ACADSB - ACADSB

ACADSB
2jif.jpg
Dostupné struktury
PDBHledání ortologu: PDBe RCSB
Identifikátory
AliasyACADSB, acyl-CoA dehydrogenáza, krátký / rozvětvený řetězec, 2-MEBCAD, ACAD7, SBCAD, acyl-CoA dehydrogenáza s krátkým / rozvětveným řetězcem
Externí IDOMIM: 600301 MGI: 1914135 HomoloGene: 1216 Genové karty: ACADSB
Umístění genu (člověk)
Chromozom 10 (lidský)
Chr.Chromozom 10 (lidský)[1]
Chromozom 10 (lidský)
Genomické umístění pro ACADSB
Genomické umístění pro ACADSB
Kapela10q26.13Start123,008,979 bp[1]
Konec123,058,290 bp[1]
Ortology
DruhČlověkMyš
Entrez

36

66885

Ensembl

ENSG00000196177

ENSMUSG00000030861

UniProt

P45954

Q9DBL1

RefSeq (mRNA)

NM_001609
NM_001330174

NM_025826

RefSeq (protein)

NP_001317103
NP_001600

NP_080102

Místo (UCSC)Chr 10: 123,01 - 123,06 Mbn / a
PubMed Vyhledávání[2][3]
Wikidata
Zobrazit / upravit člověkaZobrazit / upravit myš

ACADSB je člověk gen který kóduje specifická acyl-CoA dehydrogenáza s krátkým / rozvětveným řetězcem (SBCAD), an enzym v acyl CoA dehydrogenáza rodina.

Může to způsobit nedostatek acyl-CoA dehydrogenázy s krátkým / rozvětveným řetězcem.[4]

Struktura

Lidský gen ACADSB je lokalizován na chromozom 10; jeho přesná lokalizace byla identifikována jako 10q25-q26.[5] The otevřený čtecí rámec (ORF) kóduje prekurzorový protein, který obsahuje 431 aminokyseliny; posttranslační zpracování vede ke zralému proteinu s 399 aminokyselinami. CDNA je významně podobná cDNA cDNA dalších členů rodiny acyl-CoA dehydrogenázy; jeho struktura je nejblíže struktuře acyl-CoA dehydrogenázy s krátkým řetězcem.[6] Byla také studována struktura katalytické kapsy; pozice 104 ve spodní části kapsy vázající substrát byla identifikována jako důležitá při určování délky primárního uhlíkového řetězce, který může být umístěn. Bylo prokázáno, že pozměňování zbytků na pozicích 105 a 177 ovlivňuje rychlost dehydrogenace reakce.[7]

Funkce

Acyl-CoA dehydrogenáza s krátkým / rozvětveným řetězcem (ACADSB) je členem rodiny enzymů acyl-CoA dehydrogenázy, které katalyzují dehydrogenaci derivátů acyl-CoA v metabolismus mastných kyselin nebo větvené aminokyseliny. Specifičnost podkladu je primární charakteristika používaná k definování členů této genové rodiny. Produkt genu ACADSB má největší aktivitu vůči derivátu acyl-CoA s krátkým rozvětveným řetězcem, (S) -2-methylbutyryl-CoA, ale také významně reaguje s dalšími substráty s 2-methylovým rozvětveným řetězcem a s acyl-CoAs.[8] Kódovaný protein je také zapojen do L-leucin katabolismus.[9]

Klinický význam

Byly spojeny mutace v genu ACADSB Nedostatek 2-methylbutyryl-CoA dehydrogenázy (SBCADD, také známý jako MBD) nedostatek, an autosomální recesivní metabolická porucha postižených isoleucin degradace.[10] Bylo identifikováno mnoho mutací napříč 10 exony genu, přičemž tyto mutace byly příčinou přeskakování exonu a další transkripční a překladové chyby. Poruchu lze detekovat rutinním screeningem novorozenců na bázi MS / MS kvůli zvýšené přítomnosti 2-methylbutyrylkarnitinu ve vzorcích tkáně.[11][12] Poruchu lze také identifikovat pomocí analýzy organických kyselin v moči detekcí přítomnosti 2-methylbutyrylu glycinurie.[9] Zatímco mnoho jedinců s mutací v tomto genu může být asymptomatických, u některých pacientů byly hlášeny příznaky v raném dětství. Děti mohou zažít apneické epizody, zobecněné svalová atrofie, hypotonie, letargie, záchvaty a zpožděný vývoj motoru. Pacienti mohou také zaznamenat metabolické příznaky, jako je podchlazení a hypoglykémie.[13] A konečně, genetické polymorfismy genu ACADSB se mohou také podílet na vývoji hypertenze v japonské populaci.[14]

