Protoporphyrinogen oxidáza - Protoporphyrinogen oxidase
| protoporfyrinogen oxidáza | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Syntéza hemu - všimněte si, že některé reakce probíhají v cytoplazma a někteří v mitochondrie (žlutá) | |||||||||
| Identifikátory | |||||||||
| EC číslo | 1.3.3.4 | ||||||||
| Číslo CAS | 53986-32-6 | ||||||||
| Databáze | |||||||||
| IntEnz | IntEnz pohled | ||||||||
| BRENDA | Vstup BRENDA | ||||||||
| EXPASY | Pohled NiceZyme | ||||||||
| KEGG | Vstup KEGG | ||||||||
| MetaCyc | metabolická cesta | ||||||||
| PRIAM | profil | ||||||||
| PDB struktur | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||||||||
| Genová ontologie | AmiGO / QuickGO | ||||||||
| |||||||||
Protoporphyrinogen oxidáza je enzym že u lidí je kódován PPOX gen.[5][6][7]
Protoporphyrinogen oxidáza je zodpovědná za sedmý krok biosyntézy protoporfyrin IX. Tento porfyrin je předchůdcem hemoglobin, kyslík nosič u zvířat a chlorofyl, barvivo v rostlinách. Enzym katalyzuje dehydrogenace (odstranění vodík atomy) protoporfyrinogenu IX (produkt šestého kroku výroby hemu) za vzniku protoporfyrinu IX. Jeden další enzym musí modifikovat protoporfyrin IX, než se z něj stane hem. Inhibice tohoto enzymu je strategie používaná jistě herbicidy.
Gen
Gen PPOX se nachází na dlouhém (q) rameni chromozom 1 v poloze 22, od základní pár 157 949 266 na základní pár 157 954 082.
Funkce
Tento gen kóduje předposlední enzym biosyntézy hemu, který katalyzuje oxidaci 6 elektronů protoporfyrinogen IX tvořit protoporfyrin IX. Tento protein je flavoprotein spojené s vnějším povrchem vnitřní mitochondriální membrána.[7]
Hemová biosyntetická dráha
Následující geny kódují enzymy, které katalyzují různé kroky v hemu biosyntetický cesta:
- ALAD: aminolevulinát, delta-, dehydratáza
- ALAS1: aminolevulinát, delta, syntáza 1
- ALAS2: aminolevulinát, delta, syntáza 2 (sideroblastická / hypochromní anémie)
- CPOX: koproporfyrinogen oxidáza
- FECH: ferrochelatase (protoporphyria)
- HMBS: hydroxymethylbilane syntáza
- PPOX: protoporphyrinogen oxidase
- UROD: uroporphyrinogen dekarboxyláza
- UROS: uroporphyrinogen III syntáza (vrozená erytropoetická porfyrie)
Klinický význam
Rozmanitá porfyrie je způsobena mutacemi v genu PPOX. V genu PPOX bylo identifikováno více než 100 mutací, které mohou způsobit pestrou porfyrii. Jedna mutace, substituce aminokyselina tryptofan pro arginin na pozici 59 (také psaný jako Arg59Trp nebo R59W), se nachází asi v 95 procentech Jihoafričan rodiny s pestrou porfyrií. Mutace v genu PPOX snižují aktivitu enzymu vytvářeného genem, což umožňuje hromadění vedlejších produktů produkce hemu v těle. Toto nahromadění v kombinaci s negenetickými faktory (jako jsou některé léky, alkohol a diety), způsobuje tento typ porfyrie.
Viz také
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000143224 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000062729 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ Taketani S, Inazawa J, Abe T, Furukawa T, Kohno H, Tokunaga R, Nishimura K, Inokuchi H (říjen 1995). „Lidský gen protoporfyrinogen oxidázy (PPOX): organizace a umístění na chromozom 1“. Genomika. 29 (3): 698–703. doi:10.1006 / geno.1995.9949. PMID 8575762.
- ^ Frank J, McGrath JA, Poh-Fitzpatrick MB, Hawk JL, Christiano AM (červenec 1999). „Mutace v kodonu iniciace translace genu protoporfyrinogen oxidázy jsou základem pestrobarevné porfyrie“. Klinická a experimentální dermatologie. 24 (4): 296–301. doi:10.1046 / j.1365-2230.1999.00484.x. PMID 10457135.
- ^ A b „Entrez Gene: PPOX protoporphyrinogen oxidase“.
Další čtení
- Starší GH (1998). "Genetické vady porfyrií: typy a význam". Dermatologické kliniky. 16 (2): 225–33. doi:10.1016 / S0738-081X (97) 00202-2. PMID 9554235.
- Maneli MH, Corrigall AV, Klump HH, Davids LM, Kirsch RE, Meissner PN (srpen 2003). "Kinetická a fyzikální charakterizace rekombinantního divokého typu a mutantních lidských protoporfyrinogen oxidáz". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - bílkoviny a proteomika. 1650 (1–2): 10–21. doi:10.1016 / s1570-9639 (03) 00186-9. PMID 12922165.
- Morgan RR, Errington R, Elder GH (leden 2004). "Identifikace sekvencí požadovaných pro import lidské protoporfyrinogen oxidázy do mitochondrií". The Biochemical Journal. 377 (Pt 2): 281–7. doi:10.1042 / BJ20030978. PMC 1223874. PMID 14535846.
- Sassa S, Kappas A (únor 2000). "Molekulární aspekty zděděných porfyrií". Journal of Internal Medicine. 247 (2): 169–78. doi:10.1046 / j.1365-2796.2000.00618.x. PMID 10692079.
- Nishimura K, Taketani S, Inokuchi H (duben 1995). „Klonování lidské cDNA pro protoporfyrinogen oxidázu in vivo komplementací hemG mutantu Escherichia coli“. The Journal of Biological Chemistry. 270 (14): 8076–80. doi:10.1074 / jbc.270.14.8076. PMID 7713909.
- Dailey TA, Meissner P, Dailey HA (leden 1994). "Exprese klonované protoporfyrinogen oxidázy". The Journal of Biological Chemistry. 269 (2): 813–5. PMID 8288631.
- Dailey TA, Dailey HA, Meissner P, Prasad AR (prosinec 1995). "Klonování, sekvence a exprese myší protoporfyrinogen oxidázy". Archivy biochemie a biofyziky. 324 (2): 379–84. doi:10.1006 / abbi.1995.0051. PMID 8554330.
- Meissner PN, Dailey TA, Hift RJ, Ziman M, Corrigall AV, Roberts AG, Meissner DM, Kirsch RE, Dailey HA (květen 1996). „Mutace R59W v lidské protoporfyrinogenoxidáze vede ke snížení aktivity enzymu a převládá u Jihoafričanů s pestrou porfyrií.“ Genetika přírody. 13 (1): 95–7. doi:10.1038 / ng0596-95. PMID 8673113.
- Dailey TA, Dailey HA (leden 1996). „Lidská protoporfyrinogenoxidáza: exprese, čištění a charakterizace klonovaného enzymu“. Věda o bílkovinách. 5 (1): 98–105. doi:10.1002 / pro.5560050112. PMC 2143237. PMID 8771201.
- Puy H, Robréau AM, Rosipal R, Nordmann Y, Deybach JC (září 1996). „Protoporphyrinogen oxidase: kompletní genomová sekvence a polymorfismy v lidském genu“. Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 226 (1): 226–30. doi:10.1006 / bbrc.1996.1337. PMID 8806618.
- Deybach JC, Puy H, Robréau AM, Lamoril J, Da Silva V, Grandchamp B, Nordmann Y (březen 1996). „Mutace v genu protoporfyrinogen oxidázy u pacientů s variegate porphyria“. Lidská molekulární genetika. 5 (3): 407–10. doi:10,1093 / hmg / 5,3,407. PMID 8852667.
- Lam H, Dragan L, Tsou HC, Merk H, Peacocke M, Goerz G, Sassa S, Poh-Fitzpatrick M, Bickers DR, Christiano AM (leden 1997). "Molekulární základ variegate porfyrie: de novo inzerční mutace v genu protoporfyrinogen oxidázy". Genetika člověka. 99 (1): 126–9. doi:10,1007 / s004390050325. PMID 9003509.
