ARHGEF1 - ARHGEF1

ARHGEF1
Protein ARHGEF1 PDB 1iap.png
Dostupné struktury
PDBHledání ortologu: PDBe RCSB
Identifikátory
AliasyARHGEF1, GEF1, LBCL2, LSC, P115-RHOGEF, SUB1,5, Rho guanin nukleotidový výměnný faktor 1, IMD62
Externí IDOMIM: 601855 MGI: 1353510 HomoloGene: 3454 Genové karty: ARHGEF1
Umístění genu (člověk)
Chromozom 19 (lidský)
Chr.Chromozom 19 (lidský)[1]
Chromozom 19 (lidský)
Genomické umístění pro ARHGEF1
Genomické umístění pro ARHGEF1
Kapela19q13.2Start41,883,161 bp[1]
Konec41,930,150 bp[1]
Exprese RNA vzor
PBB GE ARHGEF1 203055 s na fs.png
Další údaje o referenčních výrazech
Ortology
DruhČlověkMyš
Entrez

9138

16801

Ensembl

ENSG00000076928

ENSMUSG00000040940

UniProt

Q92888

Q61210

RefSeq (mRNA)

NM_004706
NM_198977
NM_199002

NM_001130150
NM_001130151
NM_001130152
NM_001130153
NM_008488

RefSeq (protein)

NP_004697
NP_945328
NP_945353

NP_001123622
NP_001123623
NP_001123624
NP_001123625
NP_032514

Místo (UCSC)Chr 19: 41,88 - 41,93 MbChr 7: 24,9 - 24,93 Mb
PubMed Vyhledávání[3][4]
Wikidata
Zobrazit / upravit člověkaZobrazit / upravit myš

Faktor výměny guaninového nukleotidu Rho 1 je protein že u lidí je kódován ARHGEF1 gen.[5][6][7] Tento protein se také nazývá RhoGEF1 nebo p115-RhoGEF.

Funkce

Faktor 1 pro výměnu guaninového nukleotidu Rho je guaninový nukleotidový výměnný faktor (GEF) pro RhoA malá GTPáza protein.[8] Rho je malá GTPáza protein, který je neaktivní, když je vázán k guanin nukleotid HDP. Ale když na něj působí proteiny Rho GEF, jako je RhoGEF1, je tento HDP uvolněn a nahrazen GTP, což vede k aktivnímu stavu Rho. V této aktivní konformaci vázané na GTP se Rho může vázat a aktivovat specificky efektor bílkoviny a enzymy regulovat buněčné funkce.[9] Aktivní Rho je zejména hlavním regulátorem buňky aktin cytoskelet.[9]

RhoGEF1 je členem skupiny čtyř proteinů RhoGEF, o nichž je známo, že jsou aktivovány Receptory spojené s G proteinem spojený s G12 a G.13 heterotrimerní G proteiny.[10][11] Ostatní jsou 11. ARHGEF (také známý jako PDZ-RhoGEF), 12. ARHGEF (také známý jako LARG) a AKAP13 (známé také jako ARHGEF13 a Lbc). [12][13] GPCR regulovaný RhoGEF1 (a tyto příbuzné proteiny GEF) působí jako efektor pro G12 a G.13 G proteiny. Kromě aktivace G12 nebo G.13 G proteiny, tři z těchto čtyř proteinů RhoGEF (ARHGEF1 / 11/12) také fungují jako Rodina RGS Proteiny aktivující GTPázu (GAP) ke zvýšení rychlosti GTP hydrolýzy G12/G13 alfa proteiny (které jsou samy o sobě proteiny GTPázy). Tato akce zvyšuje rychlost deaktivace G proteinu a omezuje dobu, po kterou tyto RhoGEF aktivují Rho.[14]

Pro tento gen bylo identifikováno několik alternativně sestřižených variant transkriptu, ale nebyla definována povaha a funkce celé varianty v celé délce.[7]

Interakce

ARHGEF1 bylo prokázáno komunikovat s:

Viz také

Reference

  1. ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000076928 - Ensembl, Květen 2017
  2. ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000040940 - Ensembl, Květen 2017
  3. ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  4. ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  5. ^ Hart MJ, Sharma S, elMasry N, Qiu RG, McCabe P, Polakis P, Bollag G (říjen 1996). "Identifikace nového guaninového nukleotidového výměnného faktoru pro Rho GTPázu". The Journal of Biological Chemistry. 271 (41): 25452–8. doi:10.1074 / jbc.271.41.25452. PMID  8810315.
  6. ^ Aasheim HC, Pedeutour F, Smeland EB (duben 1997). "Charakterizace, exprese a chromozomální lokalizace lidského genu homologního s myším Lsc onkogenem, s nejsilnější expresí v hematopoetických tkáních". Onkogen. 14 (14): 1747–52. doi:10.1038 / sj.onc.1200994. PMID  9135076. S2CID  24528606.
  7. ^ A b „Entrez Gene: ARHGEF1 Rho guaninový nukleotidový výměnný faktor (GEF) 1“.
  8. ^ Hart MJ, Sharma S, elMasry N, Qiu RG, McCabe P, Polakis P, Bollag G (říjen 1996). "Identifikace nového guaninového nukleotidového výměnného faktoru pro Rho GTPázu". The Journal of Biological Chemistry. 271 (41): 25452–8. doi:10.1074 / jbc.271.41.25452. PMID  8810315.
  9. ^ A b Thumkeo D, Watanabe S, Narumiya S (říjen – listopad 2013). "Fyziologické role Rho a Rho efektorů u savců". European Journal of Cell Biology. 92 (10–11): 303–15. doi:10.1016 / j.ejcb.2013.09.002. PMID  24183240.
  10. ^ Kozasa T, Jiang X, Hart MJ, Sternweis PM, Singer WD, Gilman AG a kol. (Červen 1998). „p115 RhoGEF, protein aktivující GTPázu pro Galpha12 a Galpha13“. Věda. 280 (5372): 2109–11. doi:10.1126 / science.280.5372.2109. PMID  9641915.
  11. ^ A b Hart MJ, Jiang X, Kozasa T, Roscoe W, Singer WD, Gilman AG a kol. (Červen 1998). "Přímá stimulace aktivity výměny guaninového nukleotidu p115 RhoGEF pomocí Galpha13". Věda. 280 (5372): 2112–4. doi:10.1126 / science.280.5372.2112. PMID  9641916.
  12. ^ Fukuhara S, Chikumi H, Gutkind JS (březen 2001). „RhoSF obsahující RGS: chybějící spojení mezi transformujícími se G proteiny a Rho?“. Onkogen. 20 (13): 1661–8. doi:10.1038 / sj.onc.1204182. PMID  11313914.
  13. ^ Diviani D, Soderling J, Scott JD (listopad 2001). „AKAP-Lbc ukotví proteinovou kinázu A a nukleázy Galpha 12-selektivní tvorbu stresových vláken zprostředkovanou Rho“. The Journal of Biological Chemistry. 276 (47): 44247–57. doi:10,1074 / jbc.M106629200. PMID  11546812.
  14. ^ Kozasa T (duben 2001). "Regulace signální transdukce zprostředkované G proteinem proteiny RGS". Humanitní vědy. 68 (19–20): 2309–17. doi:10.1016 / S0024-3205 (01) 01020-7. PMID  11358341.
  15. ^ A b Johnson EN, Seasholtz TM, Waheed AA, Kreutz B, Suzuki N, Kozasa T a kol. (Prosinec 2003). „RGS16 inhibuje signalizaci osou G alfa 13-Rho“. Přírodní buněčná biologie. 5 (12): 1095–103. doi:10.1038 / ncb1065. PMID  14634662. S2CID  6798899.
  16. ^ Holinstat M, Mehta D, Kozasa T, Minshall RD, Malik AB (srpen 2003). „Protein kináza Calpha indukovaná fosforylace p115RhoGEF signalizuje endoteliální cytoskeletální přesmyk“. The Journal of Biological Chemistry. 278 (31): 28793–8. doi:10,1074 / jbc.M303900200. PMID  12754211.

externí odkazy

Další čtení