UHRF1 - UHRF1

UHRF1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2FAZ, 2L3R, 2LGG, 2 LGK, 2LGL, 2PB7, 3ASK, 3ASL, 3BI7, 3 CLZ, 3DB3, 3DB4, 3DWH, 3FL2, 3SHB, 3SOU, 3SOW, 3SOX, 3T6R, 3ZVY, 3ZVZ, 4GY5, 4QQD, 5C6D, 5IAY
Identifikátory
Aliasy	UHRF1, ICBP90, Np95, RNF106, hNP95, hhuNp95, TDRD22, ubikvitin jako u domén PHD a prstenů 1
Externí ID	OMIM: 607990 MGI: 1338889 HomoloGene: 7866 Genové karty: UHRF1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 19 (lidský)
Konec	4,962,154 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 17 (myš)
Konec	56,323,486 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Vazba DNA; • GO: 1904264, GO: 1904822, GO: 0090622, GO: 0090302 aktivita ubikvitinové proteinové ligázy; • hemi-methylovaná vazba DNA; • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA; • vazba methyl-CpG; • GO: 0001158 jádrový promotor vázání sekvenčně specifické DNA pro sekvenci proximální oblasti; • vazba kovových iontů; • aktivita ubikvitin-protein transferázy; • vazba nukleosomálních histonů; • vazba methylovaného histonu; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • identická vazba na protein; • aktivita transferázy; • vazba iontů zinku; • histonová vazba;
Buněčná složka	• euchromatin; • jaderná matice; • replikační vidlice; • heterochromatin; • nukleární heterochromatin; • nukleární chromatin; • buněčné jádro;
Biologický proces	• histon monoubiquitination; • pozitivní regulace buněčného metabolismu bílkovin; • regulace transkripce, DNA-šablony; • udržování methylace DNA; • pozitivní regulace aktivity DNA topoizomerázy (ATP-hydrolyzující); • negativní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • transkripce, chráněná DNA; • regulace umlčování chromatinu závislého na methylaci; • buněčná odpověď na stimul poškození DNA; • ubikvitinace bílkovin; • buněčný cyklus; • buněčná proliferace; • ubikvitinace histonu; • Oprava DNA; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • autoubiquitination bílkovin; • organizace chromatinu; • ubikvitin-dependentní proteinový katabolický proces; • regulace proliferace epiteliálních buněk;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	29128
	18140
	ENSG00000276043
	ENSMUSG00000001228
	Q96T88
	Q8VDF2
	NM_001048201; NM_001290050; NM_001290051; NM_001290052; NM_013282
	NM_001111078; NM_001111079; NM_001111080; NM_010931
	NP_001041666; NP_001276979; NP_001276980; NP_001276981; NP_037414
	NP_001104548; NP_001104549; NP_001104550; NP_035061
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Ubikvitin podobné, obsahující domény prstů PHD a RING, 1, také známý jako UHRF1, je protein který je u lidí kódován UHRF1 gen.^[5]^[6]

Funkce

Tento gen kóduje člena podčeledi Prsteník typ E3 ubikvitinové ligázy. Protein se váže na hemi-methylovanou DNA během S-fáze a získává hlavní protein DNA methyltransferázy, DNMT1, k regulaci struktury chromatinu a genové exprese. Jeho exprese vrcholí v pozdní fázi G1 a pokračuje během G2 a M fází buněčný cyklus. Hraje hlavní roli v přechodu G1 / S a funguje v p53 -závislý kontrolní bod poškození DNA. Pro tento gen bylo nalezeno několik variant transkriptu kódujících různé izoformy. Původně byl identifikován jako přímý regulátor topoizomerázy 2a, ale toto bylo následně vyvráceno. Uhrf1 byl rozsáhle studován in vivo pomocí zebrafish.

Klinický význam

UHRF1 byl nedávno identifikován jako román onkogen u hepatocelulárního karcinomu, primárního typu rakoviny jater.^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000276043 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000001228 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Entrez Gene: UHRF1 podobný ubikvitinu, obsahující domény prstů PHD a RING, 1“.
^ Hopfner R, Mousli M, Jeltsch JM, Voulgaris A, Lutz Y, Marin C, Bellocq JP, Oudet P, Bronner C (leden 2000). „ICBP90, nový lidský vazebný protein pro CCAAT, zapojený do regulace exprese topoizomerázy IIalfa“. Výzkum rakoviny. 60 (1): 121–8. PMID 10646863.
^ Mudbhary, Raksha; Hoshida, Yujin; Chernyavskaya, Yelena; Jacob, Vinitha; Villanueva, Augusto; Fiel, M. Isabel; Chen, Xintong; Kojima, Kensuke; Thung, Swan; Bronson, Roderick T .; Lachenmayer, Anja; Revill, Kate; Alsinet, Clara; Sachidanandam, Ravi; Desai, Anal; Senbanerjee, Sucharita; Ukomadu, Chinweike; Llovet, Josep M .; Sadler, Kirsten C. (2014). „Nadměrná exprese UHRF1 řídí hypomethylaci DNA a hepatocelulární karcinom“. Rakovinová buňka. 25 (2): 196–209. doi:10.1016 / j.ccr.2014.01.003. PMC 3951208. PMID 24486181.

