EIF1AX - EIF1AX

EIF1AX
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1D7Q, 3ZJY, 4KZY, 4KZZ
Identifikátory
Aliasy	EIF1AX, EIF1A, EIF1AP1, EIF4C, eIF-1A, eIF-4C, eukaryotický iniciační faktor translace 1A, X-vázaný, eukaryotický iniciační faktor translace 1A X-vázaný
Externí ID	OMIM: 300186 MGI: 95298 HomoloGene: 20364 Genové karty: EIF1AX
Umístění genu (člověk)
Chr.	X chromozom (lidský)
Konec	20,141,838 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 18 (myš)
Konec	46,616,456 bp
Exprese RNA vzor
	; ; ; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita translačního faktoru, vazba RNA; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita faktoru iniciace translace; • Vazba RNA;
Buněčná složka	• cytosol;
Biologický proces	• překladová iniciace; • biosyntéza bílkovin;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	1964
	13664
	ENSG00000173674
	ENSMUSG00000057561
	P47813
	Q60872
	NM_001412
	NM_010120; NM_001374654
	NP_001403
	NP_034250
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Eukaryotický iniciační faktor translace 1A, X-chromozomální (eIF1A) je protein že u lidí je kódován EIF1AX gen.^[5]^[6]^[7] Tento gen kóduje základní eukaryotický iniciační faktor translace. Protein je součástí preiniciačního komplexu 43S (PIC), který zprostředkovává nábor malých 40S ribozomální podjednotka k 5 'čepice poselských RNA.^[7]

Funkce

eIF1A je malý protein (17 kDa v nadějných kvasnicích) a složka preinitačních komplexů 43S (PIC). eIF1A se váže poblíž ribozomu Stránka podobným způsobem jako funkčně související bakteriální protějšek IF1.^[8]

Klinický význam

Mutace v tomto genu byly opakovaně pozorovány v souvislosti s případy uveálního melanomu s disomií 3.^[9] eIF1A je mutován rakoviny štítné žlázy.^[10]

Interakce

EIF1AX bylo prokázáno komunikovat s IPO13.^[11]

Viz také

Eukaryotické iniciační faktory

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000173674 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000057561 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Dever TE, Wei CL, Benkowski LA, Browning K, Merrick WC, Hershey JW (únor 1994). "Stanovení aminokyselinové sekvence králičího, lidského a proteinového faktoru syntézy bílkovin z pšeničných klíčků eIF-4C klonováním a chemickým sekvenováním". The Journal of Biological Chemistry. 269 (5): 3212–8. PMID 8106356.
^ Lahn BT, Strana DC (říjen 1997). "Funkční koherence lidského chromozomu Y". Věda. 278 (5338): 675–80. Bibcode:1997Sci ... 278..675L. doi:10.1126 / science.278.5338.675. PMID 9381176.
^ ^A ^b "Entrez Gene: EIF1AX eukaryotický iniciační faktor translace 1A, X-vázaný".
^ Fraser, Christopher S. (2015). „Kvantitativní studie náboru mRNA do eukaryotického ribozomu“. Biochimie. 114: 58–71. doi:10.1016 / j.biochi.2015.02.017. PMC 4458453. PMID 25742741.
^ Martin M, Maßhöfer L, Temming P, Rahmann S, Metz C, Bornfeld N, van de Nes J, Klein-Hitpass L, Hinnebusch AG, Horsthemke B, Lohmann DR, Zeschnigk M (srpen 2013). "Exome sekvenování identifikuje opakující se somatické mutace v EIF1AX a SF3B1 v uveálním melanomu s disomií 3". Genetika přírody. 45 (8): 933–6. doi:10,1038 / ng.2674. PMC 4307600. PMID 23793026.
^ Xu, Yichen; Ruggero, Davide (09.03.2020). „Úloha kontroly translace v tumorogenezi a její terapeutické důsledky“. Roční přehled biologie rakoviny. 4 (1): 437–457. doi:10.1146 / annurev-cancerbio-030419-033420. ISSN 2472-3428.
^ Mingot JM, Kostka S, Kraft R, Hartmann E, Görlich D (červenec 2001). „Importin 13: nový zprostředkovatel jaderného dovozu a vývozu“. Časopis EMBO. 20 (14): 3685–94. doi:10.1093 / emboj / 20.14.3685. PMC 125545. PMID 11447110.

