ARHGEF7 - ARHGEF7
Faktor výměny guaninového nukleotidu Rho 7 je protein že u lidí je kódován ARHGEF7 gen.[5][6][7][8]
ARHGEF7 je obecně známý jako p21-Activated protein kinase eXzměnit faktor alfa (beta-PIX nebo βPIX), protože byl identifikován vazbou na kináza aktivovaná p21 (PAK) a také obsahuje a guaninový nukleotidový výměnný faktor doména.[6]
Domény a funkce
βPIX je protein s více doménami, který funguje jako a signalizace protein lešení a jako enzym.[9] βPIX sdílí tuto doménovou strukturu a signalizační funkci s velmi podobnými ARHGEF6 / αPIX protein.
βPIX prochází rozsáhlým alternativním sestřihem, aby generoval více variantních proteinů obsahujících nebo postrádajících konkrétní proteinové domény.[9] Všechny dospělé formy postrádají aminoterminální CH doménu a dvě hlavní varianty pro dospělé mají alternativní karboxylovou koncovou oblast (označovanou jako β1 a β2): formy β1 obsahují doménu trimerace ve svinuté cívce a cílový motiv PDZ pro vazbu na proteiny PDZ (viz níže), zatímco formy β2 postrádají obě domény a jejich odpovídající funkce.[9]
βPIX obsahuje centrální DH / PH doména RhoGEF který funguje jako a guaninový nukleotidový výměnný faktor (GEF) pro malé GTPasy z Rho rodina a konkrétně Rac a Cdc42.[6] Stejně jako ostatní GEF může i βPIX podporovat obě uvolňování HDP z neaktivního malého proteinu vázajícího GTP a vazby GTP na podporu jeho aktivace. Signální lešení se váží na konkrétní partnery, aby podpořili efektivní transdukci signálu uspořádáním sekvenčních prvků dráhy blízko sebe, aby se usnadnil interakce / přenos informací, a také tím, že drží tyto komplexy partnerských proteinů na konkrétních místech v buňce, aby podporovaly místní nebo regionální signalizaci. V případě βPIX je to SH3 doména váže se na partnerské proteiny s vhodnými motivy polyprolinu, zejména na skupinu I. kinázy aktivované p21 (PAK) (PAK1, PAK2 a PAK3 ).[6] PAK je v neaktivním stavu vázán na doménu βPIX SH3 a aktivovaná vazba Rac1 nebo Cdc42 na tento PAK stimuluje jeho protein kináza aktivita vedoucí k downstream cílovému proteinu fosforylace; protože βPIX může aktivovat malé „G21“ pTP „p21“ Rac1 nebo Cdc42 prostřednictvím své aktivity GEF, je tento komplex βPIX / PAK / Rac příkladem funkce lešení.
Strukturálně se βPIX sestavuje jako trimer přes karboxylovou koncovou doménu cívkové cívky, která je přítomna v hlavní karboxylové koncové spojovací variantě β1, a dále interaguje s dimery GIT1 nebo GIT2 prostřednictvím blízké domény vázající GIT za vzniku oligomerních komplexů GIT-PIX.[9] Prostřednictvím tohoto komplexu GIT-PIX je funkce lešení βPIX zesílena také schopností držet partnery GIT v blízkosti partnerů βPIX. Naproti tomu variantám β2 karboxylových terminálů tato oblast stočené cívky chybí a předpokládá se, že nebudou schopny trimerovat. Hlavní varianta karboxylového terminálu β1 má také a Doména PDZ vazebný cílový motiv, který se váže na PDZ domény v SHANK1,[10] čmáranice,[11] a SNX27[12] bílkoviny. Některé sestřihové varianty βPIX obsahují amino-konec Doména kalponinové homologie (CH) jejichž funkce zůstávají relativně špatně definované, ale mohou s nimi interagovat rodina parvin / affixin bílkoviny. [13][9] Varianty βPIX s touto prodlouženou aminoterminální CH doménou jsou nejvíce vysoce exprimovány na počátku vývoje, ale po narození se objevují vzácně.[9]
Interakce
Bylo hlášeno, že βPIX interaguje s více než 120 proteiny.[9][14]
Mezi hlavní interagující proteiny patří:
- Sám nebo velmi příbuzný ARHGEF6 / αPIX prostřednictvím trimerické interakce cívka-cívka.
- GIT1 nebo GIT2 dimery přes GIT-vazebnou doménu.
- kinázy aktivované p21 (PAK) 1, 2 a 3 přes doménu SH3.
- c-Cbl přes doménu SH3.
- Rodina Rho rodina proteinů vázajících GTP členů Rac1 a Cdc42, aktivováno prostřednictvím DHPH RhoGEF doména.
