12. ARHGEF - ARHGEF12 - Wikipedia

12. ARHGEF
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1TXD, 1X86, 2OMJ, 2OS6
Identifikátory
Aliasy	12. ARHGEF, LARG, PRO2792, Rho guaninový nukleotidový výměnný faktor 12
Externí ID	OMIM: 604763 MGI: 1916882 HomoloGene: 9088 Genové karty: 12. ARHGEF
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 11 (lidský)
Konec	120,489,937 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 9 (myš)
Konec	43,107,239 bp
Exprese RNA vzor
	; ; ; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny; • Vazba na receptor spojený s G-proteinem; • GO: 0005097, GO: 0005099, GO: 0005100 Aktivátor aktivity GTPázy; • aktivita faktoru výměny guanyl-nukleotidů; • Aktivita výměnného faktoru Rho guanyl-nukleotid;
Buněčná složka	• cytoplazma; • cytosol; • extracelulární exosom; • membrána;
Biologický proces	• GO: 0032320, GO: 0032321, GO: 0032855, GO: 0043089, GO: 0032854 pozitivní regulace aktivity GTPázy; • regulace přenosu signálu proteinu Rho; • GO: 0007243 transdukce intracelulárního signálu; • regulace přenosu signálu zprostředkovaného malou GTPázou; • pozitivní regulace apoptotického procesu; • Signální dráha receptoru spřaženého s G-proteinem; • regulace molekulární funkce; • Rho proteinová signální transdukce;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	23365
	69632
	ENSG00000196914
	ENSMUSG00000059495
	Q9NZN5
	Q8R4H2
	NM_001198665; NM_001301084; NM_015313
	NM_027144; NM_001359232
	NP_001185594; NP_001288013; NP_056128
	NP_081420; NP_001346161
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Faktor výměny guaninového nukleotidu Rho 12 je protein že u lidí je kódován 12. ARHGEF gen.^[5]^[6]^[7] Tento protein se také nazývá RhoGEF12 nebo s leukemií spojený Rho guanin nukleotidový výměnný faktor (LARG).

Funkce

Rho guanin nukleotidový výměnný faktor 12 je guaninový nukleotidový výměnný faktor (GEF) pro RhoA malá GTPáza protein. ^[5] Rho je malá GTPáza protein, který je neaktivní, když je vázán k guanin nukleotid HDP. Ale když na něj působí proteiny Rho GEF, jako je RhoGEF1, je tento HDP uvolněn a nahrazen GTP, což vede k aktivnímu stavu Rho. V této aktivní konformaci vázané na GTP se Rho může vázat a aktivovat specificky efektor bílkoviny a enzymy regulovat buněčné funkce.^[8] Aktivní Rho je zejména hlavním regulátorem buňky aktin cytoskelet.^[8]

RhoGEF12 je členem skupiny čtyř proteinů RhoGEF, o nichž je známo, že jsou aktivovány Receptory spojené s G proteinem spojený s G₁₂ a G.₁₃ heterotrimerní G proteiny.^[9] Ostatní jsou ARHGEF1 (také známý jako p115-RhoGEF), 11. ARHGEF (také známý jako PDZ-RhoGEF) a AKAP13 (známé také jako ARHGEF13 a Lbc). ^[10]^[11] GPCR regulovaný RhoGEF12 (a tyto příbuzné proteiny GEF) působí jako efektor pro G₁₂ a G.₁₃ G proteiny. Kromě aktivace G₁₂ nebo G.₁₃ G proteiny, tři z těchto čtyř proteinů RhoGEF (ARHGEF1 / 11/12) také fungují jako Rodina RGS Proteiny aktivující GTPázu (GAP) ke zvýšení rychlosti GTP hydrolýzy G₁₂/G₁₃ alfa proteiny (které jsou samy o sobě proteiny GTPázy). Tato akce zvyšuje rychlost deaktivace G proteinu a omezuje dobu, po kterou tyto RhoGEF aktivují Rho.^[12]

Klinický význam

Je pozorováno, že tento protein tvoří myeloidní / lymfoidní fúzní partner Akutní myeloidní leukémie.^[7]

