RhoGEF doména - RhoGEF domain
DH / PH doména RhoGEF | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
![]() Struktura RhoGEF domény od lidského Syna sedmkrát bílkovin, příklad DH / PH domény RhoGEF.[1] | |||||||||||
Identifikátory | |||||||||||
Symbol | RhoGEF | ||||||||||
Pfam | PF00621 | ||||||||||
InterPro | IPR035899 IPR000219, IPR035899 | ||||||||||
CHYTRÝ | RhoGEF | ||||||||||
SCOP2 | 1dbh / Rozsah / SUPFAM | ||||||||||
OPM protein | 1xd4 | ||||||||||
CDD | cd00160 | ||||||||||
|
Dedikátor domény RhoGEF cytokineze (DOCK) | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Identifikátory | |||||||||||
Symbol | RhoGEF | ||||||||||
Pfam | PF06920 | ||||||||||
InterPro | IPR010703 IPR026791, IPR010703 | ||||||||||
SCOP2 | 7wg7 / Rozsah / SUPFAM | ||||||||||
CDD | cd11684 | ||||||||||
|
RhoGEF doména popisuje dva odlišné strukturální domény s guaninový nukleotidový výměnný faktor (GEF) činnost regulovat malé GTPasy v Rho rodina. Rho malé GTPasy jsou po navázání neaktivní HDP ale aktivní, když je vázán na GTP; RhoGEF domény v proteinech jsou schopné podporovat uvolňování GDP a GTP vazbu k aktivaci konkrétních členů rodiny Rho, včetně RhoA, Rac1 a Cdc42.
Největší třída RhoGEF je složena z proteinů obsahujících „Dbl -homologie "(DH) doména, která se téměř vždy nachází společně s doménou pleckstrin-homologická (PH) doména k vytvoření kombinované struktury domény DH / PH.[2][3]
Výraznou třídou RhoGEF jsou proteiny obsahující DOCK / CZH / DHR-2 doména. Tato struktura nemá žádnou sekvenční podobnost s doménami homologie DBL.[4]
Lidské proteiny obsahující doménu DH / PH RhoGEF
ABR; AKAP13 / ARHGEF13 / Lbc; ALS2; ALS2CL; ARHGEF1 / p115-RhoGEF; 10. ARHGEF; ARHGEF10L; ARHGEF11 / PDZ-RhoGEF.; ARHGEF12 / LARG; 15. ARHGEF; 16. ARHGEF; ARHGEF17; ARHGEF18; ARHGEF19; ARHGEF2; ARHGEF25; ARHGEF26; ARHGEF28; ARHGEF3; ARHGEF33; ARHGEF35; ARHGEF37; 38. ARHGEF; 39 ARHGEF; ARHGEF4; ARHGEF40; ARHGEF5; ARHGEF6 / alpha-PIX; ARHGEF7 / beta-PIX; ARHGEF9; BCR; DNMBP; ECT2; ECT2L; FARP1; FARP2; FGD1; FGD2; FGD3; FGD4; FGD5; FGD6; ITSN1 / intertersektin 1; ITSN2 / intertersektin 2; KALRN / Kalirin; MCF2; MCF2L; MCF2L2; NET1; NGEF; OBSCN; PLEKHG1; PLEKHG2; PLEKHG3; PLEKHG4; PLEKHG4B; PLEKHG5; PLEKHG6; PREX1; PREX2; RASGRF1; RASGRF2; SPATA13; TIAM1; TIAM2; TRIO; VAV1; VAV2; VAV3.
Lidské proteiny obsahující doménu DOCK / CZH RhoGEF
DOCK1 / DOCK180; DOCK2; DOCK3 / MOCA; DOCK4; DOCK5; DOCK6 / ZIR1; DOCK7 / ZIR2; DOCK8 / ZIR3; DOCK9 / Zizimin1; DOCK10 / Zizimin2; DOCK11 / Zizimin3
Viz také
Reference
- ^ Soisson SM, Nimnual AS, Uy M, Bar-Sagi D, Kuriyan J (říjen 1998). "Krystalová struktura Dbl a pleckstrinových homologických domén z lidského Syna sedmkrát bílkovin". Buňka. 95 (2): 259–68. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 81756-0. PMID 9790532. S2CID 11868669.
- ^ Fort P, Blangy A (červen 2017). „Evoluční krajina rodin RhoGEF podobných Dbl: Přizpůsobení eukaryotických buněk signálům životního prostředí“. Biologie genomu a evoluce. 9 (6): 1471–1486. doi:10.1093 / gbe / evx100. PMC 5499878. PMID 28541439.
- ^ Cerione RA, Zheng Y (duben 1996). "Rodina onkogenů Dbl". Současný názor na buněčnou biologii. 8 (2): 216–22. doi:10.1016 / s0955-0674 (96) 80068-8. PMID 8791419.
- ^ Côté JF, Vuori K (prosinec 2002). „Identifikace evolučně konzervované nadrodiny proteinů souvisejících s DOCK180 s aktivitou výměny guaninových nukleotidů“. Journal of Cell Science. 115 (Pt 24): 4901–13. doi:10.1242 / jcs.00219. PMID 12432077.
Další čtení
- Hart MJ, Eva A, Evans T, Aaronson SA, Cerione RA (listopad 1991). "Katalýza výměny guaninových nukleotidů na proteinu CDC42Hs produktem dbl onkogenu". Příroda. 354 (6351): 311–4. doi:10.1038 / 354311a0. PMID 1956381. S2CID 4240053.
- Tan EC, Leung T, Manser E, Lim L (prosinec 1993). „Lidský gen související s aktivní oblastí zlomového klastru kóduje mozkový protein s homologií s guaninovými nukleotidovými výměnnými proteiny a proteiny aktivujícími GTPasu“. The Journal of Biological Chemistry. 268 (36): 27291–8. PMID 8262969.
- Soisson SM, Nimnual AS, Uy M, Bar-Sagi D, Kuriyan J (říjen 1998). "Krystalová struktura Dbl a pleckstrinových homologických domén z lidského Syna sedmkrát bílkovin". Buňka. 95 (2): 259–68. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 81756-0. PMID 9790532. S2CID 11868669.
![]() | Tento membránový protein –Vztahující se článek je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |