DUSP6 - DUSP6

DUSP6
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1HZM, 1MKP
Identifikátory
Aliasy	DUSP6, HH19, MKP3, PYST1, fosfatáza duální specificity 6
Externí ID	OMIM: 602748 MGI: 1914853 HomoloGene: 55621 Genové karty: DUSP6
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 12 (lidský)
Konec	89,352,501 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 10 (myš)
Konec	99,267,489 bp
Exprese RNA vzor
	; ; ; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita fosfoprotein fosfatázy; • aktivita fosfatázy; • aktivita hydrolázy; • Aktivita MAP kinázy tyrosin / serin / threonin fosfatáza; • aktivita protein tyrosin fosfatázy; • aktivita protein tyrosin / serin / threonin fosfatáza;
Buněčná složka	• nukleoplazma; • cytosol; • cytoplazma;
Biologický proces	• negativní regulace fosforylace bílkovin; • diferenciace buněk; • pozitivní regulace buněčné smrti; • reakce na organickou cyklickou sloučeninu; • regulace signální dráhy receptoru fibroblastového růstového faktoru; • deaktivace aktivity MAPK; • defosforylace bílkovin; • reakce na organickou látku; • Kaskáda MAPK; • aktivace aktivity MAPK; • reakce na nitrosativní stres; • pozitivní regulace apoptotického procesu; • negativní regulace kaskády ERK1 a ERK2; • peptidyl-tyrosin defosforylace; • reakce na růstový faktor; • tvorba hřbetní / břišní struktury; • regulace specifikace osudu endodermálních buněk; • reakce na drogu; • defosforylace; • regulace srdečního růstu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	1848
	67603
	ENSG00000139318
	ENSMUSG00000019960
	Q16828
	Q9DBB1
	NM_022652; NM_001946
	NM_026268
	NP_001937; NP_073143
	NP_080544
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Fosfatáza s dvojí specificitou 6 (DUSP6) je enzym že u lidí je kódován DUSP6 gen.^[5]^[6]^[7]

Funkce

The protein kódovaný tímto genem je členem proteinu dvojí specificity fosfatáza podčeleď. Tyto fosfatázy deaktivují svůj cíl kinázy defosforylací obou fosfoserin /threonin a fosfotyrosin zbytky. Negativně regulují členy mitogenem aktivovaný protein (MAP) kinázová nadrodina (MAPK / ERK, SAPK / JNK, p38), které jsou spojeny s buněčnou proliferací a diferenciací. Různí členové rodiny fosfatáz s duální specificitou vykazují odlišné substrátové specificity pro různé MAP kinázy, odlišnou distribuci tkání a subcelulární lokalizaci a různé způsoby indukovatelnosti jejich exprese extracelulárními stimuly. Tento genový produkt se deaktivuje ERK2, je exprimován v různých tkáních s nejvyššími hladinami v srdci a slinivce břišní a na rozdíl od většiny ostatních členů této rodiny je lokalizován v cytoplazmě. Pro tento gen byly nalezeny dvě varianty transkriptu kódující různé izoformy.^[5] Ukázalo se, že upregulace MKP-3 zmírňuje chronickou pooperační bolest.^[8]^[9]

Interakce

Bylo prokázáno, že DUSP6 komunikovat s MAPK3.^[10]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000139318 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000019960 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b „Entrez Gene: DUSP6 dual specificity phosphatase 6“.
^ Muda M, Boschert U, Dickinson R, Martinou JC, Martinou I, Camps M, Schlegel W, Arkinstall S (únor 1996). „MKP-3, nová cytosolická protein-tyrosin fosfatáza, která je příkladem nové třídy mitogenem aktivované protein kinázy fosfatázy“. The Journal of Biological Chemistry. 271 (8): 4319–26. doi:10.1074 / jbc.271.8.4319. PMID 8626780.
^ Smith A, Price C, Cullen M, Muda M, King A, Ozanne B, Arkinstall S, Ashworth A (červen 1997). "Chromozomální lokalizace tří lidských genů fosfatázy s dvojí specificitou (DUSP4, DUSP6 a DUSP7)". Genomika. 42 (3): 524–7. doi:10.1006 / geno.1997.4756. PMID 9205128.
^ Saha M, Skopelja S, Martinez E, Alvarez DL, Liponis BS, Romero-Sandoval EA (říjen 2013). „Spinální mitogenem aktivovaná protein kináza fosfatáza-3 (MKP-3) je nezbytná pro normální rozlišení mechanické alodynie u myšího modelu akutní pooperační bolesti“. The Journal of Neuroscience. 33 (43): 17182–7. doi:10.1523 / JNEUROSCI.5605-12.2013. PMC 6618446. PMID 24155322.
^ Skopelja-Gardner S, Saha M, Alvarado-Vazquez PA, Liponis BS, Martinez E, Romero-Sandoval EA (2017-03-28). „Mitogenem aktivovaná proteinkináza fosfatáza-3 (MKP-3) v chirurgické ráně je nezbytná pro vyřešení pooperační bolesti u myší“. Journal of Pain Research. 10: 763–774. doi:10.2147 / jpr.s129826. PMC 5378457. PMID 28405172.
^ Muda M, Theodosiou A, Gillieron C, Smith A, Chabert C, Camps M, Boschert U, Rodrigues N, Davies K, Ashworth A, Arkinstall S (duben 1998). „Mitogenem aktivovaná proteinkináza fosfatáza-3 N-koncová nekatalytická oblast je zodpovědná za těsnou vazbu substrátu a enzymatickou specificitu“. The Journal of Biological Chemistry. 273 (15): 9323–9. doi:10.1074 / jbc.273.15.9323. PMID 9535927.

Další čtení

Maruyama K, Sugano S (leden 1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Ženich LA, Sneddon AA, Alessi DR, Dowd S, Keyse SM (červenec 1996). „Diferenciální regulace kináz MAP, SAP a RK / p38 pomocí Pyst1, nové cytosolické dvouspecifické fosfatázy“. Časopis EMBO. 15 (14): 3621–32. doi:10.1002 / j.1460-2075.1996.tb00731.x. PMC 451978. PMID 8670865.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (říjen 1997). "Konstrukce a charakterizace knihovny cDNA obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Furukawa T, Yatsuoka T, Youssef EM, Abe T, Yokoyama T, Fukushige S, Soeda E, Hoshi M, Hayashi Y, Sunamura M, Kobari M, Horii A (1999). "Genomická analýza DUSP6, dvojí specificity MAP kinázy fosfatázy, u rakoviny pankreatu". Cytogenetika a genetika buněk. 82 (3–4): 156–9. doi:10.1159/000015091. PMID 9858808. S2CID 46883904.
Stewart AE, Dowd S, Keyse SM, McDonald NQ (únor 1999). "Krystalová struktura katalytické domény MAPK fosfatázy Pyst1 a důsledky pro regulovanou aktivaci". Přírodní strukturní biologie. 6 (2): 174–81. doi:10.1038/5861. PMID 10048930. S2CID 11373236.
Rössig L, Hermann C, Haendeler J, Assmus B, Zeiher AM, Dimmeler S (leden 2002). „Zvýšená regulace hladin mRNA MAP kinázy fosfatázy-3 vyvolaná angiotenzinem II zprostředkovává apoptózu endoteliálních buněk“. Základní výzkum v kardiologii. 97 (1): 1–8. doi:10.1007 / s395-002-8381-2. PMID 11998972. S2CID 27714293.
Furukawa T, Sunamura M, Motoi F, Matsuno S, Horii A (červen 2003). „Potenciální nádorová supresivní cesta zahrnující DUSP6 / MKP-3 u rakoviny pankreatu“. American Journal of Pathology. 162 (6): 1807–15. doi:10.1016 / S0002-9440 (10) 64315-5. PMC 1868131. PMID 12759238.
Kim HS, Song MC, Kwak IH, Park TJ, Lim IK (září 2003). „Konstitutivní indukce p-Erk1 / 2 doprovázená sníženou aktivitou proteinových fosfatáz 1 a 2A a MKP3 v důsledku reaktivních forem kyslíku během buněčné stárnutí“. The Journal of Biological Chemistry. 278 (39): 37497–510. doi:10,1074 / jbc.M211739200. PMID 12840032.
Kim Y, Rice AE, Denu JM (prosinec 2003). "Intramolekulární defosforylace ERK pomocí MKP3". Biochemie. 42 (51): 15197–207. doi:10.1021 / bi035346b. PMID 14690430.
Karlsson M, Mathers J, Dickinson RJ, Mandl M, Keyse SM (říjen 2004). „Jak jaderně-cytoplazmatické vypouštění fosfatázy MKP-3 s dvojí specificitou, tak její schopnost ukotvit MAP kinázu v cytoplazmě jsou zprostředkovány konzervovaným jaderným exportním signálem“. The Journal of Biological Chemistry. 279 (40): 41882–91. doi:10,1074 / jbc.M406720200. PMID 15269220.
Marchetti S, Gimond C, Chambard JC, Touboul T, Roux D, Pouysségur J, Pagès G (leden 2005). „Extracelulární signální regulované kinázy fosforylují mitogenem aktivovanou protein kinázu fosfatázu 3 / DUSP6 na serinech 159 a 197, dvě místa kritická pro jeho proteazomální degradaci“. Molekulární a buněčná biologie. 25 (2): 854–64. doi:10.1128 / MCB.25.2.854-864.2005. PMC 543408. PMID 15632084.
Kamata H, Honda S, Maeda S, Chang L, Hirata H, Karin M (březen 2005). „Reaktivní formy kyslíku podporují smrt indukovanou TNFalfa a trvalou aktivaci JNK inhibicí fosfatáz MAP kinázy“. Buňka. 120 (5): 649–61. doi:10.1016 / j.cell.2004.12.041. PMID 15766528. S2CID 15009756.
Xu S, Furukawa T, Kanai N, Sunamura M, Horii A (2005). "Abrogace DUSP6 hypermethylací u lidské rakoviny pankreatu". Journal of Human Genetics. 50 (4): 159–67. doi:10,1007 / s10038-005-0235-r. PMID 15824892.
Furukawa T, Fujisaki R, Yoshida Y, Kanai N, Sunamura M, Abe T, Takeda K, Matsuno S, Horii A (srpen 2005). „Výrazné cesty progrese zahrnující dysfunkci DUSP6 / MKP-3 u pankreatické intraepiteliální neoplazie a intraduktálních papilárně-mucinózních novotvarů pankreatu“. Moderní patologie. 18 (8): 1034–42. doi:10.1038 / modpathol.3800383. PMID 15832194.

externí odkazy

Přehled všech strukturálních informací dostupných v PDB pro UniProt: Q16828 (Protein s dvojí specificitou fosfatáza 6) na PDBe-KB.

Tento článek o gen na lidský chromozom 12 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000139318 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000019960 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[entrez-5] A ^b „Entrez Gene: DUSP6 dual specificity phosphatase 6“.

[pmid8626780-6] Muda M, Boschert U, Dickinson R, Martinou JC, Martinou I, Camps M, Schlegel W, Arkinstall S (únor 1996). „MKP-3, nová cytosolická protein-tyrosin fosfatáza, která je příkladem nové třídy mitogenem aktivované protein kinázy fosfatázy“. The Journal of Biological Chemistry. 271 (8): 4319–26. doi:10.1074 / jbc.271.8.4319. PMID 8626780.

[pmid9205128-7] Smith A, Price C, Cullen M, Muda M, King A, Ozanne B, Arkinstall S, Ashworth A (červen 1997). "Chromozomální lokalizace tří lidských genů fosfatázy s dvojí specificitou (DUSP4, DUSP6 a DUSP7)". Genomika. 42 (3): 524–7. doi:10.1006 / geno.1997.4756. PMID 9205128.

[8] Saha M, Skopelja S, Martinez E, Alvarez DL, Liponis BS, Romero-Sandoval EA (říjen 2013). „Spinální mitogenem aktivovaná protein kináza fosfatáza-3 (MKP-3) je nezbytná pro normální rozlišení mechanické alodynie u myšího modelu akutní pooperační bolesti“. The Journal of Neuroscience. 33 (43): 17182–7. doi:10.1523 / JNEUROSCI.5605-12.2013. PMC 6618446. PMID 24155322.

[9] Skopelja-Gardner S, Saha M, Alvarado-Vazquez PA, Liponis BS, Martinez E, Romero-Sandoval EA (2017-03-28). „Mitogenem aktivovaná proteinkináza fosfatáza-3 (MKP-3) v chirurgické ráně je nezbytná pro vyřešení pooperační bolesti u myší“. Journal of Pain Research. 10: 763–774. doi:10.2147 / jpr.s129826. PMC 5378457. PMID 28405172.

[pmid9535927-10] Muda M, Theodosiou A, Gillieron C, Smith A, Chabert C, Camps M, Boschert U, Rodrigues N, Davies K, Ashworth A, Arkinstall S (duben 1998). „Mitogenem aktivovaná proteinkináza fosfatáza-3 N-koncová nekatalytická oblast je zodpovědná za těsnou vazbu substrátu a enzymatickou specificitu“. The Journal of Biological Chemistry. 273 (15): 9323–9. doi:10.1074 / jbc.273.15.9323. PMID 9535927.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]