ARHGEF2 - ARHGEF2 - Wikipedia

ARHGEF2
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	5EFX
Identifikátory
Aliasy	ARHGEF2, GEF, GEF-H1, GEFH1, LFP40, P40, Rho / Rac guaninový nukleotidový výměnný faktor 2, NEDMHM, Lfc
Externí ID	OMIM: 607560 MGI: 103264 HomoloGene: 3468 Genové karty: ARHGEF2
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 1 (lidský)
Konec	156,007,070 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 3 (myš)
Konec	88,648,052 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Aktivita výměnného faktoru rac guanyl-nukleotid; • Rac GTPase vazba; • vazba mikrotubulů; • vazba iontů zinku; • vazba transkripčního faktoru; • vazba kovových iontů; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • Vazba Rho GTPázy; • Aktivita výměnného faktoru Rho guanyl-nukleotid; • aktivita faktoru výměny guanyl-nukleotidů;
Buněčná složka	• cytoplazma; • váček; • cytosol; • Golgiho aparát; • buněčná projekce; • membrána; • ohnisková adheze; • dvoubuněčný těsný spoj; • vřeteno; • buněčná membrána; • dendritická hřídel; • volánová membrána; • buněčné spojení; • tělo neuronových buněk; • mikrotubuly; • cytoskelet; • cytoplazmatický váček; • podosomy; • GO: 0097483, GO: 0097481 postsynaptická hustota; • makromolekulární komplex; • glutamátergická synapse; • postsynaptická hustota, intracelulární složka;
Biologický proces	• GO: 0007243 transdukce intracelulárního signálu; • negativní regulace vnitřní apoptotické signální dráhy v reakci na osmotický stres; • negativní regulace nekroptotického procesu; • organizace aktinových vláken; • proces imunitního systému; • negativní regulace neurogeneze; • buněčná odpověď na faktor nekrózy nádoru; • buněčné dělení; • buněčná odpověď na muramyldipeptid; • buněčná hyperosmotická odpověď; • negativní regulace depolymerace mikrotubulů; • regulace buněčné proliferace; • pozitivní regulace aktivity transkripčního faktoru NF-kappaB; • negativní regulace vnější apoptotické signální dráhy prostřednictvím receptorů domény smrti; • buněčná morfogeneze; • vytvoření orientace mitotického vřetena; • pozitivní regulace produkce interleukinu-6; • pozitivní regulace produkce faktoru nekrózy nádorů; • pozitivní regulace apoptotického procesu; • pozitivní regulace fosforylace peptidyl-tyrosinu; • buněčný cyklus; • regulace přenosu signálu proteinu Rho; • transport intracelulárních proteinů; • vrozený imunitní systém; • regulace přenosu signálu zprostředkovaného malou GTPázou; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • negativní regulace sestavy podosomu; • Signální dráha receptoru spřaženého s G-proteinem; • pozitivní regulace neuronové diferenciace; • asymetrické dělení neuroblastů; • pozitivní regulace migrace neuronů; • vývoj mnohobuněčných organismů; • vývoj nervového systému; • diferenciace buněk;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	9181
	16800
	ENSG00000116584
	ENSMUSG00000028059
	Q92974
	Q60875
NM_001162383; NM_001162384; NM_004723; NM_001350110; NM_001350111;
	NM_001350112
	NM_001198911; NM_001198912; NM_001198913; NM_008487; NM_001377126
NP_001155855; NP_001155856; NP_004714; NP_001337039; NP_001337040;
	NP_001337041
	NP_001185840; NP_001185841; NP_001185842; NP_032513; NP_001364055
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Rho guaninový nukleotidový výměnný faktor 2 je protein že u lidí je kódován ARHGEF2 gen.^[5]^[6]^[7]

Funkce

Rho GTPázy hrají zásadní roli v mnoha buněčných procesech, které jsou iniciovány extracelulárními stimuly, které fungují prostřednictvím receptorů spojených s G proteinem. Kódovaný protein může tvořit komplex s G proteiny a stimulovat signály závislé na rho.^[7]

Interakce

ARHGEF2 bylo prokázáno komunikovat s PAK1.^[8]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000116584 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000028059 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Ren Y, Li R, Zheng Y, Busch H (únor 1999). „Klonování a charakterizace GEF-H1, mikrotubulově vázaného guaninového nukleotidového výměnného faktoru pro Rac a Rho GTPasy“. J Biol Chem. 273 (52): 34954–60. doi:10.1074 / jbc.273.52.34954. PMID 9857026.
^ Ishikawa K, Nagase T, Suyama M, Miyajima N, Tanaka A, Kotani H, Nomura N, Ohara O (prosinec 1998). "Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. X. Kompletní sekvence 100 nových klonů cDNA z mozku, které mohou kódovat velké proteiny in vitro". DNA Res. 5 (3): 169–76. doi:10.1093 / dnares / 5.3.169. PMID 9734811.
^ ^A ^b „Entrez Gene: ARHGEF2 rho / rac guaninový nukleotidový výměnný faktor (GEF) 2“.
^ Zenke FT, Krendel M, DerMardirossian C, King CC, Bohl BP, Bokoch GM (duben 2004). „kináza 1 aktivovaná p21 fosforyluje a reguluje vazbu 14-3-3 na GEF-H1, mikrotubulově lokalizovaný faktor výměny Rho“. J. Biol. Chem. 279 (18): 18392–400. doi:10,1074 / jbc.M400084200. PMID 14970201.

externí odkazy

Člověk ARHGEF2 umístění genomu a ARHGEF2 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

Další čtení

Ehrhardt A, Ehrhardt GR, Guo X, Schrader JW (2002). „Ras a příbuzní - sdílení práce a vytváření sítí udržují starou rodinu pohromadě“. Exp. Hematol. 30 (10): 1089–106. doi:10.1016 / S0301-472X (02) 00904-9. PMID 12384139.
Reddy AB, Chatterjee A, Rothblum LI, Black A, Busch H (1989). "Izolace a charakterizace komplementární DNA k proliferujícímu buněčnému nukleolárnímu antigenu P40". Cancer Res. 49 (7): 1763–7. PMID 2466560.
Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (2001). „Klonování DNA pomocí in vitro specifické specifické rekombinace“. Genome Res. 10 (11): 1788–95. doi:10,1101 / gr. 143000. PMC 310948. PMID 11076863.
Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, Gassenhuber J, Glassl S, Ansorge W, Böcher M, Blöcker H, Bauersachs S, Blum H, Lauber J, Düsterhöft A, Beyer A, Köhrer K, Strack N, Mewes HW, Ottenwälder B Obermaier B, Tampe J, Heubner D, Wambutt R, Korn B, Klein M, Poustka A (2001). „Směrem ke katalogu lidských genů a proteinů: Sekvenování a analýza 500 nových kompletních lidských cDNA kódujících proteiny“. Genome Res. 11 (3): 422–35. doi:10,1101 / gr. GR1547R. PMC 311072. PMID 11230166.
Gao Y, Xing J, Streuli M, Leto TL, Zheng Y (2002). „Trp (56) rac1 specifikuje interakci s podmnožinou guaninových nukleotidových výměnných faktorů“. J. Biol. Chem. 276 (50): 47530–41. doi:10,1074 / jbc.M108865200. PMID 11595749.
Krendel M, Zenke FT, Bokoch GM (2002). „Faktor nukleové výměny GEF-H1 zprostředkovává vzájemné rozhovory mezi mikrotubuly a aktinovým cytoskeletem“. Nat. Cell Biol. 4 (4): 294–301. doi:10.1038 / ncb773. PMID 11912491.
Brajenovic M, Joberty G, Küster B, Bouwmeester T, Drewes G (2004). „Komplexní proteomická analýza lidských proteinových komplexů Par odhaluje vzájemně propojenou proteinovou síť“. J. Biol. Chem. 279 (13): 12804–11. doi:10,1074 / jbc.M312171200. PMID 14676191.
Bouwmeester T, Bauch A, Ruffner H, Angrand PO, Bergamini G, Croughton K, Cruciat C, Eberhard D, Gagneur J, Ghidelli S, Hopf C, Huhse B, Mangano R, Michon AM, Schirle M, Schlegl J, Schwab M , Stein MA, Bauer A, Casari G, Drewes G, Gavin AC, Jackson DB, Joberty G, Neubauer G, Rick J, Kuster B, Superti-Furga G (2004). "Fyzická a funkční mapa lidské signální transdukční dráhy TNF-alfa / NF-kappa B". Nat. Cell Biol. 6 (2): 97–105. doi:10.1038 / ncb1086. PMID 14743216.
Zenke FT, Krendel M, DerMardirossian C, King CC, Bohl BP, Bokoch GM (2004). „kináza 1 aktivovaná p21 fosforyluje a reguluje vazbu 14-3-3 na GEF-H1, mikrotubulově lokalizovaný výměnný faktor Rho“. J. Biol. Chem. 279 (18): 18392–400. doi:10,1074 / jbc.M400084200. PMID 14970201.
Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D, Elias JE, Villén J, Li J, Cohn MA, Cantley LC, Gygi SP (2004). „Rozsáhlá charakterizace jaderných fosfoproteinů z buněk HeLa“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 101 (33): 12130–5. doi:10.1073 / pnas.0404720101. PMC 514446. PMID 15302935.
Jin J, Smith FD, Stark C, Wells CD, Fawcett JP, Kulkarni S, Metalnikov P, O'Donnell P, Taylor P, Taylor L, Zougman A, Woodgett JR, Langeberg LK, Scott JD, Pawson T (2004). "Proteomická, funkční a doménová analýza in vivo 14-3-3 vazebných proteinů zapojených do cytoskeletální regulace a buněčné organizace". Curr. Biol. 14 (16): 1436–50. doi:10.1016 / j.cub.2004.07.051. PMID 15324660.
Wiemann S, Arlt D, Huber W, Wellenreuther R, Schleeger S, Mehrle A, Bechtel S, Sauermann M, Korf U, Pepperkok R, Sültmann H, Poustka A (2004). „Od ORFeome k biologii: potrubí funkční genomiky“. Genome Res. 14 (10B): 2136–44. doi:10,1101 / gr. 2576704. PMC 528930. PMID 15489336.
Callow MG, Zozulya S, Gishizky ML, Jallal B, Smeal T (2005). „PAK4 zprostředkovává morfologické změny prostřednictvím regulace GEF-H1“. J. Cell Sci. 118 (Pt 9): 1861–1872. doi:10.1242 / jcs.02313. PMID 15827085.
Aijaz S, D'Atri F, Citi S, Balda MS, Matter K (2005). „Vazba GEF-H1 na cingulin adaptéru spojeného s těsným spojením vede k inhibici signalizace Rho a fázového přechodu G1 / S“. Dev. Buňka. 8 (5): 777–86. doi:10.1016 / j.devcel.2005.03.003. PMID 15866167.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (2005). „Směrem k mapě interakční sítě lidský protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514.
Mehrle A, Rosenfelder H, Schupp I, del Val C, Arlt D, Hahne F, Bechtel S, Simpson J, Hofmann O, Hide W, Glatting KH, Huber W, Pepperkok R, Poustka A, Wiemann S (2006). „Databáze LIFEdb v roce 2006“. Nucleic Acids Res. 34 (Problém s databází): D415–8. doi:10.1093 / nar / gkj139. PMC 1347501. PMID 16381901.

Tento článek o gen na lidský chromozom 1 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000116584 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000028059 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9857026-5] Ren Y, Li R, Zheng Y, Busch H (únor 1999). „Klonování a charakterizace GEF-H1, mikrotubulově vázaného guaninového nukleotidového výměnného faktoru pro Rac a Rho GTPasy“. J Biol Chem. 273 (52): 34954–60. doi:10.1074 / jbc.273.52.34954. PMID 9857026.

[pmid9734811-6] Ishikawa K, Nagase T, Suyama M, Miyajima N, Tanaka A, Kotani H, Nomura N, Ohara O (prosinec 1998). "Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. X. Kompletní sekvence 100 nových klonů cDNA z mozku, které mohou kódovat velké proteiny in vitro". DNA Res. 5 (3): 169–76. doi:10.1093 / dnares / 5.3.169. PMID 9734811.

[entrez-7] A ^b „Entrez Gene: ARHGEF2 rho / rac guaninový nukleotidový výměnný faktor (GEF) 2“.

[pmid14970201-8] Zenke FT, Krendel M, DerMardirossian C, King CC, Bohl BP, Bokoch GM (duben 2004). „kináza 1 aktivovaná p21 fosforyluje a reguluje vazbu 14-3-3 na GEF-H1, mikrotubulově lokalizovaný faktor výměny Rho“. J. Biol. Chem. 279 (18): 18392–400. doi:10,1074 / jbc.M400084200. PMID 14970201.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]