PTPRN - PTPRN

PTPRN
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2I1Y, 2QT7, 3N01, 3N4W, 3NG8, 3NP5
Identifikátory
Aliasy	PTPRN, IA-2, IA-2 / PTP, IA2, ICA512, R-PTP-N, protein tyrosin fosfatáza, receptor typu N, protein tyrosin fosfatáza receptor typu N
Externí ID	OMIM: 601773 MGI: 102765 HomoloGene: 48142 Genové karty: PTPRN
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 2 (lidský)
Konec	219,309,648 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 1 (myš)
Konec	75,264,502 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba spektrinu; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita protein tyrosin fosfatázy; • transkripční faktor vazba; • vazba ubikvitinového proteinu na ligázu; • Vazba GTPázy; • aktivita fosfatázy; • aktivita hydrolázy;
Buněčná složka	• axonový konec; • integrální součást membrány; • perikaryon; • endozom; • Golgiho aparát; • buněčná projekce; • membrána; • synaptický váček; • buněčná membrána; • transportní vezikulární membrána; • synapse; • sekreční granule; • axon; • buněčné spojení; • tělo neuronových buněk; • cytoplazmatický váček; • buněčné jádro;
Biologický proces	• luteinizace; • cytokiny zprostředkovanou signální cestu; • reakce na reaktivní formy kyslíku; • sekrece inzulínu; • reakce na glukózu; • reakce na estrogen; • reakce na inzulín; • reakce na cAMP; • zrání zrna hustého jádra; • sekrece inzulínu zapojená do buněčné odpovědi na stimul glukózy; • transkripce, chráněná DNA; • regulace transkripce, DNA-šablony; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • pozitivní regulace proliferace pankreatických buněk typu B.; • peptidyl-tyrosin defosforylace; • defosforylace bílkovin; • defosforylace;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	5798
	19275
	ENSG00000054356
	ENSMUSG00000026204
	Q16849
	Q60673
	NM_001199763; NM_001199764; NM_002846
	NM_008985; NM_001359281
	NP_001186692; NP_001186693; NP_002837
	n / a
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Receptorový typ tyrosin-protein fosfatázy podobný N je enzym že u lidí je kódován PTPRN gen.^[5]^[6]

Funkce

Protein kódovaný tímto genem je členem protein tyrosin fosfatáza (PTP) rodina a PTPRN podčeleď. Je známo, že PTP jsou signální molekuly že regulovat různé buněčné procesy včetně růst buněk, diferenciace, mitotický cyklus, a onkogenní proměna. Tento PTP má extracelulární region, jediný transmembránová oblast a jeden katalytická doména, a tedy představuje a receptor -typ PTP. Bylo zjištěno, že tento PTP je autoantigen který je reaktivní s inzulín-dependentní diabetes mellitus (IDDM) pacient sera, a může tedy být potenciálním cílem autoimunita při diabetes mellitus.^[6]

Interakce

Bylo prokázáno, že PTPRN komunikovat s SPTBN4.^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000054356 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000026204 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Lan MS, Lu J, Goto Y, Notkins AL (srpen 1994). „Molekulární klonování a identifikace proteinového receptoru tyrosin fosfatázy, IA-2, z lidského inzulinomu“. DNA Cell Biol. 13 (5): 505–14. doi:10.1089 / dna.1994.13.505. PMID 8024693.
^ ^A ^b "Entrez Gene: PTPRN protein tyrosin fosfatáza, receptorového typu, N".
^ Berghs S, Aggujaro D, Dirkx R, Maksimova E, Stabach P, Hermel JM, Zhang JP, Philbrick W, Slepnev V, Ort T, Solimena M (listopad 2000). „βiv spektrum, nový spektrum lokalizované v počátečních segmentech Axonu a uzlech Ranvier v centrálním a periferním nervovém systému“. J. Cell Biol. 151 (5): 985–1002. doi:10.1083 / jcb.151.5.985. PMC 2174349. PMID 11086001.

