UQCRB - UQCRB

UQCRB
Identifikátory
AliasyUQCRB, MC3DN3, QCR7, QP-C, QPC, UQBC, UQBP, UQCR6, UQPC, protein vázající ubichinol-cytochrom c reduktázu
Externí IDOMIM: 191330 MGI: 1914780 HomoloGene: 38164 Genové karty: UQCRB
Umístění genu (člověk)
Chromozom 8 (lidský)
Chr.Chromozom 8 (lidský)[1]
Chromozom 8 (lidský)
Genomické umístění pro UQCRB
Genomické umístění pro UQCRB
Kapela8q22.1Start96,225,920 bp[1]
Konec96,235,634 bp[1]
Ortology
DruhČlověkMyš
Entrez

7381

67530

Ensembl

ENSG00000156467

ENSMUSG00000021520

UniProt

P14927

Q9D855
Q9CQB4

RefSeq (mRNA)

NM_001199975
NM_001254752
NM_006294

NM_026219

RefSeq (protein)

NP_001186904
NP_001241681
NP_006285

NP_080495

Místo (UCSC)Chr 8: 96,23 - 96,24 MbChr 13: 66,9 - 66,91 Mb
PubMed Vyhledávání[3][4]
Wikidata
Zobrazit / upravit člověkaZobrazit / upravit myš

Ubiquinol-cytochrom c reduktázový vazebný protein, také známý jako UQCRB, Podjednotka komplexu III 7, QP-Cnebo Komplex ubichinol-cytochrom c reduktázy 14 kDa protein je protein který je u lidí kódován UQCRB gen. Tento gen kóduje podjednotku komplex ubichinol-cytochrom c oxidoreduktázy, který se skládá z jednoho mitochondriální -kódované a 10 jaderně kódovaných podjednotek. Mutace v tomto genu jsou spojeny s nedostatkem mitochondriálního komplexu III. Alternativně sestříhané byly nalezeny varianty transkriptu pro tento gen. Příbuzný pseudogeny byly identifikovány dne chromozomy 1, 5 a X.[5]

Struktura

UQCRB se nachází na q rameno z chromozóm 8 v poloze 22,1, má 18 exony a zahrnuje 8 958 párů bází.[5] The UQCRB Gen produkuje 5,9 kDa protein složený z 161 aminokyseliny.[6][7] Genový produkt UQCRB je podjednotkou proteinu dýchacího řetězce Ubichinol cytochrom c reduktáza (UQCR, Komplex III nebo komplex cytochromu bc1; E.C. 1.10.2.2), který se skládá z produktů jednoho mitochondriálně kódovaného genu, MTCYTB (mitochondriální cytochrom b ) a deset jaderných genů: UQCRC1, UQCRC2, Cytochrom C1, UQCRFS1 (Rieskeho protein ), UQCRB, „protein 14 kDa“, UQCRH (Cyt c1 Hinge protein), předvolba proteinu Rieske, „protein asociovaný s cyt. c1“ a „protein asociovaný s Rieske“. Po zpracování byla štěpená vedoucí sekvence železo-sirný protein je zachována jako podjednotka 9, což dává 11 podjednotek z 10 genů.[5]

Funkce

Ubiquinon-binding protein je a jádro -kódovaná součást ubichinol-cytochrom c oxidoreduktáza (Komplex III) v mitochondriální dýchací řetězec a hraje důležitou roli v elektronovém přenosu jako komplex ubichinon a QP-C. Protein kódovaný tímto genem se váže ubichinon a podílí se na přenosu elektronů, když ubichinon vázána.[5] Je to cíl pojmenovaného proteinu přírodní antiangiogenní terpestacin s malou molekulou, což umožňuje roli proteinu vázajícího ubichinon jako buněčných senzorů kyslíku a účastníků angiogeneze. Tento angiogeneze, což je vývoj nových krevních cév, je hypoxie indukována a je usnadněna signalizací zprostředkovanou mitochondriální ROS (reaktivní formy kyslíku). Kromě toho UQCRB udržuje údržbu komplexu III.[8][9][10]

Klinický význam

Mutace v UQCRB může vést k mitochondriálním nedostatkům a souvisejícím poruchám. Je spojován hlavně s nedostatkem komplexu III, nedostatkem komplexu enzymů, který katalyzuje přenos elektronů koenzym Q na cytochrom c v mitochondriální dýchací řetězec. Komplexní nedostatek III může mít za následek vysoce variabilní fenotyp podle toho, které tkáně jsou ovlivněny.[11] Mezi nejčastější klinické projevy patří progresivní nesnášenlivost cvičení a kardiomyopatie. Mohou také nastat občasné multisystémové poruchy doprovázené intolerancí cvičení hluchota, mentální retardace, retinitis pigmentosa, šedý zákal, zpomalení růstu, a epilepsie.[11] Jiné fenotypy zahrnují mitochondriální encefalomyopatie, mitochondriální myopatie, Leber dědičná optická neuropatie, svalová slabost, myoglobinurie, acidóza krve, ledvin tubulopatie, a více.[11][12] Je známo, že nedostatek komplexu III je vzácný mitochondriální nemoci.[12]

Interakce

UQCRB má binární interakce se 3 proteiny, včetně MAGA4, Q1RN33, a 1A1L1. Kromě toho má SDHAF2 69 interakce protein-protein, počítaje v to COX6B1, CYC1, MYO18A, UHRF1, a další.[13]

Reference

  1. ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000156467 - Ensembl, Květen 2017
  2. ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000021520 - Ensembl, Květen 2017
  3. ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  4. ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  5. ^ A b C d „Entrez Gene: UQCRB ubichinol-cytochrom c reduktázový vazebný protein“. Tento článek včlení text z tohoto zdroje, který je v veřejná doména.
  6. ^ Zong NC, Li H, Li H, Lam MP, Jimenez RC, Kim CS a kol. (Říjen 2013). „Integrace biologie a medicíny srdečního proteomu pomocí specializované znalostní databáze“. Výzkum oběhu. 113 (9): 1043–53. doi:10.1161 / CIRCRESAHA.113.301151. PMC  4076475. PMID  23965338.
  7. ^ Yao D. „Znalostní databáze atlasu srdečních organelárních proteinů (COPaKB) - —proteinové informace“. amino.heartproteome.org. Citováno 2018-07-27.
  8. ^ Chang J, Jung HJ, Jeong SH, Kim HK, Han J, Kwon HJ (prosinec 2014). „Mutace v mitochondriálním proteinu UQCRB podporuje angiogenezi generováním mitochondriálních reaktivních forem kyslíku“. Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 455 (3–4): 290–7. doi:10.1016 / j.bbrc.2014.11.005. PMID  25446085.
  9. ^ Jung HJ, Cho M, Kim Y, Han G, Kwon HJ (říjen 2014). „Vývoj nové třídy modulátorů mitochondriálních modulátorů vázajících protein na ubichinol-cytochrom c reduktázový vazebný protein (UQCRB) jako slibných antiangiogenních vodítek“. Journal of Medicinal Chemistry. 57 (19): 7990–8. doi:10.1021 / jm500863j. PMID  25244355.
  10. ^ * Jung HJ, Kim KH, Kim ND, Han G, Kwon HJ (únor 2011). „Identifikace nové malé molekuly zaměřené na UQCRB mitochondriálního komplexu III a jeho antiangiogenní aktivita“. Dopisy o bioorganické a léčivé chemii. 21 (3): 1052–6. doi:10.1016 / j.bmcl.2010.12.002. PMID  21215626.
  11. ^ A b C „UQCRB - ​​cytochrom b-c1 komplexní podjednotka 7“. Konsorcium UniProt.
  12. ^ A b Gil Borlado MC, Moreno Lastres D, Gonzalez Hoyuela M, Moran M, Blazquez A, Pello R a kol. (Září 2010). „Dopad mitochondriálního genetického pozadí na nedostatek komplexu III“. PLOS ONE. 5 (9): e12801. doi:10.1371 / journal.pone.0012801. PMC  2941448. PMID  20862300.
  13. ^ Kerrien S, Alam-Faruque Y, Aranda B, Bancarz I, Bridge A, Derow C a kol. (Leden 2007). „IntAct - zdroj otevřeného zdroje pro data molekulární interakce“. Výzkum nukleových kyselin. 35 (Problém s databází): D561-5. doi:10.1093 / nar / gkl958. PMC  1751531. PMID  17145710.

Další čtení

  • Chang J, Jung HJ, Park HJ, Cho SW, Lee SK, Kwon HJ (září 2015). „Buněčně propustný mitochondriální protein vázající ubichinol-cytochrom c reduktázu indukuje angiogenezi in vitro a in vivo“. Dopisy o rakovině. 366 (1): 52–60. doi:10.1016 / j.canlet.2015.06.013. PMID  26118773.
  • Cho YS, Jung HJ, Seok SH, Payumo AY, Chen JK, Kwon HJ (duben 2013). „Funkční inhibice UQCRB potlačuje angiogenezi u zebrafish“. Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 433 (4): 396–400. doi:10.1016 / j.bbrc.2013.02.082. PMC  3691074. PMID  23454382.
  • Jung HJ, Kwon HJ (květen 2013). "Zkoumání role mitochondriálního UQCRB v angiogenezi s použitím malých molekul". Molekulární biosystémy. 9 (5): 930–9. doi:10,1039 / c3mb25426g. PMID  23475074.
  • Jung HJ, Kim Y, Chang J, Kang SW, Kim JH, Kwon HJ (září 2013). "Mitochondriální UQCRB reguluje signalizaci VEGFR2 v endotelových buňkách". Journal of Molecular Medicine. 91 (9): 1117–28. doi:10.1007 / s00109-013-1049-6. PMID  23708980. S2CID  13973232.
  • Suzuki H, Hosokawa Y, Toda H, Nishikimi M, Ozawa T (květen 1990). "Běžná vazebná místa pro proteiny v 5'-ohraničujících oblastech lidských genů pro cytochrom cl a ubichinon vázající protein". The Journal of Biological Chemistry. 265 (14): 8159–63. PMID  2159470.
  • Hosokawa Y, Suzuki H, Nishikimi M, Matsukage A, Yoshida MC, Ozawa T (1990). „Chromozomální přiřazení genu pro protein vázající ubichinon lidského komplexu lidského mitochondriálního cytochromu bc1“. Biochemistry International. 21 (1): 41–4. PMID  2167087.
  • Suzuki H, Hosokawa Y, Toda H, Nishikimi M, Ozawa T (květen 1989). „Izolace jediného jaderného genu kódujícího lidský protein vázající ubichinon v komplexu III mitochondriálního dýchacího řetězce“. Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 161 (1): 371–8. doi:10.1016 / 0006-291X (89) 91607-0. PMID  2543413.
  • Wakabayashi S, Takao T, Shimonishi Y, Kuramitsu S, Matsubara H, Wang T, Zhang Z, King TE (leden 1985). „Kompletní aminokyselinová sekvence proteinu vázajícího ubichinon (QP-C), což je protein podobný 14 000 daltonové podjednotce kvasinkového komplexu ubichinol-cytochrom c reduktáza“. The Journal of Biological Chemistry. 260 (1): 337–43. PMID  2981208.
  • Suzuki H, Hosokawa Y, Toda H, Nishikimi M, Ozawa T (říjen 1988). „Klonování a sekvenování cDNA pro lidský mitochondriální protein vázající na ubichinon komplexu III“. Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 156 (2): 987–94. doi:10.1016 / S0006-291X (88) 80941-0. PMID  3056408.
  • Malaney S, Heng HH, Tsui LC, Shi XM, Robinson BH (1996). „Lokalizace lidského genu kódujícího podjednotku 13,3 kDa mitochondriálního komplexu III (UQCRB) na 8q22 hybridizací in situ“. Cytogenetika a genetika buněk. 73 (4): 297–9. doi:10.1159/000134360. hdl:10722/42534. PMID  8751380.
  • Haut S, Brivet M, Touati G, Rustin P, Lebon S, Garcia-Cazorla A, Saudubray JM, Boutron A, Legrand A, Slama A (červenec 2003). „Delece v lidském genu QP-C způsobuje komplexní deficit III, který vede k hypoglykémii a laktátové acidóze.“ Genetika člověka. 113 (2): 118–22. doi:10.1007 / s00439-003-0946-0. PMID  12709789. S2CID  24273072.
  • Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N a kol. (Říjen 2005). „Směrem k mapě interakční sítě lidský protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.