PTPRG - PTPRG - Wikipedia

PTPRG
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2H4V, 2HY3, 2NLK, 2PBN, 3JXH, 3QCB, 3QCC, 3QCD, 3QCE, 3QCF, 3QCG, 3QCH, 3QCI, 3QCJ, 3QCK, 3QCL, 3QCM, 3QCN
Identifikátory
Aliasy	PTPRG, HPTPG, PTPG, R-PTP-GAMMA, RPTPG, protein tyrosin fosfatáza, receptor typu G, protein tyrosin fosfatáza receptor typu G
Externí ID	OMIM: 176886 MGI: 97814 HomoloGene: 2129 Genové karty: PTPRG
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 3 (lidský)
Konec	62,297,609 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 14 (myš)
Konec	12,242,041 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita protein tyrosin fosfatázy; • aktivita fosfatázy; • aktivita proteinu transmembránového receptoru tyrosin fosfatázy; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita fosfoprotein fosfatázy; • aktivita hydrolázy; • identická vazba na protein;
Buněčná složka	• integrální součást membrány; • integrální součást plazmatické membrány; • extracelulární exosom; • membrána; • extracelulární;
Biologický proces	• regulace adheze homofilních buněk; • defosforylace bílkovin; • negativní regulace migrace epiteliálních buněk; • transmembránový receptorový protein tyrosinkinázová signální dráha; • defosforylace; • vývoj mozku; • negativní regulace vývoje projekce neuronů; • peptidyl-tyrosin defosforylace;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	5793
	19270
	ENSG00000144724
	ENSMUSG00000021745
	P23470
	Q05909
	NM_002841; NM_001375471
	NM_008981; NM_001347593
	NP_002832; NP_001362400
	NP_001334522; NP_033007
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Receptorový typ tyrosin-protein fosfatázy gama je enzym že u lidí je kódován PTPRG gen.^[5]^[6]

Protein kódovaný tímto genem je členem protein tyrosin fosfatáza (PTP) rodina. Je známo, že PTP jsou signální molekuly které regulují různé buněčné procesy včetně buněčného růstu, diferenciace, mitotický cyklus a onkogenní transformace.

Tento PTP má extracelulární oblast, jedinou transmembránový oblast a dvě tandemové intracytoplazmatické katalytické domény, a tak představuje PTP receptorového typu. Extracelulární oblast tohoto PTP obsahuje a uhličitá anhydráza doména typu CAH, která se také nachází v extracelulární oblasti PTPRBETA / ZETA. Tento gen je umístěn v chromozomální oblasti, která je často deletována karcinom ledvin a karcinom plic, je tedy považován za kandidátský tumor supresorový gen.^[6]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000144724 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000021745 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ LaForgia S, Morse B, Levy J, Barnea G, Cannizzaro LA, Li F, Nowell PC, Boghosian-Sell L, Glick J, Weston A a kol. (Červenec 1991). „Receptorový protein-tyrosin-fosfatáza gama je kandidátským genem potlačujícím nádor v oblasti lidského chromozomu 3p21“. Proc Natl Acad Sci U S A. 88 (11): 5036–40. doi:10.1073 / pnas.88.11.5036. PMC 51802. PMID 1711217.
^ ^A ^b "Entrez Gene: PTPRG protein tyrosin fosfatáza, receptorového typu, G".

