EIF5A - EIF5A

EIF5A
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	3CPF, 5DLQ
Identifikátory
Aliasy	EIF5A, EIF-5A, EIF5A1, eIF5AI, eukaryotický iniciační faktor translace 5A, eIF-4D
Externí ID	OMIM: 600187 MGI: 106248 HomoloGene: 133803 Genové karty: EIF5A
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 17 (lidský)
Konec	7,312,463 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 11 (myš)
Konec	69,921,958 bp
Exprese RNA vzor
	; ; ; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba N-konce proteinu; • vazba ribozomu; • aktivita činitele translačního prodloužení; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • Vazba RNA; • Vazba U6 snRNA;
Buněčná složka	• cytoplazma; • cytosol; • membrána endoplazmatického retikula; • membrána; • jaderný pór; • prstencové lamely; • endoplazmatické retikulum; • extracelulární exosom; • buněčné jádro; • dendrit; • tělo neuronových buněk;
Biologický proces	• transport mRNA; • biosyntéza bílkovin; • pozitivní regulace translační tažnosti; • translační prodloužení; • export mRNA z jádra; • modifikace peptidyl-lysinu na peptidyl-hypusin; • nukleocytoplazmatický transport; • export bílkovin z jádra; • pozitivní regulace buněčné proliferace; • transport bílkovin; • překladové posuny rámců; • pozitivní regulace ukončení překladu; • apoptotický proces; • pozitivní regulace koncentrace cytosolických iontů vápníku; • stárnutí; • pozitivní regulace apoptotického procesu buněk srdečního svalu; • pozitivní regulace apoptotického procesu; • negativní regulace apoptotického procesu; • pozitivní regulace diferenciace svalových buněk; • buněčná odpověď na stimul hormonu štítné žlázy; • pozitivní regulace metabolického procesu reaktivních forem kyslíku; • doprava;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	1984
	276770
	ENSG00000132507; ENSG00000288145
	ENSMUSG00000078812
	P63241
	P63242
NM_001143760; NM_001143761; NM_001143762; NM_001970; NM_001370420;
	NM_001370421
NM_001166589; NM_001166590; NM_001166591; NM_001166592; NM_001166593;
	NM_001166594; NM_001166595; NM_001166596; NM_181582
NP_001137232; NP_001137233; NP_001137234; NP_001961; NP_001357349;
	NP_001357350
NP_001160061; NP_001160062; NP_001160063; NP_001160064; NP_001160065;
	NP_001160066; NP_001160067; NP_001160068; NP_853613
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Faktor iniciace eukaryotického translace 5A-1 je protein že u lidí je kódován EIF5A gen.^[5]

Je to jediný známý protein, který obsahuje neobvyklou aminokyselinu hypusin [N (ε) - (4-amino-2-hydroxybutyl) -lysin], který je syntetizován na eIF5A na specifickém lysinovém zbytku z polyaminu spermidin dvěma katalytickými kroky.^[6]

EF-P je prokaryotický homolog eIF5A, který je také upraven posttranslačně podobným, ale odlišným způsobem.^[7]^[8] Předpokládá se, že oba proteiny katalyzují tvorbu peptidové vazby a pomáhají řešit ribozomální stánky, což je dělá faktory prodloužení.^[9]

