DUSP5 - DUSP5

DUSP5
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2G6Z
Identifikátory
Aliasy	DUSP5, DUSP, HVH3, fosfatáza s dvojí specificitou 5
Externí ID	OMIM: 603069 MGI: 2685183 HomoloGene: 3256 Genové karty: DUSP5
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 10 (lidský)
Konec	110,511,533 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 19 (myš)
Konec	53,542,431 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita fosfoprotein fosfatázy; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita protein tyrosin fosfatázy; • Aktivita MAP kinázy tyrosin / serin / threonin fosfatáza; • aktivita hydrolázy; • aktivita fosfatázy; • aktivita protein tyrosin / serin / threonin fosfatáza;
Buněčná složka	• nukleoplazma; • buněčné jádro; • cytoplazma;
Biologický proces	• inaktivace aktivity MAPK; • defosforylace bílkovin; • Kaskáda MAPK; • aktivace aktivity MAPK; • tvorba endodermu; • peptidyl-tyrosin defosforylace; • defosforylace; • defosforylace peptidyl-threoninu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	1847
	240672
	ENSG00000138166
	ENSMUSG00000034765
	Q16690
	Q1HL35
	NM_004419
	NM_001085390
	NP_004410
	NP_001078859
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Fosfatáza s dvojí specificitou 5 je enzym že u lidí je kódován DUSP5 gen.^[5]^[6]

Funkce

Protein kódovaný tímto genem je členem podrodiny proteinové fosfatázy s dvojí specificitou. Tyto fosfatázy inaktivují své cílové kinázy defosforylací jak fosfoserinových / threoninových, tak fosfotyrosinových zbytků. Negativně regulují členy mitogenem aktivované proteinové (MAP) kinázové superrodiny (MAPK / ERK, SAPK / JNK, p38), které jsou spojeny s buněčnou proliferací a diferenciací. Různí členové rodiny fosfatáz s duální specificitou vykazují odlišné substrátové specificity pro různé MAP kinázy, odlišnou distribuci tkání a subcelulární lokalizaci a různé způsoby indukovatelnosti jejich exprese extracelulárními stimuly. Tento genový produkt inaktivuje ERK1 / 2, je exprimován v různých tkáních s nejvyššími hladinami v pankreatu a mozku a je lokalizován v jádře.^[6]

Modelové organismy

Modelové organismy byly použity při studiu funkce DUSP5. Podmíněný knockout myš linka volala Dusp5^{tm1a (KOMP) Wtsi} byl vygenerován na Wellcome Trust Sanger Institute.^[7] Samci a samice prošli standardizací fenotypová obrazovka^[8] k určení účinků vypuštění.^[9]^[10]^[11]^[12] Další provedená vyšetření: - Hloubková imunologická fenotypizace^[13]

*Dusp5* knockout myší fenotyp^[8]^[13]
Charakteristický	Fenotyp
Inzulín	Normální
Homozygotní životaschopnost na P14	Normální
Homozygotní plodnost	Normální
Tělesná hmotnost	Normální
Neurologické hodnocení	Normální
Síla úchopu	Normální
Dysmorfologie	Normální
Nepřímá kalorimetrie	Normální
Zkouška tolerance glukózy	Normální
Sluchová odezva mozkového kmene	Normální
DEXA	Normální
Radiografie	Normální
Morfologie očí	Normální
Klinická chemie	Normální
Hematologie 16 týdnů	Normální
Leukocyty v periferní krvi 16 týdnů	Normální
Váha srdce	Normální
Salmonella infekce	Normální
Imunofenotypizace sleziny	Normální
Epidermální imunitní složení	Normální