Interakce

ARHGEF12 bylo prokázáno komunikovat s:

Viz také

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000196914 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání Ensembl 89: ENSMUSG00000059495 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b Kourlas PJ, Strout MP, Becknell B, Veronese ML, Croce CM, Theil KS a kol. (Únor 2000). „Identifikace genu na 11q23 kódujícího faktor výměny guaninového nukleotidu: důkazy o jeho fúzi s MLL u akutní myeloidní leukémie“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 97 (5): 2145–50. doi:10.1073 / pnas.040569197. PMC 15768. PMID 10681437.
^ Nagase T, Ishikawa K, Nakajima D, Ohira M, Seki N, Miyajima N a kol. (Duben 1997). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. VII. Kompletní sekvence 100 nových cDNA klonů z mozku, které mohou kódovat velké proteiny in vitro“. Výzkum DNA. 4 (2): 141–50. doi:10.1093 / dnares / 4.2.141. PMID 9205841.
^ ^A ^b „Entrez Gene: ARHGEF12 Rho guaninový nukleotidový výměnný faktor (GEF) 12“.
^ ^A ^b Thumkeo D, Watanabe S, Narumiya S (říjen – listopad 2013). "Fyziologické role Rho a Rho efektorů u savců". European Journal of Cell Biology. 92 (10–11): 303–15. doi:10.1016 / j.ejcb.2013.09.002. PMID 24183240.
^ Booden MA, Siderovski DP, Der CJ (červen 2002). „Faktor guininového nukleotidu souvisejícího s leukémií podporuje aktivaci RhoA spojenou s G alfa q“. Molekulární a buněčná biologie. 22 (12): 4053–61. doi:10.1128 / mcb.22.12.4053-4061.2002. PMC 133844. PMID 12024019.
^ Fukuhara S, Chikumi H, Gutkind JS (březen 2001). „RhoSF obsahující RGS: chybějící spojení mezi transformujícími se G proteiny a Rho?“. Onkogen. 20 (13): 1661–8. doi:10.1038 / sj.onc.1204182. PMID 11313914.
^ Diviani D, Soderling J, Scott JD (listopad 2001). „AKAP-Lbc ukotví proteinovou kinázu A a nukleázy Galpha 12-selektivní tvorbu stresových vláken zprostředkovanou Rho“. The Journal of Biological Chemistry. 276 (47): 44247–57. doi:10,1074 / jbc.M106629200. PMID 11546812.
^ Kozasa T (duben 2001). "Regulace signální transdukce zprostředkované G proteinem proteiny RGS". Humanitní vědy. 68 (19–20): 2309–17. doi:10.1016 / S0024-3205 (01) 01020-7. PMID 11358341.
^ ^A ^b Fukuhara S, Chikumi H, Gutkind JS (listopad 2000). „S leukemií spojený Rho guanin nukleotidový výměnný faktor (LARG) spojuje heterotrimerní G proteiny rodiny G (12) s Rho“. FEBS Dopisy. 485 (2–3): 183–8. doi:10.1016 / S0014-5793 (00) 02224-9. PMID 11094164. S2CID 7300556.
^ ^A ^b ^C ^d Suzuki N, Nakamura S, Mano H, Kozasa T (leden 2003). „Galpha 12 aktivuje Rho GTPázu prostřednictvím RhoGEF spojeného s tyrosinem fosforylovanou leukémií“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 100 (2): 733–8. doi:10.1073 / pnas.0234057100. PMC 141065. PMID 12515866.
^ Taya S, Inagaki N, Sengiku H, Makino H, Iwamatsu A, Urakawa I a kol. (Listopad 2001). „Přímá interakce receptoru růstového faktoru 1 podobného inzulínu s RhoGEF spojeným s leukémií“. The Journal of Cell Biology. 155 (5): 809–20. doi:10.1083 / jcb.200106139. PMC 2150867. PMID 11724822.
^ Hirotani M, Ohoka Y, Yamamoto T, Nirasawa H, Furuyama T, Kogo M a kol. (Září 2002). „Interakce plexinu-B1 s výměnnými faktory guaninových nukleotidů Rho obsahujících doménu PDZ“. Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 297 (1): 32–7. doi:10.1016 / S0006-291X (02) 02122-8. PMID 12220504.
^ Reuther GW, Lambert QT, Booden MA, Wennerberg K, Becknell B, Marcucci G a kol. (Červenec 2001). „Faktor guininového nukleotidu pro výměnu asociovaný s leukémií, protein rodiny Dbl nalezený mutovaný v leukémii, způsobuje transformaci aktivací RhoA“. The Journal of Biological Chemistry. 276 (29): 27145–51. doi:10,1074 / jbc.M103565200. PMID 11373293.

