MT-RNR1 - MT-RNR1

mitochondriálně kódovaná 12S RNA
Identifikátory
SymbolMT-RNR1
Alt. symbolyMTRNR1
Gen NCBI4549
HGNC7470
Další údaje
MístoChr. MT [1]
Umístění MT-RNR1 gen na H řetězci lidského mitochondriálního genomu. MT-RNR1nebo RRNS, je jedním ze dvou genů mitochondriální ribozomální RNA (modré rámečky).

Mitochondriálně kódovaná 12S ribozomální RNA (často zkráceno jako 12S nebo 12S rRNA), také známý jako Mitochondriální peptid MOTS-c nebo Mitochondriální otevřený čtecí rámec 12S rRNA-c je součástí malé podjednotky (SSU) mitochondriální ribozom. U lidí je 12S kódován MT-RNR1 gen a je 959 nukleotidy dlouho.[1][2][3] MT-RNR1 je jedním z 37 genů obsažených v genomech zvířecích mitochondrií. Jejich 2 rRNA, 22 tRNA a 13 mRNA geny jsou velmi užitečné ve fylogenetických studiích, zejména v 12S a 16S rRNA. 12S rRNA je mitochondriálním homologem prokaryotické 16S a eukaryotická jaderná 18S ribozomální RNA.[4] Mutace v genu MT-RNR1 mohou být spojeny se ztrátou sluchu.[5]

Struktura

The MT-RNR1 gen se nachází na p rameno z mitochondriální DNA na pozici 12 a zabírá 953 párů bází.[6]

Funkce

The MT-RNR1 gen kóduje a protein odpovědný za regulaci inzulín citlivost a metabolické homeostáza. Protein působí jako inhibitor folátový cyklus, čímž se snižuje de novo purin biosyntéza což vede k akumulaci de novo purin syntéza meziprodukt 5-aminoimidazol-4-karboxamid (AICAR) a aktivace metabolického regulátoru 5'-AMP aktivovaná protein kináza (AMPK). Protein také chrání před věkem a dietou inzulín rezistence a také vyvolaná dietou obezita.[3][2]

Klinický význam

Nesyndromová ztráta sluchu a hluchota, mitochondriální

Patogenní mutace v MT-RNR1 Bylo zjištěno, že tento gen způsobuje pozdní nástup Mitochondriální nesyndromová ztráta sluchu a hluchota s predispozicí aminoglykosid ototoxicita.[7] Nesyndromová hluchota je charakterizován částečným nebo celkovým senzorineurální ztráta sluchu (SNHL) proměnlivého nástupu a závažnosti, která není spojena s jinými příznaky a příznaky.[8] Většina forem nesyndromické hluchoty je spojena s trvalou ztráta sluchu způsobené poškozením konstrukcí v vnitřní ucho.[2][3]Mutace 1494C> T, 1555A> G a 1095T> C v MT-RNR1 gen byl identifikován jako příčina ztráta sluchu.[9][10][11]

Komplexní nedostatek IV

MT-RNR1 mutace byly spojeny s komplexním nedostatkem IV mitochondriální dýchací řetězec, také známý jako cytochrom c oxidáza nedostatek. Nedostatek cytochrom c oxidázy je vzácný genetický stav, který může ovlivnit více částí těla, včetně kosterní svalstvo, srdce, mozek, nebo játra. Mezi běžné klinické projevy patří myopatie, hypotonie, a encefalomyopatie, laktátová acidóza, a Hypertrofické kardiomyopatie.[12] U pacienta s deficitem byla nalezena mutace 9952G> A.[13]

Reference

  1. ^ Anderson S, Bankier AT, Barrell BG, de Bruijn MH, Coulson AR, Drouin J, Eperon IC, Nierlich DP, Roe BA, Sanger F, Schreier PH, Smith AJ, Staden R, Young IG (duben 1981). "Pořadí a organizace lidského mitochondriálního genomu". Příroda. 290 (5806): 457–465. doi:10.1038 / 290457a0. PMID  7219534.
  2. ^ A b C „UniProt: univerzální znalostní databáze proteinů“. Výzkum nukleových kyselin. 45 (D1): D158 – D169. Ledna 2017. doi:10.1093 / nar / gkw1099. PMC  5210571. PMID  27899622.
  3. ^ A b C „MT-RNR1 - mitochondriální peptid MOTS-c - Homo sapiens (člověk) - gen a protein MT-RNR1“. Citováno 2018-08-28. Tento článek zahrnuje text k dispozici pod CC BY 4.0 licence.
  4. ^ Eperon IC, Anderson S, Nierlich DP (červenec 1980). "Výrazná sekvence genů lidské mitochondriální ribozomální RNA". Příroda. 286 (5772): 460–467. doi:10.1038 / 286460a0. PMID  6157106.
  5. ^ Ballana E, Morales E, Rabionet R, Montserrat B, Ventayol M, Bravo O, Gasparini P, Estivill X (březen 2006). „Mitochondriální 12S rRNA genové mutace ovlivňují sekundární strukturu RNA a vedou k variabilní penetraci při poškození sluchu“. Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 341 (4): 950–957. doi:10.1016 / j.bbrc.2006.01.049. PMID  16458854.
  6. ^ „MT-RNR1 mitochondriálně kódovaná 12S RNA [Homo sapiens (člověk)] - gen - NCBI“. www.ncbi.nlm.nih.gov.
  7. ^ Usami, Shin-ichi; Nishio, Shin-ya (1993). „Nesyndromová ztráta sluchu a hluchota, mitochondriální“. GeneReviews®. University of Washington, Seattle.
  8. ^ Reference, Genetics Home. „Nesyndromická ztráta sluchu“. Genetická domácí reference.
  9. ^ Li R, Greinwald JH, Yang L, Choo DI, Wenstrup RJ, Guan MX (srpen 2004). „Molekulární analýza mitochondriálních genů 12R rRNA a tRNASer (UCN) u pediatrických subjektů se nesyndromatickou ztrátou sluchu“. Journal of Medical Genetics. 41 (8): 615–620. doi:10.1136 / jmg.2004.020230. PMC  1735864. PMID  15286157.
  10. ^ Zhao H, Li R, Wang Q, Yan Q, Deng JH, Han D, Bai Y, Young WY, Guan MX (leden 2004). „Mateřsky zděděná a nesyndromická hluchota vyvolaná aminoglykosidy je spojena s novou mutací C1494T v mitochondriálním genu 12S rRNA ve velké čínské rodině“. American Journal of Human Genetics. 74 (1): 139–152. doi:10.1086/381133. PMC  1181901. PMID  14681830.
  11. ^ Yao YG, Salas A, Bravi CM, Bandelt HJ (červen 2006). „Přehodnocení úplné variace mtDNA ve východoasijských rodinách se sluchovým postižením“. Genetika člověka. 119 (5): 505–515. doi:10.1007 / s00439-006-0154-9. PMID  16528519.
  12. ^ Reference, Genetics Home. "Nedostatek cytochrom c oxidázy". Genetická domácí reference. Tento článek včlení text z tohoto zdroje, který je v veřejná doména.
  13. ^ Hanna MG, Nelson IP, Rahman S, Lane RJ, Land J, Heales S, Cooper MJ, Schapira AH, Morgan-Hughes JA, Wood NW (červenec 1998). „Nedostatek cytochrom c oxidázy spojený s první mutací stop-kodonového bodu v lidské mtDNA“. American Journal of Human Genetics. 63 (1): 29–36. doi:10.1086/301910. PMC  1377234. PMID  9634511.

externí odkazy


Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.