Dock9 - Dock9
Dock9 (Dedikátor ÓF Cytokinesis 9), také známý jako 1, je velká (~ 230 kDa) protein zahrnutý do něčeho, zůčastnit se čeho intracelulární signalizační sítě.[5] Je členem podrodiny DOCK-D skupiny DOK rodina guaninové nukleotidové výměnné faktory které fungují jako aktivátory malých G proteiny. Dock9 aktivuje malý G protein Cdc42.
Objev
Dock9 byl objeven pomocí afinity proteomický přístup navržený k identifikaci nových aktivátorů malého G proteinu Cdc42 v fibroblasty.[6] Následující severní skvrna analýza ukázala, že Dock9 je vyjádřen především v mozek, srdce, kosterní sval, ledviny, placenta a plíce. Nižší hladiny byly zjištěny v EU dvojtečka, brzlík, játra, tenké střevo a v leukocyty z periferní krve.
Struktura a funkce
Dock9 sdílí podobnou strukturu dvou jader domén (známý jako DHR1 a DHR2 ), které sdílejí všichni členové rodiny DOCK. The C-terminál Doména DHR2 funguje jako atypická doména GEF pro malé G proteiny (viz Dock180: struktura a funkce ) a je známo, že doména DHR1 je v některých proteinech podrodiny DOCK-A / B / C zapojena do jejich náboru do plazmatická membrána. Na rozdíl od proteinů DOCK-A / B / C obsahují proteiny DOCK-D (včetně Dock9) N-terminál pleckstrinová homologická (PH) doména který zprostředkovává jejich nábor na membránu.[7] Dock9 může spolu s dalšími členy podrodiny DOCK-C / D aktivovat Cdc42 in vitro a in vivo prostřednictvím své domény DHR2.[6] Dock9 však přijímá autoinhibiční konformaci, která maskuje doménu DHR2 v klidovém stavu.[7] Mechanismus, kterým je tato autoinhibice překonána, je stále nejasný, i když u některých jiných proteinů DOCK, které také podléhají autoinhibici, vyžaduje interakci s adaptační proteiny jako ELMO.[8][9] Dock9 bylo také hlášeno dimerizovat za klidových podmínek prostřednictvím svých domén DHR2 a tato studie naznačuje, že stejně se mohou chovat i jiné proteiny rodiny DOCK.[10] Nedávná analýza a chromozomální oblast spojená s náchylností k bipolární porucha odhalil to jednonukleotidové polymorfismy v DOCK9 gen přispívají k riziku a závažnosti tohoto stavu.[11]
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000088387 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000025558 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Entrez Gene: DOCK9 dedikátor cytokineze 9“.
- ^ A b Meller N, Irani-Tehrani M, Kiosses WB, et al. (Září 2002). „Zizimin1, nový aktivátor Cdc42, odhaluje novou doménu GEF pro proteiny Rho“. Nat. Cell Biol. 4 (9): 639–47. doi:10.1038 / ncb835. PMID 12172552.
- ^ A b Meller N, Westbrook MJ, Shannon JD a kol. (Leden 2008). "Funkce N-konce zizimin1: autoinhibice a cílení na membránu". Biochem. J. 409 (2): 525–33. doi:10.1042 / BJ20071263. PMC 2740492. PMID 17935486.
- ^ Lu M, Kinchen JM, Rossman KL a kol. (Srpen 2004). "PH doména ELMO funguje v trans k regulaci aktivace Rac přes Dock180". Nat. Struct. Mol. Biol. 11 (8): 756–62. doi:10.1038 / nsmb800. PMID 15247908.
- ^ Lu M, Kinchen JM, Rossman KL a kol. (Únor 2005). „Sterický inhibiční model pro regulaci nukleotidové výměny prostřednictvím rodiny GEF Dock180“. Curr. Biol. 15 (4): 371–77. doi:10.1016 / j.cub.2005.01.050. PMID 15723800.
- ^ Meller N, Irani-Tehrani M, Ratnikov BI a kol. (Září 2004). „Nový Cdc42 guaninový nukleotidový výměnný faktor, zizimin1, dimerizuje prostřednictvím domény Cdc42 vázající CZH2“. J. Biol. Chem. 279 (36): 37470–76. doi:10,1074 / jbc.M404535200. PMID 15247287.
- ^ Detera-Wadleigh SD, Liu CY, Maheshwari M a kol. (Říjen 2007). „Sekvenční variace v DOCK9 a heterogenita u bipolární poruchy“. Psychiatr. Genet. 17 (5): 274–86. doi:10.1097 / YPG.0b013e328133f352. PMID 17728666.
Další čtení
- Nakajima D, Okazaki N, Yamakawa H a kol. (2003). „Konstrukce klonů cDNA připravených na expresi pro geny KIAA: ruční kurace 330 klonů cDNA KIAA“. DNA Res. 9 (3): 99–106. doi:10.1093 / dnares / 9.3.99. PMID 12168954.
- Kwofie MA, Skowronski J (2008). "Specifické rozpoznávání Rac2 a Cdc42 DOCK2 a DOCK9 guaninovými nukleotidovými výměnnými faktory". J. Biol. Chem. 283 (6): 3088–96. doi:10,1074 / jbc.M705170200. PMID 18056264.
- Meller N, Westbrook MJ, Shannon JD a kol. (2008). "Funkce N-konce zizimin1: autoinhibice a cílení na membránu". Biochem. J. 409 (2): 525–33. doi:10.1042 / BJ20071263. PMC 2740492. PMID 17935486.
- Detera-Wadleigh SD, Liu CY, Maheshwari M a kol. (2007). „Sekvenční variace v DOCK9 a heterogenita u bipolární poruchy“. Psychiatr. Genet. 17 (5): 274–86. doi:10.1097 / YPG.0b013e328133f352. PMID 17728666.
- Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
- Dunham A, Matthews LH, Burton J a kol. (2004). „Sekvence DNA a analýza lidského chromozomu 13“. Příroda. 428 (6982): 522–8. doi:10.1038 / nature02379. PMC 2665288. PMID 15057823.
- Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
- Côté JF, Vuori K (2003). „Identifikace evolučně konzervované nadrodiny proteinů souvisejících s DOCK180 s aktivitou výměny guaninových nukleotidů“. J. Cell Sci. 115 (Pt 24): 4901–13. doi:10.1242 / jcs.00219. PMID 12432077.
- Meller N, Irani-Tehrani M, Kiosses WB, et al. (2002). „Zizimin1, nový aktivátor Cdc42, odhaluje novou doménu GEF pro proteiny Rho“. Nat. Cell Biol. 4 (9): 639–47. doi:10.1038 / ncb835. PMID 12172552.
- Kikuno R, Nagase T, Ishikawa K a kol. (1999). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. XIV. Kompletní sekvence 100 nových cDNA klonů z mozku, které kódují velké proteiny in vitro“. DNA Res. 6 (3): 197–205. doi:10.1093 / dnares / 6.3.197. PMID 10470851.
Tento článek o gen na lidský chromozom 13 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |