EIF2S1 - EIF2S1

EIF2S1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1KL9, 1Q8K
Identifikátory
Aliasy	EIF2S1, EIF-2, EIF-2A, EIF-2alfa, EIF2, EIF2A, eukaryotický faktor iniciace translace podjednotka alfa
Externí ID	OMIM: 603907 MGI: 95299 HomoloGene: 3020 Genové karty: EIF2S1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 14 (lidský)
Konec	67,386,516 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 12 (myš)
Konec	78,887,010 bp
Exprese RNA vzor
	; ; ; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita faktoru iniciace translace; • vazba ribozomu; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba nukleové kyseliny; • Vazba RNA;
Buněčná složka	• cytoplazma; • eukaryotický 48S preiniciační komplex; • polysome; • cytosol; • ribozom; • membrána; • komplex multi-eIF; • Eukaryotický iniciační faktor 2B; • gliové omezující končetiny; • ternární komplex iniciace překladu; • Stresová granule; • extracelulární exosom; • buněčné jádro; • komplex iniciačního faktoru 2 eukaryotického překladu; • synapse;
Biologický proces	• buněčná reakce na teplo; • pozitivní regulace apoptotického procesu pankreatických buněk typu B.; • negativní regulace iniciace translace v reakci na stres; • buněčná odpověď na UV záření; • buněčná odpověď na hladovění aminokyselin; • stárnutí; • reakce na stres endoplazmatického retikula; • PERK zprostředkovaná rozložená proteinová odpověď; • reakce na stres endoplazmatického retikula vyvolaný manganem; • transmembránová doprava; • překladová iniciace; • autofosforylace; • regulace překladu; • regulace iniciace translace v reakci na stres; • negativní regulace aktivity faktoru výměny guanyl-nukleotidů; • pozitivní regulace neuronové smrti; • biosyntéza bílkovin; • sestava stresových granulí; • buněčná odpověď na oxidační stres;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	1965
	13665
	ENSG00000134001
	ENSMUSG00000021116
	P05198
	Q6ZWX6
	NM_004094
	NM_026114
	NP_004085
	NP_080390
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Eukaryotický translační iniciační faktor 2 podjednotka 1 (eIF2α) je protein že u lidí je kódován EIF2S1 gen.^[5]^[6]

Funkce

The protein kódovaný tímto genem je alfa (α) podjednotka iniciační faktor překladu eIF2 komplex, který katalyzuje časně regulovaný krok proteosyntéza iniciace, podporující vazbu iniciátorové tRNA (Met-tRNA_i^{Se setkal}) až 40S ribozomální podjednotky. Vazba se vyskytuje jako ternární komplex methionyl -tRNA, eIF2, a GTP. eIF2 se skládá ze 3 neidentických podjednotek, alfa (α, 36 kD, tento článek), beta (β, 38 kD) a gama (y, 52 kD). Rychlost tvorby ternárního komplexu je modulována pomocí fosforylace stav eIF2α.^[6]

Klinický význam

Po reperfuzi po mozku ischemie existuje inhibice syntézy neuronových proteinů v důsledku fosforylace eIF2α. Mezi fosforylovaným eIF2α a cytosolický cytochrom c, který je uvolněn z mitochondrie v apoptóza. Fosforylovaný Eif2-alfa se objevil před uvolněním cytochromu c, což naznačuje, že fosforylace eIF2α spouští uvolňování cytochromu c během apoptotické buněčné smrti.^[7]

Myši heterozygotní pro S51A mutace stát se obézní a diabetik na stravě s vysokým obsahem tuku. Nesnášenlivost glukózy vyplývá z redukovaného inzulín sekrece, vadný transport proinzulinu a snížený počet granulí inzulínu v beta buňky. Správná funkce eIF2α se proto jeví jako nezbytná pro prevenci vyvolané dietou cukrovka typu II.^[8]

Inhibitory defosforylace

Salubrinal je selektivní inhibitor enzymů, které defosforylují eIF2α.^[9] Salubrinal také blokuje eIF2α defosforylaci a virus herpes simplex protein a inhibuje virovou replikaci. Fosforylace eIF2α je cytoprotektivní během endoplazmatické retikulum stres.^[10]^[11]

