11. ARHGEF - ARHGEF11
Faktor výměny guaninového nukleotidu Rho 11 je protein že u lidí je kódován 11. ARHGEF gen.[5][6][7] Tento protein se také nazývá RhoGEF11 nebo PDZ-RhoGEF.
Funkce
Rho guanin nukleotidový výměnný faktor 11 je guaninový nukleotidový výměnný faktor (GEF) pro RhoA malá GTPáza protein.[8] Rho je malá GTPáza protein, který je neaktivní, když je vázán k guanin nukleotid HDP. Ale když na něj působí proteiny Rho GEF, jako je RhoGEF1, je tento HDP uvolněn a nahrazen GTP, což vede k aktivnímu stavu Rho. V této aktivní konformaci vázané na GTP se Rho může vázat a aktivovat specificky efektor bílkoviny a enzymy regulovat buněčné funkce.[9] Aktivní Rho je zejména hlavním regulátorem buňky aktin cytoskelet.[9]
RhoGEF11 je členem skupiny čtyř proteinů RhoGEF, o nichž je známo, že jsou aktivovány Receptory spojené s G proteinem spojený s G12 a G.13 heterotrimerní G proteiny.[8] Ostatní jsou ARHGEF1 (také známý jako p115-RhoGEF), 12. ARHGEF (také známý jako LARG) a AKAP13 (známé také jako ARHGEF13 a Lbc). [10][11] GPCR regulovaný RhoGEF11 (a tyto příbuzné proteiny GEF) působí jako efektor pro G12 a G.13 G proteiny. Kromě aktivace G12 nebo G.13 G proteiny, tři z těchto čtyř proteinů RhoGEF (ARHGEF1 / 11/12) také fungují jako Rodina RGS Proteiny aktivující GTPázu (GAP) ke zvýšení rychlosti GTP hydrolýzy G12/G13 alfa proteiny (které jsou samy o sobě proteiny GTPázy). Tato akce zvyšuje rychlost deaktivace G proteinu a omezuje dobu, po kterou tyto RhoGEF aktivují Rho.[12]
Byly popsány dva alternativní přepisy kódující různé izoformy.[7]
Interakce
ARHGEF11 bylo prokázáno komunikovat s:
Viz také
- Druhý poselský systém
- Receptor spojený s G proteinem
- Heterotrimerický G protein
- Malé GTPasy
- Rodina Rho GTPas
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000132694 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000041977 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ A b Rümenapp U, Blomquist A, Schwörer G, Schablowski H, Psoma A, Jakobs KH (říjen 1999). "Rho-specifická vazba a guaninová nukleotidová katalýza výměny KIAA0380, člen rodiny dbl". FEBS Dopisy. 459 (3): 313–8. doi:10.1016 / S0014-5793 (99) 01270-3. PMID 10526156.
- ^ Nagase T, Ishikawa K, Nakajima D, Ohira M, Seki N, Miyajima N, Tanaka A, Kotani H, Nomura N, Ohara O (duben 1997). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. VII. Kompletní sekvence 100 nových cDNA klonů z mozku, které mohou kódovat velké proteiny in vitro“. Výzkum DNA. 4 (2): 141–50. doi:10.1093 / dnares / 4.2.141. PMID 9205841.
- ^ A b „Entrez Gene: ARHGEF11 Rho guaninový nukleotidový výměnný faktor (GEF) 11“.
- ^ A b Fukuhara S, Murga C, Zohar M, Igishi T, Gutkind JS (únor 1999). „Nová doména PDZ obsahující guanin nukleotidový výměnný faktor spojuje heterotrimerické G proteiny s Rho“. The Journal of Biological Chemistry. 274 (9): 5868–79. doi:10.1074 / jbc.274.9.5868. PMID 10026210.
- ^ A b Thumkeo, D; Watanabe, S; Narumiya, S (říjen – listopad 2013). "Fyziologické role Rho a Rho efektorů u savců". European Journal of Cell Biology. 92 (10–11): 303–315. doi:10.1016 / j.ejcb.2013.09.002. PMID 24183240.
- ^ Fukuhara S, Chikumi H, Gutkind JS (2001). „RhoSF obsahující RGS: chybějící spojení mezi transformujícími se G proteiny a Rho?“. Onkogen. 20 (13): 1661–8. doi:10.1038 / sj.onc.1204182. PMID 11313914.
- ^ Diviani, D; Soderling, J; Scott, JD (listopad 2001). „AKAP-Lbc ukotví proteinovou kinázu A a nukleázy Galpha 12-selektivní tvorbu stresových vláken zprostředkovanou Rho“. Journal of Biological Chemistry. 276 (47): 44247–44257. doi:10,1074 / jbc.M106629200. PMID 11546812.
- ^ Kozasa T (2001). "Regulace signální transdukce zprostředkované G proteinem proteiny RGS". Life Sci. 68 (19–20): 2309–17. doi:10.1016 / S0024-3205 (01) 01020-7. PMID 11358341.
- ^ A b Chen, Z; Singer, WD; Danesh, SM; Sternweis, PC; Sprang, SR (říjen 2008). "Rozpoznání aktivovaných stavů Galpha13 doménou rgRGS PDZRhoGEF". Struktura. 16 (10): 1532–1543. doi:10.1016 / j.str.2008.07.009. PMC 2586972. PMID 18940608.
- ^ A b C Perrot V, Vazquez-Prado J, Gutkind JS (listopad 2002). „Plexin B reguluje Rho prostřednictvím guaninových nukleotidových výměnných faktorů leukemií asociovaných Rho GEF (LARG) a PDZ-RhoGEF“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (45): 43115–20. doi:10,1074 / jbc.M206005200. PMID 12183458.
- ^ A b Swiercz JM, Kuner R, Behrens J, Offermanns S (červenec 2002). „Plexin-B1 přímo interaguje s PDZ-RhoGEF / LARG k regulaci morfologie RhoA a růstového kužele“. Neuron. 35 (1): 51–63. doi:10.1016 / S0896-6273 (02) 00750-X. PMID 12123608.
- ^ Oinuma I, Katoh H, Harada A, Negishi M (červenec 2003). „Přímá interakce Rnd1 s plexinem-B1 reguluje aktivaci Rho zprostředkovanou PDZ-RhoGEF pomocí plexinu-B1 a indukuje kontrakci buněk v buňkách COS-7“. The Journal of Biological Chemistry. 278 (28): 25671–7. doi:10,1074 / jbc.M303047200. PMID 12730235.
- ^ Hirotani M, Ohoka Y, Yamamoto T, Nirasawa H, Furuyama T, Kogo M, Matsuya T, Inagaki S (září 2002). "Interakce plexinu-B1 s výměnnými faktory guaninových nukleotidů Rho obsahujících doménu PDZ". Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 297 (1): 32–7. doi:10.1016 / S0006-291X (02) 02122-8. PMID 12220504.
Další čtení
- Togashi H, Nagata K, Takagishi M, Saitoh N, Inagaki M (září 2000). "Funkce rho-specifického guaninového nukleotidového výměnného faktoru při zatahování neuritů. Možná role motivu KIAA0380 bohatého na prolin v lokalizaci". The Journal of Biological Chemistry. 275 (38): 29570–8. doi:10,1074 / jbc.M003726200. PMID 10900204.
- Jackson M, Song W, Liu MY, Jin L, Dykes-Hoberg M, Lin CI, Bowers WJ, Federoff HJ, Sternweis PC, Rothstein JD (březen 2001). "Modulace neuronového glutamátového transportéru EAAT4 dvěma interagujícími proteiny". Příroda. 410 (6824): 89–93. doi:10.1038/35065091. PMID 11242047.
- Longenecker KL, Lewis ME, Chikumi H, Gutkind JS, Derewenda ZS (červenec 2001). "Struktura domény podobné RGS z PDZ-RhoGEF: navázání heterotrimerní signalizace spojené s proteinem g na Rho GTPasy". Struktura. 9 (7): 559–69. doi:10.1016 / S0969-2126 (01) 00620-7. PMID 11470431.
- Perrot V, Vazquez-Prado J, Gutkind JS (listopad 2002). „Plexin B reguluje Rho prostřednictvím guaninových nukleotidových výměnných faktorů leukemií asociovaných Rho GEF (LARG) a PDZ-RhoGEF“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (45): 43115–20. doi:10,1074 / jbc.M206005200. PMID 12183458.
