Dock180 - Dock180

DOCK1
Dostupné struktury
PDBHledání ortologu: PDBe RCSB
Identifikátory
AliasyDOCK1„DOCK180, ced5, Dock180, dedikátor cytokineze 1
Externí IDOMIM: 601403 MGI: 2429765 HomoloGene: 55575 Genové karty: DOCK1
Umístění genu (člověk)
Chromozom 10 (lidský)
Chr.Chromozom 10 (lidský)[1]
Chromozom 10 (lidský)
Genomic location for DOCK1
Genomic location for DOCK1
Kapela10q26.2Start126,905,409 bp[1]
Konec127,452,517 bp[1]
Ortology
DruhČlověkMyš
Entrez

1793

330662

Ensembl

ENSG00000150760

ENSMUSG00000058325

UniProt

Q14185

Q8BUR4

RefSeq (mRNA)

NM_001290223
NM_001380

NM_001033420

RefSeq (protein)

NP_001028592

Místo (UCSC)Chr 10: 126,91 - 127,45 MbChr 7: 134,67 - 135,17 Mb
PubMed Vyhledávání[3][4]
Wikidata
Zobrazit / upravit člověkaZobrazit / upravit myš

Dock180, (Dedikátor ÓF Cytokinesis) také známý jako DOCK1, je velká (~ 180 kDa) protein zahrnutý do něčeho, zůčastnit se čeho intracelulární signalizační sítě.[5] Je to savec ortolog z C. elegans protein CED-5 a patří do DOK rodina Faktory výměny guaninových nukleotidů (GEF).[6]

Objev

Dock180 byl identifikován pomocí a far-western blot přístup, jako závazný partner adaptační protein Crk který byl schopen vyvolat morfologické změny v 3T3 fibroblasty.[7] Následně bylo oznámeno, že Dock180 byl schopen aktivovat malý protein vázající GTP (G protein ) Rac1[8] a to se později ukázalo díky schopnosti jednat jako GEF.[9]

Struktura a funkce

Dock180 je součástí velké třídy proteinů (GEF), které přispívají k buněčným signalizačním událostem aktivací malých G proteinů. V klidovém stavu jsou na G proteiny vázány Guanosin difosfát (HDP) a jejich aktivace vyžaduje disociaci HDP a vazbu na guanosin trifosfát (GTP). GEF aktivují G proteiny podporou této nukleotidové výměny.

Dock180 a příbuzné proteiny se liší od ostatních GEF v tom, že nemají kanonickou strukturu tandemu DH -PH domény, o nichž je známo, že vyvolávají nukleotidovou výměnu. Místo toho vlastní DHR2 doména který zprostředkovává aktivaci Rac stabilizací ve stavu bez nukleotidů.[9] Proteiny související s Dock180 také mají a DHR1 doména který se ukázal, in vitro, přivázat fosfolipidy[10] a které mohou být zapojeny do jejich interakce s buněčné membrány. Mezi další strukturální vlastnosti Dock180 patří N-terminál SH3 doména podílí se na vazbě na proteiny ELMO (viz níže)[11] a a C-terminál prolin - bohatý region, který v Město Myoblast (dále jen Drosophila melanogaster ortholog of Dock180), bylo prokázáno, že se váže DCrk (dále jen Drosophila ortolog Crk ).[12]

Regulace aktivity Dock180

Za fyziologických podmínek samotný Dock180 je neúčinný při podpoře výměny nukleotidů na Rac.[11] Efektivní aktivita GEF vyžaduje interakci mezi Dock180 a jeho vazebným partnerem ELMO. ELMO1 je nejobsáhleji popsán izoforma této malé rodiny ne-katalyticky aktivní proteiny, které slouží k náboru Dock180 do plazmatická membrána a vyvolat konformační změny, které zvyšují účinnost GEF.[13][14][15] Bylo také hlášeno, že ELMO1 inhibuje ubikvitinylace Dock180 a tak zabránit jeho degradaci o proteazomy.[16] Receptor zprostředkovaná aktivace RhoG (malý G protein z Rac podčeleď ) je možná nejznámější induktor aktivity Dock180 GEF. Aktivní (vázaný na GTP) RhoG rekrutuje komplex ELMO / Dock180 na plazmatickou membránu, čímž Dock180 kontaktuje s jeho Podklad, Rac.[17] v nádor buněk Dock180 je regulován komplexem obsahujícím Crk a p130Cas což je zase regulováno kooperativní signalizací β3-obsahující integrin komplexy a protein vázaný na membránu uPAR.[18]

Signalizace po proudu od Dock180

Dock180 je GEF specifický pro Rac a je tedy zodpovědný za podmnožinu signálních událostí specifických pro Rac. Tyto zahrnují migrace buněk a fagocytóza z apoptotický buňky v C. elegans,[19] neurit růst v Buňky PC12[20] a myoblast fúze v Zebrafish embryo.[21] Více nedávno se ukázalo, že se doména DHR1 Dock180 váže SNX5 (A třídění nexinu ) a tato interakce podpořila retrográdní transport na kationu nezávislý manosový 6-fosfátový receptor do Síť Trans-Golgi způsobem nezávislým na Rac.[22] Zvýšené výraz Dock180 a Elmo údajně přispívají gliom invaze.[23]

Interakce

Dock180 bylo prokázáno komunikovat s:

Reference

  1. ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000150760 - Ensembl, Květen 2017
  2. ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000058325 - Ensembl, Květen 2017
  3. ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  4. ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  5. ^ „Entrez Gene: DOCK1 dedicator cytokineze 1“.
  6. ^ Meller N, Merlot S, Guda C (listopad 2005). „Proteiny CZH: nová rodina Rho-GEF“. J. Cell Sci. 118 (Pt 21): 4937–46. doi:10.1242 / jcs.02671. PMID  16254241.
  7. ^ Hasegawa H, Kiyokawa E, Tanaka S a kol. (Duben 1996). „DOCK180, hlavní protein vázající CRK, mění morfologii buněk po translokaci na buněčnou membránu“. Mol. Buňka. Biol. 16 (4): 1770–76. doi:10,1128 / mcb.16.4.1770. PMC  231163. PMID  8657152.
  8. ^ Kiyokawa E, Hashimoto Y, Kobayashi S a kol. (Listopad 1998). „Aktivace Rac1 proteinem vázajícím se na Crk SH3, DOCK180“. Genes Dev. 12 (21): 3331–36. doi:10.1101 / gad.12.21.3331. PMC  317231. PMID  9808620.
  9. ^ A b Côté JF, Vuori K (prosinec 2002). „Identifikace evolučně konzervované nadrodiny proteinů souvisejících s DOCK180 s aktivitou výměny guaninových nukleotidů“. J. Cell Sci. 115 (Pt 24): 4901–13. doi:10.1242 / jcs.00219. PMID  12432077.
  10. ^ Côté JF, Motoyama AB, Bush JA a kol. (Srpen 2005). „Nová a evolučně konzervovaná PtdIns (3,4,5) P3-vazebná doména je nezbytná pro signalizaci DOCK180“. Nat. Cell Biol. 7 (8): 797–807. doi:10.1038 / ncb1280. PMC  1352170. PMID  16025104.
  11. ^ A b Brugnera E, Haney L, Grimsley C a kol. (Srpen 2002). „Nekonvenční aktivita Rac-GEF je zprostředkována komplexem Dock180-ELMO.“ Nat. Cell Biol. 4 (8): 574–82. doi:10.1038 / ncb824. PMID  12134158. S2CID  36363774.
  12. ^ Balagopalan L, Chen MH, Geisbrecht ER a kol. (Prosinec 2006). „Protein MBM nadrodiny MBC řídí fúzi myoblastů prostřednictvím mechanismu, který vyžaduje vazbu fosfatidylinositol 3,4,5-trifosfátu, ale je nezávislý na přímé interakci s DCrk.“. Mol. Buňka. Biol. 26 (24): 9442–55. doi:10.1128 / MCB.00016-06. PMC  1698515. PMID  17030600.
  13. ^ Lu M, Ravichandran KS (2006). "Spolupráce Dock180-ELMO při aktivaci Rac". Pervitin Enzymol. Metody v enzymologii. 406: 388–402. doi:10.1016 / S0076-6879 (06) 06028-9. ISBN  9780121828110. PMID  16472672.
  14. ^ Lu M, Kinchen JM, Rossman KL a kol. (2004). "PH doména funkcí ELMO v trans k regulaci aktivace Rac přes Dock180 ". Přírodní strukturní a molekulární biologie. 11 (8): 756–62. doi:10.1038 / nsmb800. PMID  15247908. S2CID  125990.
  15. ^ Lu M, Kinchen JM, Rossman KL a kol. (Únor 2005). „Sterický inhibiční model pro regulaci nukleotidové výměny prostřednictvím rodiny GEF Dock180“. Curr. Biol. 15 (4): 371–77. doi:10.1016 / j.cub.2005.01.050. PMID  15723800. S2CID  14267018.
  16. ^ Makino Y, Tsuda M, Ichihara S a kol. (Březen 2006). „Elmo1 inhibuje všudypřítomnost Dock180“. J. Cell Sci. 119 (Pt 5): 923–32. doi:10.1242 / jcs.02797. PMID  16495483.
  17. ^ Katoh H, Negishi M (červenec 2003). „RhoG aktivuje Rac1 přímou interakcí s proteinem vázajícím na Dock180 Elmo.“ Příroda. 424 (6947): 461–64. doi:10.1038 / nature01817. PMID  12879077. S2CID  4411133.
  18. ^ Smith HW, Marra P, Marshall CJ (srpen 2008). „uPAR podporuje vznik komplexu p130Cas – Crk k aktivaci Rac přes DOCK180“. J. Cell Biol. 182 (4): 777–90. doi:10.1083 / jcb.200712050. PMC  2518715. PMID  18725541.
