Baculovirový protein obsahující IAP repetice 3 - Baculoviral IAP repeat-containing protein 3

BIRC3
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2UVL, 3EB5, 3EB6, 3M0A, 3M0D
Identifikátory
Aliasy	BIRC3, AIP1, API2, CIAP2, HAIP1, HIAP1, MALT2, MIHC, RNF49, c-IAP2, bakulovirová IAP repetice obsahující 3, IAP-1
Externí ID	OMIM: 601721 MGI: 1197007 HomoloGene: 899 Genové karty: BIRC3
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 11 (lidský)
Konec	102,339,403 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 9 (myš)
Konec	7,873,186 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba kovových iontů; • aktivita inhibitoru endopeptidázy cysteinového typu zapojená do apoptotického procesu; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita ubikvitin-protein transferázy; • aktivita transferázy; • GO: 1904264, GO: 1904822, GO: 0090622, GO: 0090302 aktivita ubikvitinové proteinové ligázy;
Buněčná složka	• cytoplazma; • nukleoplazma; • membránový vor; • buněčné jádro; • cytosol; • makromolekulární komplex;
Biologický proces	• regulace apoptotického procesu; • regulace nukleotidové vazebné oligomerizační domény obsahující signální cestu; • regulace vrozené imunitní odpovědi; • regulace signální dráhy receptoru podobného mýtnému; • negativní regulace nekroptotického procesu; • inhibice aktivity endopeptidázy cysteinového typu zapojené do apoptotického procesu; • regulace aktivity endopeptidázy cysteinového typu; • regulace signální dráhy RIG-I; • regulace signální dráhy zprostředkované faktorem nekrózy nádorů; • negativní regulace apoptotického procesu; • signální dráha zprostředkovaná faktorem nekrózy nádorů; • sestava mitotického vřetena; • signální dráha receptoru buněčného povrchu; • Signalizace NIK / NF-kappaB; • spermatogeneze; • regulace zánětlivé reakce; • pozitivní regulace signalizace I-kappaB kinázy / NF-kappaB; • Signalizace I-kappaB kinázy / NF-kappaB; • pozitivní regulace ubikvitinace bílkovin; • apoptotický proces; • ubikvitinace bílkovin; • deubikvitinace bílkovin; • regulace nekroptotického procesu; • heterooligomerizace bílkovin; • MyD88 nezávislá signální dráha receptoru podobného mýtnému; • Signální dráha mýtného receptoru závislá na TRIF; • negativní regulace aktivity endopeptidázy cysteinového typu účastnící se apoptotického procesu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	330
	11796
	ENSG00000023445
	ENSMUSG00000032000
	Q13489
	O08863
	NM_001165; NM_182962
	NM_007464
	NP_001156; NP_892007
	NP_031490
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Baculovirový protein obsahující IAP repetice3 (také známý jako cIAP2) je protein že u lidí je kódován BIRC3 gen.^[5]^[6]

cIAP2 je členem inhibitor apoptózy rodina, která brzdí apoptóza zásahem do aktivace kaspázy. Kódovaný protein inhibuje apoptózu vyvolanou deprivací séra, ale neovlivňuje apoptózu vyplývající z expozice menadion, silný induktor volné radikály. Protein cIAP2 obsahuje tři BIR domény, a UBA doména, a CARD doména a a Prst doména prsten. Varianty přepisu kódující stejné izoforma byl identifikován.^[7]

Interakce

Bylo prokázáno, že protein 3 obsahující bakulovirový IAP repetice komunikovat s:

