PTPRR - PTPRR

PTPRR
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2A8B
Identifikátory
Aliasy	PTPRR, EC-PTP, PCPTP1, PTP-SL, PTPBR7, PTPRQ, protein tyrosin fosfatáza, receptor typu R, protein tyrosin fosfatáza receptor typu R
Externí ID	OMIM: 602853 MGI: 109559 HomoloGene: 2135 Genové karty: PTPRR
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 12 (lidský)
Konec	70,920,738 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 10 (myš)
Konec	116,274,932 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita fosfoprotein fosfatázy; • aktivita fosfatázy; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita protein tyrosin fosfatázy; • aktivita proteinu transmembránového receptoru tyrosin fosfatázy; • vazba protein kinázy; • aktivita hydrolázy;
Buněčná složka	• integrální součást membrány; • membrána; • buněčná membrána; • buněčné spojení; • perinukleární oblast cytoplazmy; • extracelulární; • cytoplazma; • cytosol;
Biologický proces	• defosforylace bílkovin; • v embryonálním vývoji dělohy; • Signální dráha ERBB2; • regulace adheze homofilních buněk; • negativní regulace kaskády ERK1 a ERK2; • peptidyl-tyrosin defosforylace; • negativní regulace migrace epiteliálních buněk; • defosforylace;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	5801
	19279
	ENSG00000153233
	ENSMUSG00000020151
	Q15256
	Q62132
	NM_001207015; NM_001207016; NM_002849; NM_130846
NM_001161837; NM_001161838; NM_001161839; NM_001161840; NM_011217;
	NM_001358484
	NP_001193944; NP_001193945; NP_002840; NP_570897
NP_001155309; NP_001155310; NP_001155311; NP_001155312; NP_035347;
	NP_001345413
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Proteinový tyrosin fosfatázový receptor typu R je enzym že u lidí je kódován PTPRR gen.^[5]^[6]^[7]

Funkce

Protein kódovaný tímto genem je členem rodiny protein tyrosin fosfatázy (PTP). Je známo, že PTP jsou signální molekuly, které regulují různé buněčné procesy včetně buněčného růstu, diferenciace, mitotického cyklu a onkogenní transformace. Tento PTP má extracelulární oblast, jednu transmembránovou oblast a jednu intracelulární katalytickou doménu, a tak představuje PTP receptorového typu. Podobný gen převážně exprimován v myší mozek Bylo zjištěno, že se asociuje s, a tak reguluje aktivitu a buněčnou lokalizaci MAP kináz. Bylo popsáno, že krysí protějšek tohoto genu je regulován nervovým růstovým faktorem, což naznačuje funkci tohoto genu při růstu a diferenciaci neuronů.^[7]

Interakce

PTPRR bylo prokázáno komunikovat s MAPK7.^[8]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000153233 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000020151 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Shiozuka K, Watanabe Y, Ikeda T, Hashimoto S, Kawashima H (listopad 1995). "Klonování a exprese PCPTP1 kódující protein tyrosin fosfatázu". Gen. 162 (2): 279–84. doi:10.1016 / 0378-1119 (95) 00306-Q. PMID 7557444.
^ van den Maagdenberg AM, Schepens JT, Schepens MT, Merkx GF, Darroudi F, Wieringa B, Geurts van Kessel A, Hendriks WJ (červenec 1999). "Přiřazení1 genu PTP-SL / PTPBR7 (Ptprr / PTPRR) do myší chromozomové oblasti 8A2 hybridizací in situ". Cytogenet Cell Genet. 84 (3–4): 243–4. doi:10.1159/000015268. PMID 10393441. S2CID 35964382.
^ ^A ^b "Entrez Gene: PTPRR protein tyrosin fosfatáza, receptorového typu, R".
^ Buschbeck M, Eickhoff J, Sommer MN, Ullrich A (srpen 2002). „Fosfatáza specifická pro fosfatázu PTP-SL reguluje signální dráhu ERK5“. J. Biol. Chem. 277 (33): 29503–9. doi:10,1074 / jbc.M202149200. PMID 12042304.

Další čtení

Sharma E, Lombroso PJ (1995). „Neuronový protein tyrosin fosfatáza indukovaný nervovým růstovým faktorem“. J. Biol. Chem. 270 (1): 49–53. doi:10.1074 / jbc.270.1.49. PMID 7814416.
Ogata M, Sawada M, Fujino Y, Hamaoka T (1995). „cDNA klonování a charakterizace nové proteinové tyrosin fosfatázy receptorového typu exprimované převážně v mozku“. J. Biol. Chem. 270 (5): 2337–43. doi:10.1074 / jbc.270.5.2337. PMID 7836467.
Pulido R, Zúñiga A, Ullrich A (1999). „PTP-SL a STEP proteinové tyrosin fosfatázy regulují aktivaci extracelulárních signálem regulovaných kináz ERK1 a ERK2 asociací prostřednictvím motivu kinázové interakce“. EMBO J.. 17 (24): 7337–50. doi:10.1093 / emboj / 17.24.7337. PMC 1171079. PMID 9857190.
Ogata M, Oh-hora M, Kosugi A, Hamaoka T (1999). „Inaktivace mitogenem aktivovaných proteinových kináz savčí tyrosin-specifickou fosfatázou, PTPBR7“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 256 (1): 52–6. doi:10.1006 / bbrc.1999.0278. PMID 10066421.
Zúñiga A, Torres J, Ubeda J, Pulido R (1999). "Interakce mitogenem aktivovaných proteinových kináz s motivem kinázové interakce tyrosin fosfatázy PTP-SL poskytuje substrátovou specificitu a zachovává ERK2 v cytoplazmě". J. Biol. Chem. 274 (31): 21900–7. doi:10.1074 / jbc.274.31.21900. PMID 10419510.
Blanco-Aparicio C, Torres J, Pulido R (2000). „Nový regulační mechanismus aktivace MAP kináz a nukleární translokace zprostředkovaný PKA a PTP-SL tyrosin fosfatázou“. J. Cell Biol. 147 (6): 1129–36. doi:10.1083 / jcb.147.6.1129. PMC 2168101. PMID 10601328.
Augustine KA, Silbiger SM, Bucay N, Ulias L, Boynton A, Trebasky LD, Medlock ES (2000). "Rodina proteinových tyrosin fosfatáz (PC12, Br7, S1): charakterizace exprese u dospělých lidí a myší". Anat. Rec. 258 (3): 221–34. doi:10.1002 / (SICI) 1097-0185 (20000301) 258: 3 <221 :: AID-AR1> 3.0.CO; 2-W. PMID 10705342.
Bektas A, Hughes JN, Warram JH, Krolewski AS, Doria A (2001). "Lokus diabetu 2. typu na 12q15. Další mapování a screening mutací dvou kandidátských genů". Cukrovka. 50 (1): 204–8. doi:10.2337 / diabetes.50.1.204. PMID 11147789.
Szedlacsek SE, Aricescu AR, Fulga TA, Renault L, Scheidig AJ (2001). „Krystalová struktura katalytické domény PTP-SL / PTPBR7: důsledky pro regulaci MAP kinázy“. J. Mol. Biol. 311 (3): 557–68. doi:10.1006 / jmbi.2001.4890. PMID 11493009.
Buschbeck M, Eickhoff J, Sommer MN, Ullrich A (2002). „Fosfatáza specifická pro fosfatázu PTP-SL reguluje signální dráhu ERK5“. J. Biol. Chem. 277 (33): 29503–9. doi:10,1074 / jbc.M202149200. PMID 12042304.
Shin BK, Wang H, Yim AM, Le Naour F, Brichory F, Jang JH, Zhao R, Puravs E, Tra J, Michael CW, Misek DE, Hanash SM (2003). „Globální profilování proteomu buněčného povrchu rakovinných buněk odkrývá nadbytek proteinů s chaperonovou funkcí“. J. Biol. Chem. 278 (9): 7607–16. doi:10,1074 / jbc.M210455200. PMID 12493773.
Tárrega C, Ríos P, Cejudo-Marín R, Blanco-Aparicio C, van den Berk L, Schepens J, Hendriks W, Tabernero L, Pulido R (2006). „ERK2 vykazuje restriktivní a lokálně selektivní mechanismus rozpoznávání jeho inaktivátory tyrosin fosfatázy, které nesdílí jeho aktivátor MEK1“. J. Biol. Chem. 280 (45): 37885–94. doi:10,1074 / jbc.M504366200. PMID 16148006.
Eswaran J, von Kries JP, Marsden B, Longman E, Debreczeni JE, Ugochukwu E, Turnbull A, Lee WH, Knapp S, Barr AJ (2006). "Krystalová struktura a identifikace inhibitoru pro PTPN5, PTPRR a PTPN7: rodina lidských MAPK-specifických proteinových tyrosin fosfatáz". Biochem. J. 395 (3): 483–91. doi:10.1042 / BJ20051931. PMC 1462698. PMID 16441242.

Tento článek o gen na lidský chromozom 12 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000153233 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000020151 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid7557444-5] Shiozuka K, Watanabe Y, Ikeda T, Hashimoto S, Kawashima H (listopad 1995). "Klonování a exprese PCPTP1 kódující protein tyrosin fosfatázu". Gen. 162 (2): 279–84. doi:10.1016 / 0378-1119 (95) 00306-Q. PMID 7557444.

[pmid10393441-6] van den Maagdenberg AM, Schepens JT, Schepens MT, Merkx GF, Darroudi F, Wieringa B, Geurts van Kessel A, Hendriks WJ (červenec 1999). "Přiřazení1 genu PTP-SL / PTPBR7 (Ptprr / PTPRR) do myší chromozomové oblasti 8A2 hybridizací in situ". Cytogenet Cell Genet. 84 (3–4): 243–4. doi:10.1159/000015268. PMID 10393441. S2CID 35964382.

[entrez-7] A ^b "Entrez Gene: PTPRR protein tyrosin fosfatáza, receptorového typu, R".

[pmid12042304-8] Buschbeck M, Eickhoff J, Sommer MN, Ullrich A (srpen 2002). „Fosfatáza specifická pro fosfatázu PTP-SL reguluje signální dráhu ERK5“. J. Biol. Chem. 277 (33): 29503–9. doi:10,1074 / jbc.M202149200. PMID 12042304.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]