MRPS22 - MRPS22

MRPS22
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	3J9M
Identifikátory
Aliasy	MRPS22, C3orf5, COXPD5, GIBT, MRP-S22, RPMS22, GK002, mitochondriální ribozomální protein S22, ODG7
Externí ID	OMIM: 605810 MGI: 1928137 HomoloGene: 57030 Genové karty: MRPS22
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 3 (lidský)
Konec	139,357,223 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 9 (myš)
Konec	98,601,660 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• strukturní složka ribozomu;
Buněčná složka	• mitochondriální vnitřní membrána; • ribozom; • mitochondriální ribozom; • mitochondrie; • mitochondriální malá ribozomální podjednotka;
Biologický proces	• mitochondriální translační prodloužení; • mitochondriální translační ukončení; • biologický proces;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	56945
	64655
	ENSG00000175110
	ENSMUSG00000032459
	P82650
	Q9CXW2
	NM_020191; NM_001363857; NM_001363893
	NM_025485
	NP_064576; NP_001350786; NP_001350822
	NP_079761
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

28S ribozomální protein S22, mitochondriální je protein že u lidí je kódován MRPS22 gen.^[5]^[6]

Savčí mitochondriální ribozomální proteiny jsou kódovány jaderné geny a pomoci proteosyntéza v rámci mitochondrie. Mitochondriální ribozomy (mitoribozomy) se skládají z malého 28S podjednotku a velkou 39S podjednotku. Mají odhadem 75% protein na rRNA složení ve srovnání s prokaryotickými ribozomy, kde je tento poměr obrácen. Další rozdíl mezi savčími mitoribozomy a prokaryotickými ribozomy je v tom, že tyto obsahují a 5S rRNA. Mezi různými druhy se proteiny obsahující mitoribozom velmi liší v sekvenci a někdy v biochemických vlastnostech, což brání snadnému rozpoznání sekvenční homologie. Tento gen kóduje protein 28S podjednotky, který zřejmě nemá protějšek v prokaryotických a fungálně mitochondriálních ribozomech. Tento gen leží telomerní z a je přepsán v opačném směru od skříň vidlice L2 gen. A pseudogen odpovídající tomuto genu se nachází na chromozomu Xq.^[6]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000175110 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000032459 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Crisponi L, Deiana M, Loi A, Chiappe F, Uda M, Amati P, Bisceglia L, Zelante L, Nagaraja R, Porcu S, Ristaldi MS, Marzella R, Rocchi M, Nicolino M, Lienhardt-Roussie A, Nivelon A, Verloes A, Schlessinger D, Gasparini P, Bonneau D, Cao A, Pilia G (únor 2001). „Předpokládaný transkripční faktor vidlice FOXL2 je mutován v syndromu blefarofimózy / ptózy / epicanthus inversus“. Nat Genet. 27 (2): 159–66. doi:10.1038/84781. PMID 11175783. S2CID 26750194.
^ ^A ^b „Entrez Gene: MRPS22 mitochondriální ribozomální protein S22“.

Další čtení

Koc EC, Burkhart W, Blackburn K a kol. (2000). „Proteomický přístup k identifikaci savčích mitochondriálních malých podjednotek ribozomálních proteinů“. J. Biol. Chem. 275 (42): 32585–91. doi:10,1074 / jbc.M003596200. PMID 10938081.
Cavdar Koc E, Burkhart W, Blackburn K a kol. (2001). „Malá podjednotka savčího mitochondriálního ribozomu. Identifikace celého komplementu přítomných ribozomálních proteinů“. J. Biol. Chem. 276 (22): 19363–74. doi:10,1074 / jbc.M100727200. PMID 11279123.
Kenmochi N, Suzuki T, Uechi T a kol. (2001). „Humánní mitochondriální ribozomální proteinové geny: mapování 54 genů na chromozomy a důsledky pro lidské poruchy“. Genomika. 77 (1–2): 65–70. doi:10.1006 / geno.2001.6622. PMID 11543634.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Zhang Z, Gerstein M (2003). "Identifikace a charakterizace více než 100 mitochondriálních ribozomálních proteinových pseudogenů v lidském genomu". Genomika. 81 (5): 468–80. doi:10.1016 / S0888-7543 (03) 00004-1. PMID 12706105.
Crisponi L, Uda M, Deiana M a kol. (2004). „Inaktivace FOXL2 translokací vzdálenou 171 kb: analýza 500 kb chromozomu 3 pro kandidátské regulační sekvence dlouhého dosahu“. Genomika. 83 (5): 757–64. doi:10.1016 / j.ygeno.2003.11.010. PMID 15081106.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Sbírka genů savců (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Guo D, Han J, Adam BL a kol. (2005). "Proteomická analýza substrátů SUMO4 v buňkách HEK293 pod stresem vyvolaným hladovým sérovým účinkem". Biochem. Biophys. Res. Commun. 337 (4): 1308–18. doi:10.1016 / j.bbrc.2005.09.191. PMID 16236267.
Otsuki T, Ota T, Nishikawa T a kol. (2007). "Signální sekvence a klíčové slovo trap in silico pro výběr lidských cDNA plné délky kódujících sekreci nebo membránové proteiny z knihoven cDNA opatřených oligo". DNA Res. 12 (2): 117–26. doi:10.1093 / dnares / 12.2.117. PMID 16303743.
Ewing RM, Chu P, Elisma F a kol. (2007). „Mapování interakcí lidských proteinů a proteinů ve velkém měřítku hmotnostní spektrometrií“. Mol. Syst. Biol. 3 (1): 89. doi:10.1038 / msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.

Tento článek o gen na lidský chromozom 3 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

Tento protein související článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000175110 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000032459 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid11175783-5] Crisponi L, Deiana M, Loi A, Chiappe F, Uda M, Amati P, Bisceglia L, Zelante L, Nagaraja R, Porcu S, Ristaldi MS, Marzella R, Rocchi M, Nicolino M, Lienhardt-Roussie A, Nivelon A, Verloes A, Schlessinger D, Gasparini P, Bonneau D, Cao A, Pilia G (únor 2001). „Předpokládaný transkripční faktor vidlice FOXL2 je mutován v syndromu blefarofimózy / ptózy / epicanthus inversus“. Nat Genet. 27 (2): 159–66. doi:10.1038/84781. PMID 11175783. S2CID 26750194.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: MRPS22 mitochondriální ribozomální protein S22“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]