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000138166 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000034765 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Martell KJ, Kwak S, Hakes DJ, Dixon JE, Trent JM (červenec 1994). "Chromozomální lokalizace čtyř lidských VH1-podobných proteinů-tyrosin fosfatáz". Genomika. 22 (2): 462–4. doi:10.1006 / geno.1994.1411. hdl:2027.42/31442. PMID 7806236.
^ ^A ^b „Entrez Gene: DUSP5 dual specificity phosphatase 5“.
^ Gerdin AK (2010). „Genetický program Sanger Mouse: vysoká propustnost charakterizace knockoutovaných myší“. Acta Ophthalmologica. 88: 925–7. doi:10.1111 / j.1755-3768.2010.4142.x. S2CID 85911512.
^ ^A ^b „Mezinárodní konsorcium pro fenotypizaci myší“.
^ Skarnes WC, Rosen B, West AP, Koutsourakis M, Bushell W, Iyer V, Mujica AO, Thomas M, Harrow J, Cox T, Jackson D, Severin J, Biggs P, Fu J, Nefedov M, de Jong PJ, Stewart AF, Bradley A (červen 2011). „Podmíněný knockoutový zdroj pro celogenomové studium funkce myšího genu“. Příroda. 474 (7351): 337–42. doi:10.1038 / příroda10163. PMC 3572410. PMID 21677750.
^ Dolgin E (červen 2011). „Knihovna myší je vyřazena“. Příroda. 474 (7351): 262–3. doi:10.1038 / 474262a. PMID 21677718.
^ Collins FS, Rossant J, Wurst W (leden 2007). "Myš ze všech důvodů". Buňka. 128 (1): 9–13. doi:10.1016 / j.cell.2006.12.018. PMID 17218247. S2CID 18872015.
^ White JK, Gerdin AK, Karp NA, Ryder E, Buljan M, Bussell JN, Salisbury J, Clare S, Ingham NJ, Podrini C, Houghton R, Estabel J, Bottomley JR, Melvin DG, Sunter D, Adams NC, Tannahill D , Logan DW, Macarthur DG, Flint J, Mahajan VB, Tsang SH, Smyth I, Watt FM, Skarnes WC, Dougan G, Adams DJ, Ramirez-Solis R, Bradley A, Steel KP (červenec 2013). „Generace v celém genomu a systematické fenotypování knockoutovaných myší odhaluje nové role mnoha genů“. Buňka. 154 (2): 452–64. doi:10.1016 / j.cell.2013.06.022. PMC 3717207. PMID 23870131.
^ ^A ^b „Konsorcium pro infekci a imunitu Imunofenotypizace (3i)“.

Další čtení

Robertson NG, Khetarpal U, Gutiérrez-Espeleta GA, Bieber FR, Morton CC (září 1994). „Izolace nových a známých genů z knihovny lidského kochleárního cDNA pomocí subtraktivní hybridizace a diferenciálního screeningu“. Genomika. 23 (1): 42–50. doi:10.1006 / geno.1994.1457. PMID 7829101.
Kwak SP, Dixon JE (leden 1995). „Mnohočetné proteinové tyrosin fosfatázy s dvojí specificitou jsou exprimovány a regulovány odlišně v jaterních buněčných liniích“. The Journal of Biological Chemistry. 270 (3): 1156–60. doi:10.1074 / jbc.270.3.1156. PMID 7836374.
Ishibashi T, Bottaro DP, Michieli P, Kelley CA, Aaronson SA (listopad 1994). „Nová fosfatáza s dvojí specificitou indukovaná stimulací séra a tepelným šokem“. The Journal of Biological Chemistry. 269 (47): 29897–902. PMID 7961985.
Ueda K, Arakawa H, Nakamura Y (srpen 2003). „Fosfatáza 5 s dvojitou specificitou (DUSP5) jako přímý transkripční cíl tumor supresoru p53“. Onkogen. 22 (36): 5586–91. doi:10.1038 / sj.onc.1206845. PMID 12944906.
Mandl M, Slack DN, Keyse SM (březen 2005). „Specifická inaktivace a nukleární ukotvení extracelulární signálně regulované kinázy 2 pomocí indukovatelné proteinové fosfatázy DUSP5 s dvojí specificitou“. Molekulární a buněčná biologie. 25 (5): 1830–45. doi:10.1128 / MCB.25.5.1830-1845.2005. PMC 549372. PMID 15713638.
Jeong DG, Cho YH, Yoon TS, Kim JH, Ryu SE, Kim SJ (leden 2007). "Krystalová struktura katalytické domény lidského DUSP5, duální specificita MAP kinázového proteinu fosfatázy". Proteiny. 66 (1): 253–8. doi:10,1002 / prot. 21224. PMID 17078075. S2CID 30285092.
Sarközi R, Miller B, Pollack V, Feifel E, Mayer G, Sorokin A, Schramek H (duben 2007). „ERK1 / 2 řízená a MKP zprostředkovaná inhibice EGF-indukované ERK5 signalizace v lidských proximálních tubulárních buňkách“. Journal of Cellular Physiology. 211 (1): 88–100. doi:10.1002 / jcp.20909. PMID 17131384. S2CID 39397816.