Další čtení

Ku DH, Chang CD, Koniecki J, Cannizzaro LA, Boghosian-Sell L, Alder H, Baserga R (duben 1991). „Nová růstově regulovaná komplementární DNA se sekvencí domnělého trans-aktivačního faktoru“. Růst a diferenciace buněk. 2 (4): 179–86. PMID 1868030.
Hillier LD, Lennon G, Becker M, Bonaldo MF, Chiapelli B, Chissoe S, Dietrich N, DuBuque T, Favello A, Gish W, Hawkins M, Hultman M, Kucaba T, Lacy M, Le M, Le N, Mardis E Moore B, Morris M, Parsons J, Prange C, Rifkin L, Rohlfing T, Schellenberg K, Bento Soares M, Tan F, Thierry-Meg J, Trevaskis E, Underwood K, Wohldman P, Waterston R, Wilson R, Marra M (září 1996). „Generování a analýza 280 000 lidských sekvenčních značek“. Výzkum genomu. 6 (9): 807–28. doi:10,1101 / gr. 6.807. PMID 8889549. Zkontrolujte hodnoty data v: | rok = / | datum = nesoulad (Pomoc)
Hopfner R, Mousli M, Jeltsch JM, Voulgaris A, Lutz Y, Marin C, Bellocq JP, Oudet P, Bronner C (leden 2000). „ICBP90, nový lidský protein vázající CCAAT, podílející se na regulaci exprese topoizomerázy IIalfa“. Výzkum rakoviny. 60 (1): 121–8. PMID 10646863.
Hopfner R, Mousli M, Garnier JM, Redon R, du Manoir S, Chatton B, Ghyselinck N, Oudet P, Bronner C (březen 2001). „Genomická struktura a chromozomální mapování genu kódujícího ICBP90, protein podílející se na regulaci exprese genu topoizomerázy IIalfa“. Gen. 266 (1–2): 15–23. doi:10.1016 / S0378-1119 (01) 00371-7. PMID 11290415.
Mousli M, Hopfner R, Abbady AQ, Monté D, Jeanblanc M, Oudet P, Louis B, Bronner C (červenec 2003). „ICBP90 patří do nové rodiny proteinů s expresí, která je deregulována v rakovinných buňkách“. British Journal of Cancer. 89 (1): 120–7. doi:10.1038 / sj.bjc.6601068. PMC 2394215. PMID 12838312.
Citterio E, Papait R, Nicassio F, Vecchi M, Gomiero P, Mantovani R, Di Fiore PP, Bonapace IM (březen 2004). „Np95 je protein vázající histon vybavený aktivitou ubikvitin ligázy“. Molekulární a buněčná biologie. 24 (6): 2526–35. doi:10.1128 / MCB.24.6.2526-2535.2004. PMC 355858. PMID 14993289.
Arima Y, Hirota T, Bronner C, Mousli M, Fujiwara T, Niwa S, Ishikawa H, Saya H (únor 2004). „Down-regulace jaderného proteinu ICBP90 signálem kontrolního bodu poškození DNA závislého na p53 / p21Cip1 / WAF1 přispívá k zastavení buněčného cyklu při přechodu G1 / S“. Geny do buněk. 9 (2): 131–42. doi:10.1111 / j.1356-9597.2004.00710.x. PMID 15009091. S2CID 23980129.
Abbady AQ, Bronner C, Trotzier MA, Hopfner R, Bathami K, Muller CD, Jeanblanc M, Mousli M (prosinec 2003). „Exprese ICBP90 je downregulována v buňkách Jurkat indukovaných apoptózou“. Annals of the New York Academy of Sciences. 1010: 300–3. doi:10.1196 / annals.1299.052. PMID 15033738. S2CID 32581931. Zkontrolujte hodnoty data v: | rok = / | datum = nesoulad (Pomoc)
Brandenberger R, Wei H, Zhang S, Lei S, Murage J, Fisk GJ, Li Y, Xu C, Fang R, Guegler K, Rao MS, Mandalam R, Lebkowski J, Stanton LW (červen 2004). „Charakterizace transkriptomu objasňuje signalizační sítě, které řídí růst a diferenciaci lidských ES buněk“. Přírodní biotechnologie. 22 (6): 707–16. doi:10.1038 / nbt971. PMID 15146197. S2CID 27764390. Zkontrolujte hodnoty data v: | rok = / | datum = nesoulad (Pomoc)
Trotzier MA, Bronner C, Bathami K, Mathieu E, Abbady AQ, Jeanblanc M, Muller CD, Rochette-Egly C, Mousli M (červen 2004). „Fosforylace ICBP90 proteinkinázou A zvyšuje expresi topoizomerázy IIalfa“. Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 319 (2): 590–5. doi:10.1016 / j.bbrc.2004.05.028. PMID 15178447.
Unoki M, Nishidate T, Nakamura Y (říjen 2004). „ICBP90, cíl E2F-1, rekrutuje HDAC1 a váže se na methyl-CpG prostřednictvím své SRA domény“. Onkogen. 23 (46): 7601–10. doi:10.1038 / sj.onc.1208053. PMID 15361834.
Abbady AQ, Bronner C, Bathami K, Muller CD, Jeanblanc M, Mathieu E, Klein JP, Candolfi E, Mousli M (srpen 2005). „Dráha TCR zahrnuje down-regulaci genu ICBP90 prostřednictvím vazebných míst E2F“. Biochemická farmakologie. 70 (4): 570–9. doi:10.1016 / j.bcp.2005.05.012. PMID 15964557.
Jeanblanc M, Mousli M, Hopfner R, Bathami K, Martinet N, Abbady AQ, Siffert JC, Mathieu E, Muller CD, Bronner C (listopad 2005). „Na gen retinoblastomu a jeho produkt se zaměřuje ICBP90: klíčový mechanismus přechodu G1 / S během buněčného cyklu“. Onkogen. 24 (49): 7337–45. doi:10.1038 / sj.onc.1208878. PMID 16007129.
Jenkins Y, Markovtsov V, Lang W, Sharma P, Pearsall D, Warner J, Franci C, Huang B, Huang J, Yam GC, Vistan JP, Pali E, Vialard J, Janicot M, Lorens JB, Payan DG, Hitoshi Y (Prosinec 2005). „Kritická role aktivity ubikvitin ligázy UHRF1, nukleárního prstového proteinu RING, v růstu nádorových buněk“. Molekulární biologie buňky. 16 (12): 5621–9. doi:10,1091 / mbc.E05-03-0194. PMC 1289407. PMID 16195352. Zkontrolujte hodnoty data v: | rok = / | datum = nesoulad (Pomoc)
Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y, Ota T, Nishikawa T, Yamashita R, Yamamoto J, Sekine M, Tsuritani K, Wakaguri H, Ishii S, Sugiyama T, Saito K, Isono Y, Irie R, Kushida N, Yoneyama T , Otsuka R, Kanda K, Yokoi T, Kondo H, Wagatsuma M, Murakawa K, Ishida S, Ishibashi T, Takahashi-Fujii A, Tanase T, Nagai K, Kikuchi H, Nakai K, Isogai T, Sugano S (leden 2006 ). „Diverzifikace transkripční modulace: rozsáhlá identifikace a charakterizace domnělých alternativních promotorů lidských genů“. Výzkum genomu. 16 (1): 55–65. doi:10,1101 / gr. 4039406. PMC 1356129. PMID 16344560.
Beausoleil SA, Villén J, Gerber SA, Rush J, Gygi SP (říjen 2006). „Přístup založený na pravděpodobnosti pro vysoce výkonnou analýzu fosforylace proteinů a lokalizaci místa“. Přírodní biotechnologie. 24 (10): 1285–92. doi:10.1038 / nbt1240. PMID 16964243. S2CID 14294292.
Muto M, Fujimori A, Nenoi M, Daino K, Matsuda Y, Kuroiwa A, Kubo E, Kanari Y, Utsuno M, Tsuji H, Ukai H, Mita K, Takahagi M, Tatsumi K (listopad 2006). „Izolace a charakterizace nového lidského genu radiosusceptibility, NP95“. Radiační výzkum. 166 (5): 723–33. doi:10.1667 / RR0459.1. PMID 17067204. S2CID 85418126.

