AKAP13 - AKAP13
A-kinázový kotevní protein 13 je protein že u lidí je kódován AKAP13 gen.[5][6][7] Tento protein se také nazývá AKAP-Lbc, protože kóduje blastovou krizi lymfocytů (Lbc) onkogen, a ARHGEF13 / RhoGEF13, protože obsahuje a guaninový nukleotidový výměnný faktor (GEF) doména pro RhoA malý protein vázající GTP.
Funkce
A-kinázový kotevní protein 13 / Rho guanin nukleotidový výměnný faktor 13 je guaninový nukleotidový výměnný faktor (GEF) pro RhoA malá GTPáza protein.[8][9] Rho je malá GTPáza protein, který je neaktivní, když je vázán k guanin nukleotid HDP. Pokud se však jedná o proteiny Rho GEF, jako je AKAP13, je tento HDP uvolněn a nahrazen GTP, což vede k aktivnímu stavu Rho. V této aktivní konformaci vázané na GTP se Rho může vázat a aktivovat specificky efektor bílkoviny a enzymy regulovat buněčné funkce.[10] Aktivní Rho je zejména hlavním regulátorem buňky aktin cytoskelet.[10]
AKAP13 je členem skupiny čtyř proteinů RhoGEF, o nichž je známo, že jsou aktivovány Receptory spojené s G proteinem spojený s G12 a G.13 heterotrimerní G proteiny.[8][9] Ostatní jsou ARHGEF1 (také známý jako p115-RhoGEF), 11. ARHGEF (také známý jako PDZ-RhoGEF) a 12. ARHGEF (také známý jako LARG). [11][8] AKCR13 regulovaný GPCR (a tyto příbuzné proteiny GEF) působí jako efektor pro G12 a G.13 G proteiny. Na rozdíl od ostatních tří členů AKAP13 nefunguje jako Rodina RGS Proteiny aktivující GTPázu (GAP) ke zvýšení rychlosti GTP hydrolýzy G12/G13 alfa proteiny.[12]
A-kinázové kotvící proteiny (AKAP) jsou skupina strukturně odlišných proteinů, které mají společnou funkci vazby na regulační podjednotku proteinové kinázy A (PKA), čímž omezují holoenzym na diskrétní místa v buňce. Gen AKAP13 kóduje člena rodiny AKAP, protože protein se pevně váže na PKA, zejména v srdci.
Alternativní sestřih tohoto genu vede k alespoň 3 variantám transkriptu kódujícím různé izoformy. Všechny tři obsahují Doména Dbl onkogenní homologie (DH) plus doména Pleckstrinovy homologie (PH) (doména DH / PH) charakteristický pro GEF rodiny Rho, zatímco pouze delší dvě izoformy také obsahují doménu AKAP.[7] Proto tyto izoformy mohou fungovat jako lešení pro koordinaci signalizace Rho a signalizace proteinkinázy A.
Interakce
AKAP13 bylo prokázáno komunikovat s:
Viz také
- Druhý poselský systém
- Receptor spojený s G proteinem
- Heterotrimerický G protein
- Malé GTPasy
- Rodina Rho GTPas
- Protein kináza A
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000170776 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000066406 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ A b Rubino D, Driggers P, Arbit D, Kemp L, Miller B, Coso O a kol. (Květen 1998). „Charakterizace Brx, nového člena rodiny Dbl, který moduluje působení estrogenových receptorů“. Onkogen. 16 (19): 2513–26. doi:10.1038 / sj.onc.1201783. PMID 9627117.
- ^ Carr DW, Stofko-Hahn RE, Fraser ID, Bishop SM, Acott TS, Brennan RG, Scott JD (srpen 1991). „Interakce regulační podjednotky (RII) cAMP-dependentní proteinové kinázy s RII-kotvícími proteiny probíhá prostřednictvím amfipatického motivu vázání šroubovice“. The Journal of Biological Chemistry. 266 (22): 14188–92. PMID 1860836.
- ^ A b „Entrez Gene: AKAP13 A kinase (PRKA) anchor protein 13“.
- ^ A b C Diviani D, Soderling J, Scott JD (listopad 2001). „AKAP-Lbc ukotví proteinovou kinázu A a nukleázy Galpha 12-selektivní tvorbu stresových vláken zprostředkovanou Rho“. The Journal of Biological Chemistry. 276 (47): 44247–57. doi:10,1074 / jbc.M106629200. PMID 11546812.
- ^ A b C d Dutt P, Nguyen N, Toksoz D (únor 2004). "Role Lbc RhoGEF v Galpha12 / 13-indukovaných signálech k Rho GTPase". Mobilní signalizace. 16 (2): 201–9. doi:10.1016 / S0898-6568 (03) 00132-3. PMID 14636890.
- ^ A b Thumkeo D, Watanabe S, Narumiya S (říjen – listopad 2013). "Fyziologické role Rho a Rho efektorů u savců". European Journal of Cell Biology. 92 (10–11): 303–15. doi:10.1016 / j.ejcb.2013.09.002. PMID 24183240.
- ^ Fukuhara S, Chikumi H, Gutkind JS (březen 2001). „RhoSF obsahující RGS: chybějící spojení mezi transformujícími se G proteiny a Rho?“. Onkogen. 20 (13): 1661–8. doi:10.1038 / sj.onc.1204182. PMID 11313914.
- ^ Kozasa T (duben 2001). "Regulace signální transdukce zprostředkované G proteinem proteiny RGS". Humanitní vědy. 68 (19–20): 2309–17. doi:10.1016 / S0024-3205 (01) 01020-7. PMID 11358341.
- ^ Park B, Nguyen NT, Dutt P, Merdek KD, Bashar M, Sterpetti P a kol. (Listopad 2002). „Sdružení Lbc Rho guaninového nukleotidového výměnného faktoru s proteinem souvisejícím s alfa-kateninem, alfa-katulinem / CTNNAL1, podporuje aktivaci faktoru sérových odpovědí“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (47): 45361–70. doi:10,1074 / jbc.M202447200. PMID 12270917.
- ^ Alto NM, Soderling SH, Hoshi N, Langeberg LK, Fayos R, Jennings PA, Scott JD (duben 2003). „Bioinformatický design proteinu kotvícího A-kinázu in silico: silný a selektivní peptidový antagonista ukotvení proteinové kinázy A typu II“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 100 (8): 4445–50. doi:10.1073 / pnas.0330734100. PMC 153575. PMID 12672969.
- ^ Carr DW, Hausken ZE, Fraser ID, Stofko-Hahn RE, Scott JD (červenec 1992). "Sdružení proteinové kinázy závislé na cAMP typu II s proteinem kotvícím RII lidské štítné žlázy. Klonování a charakterizace domény vázající RII". The Journal of Biological Chemistry. 267 (19): 13376–82. PMID 1618839.
externí odkazy
- Člověk AKAP13 umístění genomu a AKAP13 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.
- Přehled všech strukturálních informací dostupných v PDB pro UniProt: Q12802 (Kotvící protein A-kinázy 13) na PDBe-KB.
Další čtení
- Hausken ZE, Coghlan VM, Hastings CA, Reimann EM, Scott JD (září 1994). „Regulační podjednotka typu II (RII) interakce proteinkinázy závislé na cAMP s kotevními proteiny A-kinázy vyžaduje isoleucin 3 a 5“. The Journal of Biological Chemistry. 269 (39): 24245–51. PMID 7929081.
- Toksoz D, Williams DA (únor 1994). "Nový lidský onkogen lbc detekovaný transfekcí s odlišnými oblastmi homologie pro signalizaci produktů transdukce". Onkogen. 9 (2): 621–8. PMID 8290273.
- Sterpetti P, Hack AA, Bashar MP, Park B, Cheng SD, Knoll JH a kol. (Únor 1999). „Aktivace protoonkogenu výměnného faktoru Lbc Rho zkrácením prodlouženého C-konce, který reguluje transformaci a cílení“. Molekulární a buněčná biologie. 19 (2): 1334–45. doi:10.1128 / mcb.19.2.1334. PMC 116062. PMID 9891067.
- Sagi SA, Seasholtz TM, Kobiashvili M, Wilson BA, Toksoz D, Brown JH (květen 2001). „Fyzické a funkční interakce Galphaqu s Rho a jeho směnné faktory“. The Journal of Biological Chemistry. 276 (18): 15445–52. doi:10,1074 / jbc.M008961200. PMC 1761691. PMID 11278452.
- Newlon MG, Roy M, Morikis D, Carr DW, Westphal R, Scott JD, Jennings PA (duben 2001). „Nový mechanismus kotvení PKA odhalený strukturami řešení kotvících komplexů“. Časopis EMBO. 20 (7): 1651–62. doi:10.1093 / emboj / 20.7.1651. PMC 145475. PMID 11285229.
- Driggers PH, Segars JH, Rubino DM (prosinec 2001). „Proto-onkoprotein Brx aktivuje estrogenový receptor beta cestou mitogenu aktivovaného proteinkinázy p38“. The Journal of Biological Chemistry. 276 (50): 46792–7. doi:10,1074 / jbc.M106927200. PMC 4152864. PMID 11579095.
- Klussmann E, Edemir B, Pepperle B, Tamma G, Henn V, Klauschenz E a kol. (Listopad 2001). „Ht31: první protein ukotvení proteinu A, který integruje signalizaci proteinkinázy A a Rho“. FEBS Dopisy. 507 (3): 264–8. doi:10.1016 / S0014-5793 (01) 02995-7. PMID 11696353.
- Tan YC, Wu H, Wang WN, Zheng Y, Wang ZX (listopad 2002). "Charakterizace interakcí mezi malou GTPázou RhoA a jejími guaninovými nukleotidovými výměnnými faktory". Analytická biochemie. 310 (2): 156–62. doi:10.1016 / S0003-2697 (02) 00382-2. PMID 12423633.
- Spierings E, Brickner AG, Caldwell JA, Zegveld S, Tatsis N, Blokland E a kol. (Červenec 2003). „Menší histokompatibilní antigen HA-3 vzniká diferenciačním proteazomem zprostředkovaným štěpením onkoproteinu lymfoidní blastické krize (Lbc)“. Krev. 102 (2): 621–9. doi:10.1182 / krev-2003-01-0260. PMID 12663445.
- Hornemann T, Kempa S, Himmel M, Hayess K, Fürst DO, Wallimann T (září 2003). „Kreatinkináza svalového typu interaguje s centrálními doménami proteinů M-bandu myomesinu a M-proteinu“. Journal of Molecular Biology. 332 (4): 877–87. doi:10.1016 / S0022-2836 (03) 00921-5. PMID 12972258.
- Chen LY, Zuraw BL, Ye RD, Pan ZK (únor 2004). „Rho výměnný faktor zprostředkovává aktivaci NF-kappaB indukovanou fMet-Leu-Phe v lidských monocytech periferní krve“. The Journal of Biological Chemistry. 279 (8): 7208–12. doi:10,1074 / jbc.M309542200. PMID 14660653.
Tento článek o gen na lidský chromozom 15 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |