PTPN12 - PTPN12

PTPN12
Dostupné struktury
PDBHledání ortologu: PDBe RCSB
Identifikátory
AliasyPTPN12, PTP-PEST, PTPG1, protein tyrosin fosfatáza, nereceptor typu 12, protein tyrosin fosfatáza nereceptor typu 12
Externí IDOMIM: 600079 MGI: 104673 HomoloGene: 37691 Genové karty: PTPN12
Umístění genu (člověk)
Chromozom 7 (lidský)
Chr.Chromozom 7 (lidský)[1]
Chromozom 7 (lidský)
Genomická poloha pro PTPN12
Genomická poloha pro PTPN12
Kapela7q11.23Start77,537,295 bp[1]
Konec77,640,069 bp[1]
Exprese RNA vzor
PBB GE PTPN12 216915 s na fs.png

PBB GE PTPN12 202006 na fs.png
Další údaje o referenčních výrazech
Ortology
DruhČlověkMyš
Entrez

5782

19248

Ensembl

ENSG00000127947

ENSMUSG00000028771

UniProt

Q05209

P35831

RefSeq (mRNA)

NM_001131008
NM_001131009
NM_002835

NM_011203
NM_001356590
NM_001356591
NM_001356592

RefSeq (protein)

NP_001124480
NP_001124481
NP_002826

NP_035333
NP_001343519
NP_001343520
NP_001343521

Místo (UCSC)Chr 7: 77,54 - 77,64 MbChr 5: 20,99 - 21,06 Mb
PubMed Vyhledávání[3][4]
Wikidata
Zobrazit / upravit člověkaZobrazit / upravit myš

Tyrosin-protein fosfatáza nereceptor typu 12 je enzym že u lidí je kódován PTPN12 gen.[5][6]

Protein kódovaný tímto genem je členem rodiny protein tyrosin fosfatázy (PTP). Je známo, že PTP jsou signální molekuly, které regulují různé buněčné procesy včetně buněčného růstu, diferenciace, mitotického cyklu a onkogenní transformace. Tento PTP obsahuje C-koncový PEST motiv, který slouží jako interakční doména protein-protein a může souviset s intracelulárním poločasem proteinu. Bylo zjištěno, že tento PTP váže a defosforyluje produkt onkogenu c-ABL, a tak může hrát roli v onkogenezi. Ukázalo se, že tento PTP interaguje s různými fosforyláty a molekulami cytoskeletu a buněčné adheze, jako jsou p130 (Cas), CAKbeta / PTK2B, PSTPIP1 a paxillin, což naznačuje jeho regulační role při kontrole buněčného tvaru a mobility.[6]

Interakce

Bylo prokázáno, že PTPN12 komunikovat s BCAR1,[7][8][9][10] Grb2,[11] PSTPIP1,[12] TGFB1I1,[13] Paxillin[14][15][16] a SHC1.[17][18]

Reference

  1. ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000127947 - Ensembl, Květen 2017
  2. ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000028771 - Ensembl, Květen 2017
  3. ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  4. ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  5. ^ Takekawa M, Itoh F, Hinoda Y, Adachi M, Ariyama T, Inazawa J, Imai K, Yachi A (březen 1994). „Chromozomální lokalizace genu proteinu tyrosin fosfatázy G1 a charakterizace aberantních transkriptů v lidských buňkách rakoviny tlustého střeva“. FEBS Lett. 339 (3): 222–8. doi:10.1016/0014-5793(94)80420-6. PMID  7509295. S2CID  4885570.
  6. ^ A b „Entrez Gene: PTPN12 protein tyrosin fosfatáza, nereceptor typu 12“.
  7. ^ Lin, Yi; Ceacareanu Alice Corina; Hassid Aviv (srpen 2003). „Inhibice oxidu dusnatého vyvolaná motilitou buněk hladkého svalstva aorty: role PTP-PEST a adaptorových proteinů p130cas a Crk“. Dopoledne. J. Physiol. Heart Circ. Physiol. 285 (2): H710–21. doi:10.1152 / ajpheart.01127.2002. ISSN  0363-6135. PMID  12714323.
  8. ^ Garton, AJ; Burnham MR; Bouton A H; Tonks N K (srpen 1997). „Sdružení PTP-PEST s doménou SH3 p130cas; nový mechanismus rozpoznávání substrátu protein tyrosin fosfatázy“. Onkogen. 15 (8): 877–85. doi:10.1038 / sj.onc.1201279. ISSN  0950-9232. PMID  9285683.
  9. ^ Côté, J F; Charest A; Wagner J; Tremblay M L (září 1998). "Kombinace genového cílení a zachycování substrátu k identifikaci substrátů proteinových tyrosin fosfatáz s použitím PTP-PEST jako modelu". Biochemie. 37 (38): 13128–37. doi:10.1021 / bi981259l. ISSN  0006-2960. PMID  9748319.
  10. ^ Garton, AJ; Flint A J; Tonks N K (listopad 1996). "Identifikace p130 (cas) jako substrátu pro cytosolický protein tyrosin fosfatáza PTP-PEST". Mol. Buňka. Biol. 16 (11): 6408–18. doi:10.1128 / MCB.16.11.6408. ISSN  0270-7306. PMC  231642. PMID  8887669.
  11. ^ Charest, A; Wagner J; Kwan M; Tremblay M L (duben 1997). „Vazba myšího proteinu tyrosin fosfatázy PEST na receptor epidermálního růstového faktoru (EGF) prostřednictvím asociace zprostředkované doménou Src 3 (SH3) s Grb2“. Onkogen. 14 (14): 1643–51. doi:10.1038 / sj.onc.1201008. ISSN  0950-9232. PMID  9135065.
  12. ^ Dowbenko, D; Spencer S; Quan C; Lasky L A (leden 1998). „Identifikace nového místa pro rozpoznávání polyprolinu v proteinu asociovaném s cytoskeletem, proteinu interagujícím s prolin serin threonin fosfatázou“. J. Biol. Chem. 273 (2): 989–96. doi:10.1074 / jbc.273.2.989. ISSN  0021-9258. PMID  9422760.
  13. ^ Nishiya, N; Iwabuchi Y; Shibanuma M; Côté J F; Tremblay M L; Nos K (duben 1999). „Hic-5, homolog paxilinu, se váže na protein-tyrosin fosfatázu PEST (PTP-PEST) prostřednictvím své domény LIM 3“. J. Biol. Chem. 274 (14): 9847–53. doi:10.1074 / jbc.274.14.9847. ISSN  0021-9258. PMID  10092676.
  14. ^ Shen, Y; Lyons P; Cooley M; Davidson D; Veillette A; Salgia R; Griffin J D; Schaller M D (leden 2000). „Nekatalytická doména protein-tyrosin fosfatázy-PEST se zaměřuje na paxillin pro defosforylaci in vivo“. J. Biol. Chem. 275 (2): 1405–13. doi:10.1074 / jbc.275.2.1405. ISSN  0021-9258. PMID  10625692.
  15. ^ Côté, J F; Turner C E; Tremblay M L (červenec 1999). „Pro asociaci s novou polyprolinovou oblastí (Pro 2) protein-tyrosin fosfatázy-PEST jsou vyžadovány intaktní LIM 3 a LIM 4 domény paxillinu.“. J. Biol. Chem. 274 (29): 20550–60. doi:10.1074 / jbc.274.29.20550. ISSN  0021-9258. PMID  10400685.
  16. ^ Shen, Y; Schneider G; Cloutier J F; Veillette A; Schaller MD (březen 1998). "Přímé spojení protein-tyrosin fosfatázy PTP-PEST s paxillinem". J. Biol. Chem. 273 (11): 6474–81. doi:10.1074 / jbc.273.11.6474. ISSN  0021-9258. PMID  9497381.
  17. ^ Habib, T; Herrera R; Decker S J (říjen 1994). "Aktivátory proteinkinázy C stimulují asociaci Shc a PEST tyrosin fosfatázy". J. Biol. Chem. 269 (41): 25243–6. ISSN  0021-9258. PMID  7929214.
  18. ^ Charest, A; Wagner J; Jacob S; McGlade C J; Tremblay M L (duben 1996). "Vazba SHC nezávislá na fosfotyrosinu k NPLH sekvenci myšího proteinu-tyrosin fosfatázy-PEST. Důkaz prodloužené specificity pro rozpoznávání vazby fosfotyrosinu / fosfotyrosinové domény". J. Biol. Chem. 271 (14): 8424–9. doi:10.1074 / jbc.271.14.8424. ISSN  0021-9258. PMID  8626541.

Další čtení