Viz také

eIF2

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000134001 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000021116 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Ernst H, Duncan RF, Hershey JW (březen 1987). "Klonování a sekvenování komplementárních DNA kódujících alfa podjednotku translačního iniciačního faktoru eIF-2. Charakterizace proteinu a jeho messengerové RNA". J Biol Chem. 262 (3): 1206–12. PMID 2948954.
^ ^A ^b „Entrez Gene: EIF2S1 eukaryotický iniciační faktor translace 2, podjednotka 1 alfa, 35 kDa“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna. Citováno 2010-10-05.
^ Page AB, Owen CR, Kumar R, Miller JM, Rafols JA, White BC, DeGracia DJ, Krause GS (červenec 2003). „Trvalý eIF2alfa (P) je kolokalizován cytoplazmatickým cytochromem c v citlivých hipokampálních neuronech po 4 hodinách reperfuze po 10minutové úplné mozkové ischemii.“ Acta Neuropathol. 106 (1): 8–16. doi:10.1007 / s00401-003-0693-2. PMID 12687390.
^ Scheuner D, Vander Mierde D, Song B, Flamez D, Creemers JW, Tsukamoto K, Ribick M, Schuit FC, Kaufman RJ (červenec 2005). „Kontrola translace mRNA zachovává funkci endoplazmatického retikula v beta buňkách a udržuje homeostázu glukózy“. Nat. Med. 11 (7): 757–764. doi:10,1038 / nm1259. PMID 15980866.
^ Boyce M, Bryant KF, Jousse C, Long K, Harding HP, Scheuner D, Kaufman RJ, Ma D, Coen DM, Ron D, Yuan J (únor 2005). "Selektivní inhibitor eIF2alfa defosforylace chrání buňky před stresem ER". Věda. 307 (5711): 935–939. doi:10.1126 / science.1101902. PMID 15705855.
^ Harding HP, Zhang Y, Bertolotti A, Zeng H, Ron D (květen 2000). „Perk je nezbytný pro translační regulaci a přežití buněk během rozvinuté proteinové odpovědi“. Mol. Buňka. 5 (5): 897–904. doi:10.1016 / S1097-2765 (00) 80330-5. PMID 10882126.
^ Scheuner D, Song B, McEwen E, Liu C, Laybutt R, Gillespie P, Saunders T, Bonner-Weir S, Kaufman RJ (červen 2001). „Translační kontrola je nutná pro rozvinutou proteinovou reakci a homeostázu glukózy in vivo.“ Mol. Buňka. 7 (6): 1165–1176. doi:10.1016 / S1097-2765 (01) 00265-9. PMID 11430820.

Další čtení

Hershey JW (1991). "Translační kontrola v savčích buňkách". Annu. Biochem. 60: 717–755. doi:10.1146 / annurev.bi.60.070191.003441. PMID 1883206.
Mao X, Green JM, Safer B a kol. (1992). "Regulace genové exprese translačního faktoru během aktivace lidských T buněk". J. Biol. Chem. 267 (28): 20444–50. PMID 1400363.
Mellor H, Proud CG (1991). "Syntetický peptidový substrát pro iniciační faktor-2 kinázy". Biochem. Biophys. Res. Commun. 178 (2): 430–437. doi:10.1016 / 0006-291X (91) 90125-Q. PMID 1677563.
Green SR, Spalding A, Ashford T a kol. (1992). "Syntéza lidského iniciačního faktoru-2 alfa v Saccharomyces cerevisiae". Gen. 108 (2): 253–258. doi:10.1016 / 0378-1119 (91) 90441-D. PMID 1748310.
Kramer G (1990). "Dvě fosforylační místa na eIF-2 alfa". FEBS Lett. 267 (2): 181–182. doi:10.1016 / 0014-5793 (90) 80919-A. PMID 2116318.
Kato S, Sekine S, Oh SW a kol. (1995). "Konstrukce lidské plné cDNA banky". Gen. 150 (2): 243–250. doi:10.1016/0378-1119(94)90433-2. PMID 7821789.
Ray MK, Chakraborty A, Datta B a kol. (1993). "Charakteristiky 67-kDa polypeptidu asociovaného s eukaryotickým iniciačním faktorem 2". Biochemie. 32 (19): 5151–5159. doi:10.1021 / bi00070a026. PMID 8098621.
Dever TE, Chen JJ, Barber GN a kol. (1993). "Savčí eukaryotický iniciační faktor 2 alfa kinázy funkčně nahrazuje proteinovou kinázu GCN2 v mechanismu kontroly translace GCN4 kvasinek". Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 90 (10): 4616–4620. doi:10.1073 / pnas.90.10.4616. PMC 46563. PMID 8099443.
Barber GN, Wambach M, Wong ML a kol. (1993). „Translační regulace proteinovou kinázou 68-kDa indukovanou dvouvláknovou RNA aktivovanou interferonem“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 90 (10): 4621–4625. doi:10.1073 / pnas.90.10.4621. PMC 46564. PMID 8099444.
Miyamoto S, Chiorini JA, Urcelay E, Safer B (1996). "Regulace genové exprese pro iniciační faktor translace eIF-2 alfa: význam 3 'nepřekládané oblasti". Biochem. J. 315 (3): 791–8. doi:10.1042 / bj3150791. PMC 1217276. PMID 8645159.
Yang W, Hinnebusch AG (1996). „Identifikace regulačního subkomplexu v guaninovém nukleotidovém výměnném faktoru eIF2B, který zprostředkovává inhibici fosforylovaným eIF2“. Mol. Buňka. Biol. 16 (11): 6603–16. doi:10.1128 / MCB.16.11.6603. PMC 231662. PMID 8887689.
Značka SR, Kobayashi R, Mathews MB (1997). „Tat protein viru lidské imunodeficience typu 1 je substrát a inhibitor interferonem indukované, virově aktivované proteinové kinázy, PKR“. J. Biol. Chem. 272 (13): 8388–8395. doi:10.1074 / jbc.272.13.8388. PMID 9079663.
Ting NS, Kao PN, Chan DW a kol. (1998). „DNA-dependentní protein kináza interaguje s proteiny NF90 a NF45 vážícími se na proteinový receptor. J. Biol. Chem. 273 (4): 2136–2145. doi:10.1074 / jbc.273.4.2136. PMID 9442054.
Kimball SR, Heinzinger NK, Horetsky RL, Jefferson LS (1998). "Identifikace interpretačních interakcí mezi podjednotkami eukaryotických iniciačních faktorů eIF2 a eIF2B". J. Biol. Chem. 273 (5): 3039–3044. doi:10.1074 / jbc.273.5.3039. PMID 9446619.
Shi Y, Vattem KM, Sood R a kol. (1998). „Identifikace a charakterizace pankreatického eukaryotického iniciačního faktoru 2 alfa-podjednotkové kinázy, PEK, podílející se na translační kontrole“. Mol. Buňka. Biol. 18 (12): 7499–509. doi:10.1128 / MCB.18.12.7499. PMC 109330. PMID 9819435.
Satoh S, Hijikata M, Handa H, Shimotohno K (1999). "Štěpení podjednotky 2alpha zprostředkované eukaryotickým translačním faktorem zprostředkované kaspázou". Biochem. J. 342 (1): 65–70. doi:10.1042/0264-6021:3420065. PMC 1220437. PMID 10432301.
Berlanga JJ, Santoyo J, De Haro C (1999). "Charakterizace savčího homologu GCN2 eukaryotického iniciačního faktoru 2alfa kinázy". Eur. J. Biochem. 265 (2): 754–762. doi:10.1046 / j.1432-1327.1999.00780.x. PMID 10504407.
Lu J, O'Hara EB, Trieselmann BA a kol. (1999). „Interferonem indukovaná dvouřetězcová RNA aktivovaná protein kináza PKR bude fosforylovat serin, threonin nebo tyrosin ve zbytku 51 v eukaryotickém iniciačním faktoru 2alfa“. J. Biol. Chem. 274 (45): 32198–32203. doi:10.1074 / jbc.274.45.32198. PMID 10542257.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000134001 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000021116 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid2948954-5] Ernst H, Duncan RF, Hershey JW (březen 1987). "Klonování a sekvenování komplementárních DNA kódujících alfa podjednotku translačního iniciačního faktoru eIF-2. Charakterizace proteinu a jeho messengerové RNA". J Biol Chem. 262 (3): 1206–12. PMID 2948954.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: EIF2S1 eukaryotický iniciační faktor translace 2, podjednotka 1 alfa, 35 kDa“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna. Citováno 2010-10-05.