- Dailey HA, Dailey TA (únor 1997). "Charakteristiky lidské protoporfyrinogenoxidázy u kontrol a pestrobarevných porfyrií". Buněčná a molekulární biologie. 43 (1): 67–73. PMID 9074790.
- Frank J, Poh-Fitzpatrick MB, King LE, Christiano AM (srpen 1998). „Genetický základ„ Scarsdale Gourmet Diet “„ variegate porphyria: missense mutation in the protoporphyrinogen oxidase gen “. Archiv dermatologického výzkumu. 290 (8): 441–5. doi:10,1007 / s004030050333. PMID 9763307.
- Roberts AG, Puy H, Dailey TA, Morgan RR, Whatley SD, Dailey HA, Martasek P, Nordmann Y, Deybach JC, Elder GH (listopad 1998). "Molekulární charakterizace homozygotní variegate porfyrie". Lidská molekulární genetika. 7 (12): 1921–5. doi:10,1093 / hmg / 7.12.1921. PMID 9811936.
- Whatley SD, Puy H, Morgan RR, Robreau AM, Roberts AG, Nordmann Y, Elder GH, Deybach JC (říjen 1999). „Variegate porphyria in Western Europe: identification of PPOX gen mutations in 104 rodiny, Range of Allelic heterogenity, and absence the correlation between phenotype and type of mutation“. American Journal of Human Genetics. 65 (4): 984–94. doi:10.1086/302586. PMC 1288269. PMID 10486317.
- Suzuki Y, Ishihara D, Sasaki M, Nakagawa H, Hata H, Tsunoda T, Watanabe M, Komatsu T, Ota T, Isogai T, Suyama A, Sugano S (březen 2000). "Statistická analýza 5 'nepřekládané oblasti lidské mRNA pomocí" Oligo-Capped "cDNA knihoven". Genomika. 64 (3): 286–97. doi:10,1006 / geno.2000.6076. PMID 10756096.
- Corrigall AV, Hift RJ, Davids LM, Hancock V, Meissner D, Kirsch RE, Meissner PN (duben 2000). „Homozygotní variegate porfyrie v Jižní Africe: genotypová analýza ve dvou případech“. Molekulární genetika a metabolismus. 69 (4): 323–30. doi:10,1006 / mgme. 2000,2975. PMID 10870850.
- Kauppinen R, Timonen K, von und zu Fraunberg M, Laitinen E, Ahola H, Tenhunen R, Taketani S, Mustajoki P (duben 2001). „Homozygotní variegate porfyrie: 20leté sledování a charakterizace molekulárního defektu“. The Journal of Investigative Dermatology. 116 (4): 610–3. doi:10.1046 / j.1523-1747.2001.01293.x. PMID 11286631.
- Palmer RA, Elder GH, Barrett DF, Keohane SG (duben 2001). „Homozygotní variegate porfyrie: sloučenina heterozygot s novými mutacemi v genu protoporfyrinogen oxidázy“. British Journal of Dermatology. 144 (4): 866–9. doi:10.1046 / j.1365-2133.2001.04147.x. PMID 11298551.
- Corrigall AV, Hift RJ, Davids LM, Hancock V, Meissner D, Kirsch RE, Meissner PN (květen 2001). "Identifikace první mutace variegate porfyrie v domorodé černé jihoafrické republice a další důkazy o heterogenitě variegate porfyrie". Molekulární genetika a metabolismus. 73 (1): 91–6. doi:10,1006 / mgme.2001,3163. PMID 11350188.
- Donnelly JG, Detombe S, Hindmarsh JT (2002). „Jednovláknový konformační polymorfismus a denaturační gradientová gelová elektroforéza při screeningu variegate porfyrie: identifikace dvou nových mutací“. Annals of Clinical and Laboratory Science. 32 (2): 107–13. PMID 12017191.
externí odkazy
- PDBe-KB poskytuje přehled všech strukturních informací dostupných v PDB pro lidskou protoporfyrinogen oxidázu