Reference

^ ^A ^b ^C ENSG00000288145 GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000132507, ENSG00000288145 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000078812 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Steinkasserer A, Jones T, Sheer D, Koettnitz K, Hauber J, Bevec D (červen 1995). „Eukaryotický kofaktor pro protein rev viru lidské imunodeficience typu 1 (HIV-1), eIF-5A, se mapuje na chromozom 17p12-p13: tři pseudogeny eIF-5A se mapují na 10q23.3, 17q25 a 19q13.2.“ Genomika. 25 (3): 749–52. doi:10.1016 / 0888-7543 (95) 80025-H. PMID 7759117.
^ Wolff EC, Kang KR, Kim YS, Park MH (květen 2007). „Posttranslační syntéza hypusinu: evoluční progrese a specificita modifikace hypusinu“. Aminokyseliny. 33 (2): 341–350. doi:10.1007 / s00726-007-0525-0. PMC 2572820. PMID 17476569.
^ Park JH, Johansson HE, Aoki H, Huang BX, Kim HY, Ganoza MC, Park MH (listopad 2011). „Posttranslační modifikace β-lysylací je nutná pro aktivitu elongačního faktoru P (EF-P) z Escherichia coli“. Journal of Biological Chemistry. 287 (4): 2579–2590. doi:10,1074 / jbc.M111.309633. PMC 3268417. PMID 22128152.
^ Peil L, Starosta AL, Virumäe K, Atkinson GC, Tenson T, Remme J, Wilson DN (2012). „Lys34 faktoru prodloužení translace EF-P je hydroxylován YfcM“. Přírodní chemická biologie. 8 (8): 695–7. doi:10.1038 / nchembio.1001. PMID 22706199.
^ Rossi, D; Kuroshu, R; Zanelli, CF; Valentini, SR (2013). „eIF5A a EF-P: dva jedinečné překladové faktory nyní cestují stejnou cestou“. Wiley Interdisciplinární hodnocení. RNA. 5 (2): 209–22. doi:10.1002 / wrna.1211. PMID 24402910.

Další čtení

Bevec D, Hauber J (1997). "Aktivita eukaryotického iniciačního faktoru 5A a funkce HIV-1 Rev". Biol. Signály. 6 (3): 124–33. doi:10.1159/000109118. PMID 9285095.
Li L, Li HS, Pauza CD a kol. (2006). „Role pomocných proteinů HIV-1 ve virové patogenezi a interakcích hostitel-patogen“. Cell Res. 15 (11–12): 923–34. doi:10.1038 / sj.cr.7290370. PMID 16354571.
Rasmussen HH, van Damme J, Puype M a kol. (1993). „Mikrosekvence 145 proteinů zaznamenané v databázi dvourozměrných gelových proteinů normálních lidských epidermálních keratinocytů“. Elektroforéza. 13 (12): 960–9. doi:10,1002 / elps.11501301199. PMID 1286667. S2CID 41855774.
Chung SI, Park MH, Folk JE, Lewis MS (1991). „Eukaryotický iniciační faktor 5A: molekulární forma proteinu obsahujícího hypusin z lidských erytrocytů“. Biochim. Biophys. Acta. 1076 (3): 448–51. doi:10.1016 / 0167-4838 (91) 90490-q. PMID 1900436.
Smit-McBride Z, Dever TE, Hershey JW, Merrick WC (1989). „Stanovení sekvence a klonování cDNA eukaryotického iniciačního faktoru 4D, proteinu obsahujícího hypusin“. J. Biol. Chem. 264 (3): 1578–83. PMID 2492279.
Park MH, Liu TY, Neece SH, Swiggard WJ (1986). "Eukaryotický iniciační faktor 4D. Čištění z lidských červených krvinek a sekvence aminokyselin kolem jeho jediného hypusinového zbytku". J. Biol. Chem. 261 (31): 14515–9. PMID 3095320.
Koettnitz K, Kappel B, Baumruker T a kol. (1994). "Genomová struktura kódující lidský iniciační faktor eIF-5A". Gen. 144 (2): 249–52. doi:10.1016/0378-1119(94)90385-9. PMID 7545941.
Klier H, Csonga R, Joäo HC a kol. (1995). „Izolace a strukturní charakterizace různých izoforem proteinu eIF-5A obsahujícího hypusin z buněk HeLa“. Biochemie. 34 (45): 14693–702. doi:10.1021 / bi00045a010. PMID 7578077.
Koettnitz K, Wöhl T, Kappel B a kol. (1995). "Identifikace nového člena rodiny lidských genů eIF-5A". Gen. 159 (2): 283–4. doi:10.1016 / 0378-1119 (95) 00136-T. PMID 7622067.
Joe YA, Park MH (1994). "Strukturální rysy prekurzoru eIF-5A potřebné pro posttranslační syntézu deoxyhypusinu". J. Biol. Chem. 269 (41): 25916–21. PMID 7929297.
Bevec D, Klier H, Holter W a kol. (1994). "Indukovaná genová exprese proteinu obsahujícího hypusin, eukaryotický iniciační faktor 5A v aktivovaných lidských T lymfocytech". Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 91 (23): 10829–33. Bibcode:1994PNAS ... 9110829B. doi:10.1073 / pnas.91.23.10829. PMC 45119. PMID 7971969.
Maruyama K, Sugano S (1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Ruhl M, Himmelspach M, Bahr GM a kol. (1994). „Eukaryotický iniciační faktor 5A je buněčným cílem aktivační domény viru lidské imunodeficience typu 1 Rev zprostředkující trans-aktivaci“. J. Cell Biol. 123 (6 Pt 1): 1309–20. doi:10.1083 / jcb.123.6.1309. PMC 2290910. PMID 8253832.
Liu YP, Nemeroff M, Yan YP, Chen KY (1997). „Interakce eukaryotického iniciačního faktoru 5A s RNA elementem odpovědi na virus lidské imunodeficience typu 1 Rev a U6 snRNA vyžaduje modifikaci deoxyhypusinu nebo hypusinu“. Biol. Signály. 6 (3): 166–74. doi:10.1159/000109123. PMID 9285100.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K a kol. (1997). "Konstrukce a charakterizace cDNA knihovny obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Singh USA, Li Q, Cerione R (1998). „Identifikace eukaryotického iniciačního faktoru 5A jako buněčného vazebného partnera stimulovaného kyselinou retinovou pro tkáňovou transglutaminázu II“. J. Biol. Chem. 273 (4): 1946–50. doi:10.1074 / jbc.273.4.1946. PMID 9442029.
Schatz O, Oft M, Dascher C a kol. (1998). "Interakce eukaryotického iniciačního faktoru 5A kofaktoru HIV-1 rev s ribozomálním proteinem L5". Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 95 (4): 1607–12. Bibcode:1998PNAS ... 95.1607S. doi:10.1073 / pnas.95.4.1607. PMC 19115. PMID 9465063.
Lee YB, Joe YA, Wolff EC a kol. (1999). „Komplexní tvorba mezi deoxyhypusinsyntázou a jejím proteinovým substrátem, prekurzorem eukaryotického iniciačního faktoru translace 5A (eIF5A)“. Biochem. J. 340 (1): 273–81. doi:10.1042/0264-6021:3400273. PMC 1220246. PMID 10229683.

