MRPS12 - MRPS12

MRPS12
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	3J9M
Identifikátory
Aliasy	MRPS12, MPR-S12, MT-RPS12, RPMS12, RPS12, RPSM12, mitochondriální ribozomální protein S12
Externí ID	OMIM: 603021 MGI: 1346333 HomoloGene: 6848 Genové karty: MRPS12
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 19 (lidský)
Konec	38,933,162 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 7 (myš)
Konec	28,741,820 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny; • Vazba RNA; • strukturní složka ribozomu;
Buněčná složka	• malá ribozomální podjednotka; • mitochondriální vnitřní membrána; • ribozom; • intracelulární; • mitochondriální ribozom; • mitochondrie; • mitochondriální malá ribozomální podjednotka;
Biologický proces	• mitochondriální translační prodloužení; • mitochondriální translační ukončení; • biosyntéza bílkovin; • mitochondriální překlad;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	6183
	24030
	ENSG00000283018; ENSG00000128626
	ENSMUSG00000045948
	O15235
	O35680
	NM_033363; NM_021107; NM_033362
	NM_011885; NM_001360250; NM_001360252; NM_001360254
	NP_066930; NP_203526; NP_203527
	NP_036015; NP_001347179; NP_001347181; NP_001347183
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

28S ribozomální protein S12, mitochondriální je protein že u lidí je kódován MRPS12 gen.^[5]^[6]^[7]

Savčí mitochondriální ribozomální proteiny jsou kódovány jaderné geny a pomoci proteosyntéza v rámci mitochondrie. Mitochondriální ribozomy (mitoribozomy) se skládají z malého 28S podjednotku a velkou 39S podjednotku. Mají odhadem 75% protein na rRNA složení ve srovnání s prokaryotickými ribozomy, kde je tento poměr obrácen. Další rozdíl mezi savčími mitoribozomy a prokaryotickými ribozomy je v tom, že tyto obsahují a 5S rRNA. Mezi různými druhy se proteiny obsahující mitoribozom velmi liší v sekvenci a někdy v biochemických vlastnostech, což brání snadnému rozpoznání sekvenční homologie. Tento gen kóduje protein 28S podjednotky, který patří do ribozomální protein Rodina S12P. Kódovaný protein je klíčovou součástí ribozomální malé podjednotky a řídí věrnost dekódování a náchylnost k aminoglykosidová antibiotika. Gen pro mitochondriální seryl -tRNA syntetáza je umístěn proti proudu a sousedí s tímto genem a oba geny jsou možnými kandidáty na autosomálně dominantní gen pro hluchotu (DFNA4). Varianty spoje pro tento gen byly nalezeny rozdíly v 5 'UTR; všechny tři varianty kódují stejný protein.^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C ENSG00000128626 GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000283018, ENSG00000128626 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000045948 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Shah ZH, Migliosi V, Miller SC, Wang A, Friedman TB, Jacobs HT (červen 1998). "Chromozomální umístění tří lidských jaderných genů (RPSM12, TUFM a AFG3L1) specifikujících domnělé komponenty mitochondriálního genového expresního přístroje". Genomika. 48 (3): 384–8. doi:10.1006 / geno.1997.5166. PMID 9545647.
^ Johnson DF, Hamon M, Fischel-Ghodsian N (prosinec 1998). "Charakterizace lidského mitochondriálního ribozomálního genu S12". Genomika. 52 (3): 363–8. doi:10.1006 / geno.1998.5448. PMID 9790755.
^ ^A ^b „Entrez Gene: MRPS12 mitochondriální ribozomální protein S12“.

Další čtení

Shah ZH, O'Dell KM, Miller SC a kol. (1998). "Metazoan jaderné geny pro mitoribozomální protein S12". Gen. 204 (1–2): 55–62. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00521-0. PMID 9434165.
Mariottini P, Shah ZH, Toivonen JM, et al. (1999). „Exprese genu pro mitoribozomální protein S12 je řízena v lidských buňkách na úrovních transkripce, sestřihu RNA a translace“. J. Biol. Chem. 274 (45): 31853–62. doi:10.1074 / jbc.274.45.31853. PMID 10542210.
Cavdar Koc E, Burkhart W, Blackburn K a kol. (2001). „Malá podjednotka savčího mitochondriálního ribozomu. Identifikace úplného doplňku přítomných ribozomálních proteinů“ (PDF). J. Biol. Chem. 276 (22): 19363–74. doi:10,1074 / jbc.M100727200. PMID 11279123. S2CID 26254238.
Suzuki T, Terasaki M, Takemoto-Hori C a kol. (2001). „Proteomická analýza mitochondriálního ribosomu savců. Identifikace proteinových složek v malé podjednotce 28 S.“. J. Biol. Chem. 276 (35): 33181–95. doi:10,1074 / jbc.M103236200. PMID 11402041.
Kenmochi N, Suzuki T, Uechi T a kol. (2001). „Humánní mitochondriální ribozomální proteinové geny: mapování 54 genů na chromozomy a důsledky pro lidské poruchy“. Genomika. 77 (1–2): 65–70. doi:10.1006 / geno.2001.6622. PMID 11543634.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Zhang Z, Gerstein M (2003). "Identifikace a charakterizace více než 100 mitochondriálních ribozomálních proteinových pseudogenů v lidském genomu". Genomika. 81 (5): 468–80. doi:10.1016 / S0888-7543 (03) 00004-1. PMID 12706105.
Cui YP, Wang JB, Zhang XY a kol. (2003). „Použití kvasinkového dvouhybridního systému k identifikaci proteinů asociovaných s ECRG2 a jejich možných interakcí s genem ECRG2“. Svět J. Gastroenterol. 9 (9): 1892–6. doi:10,3748 / wjg.v9.i9.1892. PMC 4656638. PMID 12970870.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Stelzl U, Worm U, Lalowski M a kol. (2005). „Síť interakce lidský protein-protein: zdroj pro anotování proteomu“. Buňka. 122 (6): 957–68. doi:10.1016 / j.cell.2005.08.029. hdl:11858 / 00-001M-0000-0010-8592-0. PMID 16169070. S2CID 8235923.

Tento článek o gen na lidský chromozom 19 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

Tento protein související článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C ENSG00000128626 GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000283018, ENSG00000128626 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000045948 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9545647-5] Shah ZH, Migliosi V, Miller SC, Wang A, Friedman TB, Jacobs HT (červen 1998). "Chromozomální umístění tří lidských jaderných genů (RPSM12, TUFM a AFG3L1) specifikujících domnělé komponenty mitochondriálního genového expresního přístroje". Genomika. 48 (3): 384–8. doi:10.1006 / geno.1997.5166. PMID 9545647.

[pmid9790755-6] Johnson DF, Hamon M, Fischel-Ghodsian N (prosinec 1998). "Charakterizace lidského mitochondriálního ribozomálního genu S12". Genomika. 52 (3): 363–8. doi:10.1006 / geno.1998.5448. PMID 9790755.

[entrez-7] A ^b „Entrez Gene: MRPS12 mitochondriální ribozomální protein S12“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]