Další čtení

Battiste JL, Pestova TV, Hellen CU, Wagner G (leden 2000). „Struktura řešení eIF1A odhaluje velký povrch vázající RNA důležitý pro funkci skenování“. Molekulární buňka. 5 (1): 109–19. doi:10.1016 / S1097-2765 (00) 80407-4. PMID 10678173.
Choi SK, Olsen DS, Roll-Mecak A, Martung A, Remo KL, Burley SK, Hinnebusch AG, Dever TE (říjen 2000). „Fyzická a funkční interakce mezi eukaryotickými ortology prokaryontních translačních iniciačních faktorů IF1 a IF2“. Molekulární a buněčná biologie. 20 (19): 7183–91. doi:10.1128 / MCB.20.19.7183-7191.2000. PMC 86272. PMID 10982835.
Mingot JM, Kostka S, Kraft R, Hartmann E, Görlich D (červenec 2001). „Importin 13: nový zprostředkovatel jaderného dovozu a vývozu“. Časopis EMBO. 20 (14): 3685–94. doi:10.1093 / emboj / 20.14.3685. PMC 125545. PMID 11447110.
Sørensen HP, Hedegaard J, Sperling-Petersen HU, Mortensen KK (květen 2001). „Pozoruhodná ochrana iniciačních faktorů translace: IF1 / eIF1A a IF2 / eIF5B jsou univerzálně distribuované fylogenetické markery“. IUBMB Life. 51 (5): 321–7. doi:10.1080/152165401317190842. PMID 11699879.
Bohnsack MT, Regener K, Schwappach B, Saffrich R, Paraskeva E, Hartmann E, Görlich D (listopad 2002). „Exp5 exportuje eEF1A přes tRNA z jader a spolupracuje s dalšími transportními cestami, aby omezila translaci do cytoplazmy“. Časopis EMBO. 21 (22): 6205–15. doi:10.1093 / emboj / cdf613. PMC 137205. PMID 12426392.
Olsen DS, Savner EM, Mathew A, Zhang F, Krishnamoorthy T, Phan L, Hinnebusch AG (leden 2003). „Domény eIF1A, které zprostředkovávají vazbu na eIF2, eIF3 a eIF5B a podporují nábor ternárních komplexů in vivo“. Časopis EMBO. 22 (2): 193–204. doi:10.1093 / emboj / cdg030. PMC 140105. PMID 12514125.
Marintchev A, Kolupaeva VG, Pestova TV, Wagner G (únor 2003). „Mapování vazebného rozhraní mezi lidskými eukaryotickými iniciačními faktory 1A a 5B: nová interakce mezi starými partnery“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 100 (4): 1535–40. Bibcode:2003PNAS..100.1535M. doi:10.1073 / pnas.0437845100. PMC 149867. PMID 12569173.
Achát RJ, Choe M, Arnold AP (únor 2004). „Pohlavní rozdíly ve struktuře a expresi genů pohlavních chromozomů CHD1Z a CHD1W v zebřích pěnkavách“. Molekulární biologie a evoluce. 21 (2): 384–96. doi:10.1093 / molbev / msh027. PMID 14660691.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (říjen 2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Natur.437.1173R. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514.
Kim S, Kim GJ, Miyoshi H, Moon SH, Ahn SE, Lee JH, Lee HJ, Cha KY, Chung HM (srpen 2007). "Účinnost promotoru elongačního faktoru-1alfa v savčích embryonálních kmenových buňkách pomocí lentivirových genových transportních systémů". Kmenové buňky a vývoj. 16 (4): 537–45. doi:10.1089 / scd.2006.0088. PMID 17784828.

externí odkazy

Přehled všech strukturálních informací dostupných v PDB pro UniProt: P47813 (Eukaryotický iniciační faktor translace 1A, X-chromozom) na PDBe-KB.

Tento článek o gen na člověka X chromozom a / nebo související protein je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000173674 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000057561 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid8106356-5] Dever TE, Wei CL, Benkowski LA, Browning K, Merrick WC, Hershey JW (únor 1994). "Stanovení aminokyselinové sekvence králičího, lidského a proteinového faktoru syntézy bílkovin z pšeničných klíčků eIF-4C klonováním a chemickým sekvenováním". The Journal of Biological Chemistry. 269 (5): 3212–8. PMID 8106356.

[pmid9381176-6] Lahn BT, Strana DC (říjen 1997). "Funkční koherence lidského chromozomu Y". Věda. 278 (5338): 675–80. Bibcode:1997Sci ... 278..675L. doi:10.1126 / science.278.5338.675. PMID 9381176.

[entrez-7] A ^b "Entrez Gene: EIF1AX eukaryotický iniciační faktor translace 1A, X-vázaný".

[Fraser-8] Fraser, Christopher S. (2015). „Kvantitativní studie náboru mRNA do eukaryotického ribozomu“. Biochimie. 114: 58–71. doi:10.1016 / j.biochi.2015.02.017. PMC 4458453. PMID 25742741.

[9] Martin M, Maßhöfer L, Temming P, Rahmann S, Metz C, Bornfeld N, van de Nes J, Klein-Hitpass L, Hinnebusch AG, Horsthemke B, Lohmann DR, Zeschnigk M (srpen 2013). "Exome sekvenování identifikuje opakující se somatické mutace v EIF1AX a SF3B1 v uveálním melanomu s disomií 3". Genetika přírody. 45 (8): 933–6. doi:10,1038 / ng.2674. PMC 4307600. PMID 23793026.

[10] Xu, Yichen; Ruggero, Davide (09.03.2020). „Úloha kontroly translace v tumorogenezi a její terapeutické důsledky“. Roční přehled biologie rakoviny. 4 (1): 437–457. doi:10.1146 / annurev-cancerbio-030419-033420. ISSN 2472-3428.

[pmid11447110-11] Mingot JM, Kostka S, Kraft R, Hartmann E, Görlich D (červenec 2001). „Importin 13: nový zprostředkovatel jaderného dovozu a vývozu“. Časopis EMBO. 20 (14): 3685–94. doi:10.1093 / emboj / 20.14.3685. PMC 125545. PMID 11447110.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]