- Neuronální synapse adaptéry SHANK1, SHANK2, a SHANK3 přes PDZ
- Čmáranice přes PDZ
- SNX27 přes PDZ
Viz také
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000102606 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000031511 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ Oh WK, Yoo JC, Jo D, Song YH, Kim MG, Park D (červenec 1997). „Klonování proteinu bohatého na prolin SH3, p85SPR a jeho lokalizace v ohniskové adhezi“. Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 235 (3): 794–798. doi:10.1006 / bbrc.1997.6875. PMID 9207241.
- ^ A b C d Manser E, Loo TH, Koh CG, Zhao ZS, Chen XQ, Tan L, Tan I, Leung T, Lim L (červenec 1998). „PAK kinázy jsou přímo navázány na rodinu PIX nukleotidových výměnných faktorů“. Molekulární buňka. 1 (2): 183–192. doi:10.1016 / S1097-2765 (00) 80019-2. PMID 9659915.
- ^ Bagrodia S, Taylor SJ, Jordon KA, Van Aelst L, Cerione RA (říjen 1998). „Nový regulátor kináz aktivovaných p21“. Journal of Biological Chemistry. 273 (37): 23633–23636. doi:10.1074 / jbc.273.37.23633. PMID 9726964.
- ^ „Entrez Gene: ARHGEF7 Rho guaninový nukleotidový výměnný faktor (GEF) 7“.
- ^ A b C d E F G Zhou W, Li X, Premont RT (květen 2016). „Rozšiřující funkce proteinů aktivujících GIT Arf GTPázu, PIX Rho guaninové nukleotidové výměnné faktory a komplexy GIT-PIX“. Journal of Cell Science. 129 (10): 1963–1974. doi:10.1242 / jcs.179465. PMC 6518221. PMID 27182061.
- ^ Park E, Na M, Choi J, Kim S, Lee JR, Yoon J, Park D, Sheng M, Kim E (2003). „Rodina Shankových proteinů postsynaptické hustoty interaguje s a podporuje synaptickou akumulaci beta PIX guaninového nukleotidového výměnného faktoru pro Rac1 a Cdc42“. J. Biol. Chem. 278 (21): 19220–9. doi:10,1074 / jbc.M301052200. PMID 12626503.
- ^ Audebert S, Navarro C, Nourry C, Chasserot-Golaz S, Lecine P, Bellaiche Y, Dupont JL, Premont RT, Sempere C, Strub JM, Van Dorsselaer A, Vitale N, Borg JP (červen 2004). „Mammalian Scribble tvoří těsný komplex s směnným faktorem betaPIX“. Aktuální biologie. 14 (11): 987–995. doi:10.1016 / j.cub.2004.05.051. PMID 15182672.
- ^ Valdes JL, Tang J, McDermott MI, Kuo JC, Zimmerman SP, Wincovitch SM, Waterman CM, Milgram SL, Playford MP (listopad 2011). „Třídění proteinu nexinu 27 reguluje přenos komplexu výměnného faktoru (P-Pix) -G interagujícího s proteinovým receptorem spojeným s proteinem (GIT) prostřednictvím interakce s doménou PDZ“. Journal of Biological Chemistry. 286 (45): 39403–39416. doi:10,1074 / jbc.M111.260802. PMC 3234764. PMID 21926430.
- ^ Rosenberger G, Jantke I, Gal A, Kutsche K (2003). „Interakce alphaPIX (ARHGEF6) s beta-parvinem (PARVB) naznačuje zapojení alphaPIX do integrinem zprostředkované signalizace“. Lidská molekulární genetika. 12 (2): 155–167. doi:10,1093 / hmg / ddg019. PMID 12499396.
- ^ „ARHGEF7 Result Summary“.
Další čtení
- Turner CE, Brown MC, Perrotta JA, Riedy MC, Nikolopoulos SN, McDonald AR, Bagrodia S, Thomas S, Leventhal PS (1999). „Motiv Paxillin LD4 váže PAK a PIX prostřednictvím nové ankyrinové repetice 95 kD, proteinu ARF-GAP: Role v remodelaci cytoskeletu“. J. Cell Biol. 145 (4): 851–63. doi:10.1083 / jcb.145.4.851. PMC 2133183. PMID 10330411.
- Bagrodia S, Bailey D, Lenard Z, Hart M, Guan JL, Premont RT, Taylor SJ, Cerione RA (1999). „Tyrosin-fosforylovaný protein, který se váže na důležitou regulační oblast v chladné rodině proteinů vázajících kinázu p21“. J. Biol. Chem. 274 (32): 22393–400. doi:10.1074 / jbc.274.32.22393. PMID 10428811.
- Premont RT, Claing A, Vitale N, Perry SJ, Lefkowitz RJ (2000). "Rodina GIT proteinů aktivujících ADP-ribosylační faktor GTPázu. Funkční rozmanitost GIT2 prostřednictvím alternativního sestřihu". J. Biol. Chem. 275 (29): 22373–80. doi:10.1074 / jbc.275.29.22373. PMID 10896954.
- Ku GM, Yablonski D, Manser E, Lim L, Weiss A (2001). „Komplex PAK1-PIX-PKL je aktivován receptorem T-buněk nezávisle na Nck, Slp-76 a LAT“. EMBO J.. 20 (3): 457–65. doi:10.1093 / emboj / 20.3.457. PMC 133476. PMID 11157752.
- Koh CG, Tan EJ, Manser E, Lim L (2002). „Kináza PAK aktivovaná p21 je negativně regulována POPX1 a POPX2, párem serin / threonin fosfatáz rodiny PP2C.“ Curr. Biol. 12 (4): 317–21. doi:10.1016 / S0960-9822 (02) 00652-8. PMID 11864573.
- Brown MC, West KA, Turner CE (2002). „Linker paxillin-dependentní paxillin kinázy a lokalizace kinázy aktivované p21 na fokální adheze zahrnuje vícestupňovou aktivační cestu“. Mol. Biol. Buňka. 13 (5): 1550–65. doi:10.1091 / mbc.02-02-0015. PMC 111126. PMID 12006652.
- Shin EY, Shin KS, Lee CS, Woo KN, Quan SH, Soung NK, Kim YG, Cha CI, Kim SR, Park D, Bokoch GM, Kim EG (2003). „Fosforylace p85 beta PIX, výměnného faktoru guaninového nukleotidu specifického pro Rac / Cdc42, cestou Ras / ERK / PAK2 je nutná pro růst neuritů vyvolaný základním fibroblastovým růstovým faktorem.“. J. Biol. Chem. 277 (46): 44417–30. doi:10,1074 / jbc.M203754200. PMID 12226077.
- Rosenberger G, Jantke I, Gal A, Kutsche K (2003). „Interakce alphaPIX (ARHGEF6) s beta-parvinem (PARVB) naznačuje zapojení alphaPIX do integrinem zprostředkované signalizace“. Hučení. Mol. Genet. 12 (2): 155–67. doi:10,1093 / hmg / ddg019. PMID 12499396.
- Mignone F, Grillo G, Liuni S, Pesole G (2003). „Výpočetní identifikace potenciálu kódování proteinu konzervovaných sekvenčních značek prostřednictvím mezidruhové evoluční analýzy“. Nucleic Acids Res. 31 (15): 4639–45. doi:10.1093 / nar / gkg483. PMC 169873. PMID 12888525.
- Yamamoto Y, Fujimoto Y, Arai R, Fujie M, Usami S, Yamada T (2003). „Obnova telomer Chlorella zprostředkovaná retrotransposonem: akumulace retrotranspozonů Zepp na koncích nově vytvořených minichromozomů“. Nucleic Acids Res. 31 (15): 4646–53. doi:10,1093 / nar / gkg490. PMC 169880. PMID 12888526.
- Flanders JA, Feng Q, Bagrodia S, Laux MT, Singavarapu A, Cerione RA (2003). „Cbl proteiny jsou vazebnými partnery pro rodinu Cool / Pix proteinů vázajících kinázu aktivovanou p21“. FEBS Lett. 550 (1–3): 119–23. doi:10.1016 / S0014-5793 (03) 00853-6. PMID 12935897.
- Shin EY, Woo KN, Lee CS, Koo SH, Kim YG, Kim WJ, Bae CD, Chang SI, Kim EG (2004). „Základní fibroblastový růstový faktor stimuluje aktivaci Rac1 cestou závislou na fosforylaci p85 betaPIX“. J. Biol. Chem. 279 (3): 1994–2004. doi:10,1074 / jbc.M307330200. PMID 14557270.
- Lim CS, Kim SH, Jung JG, Kim JK, Song WK (2004). „Regulace fosforylace SPIN90 a interakce s Nck pomocí ERK a adheze buněk“. J. Biol. Chem. 278 (52): 52116–23. doi:10,1074 / jbc.M310974200. PMID 14559906.
externí odkazy
- ARHGEF7 Informace s odkazy v Brána pro migraci buněk
- Člověk ARHGEF7 umístění genomu a ARHGEF7 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.
- Člověk PAK3 umístění genomu a PAK3 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.
Galerie PDB | |
|---|---|
|
 | Tento článek o gen na lidský chromozom 13 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |