PTPN2 - PTPN2

PTPN2
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1L8K
Identifikátory
Aliasy	PTPN2, PTN2, PTPT, TC-PTP, TCELLPTP, TCPTP, protein tyrosin fosfatáza, nereceptor typu 2, protein tyrosin fosfatáza nereceptor typu 2
Externí ID	OMIM: 176887 MGI: 97806 HomoloGene: 7497 Genové karty: PTPN2
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 18 (lidský)
Konec	12,929,643 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 18 (myš)
Konec	67,724,595 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba protein kinázy; • aktivita fosfatázy; • integrinová vazba; • aktivita fosfoprotein fosfatázy; • syntaxinová vazba; • aktivita membránového proteinu tyrosin fosfatázy; • vazba na receptorovou tyrosinkinázu; • aktivita hydrolázy; • aktivita protein tyrosin fosfatázy; • Vazba na proteiny rodiny STAT;
Buněčná složka	• cytoplazma; • membrána; • buněčná membrána; • endoplazmatické retikulum; • buněčné jádro; • endoplazmatické retikulum - Golgiho meziprostor; • nukleoplazma; • cytosol;
Biologický proces	• negativní regulace signální dráhy zprostředkované interferonem typu I.; • negativní regulace signální dráhy receptoru epidermálního růstového faktoru; • pozitivní regulace PERK zprostředkované rozvinuté proteinové odpovědi; • defosforylace; • negativní regulace interleukin-4 zprostředkované signální dráhy; • pozitivní regulace endoplazmatického retikula vnitřní apoptotické signální dráhy vyvolané stresem; • negativní regulace interleukin-6 zprostředkované signální dráhy; • negativní regulace buněčné proliferace; • defosforylace bílkovin; • negativní regulace interleukin-2 zprostředkované signální dráhy; • regulace interferonem-gama zprostředkované signální dráhy; • negativní regulace aktivity protein tyrosin kinázy; • regulace signální dráhy receptoru pro růstový faktor hepatocytů; • negativní regulace signální dráhy receptoru beta beta růstového faktoru; • signální dráha inzulínového receptoru; • negativní regulace interferonem-gama zprostředkované signální dráhy; • homeostáza glukózy; • negativní regulace chemotaxe; • negativní regulace signální dráhy zprostředkované faktorem nekrózy nádorů; • negativní regulace diferenciace makrofágů; • negativní regulace signální dráhy receptoru T buněk; • negativní regulace pozitivního výběru thymických T buněk; • negativní regulace signální dráhy inzulínového receptoru; • Diferenciace T buněk; • negativní regulace kaskády ERK1 a ERK2; • diferenciace erytrocytů; • negativní regulace ukládání lipidů; • Diferenciace B buněk; • peptidyl-tyrosin defosforylace; • pozitivní regulace glukoneogeneze; • negativní regulace signální dráhy faktoru stimulujícího kolonie makrofágů; • negativní regulace zánětlivé reakce; • negativní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • negativní regulace fosforylace tyrosinu STAT proteinu; • buněčná odpověď na stimul cytokinů;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	5771
	19255
	ENSG00000175354
	ENSMUSG00000024539
	P17706
	Q06180
	NM_001207013; NM_001308287; NM_002828; NM_080422; NM_080423
	NM_001127177; NM_008977
	NP_001193942; NP_001295216; NP_002819; NP_536347; NP_536348
	NP_001120649; NP_033003
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Tyrosin-protein fosfatáza nereceptor typu 2 je enzym že u lidí je kódován PTPN2 gen.^[5]^[6]

Protein kódovaný tímto genem je členem protein tyrosin fosfatáza (PTP) rodina. Členové rodiny PTP sdílejí vysoce konzervovaný katalytický motiv, který je nezbytný pro katalytickou aktivitu. Je známo, že PTP jsou signální molekuly které regulují různé buněčné procesy včetně buněčného růstu, diferenciace, mitotický cyklus a onkogenní proměna.

Epidermální růstový faktor receptor a adaptorový protein Shc byly údajně substráty tohoto PTP, což naznačuje role v buněčné signalizaci zprostředkované růstovým faktorem. Tři alternativně sestříhané varianty tohoto genu, které kódují izoformy které se liší jejich extrémními C-konci, byly popsány.

Předpokládá se, že různé C-konce určují substrátovou specificitu, stejně jako buněčnou lokalizaci izoforem. Dva vysoce příbuzné, ale výrazně zpracované pseudogeny které lokalizují na odlišné chromozomy byl nahlášen.^[6]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000175354 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000024539 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Brown-Shimer S, Johnson KA, Lawrence JB, Johnson C, Bruskin A, Green NR, Hill DE (srpen 1990). "Molekulární klonování a mapování chromozomů lidského genu kódujícího protein fosfotyrosylfosfatázu 1B". Proc Natl Acad Sci U S A. 87 (13): 5148–52. doi:10.1073 / pnas.87.13.5148. PMC 54279. PMID 2164224.
^ ^A ^b „Entrez Gene: PTPN2 protein tyrosin fosfatáza, nereceptor typu 2“.

Další čtení

Mosinger B, Tillmann U, Westphal H, Tremblay ML (1992). "Klonování a charakterizace myší cDNA kódující cytoplazmatický protein-tyrosin-fosfatáza". Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 89 (2): 499–503. doi:10.1073 / pnas.89.2.499. PMC 48266. PMID 1731319.
Swarup G, Kamatkar S, Radha V, Rema V (1991). "Molekulární klonování a exprese protein-tyrosin fosfatázy vykazující homologii s transkripčními faktory Fos a Jun". FEBS Lett. 280 (1): 65–9. doi:10.1016 / 0014-5793 (91) 80205-H. PMID 1849097. S2CID 10568838.
Cool DE, Tonks NK, Charbonneau H a kol. (1989). "cDNA izolovaná z knihovny lidských T-buněk kóduje člena rodiny protein-tyrosin-fosfatáza". Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 86 (14): 5257–61. doi:10.1073 / pnas.86.14.5257. PMC 297600. PMID 2546150.
Lorenzen JA, Dadabay CY, Fischer EH (1995). „Motivy terminální sekvence COOH cílí na T buněčnou proteinovou tyrosin fosfatázu do ER a jádra“. J. Cell Biol. 131 (3): 631–43. doi:10.1083 / jcb.131.3.631. PMC 2120615. PMID 7593185.
Maruyama K, Sugano S (1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Johnson CV, Cool DE, Glaccum MB a kol. (1993). „Izolace a mapování sekvencí proteinů tyrosin fosfatázy lidských T-buněk: lokalizace genů a pseudogenů rozlišena pomocí fluorescenční hybridizace s genomovými versus cDNA sondami“. Genomika. 16 (3): 619–29. doi:10.1006 / geno.1993.1239. PMID 8325634.
Tiganis T, Flint AJ, Adam SA, Tonks NK (1997). "Sdružení proteinu T-buněk tyrosin fosfatázy s jaderným importním faktorem p97". J. Biol. Chem. 272 (34): 21548–57. doi:10.1074 / jbc.272.34.21548. PMID 9261175.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K a kol. (1997). "Konstrukce a charakterizace knihovny cDNA obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Tiganis T, Bennett AM, Ravichandran KS, Tonks NK (1998). „Receptor epidermálního růstového faktoru a adaptorový protein p52Shc jsou specifické substráty proteinu T-buněk tyrosin fosfatázy“. Mol. Buňka. Biol. 18 (3): 1622–34. doi:10.1128 / MCB.18.3.1622. PMC 108877. PMID 9488479.
Tiganis T, Kemp BE, Tonks NK (1999). „Proteinový tyrosin fosfatáza TCPTP reguluje signalizaci zprostředkovanou receptorem epidermálního růstového faktoru a fosfatidylinositol 3-kinázu“. J. Biol. Chem. 274 (39): 27768–75. doi:10.1074 / jbc.274.39.27768. PMID 10488121.
Aoki N, Matsuda T (2002). „Jaderný protein tyrosin fosfatáza TC-PTP je potenciálním negativním regulátorem signální dráhy zprostředkované PRL: defosforylace a deaktivace signálního měniče a aktivátoru transkripce 5a a 5b TC-PTP v jádře“. Mol. Endokrinol. 16 (1): 58–69. doi:10.1210 / mě.16.1.58. PMID 11773439.
Iversen LF, Moller KB, Pedersen AK a kol. (2002). "Strukturní stanovení T-buněčného proteinu-tyrosin fosfatázy". J. Biol. Chem. 277 (22): 19982–90. doi:10,1074 / jbc.M200567200. PMID 11907034.
Simoncic PD, Lee-Loy A, Barber DL a kol. (2002). „T buněčný protein tyrosin fosfatáza je negativní regulátor kináz 1 a 3 rodiny janus.“ Curr. Biol. 12 (6): 446–53. doi:10.1016 / S0960-9822 (02) 00697-8. PMID 11909529. S2CID 16693906.
ten Hoeve J, de Jesus Ibarra-Sanchez M, Fu Y a kol. (2002). "Identifikace jaderného proteinu Stat1 tyrosin fosfatázy". Mol. Buňka. Biol. 22 (16): 5662–8. doi:10.1128 / MCB.22.16.5662-5668.2002. PMC 133976. PMID 12138178.
Zhu W, Mustelin T, David M (2002). „Argininová methylace STAT1 reguluje jeho defosforylaci pomocí T-buněčného proteinu tyrosin fosfatázy“. J. Biol. Chem. 277 (39): 35787–90. doi:10.1074 / jbc.C200346200. PMID 12171910.
Yamamoto T, Sekine Y, Kashima K a kol. (2002). „Jaderná izoforma protein-tyrosin fosfatázy TC-PTP reguluje signální cestu zprostředkovanou interleukinem 6 prostřednictvím defosforylace STAT3“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 297 (4): 811–7. doi:10.1016 / S0006-291X (02) 02291-X. hdl:2115/28124. PMID 12359225.
Gupta S, Radha V, Sudhakar Ch, Swarup G (2003). „Jaderný protein tyrosin fosfatáza aktivuje p53 a indukuje apoptózu závislou na kaspáze-1“. FEBS Lett. 532 (1–2): 61–6. doi:10.1016 / S0014-5793 (02) 03628-1. PMID 12459463. S2CID 33468275.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Galic S, Klingler-Hoffmann M, Fodero-Tavoletti MT a kol. (2003). "Regulace signalizace inzulínového receptoru proteinem tyrosin fosfatázou TCPTP". Mol. Buňka. Biol. 23 (6): 2096–108. doi:10.1128 / MCB.23.6.2096-2108.2003. PMC 149470. PMID 12612081.

Tento protein související článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000175354 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000024539 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid2164224-5] Brown-Shimer S, Johnson KA, Lawrence JB, Johnson C, Bruskin A, Green NR, Hill DE (srpen 1990). "Molekulární klonování a mapování chromozomů lidského genu kódujícího protein fosfotyrosylfosfatázu 1B". Proc Natl Acad Sci U S A. 87 (13): 5148–52. doi:10.1073 / pnas.87.13.5148. PMC 54279. PMID 2164224.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: PTPN2 protein tyrosin fosfatáza, nereceptor typu 2“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]