  19. ^ Gumienny TL, Brugnera E, Tosello-Trampont AC a kol. (Říjen 2001). „CED-12 / ELMO, nový člen dráhy CrkII / Dock180 / Rac, je vyžadován pro fagocytózu a migraci buněk“ (PDF). Buňka. 107 (1): 27–41. doi:10.1016 / S0092-8674 (01) 00520-7. PMID  11595183. S2CID  15232864.
  20. ^ Katoh H, Yasui H, Yamaguchi Y a kol. (Říjen 2000). „Malý GTPase RhoG je klíčovým regulátorem pro růst neuritů v buňkách PC12“. Mol. Buňka. Biol. 20 (19): 7378–87. doi:10.1128 / MCB.20.19.7378-7387.2000. PMC  86291. PMID  10982854.
  21. ^ Moore CA, Parkin CA, Bidet Y a kol. (Září 2007). „Role homologů města Myoblast Dock1 a Dock5 a adaptorových proteinů Crk a Crk-like ve fúzi zebrafish myoblastů“. Rozvoj. 134 (17): 3145–53. doi:10,1242 / dev.001214. PMID  17670792.
  22. ^ Hara S, Kiyokawa E, Iemura SI a kol. (Červenec 2008). „Doména DHR1 DOCK180 se váže na SNX5 a reguluje transport kation-nezávislého 6-fosfátového receptoru nezávislého na kationu“. Mol. Biol. Buňka. 19 (9): 3823–35. doi:10,1091 / mbc.E08-03-0314. PMC  2526700. PMID  18596235.
  23. ^ Jarzynka MJ, Hu B, Hui KM a kol. (Srpen 2007). „ELMO1 a Dock180, bipartitní racanový výměnný faktor guaninových nukleotidů, podporují invazi lidských gliomů“. Cancer Res. 67 (15): 7203–11. doi:10.1158 / 0008-5472.CAN-07-0473. PMC  2867339. PMID  17671188.
  24. ^ A b C Hsia DA, Mitra SK, Hauck CR, Streblow DN, Nelson JA, Ilic D, Huang S, Li E, Nemerow GR, Leng J, Spencer KS, Cheresh DA, Schlaepfer DD (březen 2003). „Diferenciální regulace buněčné motility a invaze pomocí FAK“. J. Cell Biol. 160 (5): 753–67. doi:10.1083 / jcb.200212114. PMC  2173366. PMID  12615911.
  25. ^ A b Hasegawa H, Kiyokawa E, Tanaka S, Nagashima K, Gotoh N, Shibuya M, Kurata T, Matsuda M (duben 1996). „DOCK180, hlavní protein vázající CRK, mění morfologii buněk po translokaci na buněčnou membránu“. Mol. Buňka. Biol. 16 (4): 1770–6. doi:10.1128 / MCB.16.4.1770. PMC  231163. PMID  8657152.
  26. ^ Nishihara H, Kobayashi S, Hashimoto Y, Ohba F, Mochizuki N, Kurata T, Nagashima K, Matsuda M (listopad 1999). "Neadherentní buněčně specifická exprese DOCK2, člena proteinů lidské rodiny CDM". Biochim. Biophys. Acta. 1452 (2): 179–87. doi:10.1016 / s0167-4889 (99) 00133-0. PMID  10559471.
  27. ^ Gu J, Sumida Y, Sanzen N, Sekiguchi K (červenec 2001). „Laminin-10/11 a fibronektin odlišně regulují na integrinu závislou aktivaci Rho a Rac cestou p130 (Cas) -CrkII-DOCK180“. J. Biol. Chem. 276 (29): 27090–7. doi:10,1074 / jbc.M102284200. PMID  11369773.
  28. ^ Matsuda M, Ota S, Tanimura R, Nakamura H, Matuoka K, Takenawa T, Nagashima K, Kurata T (červen 1996). „Interakce mezi aminoterminální SH3 doménou CRK a jejími přirozenými cílovými proteiny“. J. Biol. Chem. 271 (24): 14468–72. doi:10.1074 / jbc.271.24.14468. PMID  8662907.
  29. ^ Gumienny TL, Brugnera E, Tosello-Trampont AC, Kinchen JM, Haney LB, Nishiwaki K, Walk SF, Nemergut ME, Macara IG, Francis R, Schedl T, Qin Y, Van Aelst L, Hengartner MO, Ravichandran KS (říjen 2001 ). „CED-12 / ELMO, nový člen dráhy CrkII / Dock180 / Rac, je vyžadován pro fagocytózu a migraci buněk“ (PDF). Buňka. 107 (1): 27–41. doi:10.1016 / s0092-8674 (01) 00520-7. PMID  11595183. S2CID  15232864.
  30. ^ Brugnera E, Haney L, Grimsley C, Lu M, Walk SF, Tosello-Trampont AC, Macara IG, Madhani H, Fink GR, Ravichandran KS (srpen 2002). „Nekonvenční aktivita Rac-GEF je zprostředkována komplexem Dock180-ELMO.“ Nat. Cell Biol. 4 (8): 574–82. doi:10.1038 / ncb824. PMID  12134158. S2CID  36363774.

Další čtení

externí odkazy