SSH1 - SSH1

SSH1
Identifikátory
Aliasy	SSH1, SSH1L, proteinová fosfatáza z praku 1
Externí ID	OMIM: 606778 MGI: 2686240 HomoloGene: 41299 Genové karty: SSH1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 12 (lidský)
Konec	108,857,590 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 5 (myš)
Konec	113,993,894 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita fosfoprotein fosfatázy; • aktivita fosfatázy; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita protein tyrosin fosfatázy; • aktinová vazba; • aktivita hydrolázy; • aktivita protein tyrosin / serin / threonin fosfatáza;
Buněčná složka	• cytoplazma; • buněčná projekce; • buněčná membrána; • střední část těla; • dělící rýha; • cytoskelet; • lamellipodium; • cytosol; • růstový kužel; • náběžná hrana buňky; • membrána; • integrální součást membrány;
Biologický proces	• regulace sestavy lamellipodia; • defosforylace bílkovin; • regulace axonogeneze; • regulace polymerace nebo depolymerace aktinu; • buněčná morfogeneze; • regulace buněčného metabolismu bílkovin; • peptidyl-tyrosin defosforylace; • buněčná odpověď na ATP; • organizace aktinového cytoskeletu; • defosforylace; • pozitivní regulace synaptické plasticity; • excitační chemický synaptický přenos; • pozitivní regulace neuronové smrti; • pozitivní regulace shlukování AMPA glutamátových receptorů; • pozitivní regulace vaskulární migrace buněk hladkého svalstva; • pozitivní regulace excitačního postsynaptického potenciálu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	54434
	231637
	ENSG00000084112
	ENSMUSG00000042121
	Q8WYL5
	Q76I79
	NM_001161330; NM_001161331; NM_018984
	NM_198109; NM_001363469
	NP_001154802; NP_001154803; NP_061857
	NP_932777; NP_001350398
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Protokol SSH-1 viz Secure Shell # verze 1.x

Protein fosfatáza Homolog praku 1 je enzym že u lidí je kódován SSH1 gen.^[5]^[6]^[7]

Skupina ADF (aktin-depolymerizační faktor) / cofilin (viz MIM 601442) se skládá z mediátorů reagujících na stimul dynamiky aktinu. ADF / cofilinové proteiny jsou inaktivovány kinázami, jako je kináza LIM domény-1 (LIMK1; MIM 601329). Zdá se, že rodina SSH hraje roli v dynamice aktinů tím, že reaktivuje proteiny ADF / cofilin in vivo (Niwa et al., 2002). [Dodáno společností OMIM]^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000084112 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000042121 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Nagase T, Kikuno R, Ishikawa KI, Hirosawa M, Ohara O (duben 2000). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. XVI. Kompletní sekvence 150 nových cDNA klonů z mozku, které kódují velké proteiny in vitro“. DNA Res. 7 (1): 65–73. doi:10.1093 / dnares / 7.1.65. PMID 10718198.
^ Niwa R, Nagata-Ohashi K, Takeichi M, Mizuno K, Uemura T (únor 2002). "Kontrola reorganizace aktinu pomocí Slingshot, rodiny fosfatáz, které defosforylují ADF / cofilin". Buňka. 108 (2): 233–46. doi:10.1016 / S0092-8674 (01) 00638-9. PMID 11832213. S2CID 5576208.
^ ^A ^b „Entrez Gene: SSH1 prakový homolog 1 (Drosophila)“.