Další čtení

Kaplan R, Morse B, Huebner K a kol. (1990). „Klonování tří lidských tyrosin fosfatáz odhaluje multigenní rodinu receptorově vázaných protein-tyrosin-fosfatáz exprimovaných v mozku“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 87 (18): 7000–4. doi:10.1073 / pnas.87.18.7000. PMC 54670. PMID 2169617.
Krueger NX, Streuli M, Saito H (1990). „Strukturální diverzita a vývoj lidských tyrosin fosfatáz podobných proteinovým receptorům“. EMBO J.. 9 (10): 3241–52. doi:10.1002 / j.1460-2075.1990.tb07523.x. PMC 552056. PMID 2170109.
Latif F, Tory K, Modi W a kol. (1993). „MspI polymorfismus a mapování vazeb genu lidského proteinu-tyrosin fosfatázy G (PTPRG)“. Hučení. Mol. Genet. 2 (1): 91. doi:10,1093 / hmg / 2,1,91. PMID 7683956.
Barnea G, Silvennoinen O, Shaanan B a kol. (1993). „Identifikace domény podobné karboanhydrázě v extracelulární oblasti RPTP gama definuje novou podrodinu receptorových tyrosin fosfatáz“. Mol. Buňka. Biol. 13 (3): 1497–506. doi:10.1128 / mcb.13.3.1497. PMC 359461. PMID 8382771.
Kastury K, Ohta M, Lasota J a kol. (1997). „Struktura genu genu pro lidský receptor tyrosin fosfatázy gama (PTPRG) a vztah k familiární translokaci chromozomů RCC t (3; 8)“. Genomika. 32 (2): 225–35. doi:10.1006 / geno.1996.0109. PMID 8833149.
van Niekerk CC, Poels LG (1999). "Snížená exprese proteinové tyrosin fosfatázy gama v nádorech plic a vaječníků". Cancer Lett. 137 (1): 61–73. doi:10.1016 / S0304-3835 (98) 00344-9. PMID 10376795.
Kawachi H, Tamura H, Watakabe I a kol. (1999). "Protein tyrosin fosfatáza zeta / RPTPbeta interaguje s rodinou PSD-95 / SAP90". Brain Res. Mol. Brain Res. 72 (1): 47–54. doi:10.1016 / S0169-328X (99) 00204-1. PMID 10521598.
Liu S, Kulp SK, Sugimoto Y a kol. (2002). „Zapojení epiteliálně-stromálních interakcí prsu do regulace exprese mRNA protein tyrosin fosfatáza-gama (PTPgamma) estrogenně aktivními látkami“. Breast Cancer Res. Zacházet. 71 (1): 21–35. doi:10.1023 / A: 1013343718942. PMID 11859871. S2CID 6175175.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Liu S, Sugimoto Y, Kulp SK a kol. (2003). „Estrogenní down-regulace proteinové tyrosin fosfatázy gama (PTP gama) v lidském prsu je spojena s estrogenovým receptorem alfa“. Anticancer Res. 22 (6C): 3917–23. PMID 12553013.
Liu S, Sugimoto Y, Sorio C a kol. (2004). „Funkční analýza estrogenně regulované proteinové tyrosin fosfatázy gama (PTPgamma) v buněčné linii lidské rakoviny prsu MCF-7“. Onkogen. 23 (6): 1256–62. doi:10.1038 / sj.onc.1207235. PMID 14676845.
van Doorn R, Zoutman WH, Dijkman R a kol. (2005). „Epigenetické profilování kožního T-buněčného lymfomu: promotorová hypermethylace více tumor supresorových genů včetně BCL7a, PTPRG a p73“. J. Clin. Oncol. 23 (17): 3886–96. doi:10.1200 / JCO.2005.11.353. PMID 15897551.
Liu T, Qian WJ, Gritsenko MA a kol. (2006). „Analýza N-glykoproteomu lidské plazmy odečtením imunoafinity, chemií hydrazidů a hmotnostní spektrometrií“. J. Proteome Res. 4 (6): 2070–80. doi:10.1021 / pr0502065. PMC 1850943. PMID 16335952.

Tento článek o gen na lidský chromozom 3 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000144724 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000021745 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid1711217-5] LaForgia S, Morse B, Levy J, Barnea G, Cannizzaro LA, Li F, Nowell PC, Boghosian-Sell L, Glick J, Weston A a kol. (Červenec 1991). „Receptorový protein-tyrosin-fosfatáza gama je kandidátským genem potlačujícím nádor v oblasti lidského chromozomu 3p21“. Proc Natl Acad Sci U S A. 88 (11): 5036–40. doi:10.1073 / pnas.88.11.5036. PMC 51802. PMID 1711217.

[entrez-6] A ^b "Entrez Gene: PTPRG protein tyrosin fosfatáza, receptorového typu, G".

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]