Další čtení

Rabin DU, Pleasic SM, Shapiro JA, Yoo-Warren H, Oles J, Hicks JM, Goldstein DE, Rae PM (1994). „Antigen ostrůvkových buněk 512 je diabetický specifický ostrůvkový autoantigen příbuzný proteinovým tyrosin fosfatázám.“ J. Immunol. 152 (6): 3183–8. PMID 8144912.
Solimena M, Dirkx R, Hermel JM, Pleasic-Williams S, Shapiro JA, Caron L, Rabin DU (1996). „ICA 512, autoantigen diabetu typu I, je vnitřní membránový protein neurosekrečních granulí“. EMBO J.. 15 (9): 2102–14. doi:10.1002 / j.1460-2075.1996.tb00564.x. PMC 450132. PMID 8641276.
van den Maagdenberg AM, Olde Weghuis D, Rijss J, van de Wetering RA, Wieringa B, Geurts van Kessel A, Hendriks WJ (1996). „Přiřazení lidského genu pro proteinový receptor tyrosin fosfatázy IA-2 (PTPRN) receptorového typu do oblasti chromozomu 2q35 -> q36.1 a identifikace intragenního genetického markeru“. Cytogenet. Cell Genet. 73 (1–2): 145–8. doi:10.1159/000134327. PMID 8646884.
Cui L, Yu WP, DeAizpurua HJ, Schmidli RS, Pallen CJ (1996). „Klonování a charakterizace proteinu tyrosin fosfatázy (PTP) souvisejícího s antigeny ostrůvkových buněk, nového receptoru podobného PTP a autoantigenu u inzulín-dependentního diabetu“. J. Biol. Chem. 271 (40): 24817–23. doi:10.1074 / jbc.271.40.24817. PMID 8798755.
Xie J, Zhang B, Lan MS, Notkins AL (1999). "Genomová struktura a sekvence promotoru autoantigenu diabetes mellitus závislého na inzulínu, IA-2 (PTPRN)". Genomika. 54 (2): 338–43. doi:10.1006 / geno.1998.5583. PMID 9828138.
Ort T, Maksimova E, Dirkx R, Kachinsky AM, Berghs S, Froehner SC, Solimena M (2001). „Receptorový protein podobný tyrosin fosfatáze ICA512 váže PDZ domény beta2-syntropinu a nNOS v beta buňkách pankreatu“. Eur. J. Cell Biol. 79 (9): 621–30. doi:10.1078/0171-9335-00095. PMID 11043403.
Park YS, Kawasaki E, Kelemen K, Yu L, Schiller MR, Rewers M, Mizuta M, Eisenbarth GS, Hutton JC (2001). „Humorální autoreaktivita k alternativně sestříhané variantě ICA512 / IA-2 u diabetu typu I“. Diabetologie. 43 (10): 1293–301. doi:10,1007 / s001250051525. PMID 11079748.
Berghs S, Aggujaro D, Dirkx R, Maksimova E, Stabach P, Hermel JM, Zhang JP, Philbrick W, Slepnev V, Ort T, Solimena M (2001). „βiv spektrum, nový spektrum lokalizované v počátečních segmentech Axonu a uzlech Ranvier v centrálním a periferním nervovém systému“. J. Cell Biol. 151 (5): 985–1002. doi:10.1083 / jcb.151.5.985. PMC 2174349. PMID 11086001.
Diez J, Park Y, Zeller M, Brown D, Garza D, Ricordi C, Hutton J, Eisenbarth GS, Pugliese A (2001). „Diferenciální sestřih mRNA IA-2 v pankreatu a lymfoidních orgánech jako permisivní genetický mechanismus pro autoimunitu proti autoantigenu diabetu typu IA-2“. Cukrovka. 50 (4): 895–900. doi:10 2337 / diabetes. 50,4 895. PMID 11289059.
Ort T, Voronov S, Guo J, Zawalich K, Froehner SC, Zawalich W, Solimena M (2001). „Defosforylace β2-syntrofinu a štěpení ICA512 zprostředkované Ca2 + / µ-kalpainem po stimulaci sekrece inzulínu“. EMBO J.. 20 (15): 4013–23. doi:10.1093 / emboj / 20.15.4013. PMC 149140. PMID 11483505.
Mikulecký M, Michalková D (2002). „Sekulární a sezónní cyklování autoprotilátek IA2-ab u slovenských diabetických dětí“. Biomed. Pharmacother. 55 Suppl 1: 106s – 109s. doi:10.1016 / s0753-3322 (01) 90014-9. PMID 11774856.
Miao D, Yu L, Tiberti C, Cuthbertson DD, Rewers M, di Mario U, Eisenbarth GS, Dotta F (2002). „ICA512 (IA-2) epitopové specifické testy odlišují přechodné autoprotilátky spojené s diabetem“. J. Autoimmun. 18 (2): 191–6. doi:10.1006 / jaut.2001.0577. PMID 11908951.
Kawasaki E, Yamaguchi H, Hattori H, Egashira T, Eguchi K (2002). „Autoprotilátky proti IA-2 u diabetu 1. typu: měření pomocí nového enzymového imunosorbentního testu“. Ann. N. Y. Acad. Sci. 958: 241–6. doi:10.1111 / j.1749-6632.2002.tb02978.x. PMID 12021115. S2CID 45659598.
Sanjeevi CB, Das AK, Shtauvere-Brameus A (2002). „BCG vakcinace a GAD65 a IA-2 autoprotilátky proti autoimunitnímu diabetu v jižní Indii“. Ann. N. Y. Acad. Sci. 958: 293–6. doi:10.1111 / j.1749-6632.2002.tb02990.x. PMID 12021127. S2CID 44799912.
Bearzatto M, Lampasona V, Belloni C, Bonifacio E (2004). "Jemné mapování diabetických asociovaných IA-2 specifických autoprotilátek". J. Autoimmun. 21 (4): 377–82. doi:10.1016 / j.jaut.2003.08.002. PMID 14624760.
Trajkovski M, Mziaut H, Altkrüger A, Ouwendijk J, Knoch KP, Müller S, Solimena M (2005). „Jaderná translokace cytosolického fragmentu ICA512 spojuje exocytózu granulí a expresi inzulínu v buňkách {beta}“. J. Cell Biol. 167 (6): 1063–74. doi:10.1083 / jcb.200408172. PMC 2172607. PMID 15596545.
Ota T, Takamura T, Nagai Y, Bando Y, Usuda R (2005). „Význam protilátky IA-2 u japonského diabetu typu 1: její asociace s protilátkou GAD“. Diabetes Res. Clin. Cvič. 67 (1): 63–9. doi:10.1016 / j.diabres.2004.05.004. PMID 15620435.

Tento článek o gen na lidský chromozom 2 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000054356 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000026204 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid8024693-5] Lan MS, Lu J, Goto Y, Notkins AL (srpen 1994). „Molekulární klonování a identifikace proteinového receptoru tyrosin fosfatázy, IA-2, z lidského inzulinomu“. DNA Cell Biol. 13 (5): 505–14. doi:10.1089 / dna.1994.13.505. PMID 8024693.

[entrez-6] A ^b "Entrez Gene: PTPRN protein tyrosin fosfatáza, receptorového typu, N".

[pmid11086001-7] Berghs S, Aggujaro D, Dirkx R, Maksimova E, Stabach P, Hermel JM, Zhang JP, Philbrick W, Slepnev V, Ort T, Solimena M (listopad 2000). „βiv spektrum, nový spektrum lokalizované v počátečních segmentech Axonu a uzlech Ranvier v centrálním a periferním nervovém systému“. J. Cell Biol. 151 (5): 985–1002. doi:10.1083 / jcb.151.5.985. PMC 2174349. PMID 11086001.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]