[pmid12687390-7] Page AB, Owen CR, Kumar R, Miller JM, Rafols JA, White BC, DeGracia DJ, Krause GS (červenec 2003). „Trvalý eIF2alfa (P) je kolokalizován cytoplazmatickým cytochromem c v citlivých hipokampálních neuronech po 4 hodinách reperfuze po 10minutové úplné mozkové ischemii.“ Acta Neuropathol. 106 (1): 8–16. doi:10.1007 / s00401-003-0693-2. PMID 12687390.

[pmid15980866-8] Scheuner D, Vander Mierde D, Song B, Flamez D, Creemers JW, Tsukamoto K, Ribick M, Schuit FC, Kaufman RJ (červenec 2005). „Kontrola translace mRNA zachovává funkci endoplazmatického retikula v beta buňkách a udržuje homeostázu glukózy“. Nat. Med. 11 (7): 757–764. doi:10,1038 / nm1259. PMID 15980866.

[pmid15705855-9] Boyce M, Bryant KF, Jousse C, Long K, Harding HP, Scheuner D, Kaufman RJ, Ma D, Coen DM, Ron D, Yuan J (únor 2005). "Selektivní inhibitor eIF2alfa defosforylace chrání buňky před stresem ER". Věda. 307 (5711): 935–939. doi:10.1126 / science.1101902. PMID 15705855.

[pmid10882126-10] Harding HP, Zhang Y, Bertolotti A, Zeng H, Ron D (květen 2000). „Perk je nezbytný pro translační regulaci a přežití buněk během rozvinuté proteinové odpovědi“. Mol. Buňka. 5 (5): 897–904. doi:10.1016 / S1097-2765 (00) 80330-5. PMID 10882126.

[pmid11430820-11] Scheuner D, Song B, McEwen E, Liu C, Laybutt R, Gillespie P, Saunders T, Bonner-Weir S, Kaufman RJ (červen 2001). „Translační kontrola je nutná pro rozvinutou proteinovou reakci a homeostázu glukózy in vivo.“ Mol. Buňka. 7 (6): 1165–1176. doi:10.1016 / S1097-2765 (01) 00265-9. PMID 11430820.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]