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000023445 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000032000 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Liston P, Roy N, Tamai K, Lefebvre C, Baird S, Cherton-Horvat G, Farahani R, McLean M, Ikeda JE, MacKenzie A, Korneluk RG (únor 1996). "Potlačení apoptózy v savčích buňkách pomocí NAIP a příbuzné rodiny genů IAP". Příroda. 379 (6563): 349–53. doi:10.1038 / 379349a0. PMID 8552191. S2CID 4305853.
^ Rothe M, Pan MG, Henzel WJ, Ayres TM, Goeddel DV (únor 1996). „Signální komplex TNFR2-TRAF obsahuje dva nové proteiny související s bakulovirovým inhibitorem proteinů apoptózy“. Buňka. 83 (7): 1243–52. doi:10.1016/0092-8674(95)90149-3. PMID 8548810. S2CID 10694839.
^ „Entrez Gene: BIRC3 bakulovirový IAP repetice obsahující 3“.
^ Deveraux QL, Roy N, Stennicke HR, Van Arsdale T, Zhou Q, Srinivasula SM, Alnemri ES, Salvesen GS, Reed JC (1998). „IAP blokují apoptotické události vyvolané kaspázou-8 a cytochromem c přímou inhibicí odlišných kaspáz“. EMBO J.. 17 (8): 2215–23. doi:10.1093 / emboj / 17.8.2215. PMC 1170566. PMID 9545235.
^ Bertrand MJ, Milutinovic S, Dickson KM, Ho WC, Boudreault A, Durkin J, Gillard JW, Jaquith JB, Morris SJ, Barker PA (2008). „cIAP1 a cIAP2 usnadňují přežití rakovinných buněk tím, že fungují jako E3 ligázy, které podporují ubikvitinaci RIP1“. Mol. Buňka. 30 (6): 689–700. doi:10.1016 / j.molcel.2008.05.014. PMID 18570872.
^ ^A ^b Roy N, Deveraux QL, Takahashi R, Salvesen GS, Reed JC (1997). „Proteiny c-IAP-1 a c-IAP-2 jsou přímými inhibitory specifických kaspáz“. EMBO J.. 16 (23): 6914–25. doi:10.1093 / emboj / 16.23.6914. PMC 1170295. PMID 9384571.
^ ^A ^b Li X, Yang Y, Ashwell JD (2002). „TNF-RII a c-IAP1 zprostředkovávají ubikvitinaci a degradaci TRAF2“. Příroda. 416 (6878): 345–7. doi:10.1038 / 416345a. PMID 11907583. S2CID 4325926.
^ Uren AG, Pakusch M, Hawkins CJ, Puls KL, Vaux DL (1996). „Klonování a exprese homologů proteinu inhibujícího apoptózu, které fungují tak, že inhibují apoptózu a / nebo váží faktory spojené s receptorem faktoru nekrotizujícího faktor“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 93 (10): 4974–8. doi:10.1073 / pnas.93.10.4974. PMC 39390. PMID 8643514.
^ Yoneda T, Imaizumi K, Maeda M, Yui D, Manabe T, Katayama T, Sato N, Gomi F, Morihara T, Mori Y, Miyoshi K, Hitomi J, Ugawa S, Yamada S, Okabe M, Tohyama M (2000) . "Regulační mechanismy transdukce signálu zprostředkované TRAF2 Bcl10, proteinem spojeným s MALT lymfomem". J. Biol. Chem. 275 (15): 11114–20. doi:10.1074 / jbc.275.15.11114. PMID 10753917. S2CID 41164520.
^ Mace PD, Linke K, Feltham R, Schumacher FR, Smith CA, Vaux DL, Silke J, Day CL (2008). „Struktury domény cIAP2 RING odhalují konformační změny spojené s náborem enzymu konjugujícího ubikvitin (E2)“. J. Biol. Chem. 283 (46): 31633–40. doi:10,1074 / jbc.M804753200. PMID 18784070. S2CID 13619386.

Další čtení

Bertoni F, Cavalli F, Cotter FE, Zucca E (2003). "Genetické změny, které jsou základem patogeneze MALT lymfomu". Hematol. J. 3 (1): 10–3. doi:10.1038 / sj.thj.6200146. PMID 11960389.
Uren AG, Pakusch M, Hawkins CJ a kol. (1996). „Klonování a exprese homologů proteinu inhibujícího apoptózu, které fungují tak, že inhibují apoptózu a / nebo váží faktory spojené s receptorem faktoru nekrotizujícího faktor“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 93 (10): 4974–8. doi:10.1073 / pnas.93.10.4974. PMC 39390. PMID 8643514.
Rajcan-Separovic E, Liston P, Lefebvre C, Korneluk RG (1997). „Přiřazení humánního inhibitoru genů apoptotického proteinu (IAP) xiap, hiap-1 a hiap-2 k chromozómům Xq25 a 11q22-q23 pomocí fluorescenční hybridizace in situ“. Genomika. 37 (3): 404–6. doi:10.1006 / geno.1996.0579. PMID 8938457.
Roy N, Deveraux QL, Takahashi R a kol. (1998). „Proteiny c-IAP-1 a c-IAP-2 jsou přímými inhibitory specifických kaspáz“. EMBO J.. 16 (23): 6914–25. doi:10.1093 / emboj / 16.23.6914. PMC 1170295. PMID 9384571.
Deveraux QL, Roy N, Stennicke HR a kol. (1998). „IAP blokují apoptotické události vyvolané kaspázou-8 a cytochromem c přímou inhibicí odlišných kaspáz“. EMBO J.. 17 (8): 2215–23. doi:10.1093 / emboj / 17.8.2215. PMC 1170566. PMID 9545235.
Young SS, Liston P, Xuan JY a kol. (1999). "Genomická organizace a fyzikální mapa lidských inhibitorů apoptózy: HIAP1 a HIAP2". Mamm. Genom. 10 (1): 44–8. doi:10,1007 / s003359900940. PMID 9892732. S2CID 7052915.
Horrevoets AJ, Fontijn RD, van Zonneveld AJ a kol. (1999). „Cévní endoteliální geny, které reagují na faktor nekrózy nádorů alfa in vitro, jsou exprimovány v aterosklerotických lézích, včetně inhibitoru apoptózového proteinu-1, staninu a dvou nových genů.“ Krev. 93 (10): 3418–31. doi:10.1182 / krev.V93.10.3418.410k23_3418_3431. PMID 10233894.
Suzuki H, Motegi M, Akagi T a kol. (1999). „API1-MALT1-MLT je zapojen do lymfomu lymfoidní tkáně asociovaného se sliznicí s t (11; 18) (q21; q21)“. Krev. 94 (9): 3270–1. doi:10,1182 / krev. V94.9.3270. PMID 10610122.
Huang H, Joazeiro CA, Bonfoco E a kol. (2000). „Inhibitor apoptózy, cIAP2, funguje jako ligáza ubikvitin-protein a podporuje in vitro monoubikvitaci kaspáz 3 a 7“. J. Biol. Chem. 275 (35): 26661–4. doi:10.1074 / jbc.C000199200. PMID 10862606.
Verhagen AM, Ekert PG, Pakusch M a kol. (2000). „Identifikace DIABLO, savčího proteinu, který podporuje apoptózu vazbou na IAP proteiny a antagonizuje je“. Buňka. 102 (1): 43–53. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 00009-X. PMID 10929712. S2CID 3192775.
Baens M, Steyls A, Dierlamm J a kol. (2001). "Struktura genu MLT a molekulární charakterizace spojení genomových zlomů v t (11; 18) (q21; q21) lymfomů B-buněk marginální zóny typu MALT". Geny Chromozomy Rakovina. 29 (4): 281–91. doi:10.1002 / 1098-2264 (2000) 9999: 9999 <:: AID-GCC1036> 3.0.CO; 2-I. PMID 11066071.
Werneburg BG, Zoog SJ, Dang TT a kol. (2001). "Molekulární charakterizace signalizačních meziproduktů CD40". J. Biol. Chem. 276 (46): 43334–42. doi:10,1074 / jbc.M104994200. PMID 11562359. S2CID 25436077.
Suzuki Y, Imai Y, Nakayama H a kol. (2001). „Serinová proteáza, HtrA2, se uvolňuje z mitochondrií a interaguje s XIAP, čímž indukuje buněčnou smrt.“ Mol. Buňka. 8 (3): 613–21. doi:10.1016 / S1097-2765 (01) 00341-0. PMID 11583623.
Li X, Yang Y, Ashwell JD (2002). „TNF-RII a c-IAP1 zprostředkovávají ubikvitinaci a degradaci TRAF2“. Příroda. 416 (6878): 345–7. doi:10.1038 / 416345a. PMID 11907583. S2CID 4325926.
Gordon GJ, Appasani K, Parcells JP, et al. (2002). „Inhibitor apoptózového proteinu-1 podporuje přežití nádorových buněk v mezoteliomu“. Karcinogeneze. 23 (6): 1017–24. doi:10.1093 / carcin / 23.6.1017. PMID 12082024.
Sharief MK, Noori MA, Zoukos Y (2002). „Snížená exprese inhibitoru proteinů apoptózy v T buňkách od pacientů s roztroušenou sklerózou po terapii interferonem-beta“. J. Neuroimmunol. 129 (1–2): 224–31. doi:10.1016 / S0165-5728 (02) 00185-6. PMID 12161039. S2CID 25809358.
Ekedahl J, Joseph B, Grigoriev MY a kol. (2002). „Exprese inhibitoru apoptózových proteinů v malobuněčných a nemalobuněčných buňkách plicního karcinomu“. Exp. Cell Res. 279 (2): 277–90. doi:10.1006 / excr.2002.5608. PMID 12243753.

externí odkazy

Člověk BIRC3 umístění genomu a BIRC3 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.
Přehled všech strukturálních informací dostupných v PDB pro UniProt: Q13489 (Bakulovirový IAP repetice obsahující protein 3) na PDBe-KB.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000023445 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000032000 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid8552191-5] Liston P, Roy N, Tamai K, Lefebvre C, Baird S, Cherton-Horvat G, Farahani R, McLean M, Ikeda JE, MacKenzie A, Korneluk RG (únor 1996). "Potlačení apoptózy v savčích buňkách pomocí NAIP a příbuzné rodiny genů IAP". Příroda. 379 (6563): 349–53. doi:10.1038 / 379349a0. PMID 8552191. S2CID 4305853.

[pmid8548810-6] Rothe M, Pan MG, Henzel WJ, Ayres TM, Goeddel DV (únor 1996). „Signální komplex TNFR2-TRAF obsahuje dva nové proteiny související s bakulovirovým inhibitorem proteinů apoptózy“. Buňka. 83 (7): 1243–52. doi:10.1016/0092-8674(95)90149-3. PMID 8548810. S2CID 10694839.

[7] „Entrez Gene: BIRC3 bakulovirový IAP repetice obsahující 3“.

[pmid9545235-8] Deveraux QL, Roy N, Stennicke HR, Van Arsdale T, Zhou Q, Srinivasula SM, Alnemri ES, Salvesen GS, Reed JC (1998). „IAP blokují apoptotické události vyvolané kaspázou-8 a cytochromem c přímou inhibicí odlišných kaspáz“. EMBO J.. 17 (8): 2215–23. doi:10.1093 / emboj / 17.8.2215. PMC 1170566. PMID 9545235.

[pmid18570872-9] Bertrand MJ, Milutinovic S, Dickson KM, Ho WC, Boudreault A, Durkin J, Gillard JW, Jaquith JB, Morris SJ, Barker PA (2008). „cIAP1 a cIAP2 usnadňují přežití rakovinných buněk tím, že fungují jako E3 ligázy, které podporují ubikvitinaci RIP1“. Mol. Buňka. 30 (6): 689–700. doi:10.1016 / j.molcel.2008.05.014. PMID 18570872.

[pmid9384571-10] A ^b Roy N, Deveraux QL, Takahashi R, Salvesen GS, Reed JC (1997). „Proteiny c-IAP-1 a c-IAP-2 jsou přímými inhibitory specifických kaspáz“. EMBO J.. 16 (23): 6914–25. doi:10.1093 / emboj / 16.23.6914. PMC 1170295. PMID 9384571.

[pmid11907583-11] A ^b Li X, Yang Y, Ashwell JD (2002). „TNF-RII a c-IAP1 zprostředkovávají ubikvitinaci a degradaci TRAF2“. Příroda. 416 (6878): 345–7. doi:10.1038 / 416345a. PMID 11907583. S2CID 4325926.

[pmid8643514-12] Uren AG, Pakusch M, Hawkins CJ, Puls KL, Vaux DL (1996). „Klonování a exprese homologů proteinu inhibujícího apoptózu, které fungují tak, že inhibují apoptózu a / nebo váží faktory spojené s receptorem faktoru nekrotizujícího faktor“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 93 (10): 4974–8. doi:10.1073 / pnas.93.10.4974. PMC 39390. PMID 8643514.

[pmid10753917-13] Yoneda T, Imaizumi K, Maeda M, Yui D, Manabe T, Katayama T, Sato N, Gomi F, Morihara T, Mori Y, Miyoshi K, Hitomi J, Ugawa S, Yamada S, Okabe M, Tohyama M (2000) . "Regulační mechanismy transdukce signálu zprostředkované TRAF2 Bcl10, proteinem spojeným s MALT lymfomem". J. Biol. Chem. 275 (15): 11114–20. doi:10.1074 / jbc.275.15.11114. PMID 10753917. S2CID 41164520.

[pmid18784070-14] Mace PD, Linke K, Feltham R, Schumacher FR, Smith CA, Vaux DL, Silke J, Day CL (2008). „Struktury domény cIAP2 RING odhalují konformační změny spojené s náborem enzymu konjugujícího ubikvitin (E2)“. J. Biol. Chem. 283 (46): 31633–40. doi:10,1074 / jbc.M804753200. PMID 18784070. S2CID 13619386.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]