externí odkazy

Přehled všech strukturálních informací dostupných v PDB pro UniProt: Q16690 (Protein s dvojí specificitou fosfatáza 5) na PDBe-KB.

Tento článek o gen na lidský chromozom 10 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000138166 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000034765 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid7806236-5] Martell KJ, Kwak S, Hakes DJ, Dixon JE, Trent JM (červenec 1994). "Chromozomální lokalizace čtyř lidských VH1-podobných proteinů-tyrosin fosfatáz". Genomika. 22 (2): 462–4. doi:10.1006 / geno.1994.1411. hdl:2027.42/31442. PMID 7806236.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: DUSP5 dual specificity phosphatase 5“.

[mgp_reference-7] Gerdin AK (2010). „Genetický program Sanger Mouse: vysoká propustnost charakterizace knockoutovaných myší“. Acta Ophthalmologica. 88: 925–7. doi:10.1111 / j.1755-3768.2010.4142.x. S2CID 85911512.

[IMPCsearch_ref-8] A ^b „Mezinárodní konsorcium pro fenotypizaci myší“.

[pmid21677750-9] Skarnes WC, Rosen B, West AP, Koutsourakis M, Bushell W, Iyer V, Mujica AO, Thomas M, Harrow J, Cox T, Jackson D, Severin J, Biggs P, Fu J, Nefedov M, de Jong PJ, Stewart AF, Bradley A (červen 2011). „Podmíněný knockoutový zdroj pro celogenomové studium funkce myšího genu“. Příroda. 474 (7351): 337–42. doi:10.1038 / příroda10163. PMC 3572410. PMID 21677750.

[mouse_library-10] Dolgin E (červen 2011). „Knihovna myší je vyřazena“. Příroda. 474 (7351): 262–3. doi:10.1038 / 474262a. PMID 21677718.

[mouse_for_all_reasons-11] Collins FS, Rossant J, Wurst W (leden 2007). "Myš ze všech důvodů". Buňka. 128 (1): 9–13. doi:10.1016 / j.cell.2006.12.018. PMID 17218247. S2CID 18872015.

[pmid23870131-12] White JK, Gerdin AK, Karp NA, Ryder E, Buljan M, Bussell JN, Salisbury J, Clare S, Ingham NJ, Podrini C, Houghton R, Estabel J, Bottomley JR, Melvin DG, Sunter D, Adams NC, Tannahill D , Logan DW, Macarthur DG, Flint J, Mahajan VB, Tsang SH, Smyth I, Watt FM, Skarnes WC, Dougan G, Adams DJ, Ramirez-Solis R, Bradley A, Steel KP (červenec 2013). „Generace v celém genomu a systematické fenotypování knockoutovaných myší odhaluje nové role mnoha genů“. Buňka. 154 (2): 452–64. doi:10.1016 / j.cell.2013.06.022. PMC 3717207. PMID 23870131.

[iii_ref-13] A ^b „Konsorcium pro infekci a imunitu Imunofenotypizace (3i)“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]