Další čtení

Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002PNAS ... 9916899M. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Endo M, Ohashi K, Sasaki Y a kol. (2003). „Kontrola motility a morfologie růstového kužele pomocí kinázy LIM a Slingshot prostřednictvím fosforylace a defosforylace kofilinu“. J. Neurosci. 23 (7): 2527–37. doi:10.1523 / JNEUROSCI.23-07-02527.2003. PMC 6742113. PMID 12684437.
Kaji N, Ohashi K, Shuin M a kol. (2003). "Změny spojené s buněčným cyklem v aktivitě fosfatázy z praku a role v cytokineze ve zvířecích buňkách". J. Biol. Chem. 278 (35): 33450–5. doi:10,1074 / jbc.M305802200. PMID 12807904.
Ohta Y, Kousaka K, Nagata-Ohashi K a kol. (2004). „Diferenciální aktivity, subcelulární distribuce a vzorce tkáňové exprese tří členů fosfatáz rodiny Slingshot, které defosforylují cofilin“. Geny buňky. 8 (10): 811–24. doi:10.1046 / j.1365-2443.2003.00678.x. PMID 14531860. S2CID 24247372.
Nishita M, Wang Y, Tomizawa C a kol. (2004). „Fosfoinositid 3-kinázou zprostředkovaná aktivace cofilin fosfatázy Slingshot a její role pro inzulínem indukovaný membránový výčnělek“. J. Biol. Chem. 279 (8): 7193–8. doi:10,1074 / jbc.M312591200. PMID 14645219.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Dai S, Sarmiere PD, Wiggan O a kol. (2004). "Efektivní vstup na Salmonella vyžaduje cykly aktivity hostitelského ADF a cofilinu". Buňka. Microbiol. 6 (5): 459–71. doi:10.1111 / j.1462-5822.2004.00375.x. PMID 15056216. S2CID 20238982.
Nagata-Ohashi K, Ohta Y, Goto K a kol. (2004). „Cesta neuregulinem indukované aktivace prakotinu cofilin-fosfatázy a cofilinu v lamellipodii“. J. Cell Biol. 165 (4): 465–71. doi:10.1083 / jcb.200401136. PMC 2172350. PMID 15159416.
Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D a kol. (2004). „Rozsáhlá charakterizace jaderných fosfoproteinů z buněk HeLa“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 101 (33): 12130–5. doi:10.1073 / pnas.0404720101. PMC 514446. PMID 15302935.
Zhang Z, Niu Z, Yuan W a kol. (2005). "Jemné mapování a identifikace kandidátského genu SSH1 v diseminované povrchové aktinické porokeratóze". Hučení. Mutat. 24 (5): 438. doi:10,1002 / humu. 9283. PMID 15459975. S2CID 22946257.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Soosairajah J, Maiti S, Wiggan O a kol. (2005). „Souhra mezi složkami nového komplexu LIM kináza-prak fosfatáza reguluje cofilin“. EMBO J.. 24 (3): 473–86. doi:10.1038 / sj.emboj.7600543. PMC 548651. PMID 15660133.
Wang Y, Shibasaki F, Mizuno K (2005). „Defosforylace kofilinu indukovaná vápníkovým signálem je zprostředkována Slingshotem přes kalcineurin“. J. Biol. Chem. 280 (13): 12683–9. doi:10,1074 / jbc.M411494200. PMID 15671020.
Nishita M, Tomizawa C, Yamamoto M a kol. (2006). „Prostorová a časová regulace aktivity cofilinu pomocí kináz LIM a Slingshot je rozhodující pro směrovou migraci buněk“. J. Cell Biol. 171 (2): 349–59. doi:10.1083 / jcb.200504029. PMC 2171197. PMID 16230460.
Yamamoto M, Nagata-Ohashi K, Ohta Y a kol. (2006). "Identifikace více míst vázajících aktin v cofilin-fosfatáze Slingshot-1L". FEBS Lett. 580 (7): 1789–94. doi:10.1016 / j.febslet.2006.02.034. PMID 16513117. S2CID 27347823.
Cai L, Marshall TW, Uetrecht AC a kol. (2007). „Coronin 1B koordinuje aktivity Arp2 / 3 a aktivity cofilinu na špičce“. Buňka. 128 (5): 915–29. doi:10.1016 / j.cell.2007.01.031. PMC 2630706. PMID 17350576.
Kligys K, Claiborne JN, DeBiase PJ a kol. (2007). „Rodina fosfatáz z praku zprostředkovává regulaci Rac1 fosforylace kofilinu, organizaci lamininu-332 a chování pohyblivosti keratinocytů“. J. Biol. Chem. 282 (44): 32520–8. doi:10,1074 / jbc.M707041200. PMC 2754063. PMID 17848544.

Tento článek o gen na lidský chromozom 12 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000084112 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000042121 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid10718198-5] Nagase T, Kikuno R, Ishikawa KI, Hirosawa M, Ohara O (duben 2000). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. XVI. Kompletní sekvence 150 nových cDNA klonů z mozku, které kódují velké proteiny in vitro“. DNA Res. 7 (1): 65–73. doi:10.1093 / dnares / 7.1.65. PMID 10718198.

[pmid11832213-6] Niwa R, Nagata-Ohashi K, Takeichi M, Mizuno K, Uemura T (únor 2002). "Kontrola reorganizace aktinu pomocí Slingshot, rodiny fosfatáz, které defosforylují ADF / cofilin". Buňka. 108 (2): 233–46. doi:10.1016 / S0092-8674 (01) 00638-9. PMID 11832213. S2CID 5576208.

[entrez-7] A ^b „Entrez Gene: SSH1 prakový homolog 1 (Drosophila)“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]