Tento protein související článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000276043 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000001228 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[entrez-5] „Entrez Gene: UHRF1 podobný ubikvitinu, obsahující domény prstů PHD a RING, 1“.

[pmid10646863-6] Hopfner R, Mousli M, Jeltsch JM, Voulgaris A, Lutz Y, Marin C, Bellocq JP, Oudet P, Bronner C (leden 2000). „ICBP90, nový lidský vazebný protein pro CCAAT, zapojený do regulace exprese topoizomerázy IIalfa“. Výzkum rakoviny. 60 (1): 121–8. PMID 10646863.

[7] Mudbhary, Raksha; Hoshida, Yujin; Chernyavskaya, Yelena; Jacob, Vinitha; Villanueva, Augusto; Fiel, M. Isabel; Chen, Xintong; Kojima, Kensuke; Thung, Swan; Bronson, Roderick T .; Lachenmayer, Anja; Revill, Kate; Alsinet, Clara; Sachidanandam, Ravi; Desai, Anal; Senbanerjee, Sucharita; Ukomadu, Chinweike; Llovet, Josep M .; Sadler, Kirsten C. (2014). „Nadměrná exprese UHRF1 řídí hypomethylaci DNA a hepatocelulární karcinom“. Rakovinová buňka. 25 (2): 196–209. doi:10.1016 / j.ccr.2014.01.003. PMC 3951208. PMID 24486181.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]