF4E“. EMBO J.. 18 (1): 270–9. doi:10.1093 / emboj / 18.1.270. PMC 1171121. PMID 9878069.
Marcotrigiano J, Gingras AC, Sonenberg N, Burley SK (1999). „Zahájení translace závislé na čepici u eukaryot je regulováno molekulárním napodobeninou eIF4G“. Mol. Buňka. 3 (6): 707–16. doi:10.1016 / S1097-2765 (01) 80003-4. PMID 10394359.
Henis-Korenblit S, Strumpf NL, Goldstaub D, Kimchi A (2000). „Nová forma proteinu DAP5 se hromadí v apoptotických buňkách v důsledku štěpení kaspázy a vnitřního místa zprostředkovaného translací ribozomu“. Mol. Buňka. Biol. 20 (2): 496–506. doi:10.1128 / MCB.20.2.496-506.2000. PMC 85113. PMID 10611228.
Marcotrigiano J, Lomakin IB, Sonenberg N, Pestova TV, Hellen CU, Burley SK (2001). "Konzervovaná doména HEAT v rámci eIF4G řídí sestavení mechanismu iniciace translace". Mol. Buňka. 7 (1): 193–203. doi:10.1016 / S1097-2765 (01) 00167-8. PMID 11172724.
Marissen WE, Gradi A, Sonenberg N, Lloyd RE (2000). „Štěpení eukaryotického iniciačního faktoru translace 4GII koreluje s inhibicí translace během apoptózy“. Buněčná smrt se liší. 7 (12): 1234–43. doi:10.1038 / sj.cdd.4400750. PMID 11175261.
Asano K, Shalev A, Phan L, Nielsen K, Clayton J, Valásek L, Donahue TF, Hinnebusch AG (2001). „Více rolí pro C-koncovou doménu eIF5 v sestavě iniciačního komplexu translace a aktivaci GTPázy“. EMBO J.. 20 (9): 2326–37. doi:10.1093 / emboj / 20.9.2326. PMC 125443. PMID 11331597.
Pyronnet S, Dostie J, Sonenberg N (2001). „Potlačení překladu závislého na čepici u mitózy“. Genes Dev. 15 (16): 2083–93. doi:10,1101 / gad.889201. PMC 312759. PMID 11511540.
Henis-Korenblit S, Shani G, Sines T, Marash L, Shohat G, Kimchi A (2002). „Protein DAP5 štěpený kaspázou podporuje interní překlad smrtících proteinů zprostředkovaný vstupním ribozomem“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (8): 5400–5. doi:10.1073 / pnas.082102499. PMC 122781. PMID 11943866.
Perales C, Carrasco L, Ventoso I (2003). „Štěpení eIF4G proteázou HIV-1: účinky na překlad“. FEBS Lett. 533 (1–3): 89–94. doi:10.1016 / S0014-5793 (02) 03764-X. PMID 12505164. S2CID 35982071.
Gevaert K, Goethals M, Martens L, Van Damme J, Staes A, Thomas GR, Vandekerckhove J (2003). "Zkoumání proteomů a analýza zpracování proteinů hmotnostní spektrometrickou identifikací tříděných N-koncových peptidů". Nat. Biotechnol. 21 (5): 566–9. doi:10.1038 / nbt810. PMID 12665801. S2CID 23783563.
Li Z, Hu CY, Mo BQ, Xu JD, Zhao Y (2003). „[Vliv beta-karotenu na genovou expresi buněk rakoviny prsu]“. AI Zheng. 22 (4): 380–4. PMID 12703993.
Qin H, Raught B, Sonenberg N, Goldstein EG, Edelman AM (2003). „Fosforylační screening identifikuje translační iniciační faktor 4GII jako intracelulární cíl Ca (2 +) / kalmodulin-dependentní protein kinázy I“. J. Biol. Chem. 278 (49): 48570–9. doi:10,1074 / jbc.M308781200. PMID 14507913.

Tento článek o gen na lidský chromozom 11 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000110321 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000005610 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9030685-5] Yamanaka S, Poksay KS, Arnold KS, Innerarity TL (březen 1997). „Nová translační represorová mRNA je značně upravována v játrech obsahujících nádory způsobené transgenní expresí apoB mRNA-editujícího enzymu“. Genes Dev. 11 (3): 321–33. doi:10.1101 / gad.11.3.321. PMID 9030685.

[pmid9032289-6] Levy-Strumpf N, Deiss LP, Berissi H, Kimchi A (březen 1997). „DAP-5, nový homolog eukaryotického iniciačního faktoru translace 4G izolovaného jako domnělý modulátor programované buněčné smrti indukované gama interferonem“. Mol. Buňka. Biol. 17 (3): 1615–25. doi:10.1128 / mcb.17.3.1615. PMC 231887. PMID 9032289.

[entrez-7] „Entrez Gene: EIF4G2 eukaryotický iniciační faktor translace 4 gama, 2“.

[pmid9418880-8] Gradi A, Imataka H, Svitkin YV, Rom E, Raught B, Morino S, Sonenberg N (leden 1998). „Nový funkční lidský eukaryotický iniciační faktor translace 4G“. Mol. Buňka. Biol. 18 (1): 334–42. doi:10,1128 / mcb.18.1.334. PMC 121501. PMID 9418880.

[pmid10611228-9] Henis-Korenblit S, Strumpf NL, Goldstaub D, Kimchi A (leden 2000). „Nová forma proteinu DAP5 se hromadí v apoptotických buňkách v důsledku štěpení kaspázy a interního translace zprostředkovaného vstupem ribozomu“. Mol. Buňka. Biol. 20 (2): 496–506. doi:10.1128 / MCB.20.2.496-506.2000. PMC 85113. PMID 10611228.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]