Tento článek o gen na lidský chromozom 17 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C ENSG00000288145 GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000132507, ENSG00000288145 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000078812 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid7759117-5] Steinkasserer A, Jones T, Sheer D, Koettnitz K, Hauber J, Bevec D (červen 1995). „Eukaryotický kofaktor pro protein rev viru lidské imunodeficience typu 1 (HIV-1), eIF-5A, se mapuje na chromozom 17p12-p13: tři pseudogeny eIF-5A se mapují na 10q23.3, 17q25 a 19q13.2.“ Genomika. 25 (3): 749–52. doi:10.1016 / 0888-7543 (95) 80025-H. PMID 7759117.

[pmid17476569-6] Wolff EC, Kang KR, Kim YS, Park MH (květen 2007). „Posttranslační syntéza hypusinu: evoluční progrese a specificita modifikace hypusinu“. Aminokyseliny. 33 (2): 341–350. doi:10.1007 / s00726-007-0525-0. PMC 2572820. PMID 17476569.

[pmid22128152-7] Park JH, Johansson HE, Aoki H, Huang BX, Kim HY, Ganoza MC, Park MH (listopad 2011). „Posttranslační modifikace β-lysylací je nutná pro aktivitu elongačního faktoru P (EF-P) z Escherichia coli“. Journal of Biological Chemistry. 287 (4): 2579–2590. doi:10,1074 / jbc.M111.309633. PMC 3268417. PMID 22128152.

[pmid22706199-8] Peil L, Starosta AL, Virumäe K, Atkinson GC, Tenson T, Remme J, Wilson DN (2012). „Lys34 faktoru prodloužení translace EF-P je hydroxylován YfcM“. Přírodní chemická biologie. 8 (8): 695–7. doi:10.1038 / nchembio.1001. PMID 22706199.

[pmid24402910-9] Rossi, D; Kuroshu, R; Zanelli, CF; Valentini, SR (2013). „eIF5A a EF-P: dva jedinečné překladové faktory nyní cestují stejnou cestou“. Wiley Interdisciplinární hodnocení. RNA. 5 (2): 209–22. doi:10.1002 / wrna.1211. PMID 24402910.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]