Reference

  1. ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000196177 - Ensembl, Květen 2017
  2. ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  3. ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  4. ^ Andresen BS, Christensen E, Corydon TJ, Bross P, Pilgaard B, Wanders RJ, Ruiter JP, Simonsen H, Winter V, Knudsen I, Schroeder LD, Gregersen N, Skovby F (listopad 2000). „Izolovaná 2-methylbutyrylglycinurie způsobená nedostatkem acyl-CoA dehydrogenázy s krátkým / rozvětveným řetězcem: identifikace nového defektu enzymu, rozlišení jeho molekulárního základu a důkazy o odlišných acyl-CoA dehydrogenázách v metabolismu isoleucinu a valinu“. American Journal of Human Genetics. 67 (5): 1095–103. doi:10.1086/303105. PMC  1288551. PMID  11013134.
  5. ^ Arden KC, Viars CS, Fu K, Rozen R (únor 1995). „Lokalizace acyl-CoA dehydrogenázy s krátkým / rozvětveným řetězcem (ACADSB) na lidský chromozom 10“. Genomika. 25 (3): 743–5. doi:10.1016 / 0888-7543 (95) 80023-f. PMID  7759115.
  6. ^ Rozen R, Vockley J, Zhou L, Milos R, Willard J, Fu K, Vicanek C, Low-Nang L, Torban E, Fournier B (listopad 1994). "Izolace a exprese cDNA kódující prekurzor nového člena (ACADSB) rodiny genů acyl-CoA dehydrogenázy". Genomika. 24 (2): 280–7. doi:10.1006 / geno.1994.1617. PMID  7698750.
  7. ^ He M, Burghardt TP, Vockley J (září 2003). „Nový přístup k charakterizaci substrátové specificity v Acyl-CoA dehydrogenáze s krátkým / rozvětveným řetězcem“. The Journal of Biological Chemistry. 278 (39): 37974–86. doi:10,1074 / jbc.M306882200. PMID  12855692.
  8. ^ "Entrez Gene: acyl-CoA dehydrogenáza, krátký / rozvětvený řetězec".
  9. ^ A b Andresen BS, Christensen E, Corydon TJ, Bross P, Pilgaard B, Wanders RJ, Ruiter JP, Simonsen H, Winter V, Knudsen I, Schroeder LD, Gregersen N, Skovby F (listopad 2000). „Izolovaná 2-methylbutyrylglycinurie způsobená nedostatkem acyl-CoA dehydrogenázy s krátkým / rozvětveným řetězcem: identifikace nového defektu enzymu, rozlišení jeho molekulárního základu a důkazy o odlišných acyl-CoA dehydrogenázách v metabolismu isoleucinu a valinu“. American Journal of Human Genetics. 67 (5): 1095–103. doi:10.1086/303105. PMC  1288551. PMID  11013134.
  10. ^ Sass JO, Ensenauer R, Röschinger W, Reich H, Steuerwald U, Schirrmacher O, Engel K, Häberle J, Andresen BS, Mégarbané A, Lehnert W, Zschocke J (leden 2008). „Nedostatek 2-methylbutyryl-koenzym A dehydrogenázy: funkční a molekulární studie týkající se poruchy katabolismu isoleucinu“. Molekulární genetika a metabolismus. 93 (1): 30–5. doi:10.1016 / j.ymgme.2007.09.002. PMID  17945527.
  11. ^ Madsen PP, Kibaek M, Roca X, Sachidanandam R, Krainer AR, Christensen E, Steiner RD, Gibson KM, Corydon TJ, Knudsen I, Wanders RJ, Ruiter JP, Gregersen N, Andresen BS (únor 2006). "Nedostatek acyl-CoA dehydrogenázy s krátkým / rozvětveným řetězcem v důsledku mutace IVS3 + 3A> G, která způsobuje přeskakování exonu". Genetika člověka. 118 (6): 680–90. doi:10.1007 / s00439-005-0070-4. PMID  16317551. S2CID  22861705.
  12. ^ Alfardan J, Mohsen AW, Copeland S, Ellison J, Keppen-Davis L, Rohrbach M, Powell BR, Gillis J, Matern D, Kant J, Vockley J (srpen 2010). "Charakterizace nových mutací genové sekvence ACADSB a klinické důsledky u pacientů s 2-methylbutyrylglycinurií identifikovaných skríninkem pro novorozence". Molekulární genetika a metabolismus. 100 (4): 333–8. doi:10.1016 / j.ymgme.2010.04.014. PMC  2906669. PMID  20547083.
  13. ^ Gibson KM, Burlingame TG, Hogema B, Jakobs C, Schutgens RB, Millington D, Roe CR, Roe DS, Sweetman L, Steiner RD, Linck L, Pohowalla P, Sacks M, Kiss D, Rinaldo P, Vockley J (červen 2000 ). „Nedostatek 2-methylbutyryl-koenzym A dehydrogenázy: nová vrozená chyba metabolismu L-isoleucinu“. Pediatrický výzkum. 47 (6): 830–3. doi:10.1203/00006450-200006000-00025. PMID  10832746.
  14. ^ Kamide K, Kokubo Y, Yang J, Matayoshi T, Inamoto N, Takiuchi S, Horio T, Miwa Y, Yoshii M, Tomoike H, Tanaka C, Banno M, Okuda T, Kawano Y, Miyata T (leden 2007). "Sdružení genetických polymorfismů ACADSB a COMT s lidskou hypertenzí". Journal of Hypertension. 25 (1): 103–10. doi:10.1097 / HJH.0b013e3280103a40. PMID  17143180. S2CID  40885244.

externí odkazy

  • Člověk ACADSB umístění genomu a ACADSB stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.
  • Přehled všech strukturálních informací dostupných v PDB pro UniProt: P45954 (Specifická acyl-CoA dehydrogenáza s krátkým / rozvětveným řetězcem, mitochondriální) na PDBe-KB.

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.