Další čtení

Fukuhara S, Chikumi H, Gutkind JS (listopad 2000). „S leukemií spojený Rho guanin nukleotidový výměnný faktor (LARG) spojuje heterotrimerní G proteiny rodiny G (12) s Rho“. FEBS Dopisy. 485 (2–3): 183–8. doi:10.1016 / S0014-5793 (00) 02224-9. PMID 11094164. S2CID 7300556.
Reuther GW, Lambert QT, Booden MA, Wennerberg K, Becknell B, Marcucci G a kol. (Červenec 2001). „Faktor guininového nukleotidu pro výměnu asociovaný s leukémií, protein rodiny Dbl nalezený mutovaný v leukémii, způsobuje transformaci aktivací RhoA“. The Journal of Biological Chemistry. 276 (29): 27145–51. doi:10,1074 / jbc.M103565200. PMID 11373293.
Taya S, Inagaki N, Sengiku H, Makino H, Iwamatsu A, Urakawa I a kol. (Listopad 2001). „Přímá interakce receptoru růstového faktoru 1 podobného inzulínu s RhoGEF spojeným s leukémií“. The Journal of Cell Biology. 155 (5): 809–20. doi:10.1083 / jcb.200106139. PMC 2150867. PMID 11724822.
Chikumi H, Fukuhara S, Gutkind JS (duben 2002). „Regulace faktorů výměny guaninových nukleotidů vázaných na G proteiny pro Rho, PDZ-RhoGEF a LARG pomocí fosforylace tyrosinu: důkazy o roli fokální adhezní kinázy“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (14): 12463–73. doi:10,1074 / jbc.M108504200. PMID 11799111.
Perrot V, Vazquez-Prado J, Gutkind JS (listopad 2002). „Plexin B reguluje Rho prostřednictvím guaninových nukleotidových výměnných faktorů leukemií asociovaných Rho GEF (LARG) a PDZ-RhoGEF“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (45): 43115–20. doi:10,1074 / jbc.M206005200. PMID 12183458.
Aurandt J, Vikis HG, Gutkind JS, Ahn N, Guan KL (září 2002). „Semaforinový receptor plexin-B1 signalizuje přímou interakcí s Rho-specifickým nukleotidovým výměnným faktorem, LARG“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 99 (19): 12085–90. doi:10.1073 / pnas.142433199. PMC 129402. PMID 12196628.
Hirotani M, Ohoka Y, Yamamoto T, Nirasawa H, Furuyama T, Kogo M a kol. (Září 2002). "Interakce plexinu-B1 s výměnnými faktory guaninových nukleotidů Rho obsahujících doménu PDZ". Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 297 (1): 32–7. doi:10.1016 / S0006-291X (02) 02122-8. PMID 12220504.
Driessens MH, Olivo C, Nagata K, Inagaki M, Collard JG (říjen 2002). "B plexiny aktivují Rho prostřednictvím PDZ-RhoGEF". FEBS Dopisy. 529 (2–3): 168–72. doi:10.1016 / S0014-5793 (02) 03323-9. PMID 12372594. S2CID 26525009.
Wennerberg K, Ellerbroek SM, Liu RY, Karnoub AE, Burridge K, Der CJ (prosinec 2002). "RhoG signály paralelně s Rac1 a Cdc42". The Journal of Biological Chemistry. 277 (49): 47810–7. doi:10,1074 / jbc.M203816200. PMID 12376551.
Suzuki N, Nakamura S, Mano H, Kozasa T (leden 2003). „Galpha 12 aktivuje Rho GTPázu prostřednictvím RhoGEF spojeného s tyrosinem fosforylovanou leukémií“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 100 (2): 733–8. doi:10.1073 / pnas.0234057100. PMC 141065. PMID 12515866.
Chikumi H, Barac A, Behbahani B, Gao Y, Teramoto H, Zheng Y, Gutkind JS (leden 2004). „Homo- a hetero-oligomerizace PDZ-RhoGEF, LARG a p115RhoGEF pomocí jejich C-koncové oblasti reguluje jejich aktivitu Rho GEF in vivo a transformační potenciál“. Onkogen. 23 (1): 233–40. doi:10.1038 / sj.onc.1207012. PMID 14712228.
Wang Q, Liu M, Kozasa T, Rothstein JD, Sternweis PC, Neubig RR (červenec 2004). „Receptory trombinu a kyseliny lysofosfatidové využívají odlišné rhoGEF v buňkách rakoviny prostaty“. The Journal of Biological Chemistry. 279 (28): 28831–4. doi:10.1074 / jbc.C400105200. PMID 15143072.
Kristelly R, Gao G, Tesmer JJ (listopad 2004). "Strukturní determinanty vazby RhoA a nukleotidové výměny u leukemie spojeného faktoru výměny guanin-nukleotid Rho". The Journal of Biological Chemistry. 279 (45): 47352–62. doi:10,1074 / jbc.M406056200. PMID 15331592.
Ballif BA, Villén J, Beausoleil SA, Schwartz D, Gygi SP (listopad 2004). „Fosfoproteomická analýza vyvíjejícího se myšího mozku“. Molekulární a buněčná proteomika. 3 (11): 1093–101. doi:10,1074 / mcp.M400085-MCP200. PMID 15345747.
Okuhira K, Fitzgerald ML, Sarracino DA, Manning JJ, Bell SA, Goss JL, Freeman MW (listopad 2005). „Čištění transportéru A1 vázajícího kazetu ATP a přidružených vazebných proteinů odhaluje význam beta1-syntropinu při odtoku cholesterolu“. The Journal of Biological Chemistry. 280 (47): 39653–64. doi:10,1074 / jbc.M510187200. PMID 16192269.
Goto M, Muramatsu H, Mihara H, Kurihara T, Esaki N, Omi R a kol. (Prosinec 2005). „Krystalové struktury Delta1-piperidein-2-karboxylátu / Delta1-pyrrolin-2-karboxylát reduktázy patřící do nové rodiny oxidoreduktáz závislých na NAD (P) H: konformační změna, rozpoznávání substrátu a stereochemie reakce“. The Journal of Biological Chemistry. 280 (49): 40875–84. doi:10,1074 / jbc.M507399200. PMID 16192274.
Bourguignon LY, Gilad E, Brightman A, Diedrich F, Singleton P (květen 2006). „Interakce hyaluronan-CD44 s leukemií asociovaným RhoGEF a receptorem pro epidermální růstový faktor podporuje ko-aktivaci Rho / Ras, signalizaci fosfolipázy C epsilon-Ca2 + a modifikaci cytoskeletu v buňkách karcinomu dlaždicových buněk hlavy a krku“. The Journal of Biological Chemistry. 281 (20): 14026–40. doi:10,1074 / jbc.M507734200. PMID 16565089.

externí odkazy

Člověk 12. ARHGEF umístění genomu a 12. ARHGEF stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

Tento článek o gen na lidský chromozom 11 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000196914 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání Ensembl 89: ENSMUSG00000059495 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid10681437-5] A ^b Kourlas PJ, Strout MP, Becknell B, Veronese ML, Croce CM, Theil KS a kol. (Únor 2000). „Identifikace genu na 11q23 kódujícího faktor výměny guaninového nukleotidu: důkazy o jeho fúzi s MLL u akutní myeloidní leukémie“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 97 (5): 2145–50. doi:10.1073 / pnas.040569197. PMC 15768. PMID 10681437.

[pmid9205841-6] Nagase T, Ishikawa K, Nakajima D, Ohira M, Seki N, Miyajima N a kol. (Duben 1997). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. VII. Kompletní sekvence 100 nových cDNA klonů z mozku, které mohou kódovat velké proteiny in vitro“. Výzkum DNA. 4 (2): 141–50. doi:10.1093 / dnares / 4.2.141. PMID 9205841.

[entrez-7] A ^b „Entrez Gene: ARHGEF12 Rho guaninový nukleotidový výměnný faktor (GEF) 12“.

[”pmid24183240”-8] A ^b Thumkeo D, Watanabe S, Narumiya S (říjen – listopad 2013). "Fyziologické role Rho a Rho efektorů u savců". European Journal of Cell Biology. 92 (10–11): 303–15. doi:10.1016 / j.ejcb.2013.09.002. PMID 24183240.

[”pmid12024019”-9] Booden MA, Siderovski DP, Der CJ (červen 2002). „Faktor guininového nukleotidu souvisejícího s leukémií podporuje aktivaci RhoA spojenou s G alfa q“. Molekulární a buněčná biologie. 22 (12): 4053–61. doi:10.1128 / mcb.22.12.4053-4061.2002. PMC 133844. PMID 12024019.

[pmid11313914-10] Fukuhara S, Chikumi H, Gutkind JS (březen 2001). „RhoSF obsahující RGS: chybějící spojení mezi transformujícími se G proteiny a Rho?“. Onkogen. 20 (13): 1661–8. doi:10.1038 / sj.onc.1204182. PMID 11313914.

[”pmid11546812”-11] Diviani D, Soderling J, Scott JD (listopad 2001). „AKAP-Lbc ukotví proteinovou kinázu A a nukleázy Galpha 12-selektivní tvorbu stresových vláken zprostředkovanou Rho“. The Journal of Biological Chemistry. 276 (47): 44247–57. doi:10,1074 / jbc.M106629200. PMID 11546812.

[”pmid11358341”-12] Kozasa T (duben 2001). "Regulace signální transdukce zprostředkované G proteinem proteiny RGS". Humanitní vědy. 68 (19–20): 2309–17. doi:10.1016 / S0024-3205 (01) 01020-7. PMID 11358341.

[pmid11094164-13] A ^b Fukuhara S, Chikumi H, Gutkind JS (listopad 2000). „S leukemií spojený Rho guanin nukleotidový výměnný faktor (LARG) spojuje heterotrimerní G proteiny rodiny G (12) s Rho“. FEBS Dopisy. 485 (2–3): 183–8. doi:10.1016 / S0014-5793 (00) 02224-9. PMID 11094164. S2CID 7300556.

[pmid12515866-14] A ^b ^C ^d Suzuki N, Nakamura S, Mano H, Kozasa T (leden 2003). „Galpha 12 aktivuje Rho GTPázu prostřednictvím RhoGEF spojeného s tyrosinem fosforylovanou leukémií“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 100 (2): 733–8. doi:10.1073 / pnas.0234057100. PMC 141065. PMID 12515866.

[pmid11724822-15] Taya S, Inagaki N, Sengiku H, Makino H, Iwamatsu A, Urakawa I a kol. (Listopad 2001). „Přímá interakce receptoru růstového faktoru 1 podobného inzulínu s RhoGEF spojeným s leukémií“. The Journal of Cell Biology. 155 (5): 809–20. doi:10.1083 / jcb.200106139. PMC 2150867. PMID 11724822.

[pmid12220504-16] Hirotani M, Ohoka Y, Yamamoto T, Nirasawa H, Furuyama T, Kogo M a kol. (Září 2002). „Interakce plexinu-B1 s výměnnými faktory guaninových nukleotidů Rho obsahujících doménu PDZ“. Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 297 (1): 32–7. doi:10.1016 / S0006-291X (02) 02122-8. PMID 12220504.

[pmid11373293-17] Reuther GW, Lambert QT, Booden MA, Wennerberg K, Becknell B, Marcucci G a kol. (Červenec 2001). „Faktor guininového nukleotidu pro výměnu asociovaný s leukémií, protein rodiny Dbl nalezený mutovaný v leukémii, způsobuje transformaci aktivací RhoA“. The Journal of Biological Chemistry. 276 (29): 27145–51. doi:10,1074 / jbc.M103565200. PMID 11373293.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]

[16]

[17]