- Driessens MH, Olivo C, Nagata K, Inagaki M, Collard JG (říjen 2002). "B plexiny aktivují Rho prostřednictvím PDZ-RhoGEF". FEBS Dopisy. 529 (2–3): 168–72. doi:10.1016 / S0014-5793 (02) 03323-9. PMID 12372594.
- Nakayama M, Kikuno R, Ohara O (listopad 2002). „Interakce proteinů a proteinů mezi velkými proteiny: dvouhybridní screening využívající funkčně klasifikovanou knihovnu složenou z dlouhých cDNA“. Výzkum genomu. 12 (11): 1773–84. doi:10,1101 / gr. 406902. PMC 187542. PMID 12421765.
- Barac A, Basile J, Vázquez-Prado J, Gao Y, Zheng Y, Gutkind JS (únor 2004). „Přímá interakce p21-aktivované kinázy 4 s PDZ-RhoGEF, faktorem výměny Rho s guaninem spojeným s G proteinem“. The Journal of Biological Chemistry. 279 (7): 6182–9. doi:10,1074 / jbc.M309579200. PMID 14625312.
- Davidkova G, McCullumsmith RE, Meador-Woodruff JH (listopad 2003). "Exprese ARHGEF11 mRNA ve schizofrenickém thalamu" (PDF). Annals of the New York Academy of Sciences. 1003: 375–7. doi:10.1196 / annals.1300.030. PMID 14684465.
- Banerjee J, Wedegaertner PB (duben 2004). „Identifikace nové sekvence v PDZ-RhoGEF, která zprostředkovává interakci s aktinovým cytoskeletem“. Molekulární biologie buňky. 15 (4): 1760–75. doi:10,1091 / mbc.E03-07-0527. PMC 379273. PMID 14742719.
- Wang Q, Liu M, Kozasa T, Rothstein JD, Sternweis PC, Neubig RR (červenec 2004). „Receptory trombinu a kyseliny lysofosfatidové využívají odlišné rhoGEF v buňkách rakoviny prostaty“. The Journal of Biological Chemistry. 279 (28): 28831–4. doi:10.1074 / jbc.C400105200. PMID 15143072.
- Guo X, Li Y, Peng K, Hu Y, Li C, Xia B, Jin C (listopad 2005). „Struktury řešení a dynamika páteře arzeničnanové reduktázy z Bacillus subtilis: reverzibilní konformační přepínač spojený s redukcí arzeničnanu“. The Journal of Biological Chemistry. 280 (47): 39601–8. doi:10,1074 / jbc.M508132200. PMID 16192272.
- Longhurst DM, Watanabe M, Rothstein JD, Jackson M (duben 2006). „Interakce PDZRhoGEF s lehkými řetězci proteinu 1 asociovaného s mikrotubuly: spojení mezi mikrotubuly, aktinovým cytoskeletem a polaritou neuronů“. The Journal of Biological Chemistry. 281 (17): 12030–40. doi:10,1074 / jbc.M513756200. PMID 16478718.
- Gu J, Wu X, Dong Q, Romeo MJ, Lin X, Gutkind JS, Berman DM (červen 2006). „Nonsynonymní jedno-nukleotidový polymorfismus ve výměnném faktoru guaninového nukleotidu PDZ-Rho (Ser1416Gly) moduluje riziko rakoviny plic u mexických Američanů“. Rakovina. 106 (12): 2716–24. doi:10.1002 / cncr.21944. PMID 16691626.
- Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, Macek B, Kumar C, Mortensen P, Mann M (listopad 2006). „Globální, in vivo a místně specifická dynamika fosforylace v signálních sítích“. Buňka. 127 (3): 635–48. doi:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID 17081983.
- Ma L, Hanson RL, Que LN, Cali AM, Fu M, Mack JL, Infante AM, Kobes S, Bogardus C, Shuldiner AR, Baier LJ (květen 2007). „Varianty v ARHGEF11, kandidátském genu pro vazbu na diabetes typu 2 na chromozomu 1q, jsou nominálně spojeny s inzulínovou rezistencí a diabetem typu 2 u indiánů Pima“. Cukrovka. 56 (5): 1454–9. doi:10.2337 / db06-0640. PMID 17287471.
externí odkazy
- Člověk 11. ARHGEF umístění genomu a 11. ARHGEF stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.
![]() | Tento článek o gen na lidský chromozom 1 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |