Dihydrolipoamid dehydrogenáza - Dihydrolipoamide dehydrogenase - Wikipedia

DLD
Dostupné struktury PDB Hledání ortologu: PDBe RCSB Seznam id kódů PDB 3RNM, 1ZMC, 1ZMD, 1ZY8, 2F5Z
Identifikátory
Aliasy	DLD, DLDD, DLDH, E3, GCSL, LAD, PHE3, dihydrolipoamid dehydrogenáza, dihydrolipoamid dehydrogenáza, OGDC-E3
Externí ID	OMIM: 238331 MGI: 107450 HomoloGene: 84 Genové karty: DLD
Umístění genu (člověk) Chr. Chromozom 7 (lidský)[1] Kapela 7q31.1 Start 107,891,162 bp[1] Konec 107,931,730 bp[1]
Genová ontologie Molekulární funkce • vazba flavinadenin dinukleotidů • Vazba NAD • aktivita dihydrolipoyl dehydrogenázy • aktivita oxidoreduktázy • aktivita pyruvátdehydrogenázy (NAD +) • lipoamidová vazba • aktivita oxidoreduktázy, působící na sírovou skupinu dárců, NAD (P) jako akceptor • aktivita přenosu elektronů • GO: 0001948 vazba na proteiny Buněčná složka • komplex oxoglutarát dehydrogenázy • myelin • komplex pyruvátdehydrogenázy • cilium • akrozomální matice • nukleoplazma • mitochondriální matice • mitochondrie • Akrozom • cytoplazmatický váček • pohyblivé cilium • buněčná projekce • buněčné jádro Biologický proces • mitochondriální acetyl-CoA biosyntetický proces z pyruvátu • regulace membránového potenciálu • stárnutí • katabolický proces s rozvětveným řetězcem aminokyselin • cyklus trikarboxylové kyseliny • Metabolický proces 2-oxoglutarátu • lysinový katabolický proces • regulace biosyntetického procesu acetyl-CoA z pyruvátu • redoxní homeostáza buněk • proteolýza • lipoátový metabolický proces • metabolický proces dihydrolipoamidu • gastrulace • pyruvát metabolický proces • kapacitace spermií • oxidačně-redukční proces • biosyntetický proces acetyl-CoA z pyruvátu • transport mitochondriálních elektronů, NADH na ubichinon • buněčný metabolický proces sloučeniny dusíku • histonová sukcinylace Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
Druh	Člověk	Myš
Entrez	1738	13382
Ensembl	ENSG00000091140	ENSMUSG00000020664
UniProt	P09622	O08749
RefSeq (mRNA)	NM_001289752 NM_000108 NM_001289750 NM_001289751	NM_007861
RefSeq (protein)	NP_000099 NP_001276679 NP_001276680 NP_001276681	NP_031887
Místo (UCSC)	Chr 7: 107,89 - 107,93 Mb	n / a
PubMed Vyhledávání	[2]	[3]
Wikidata
Zobrazit / upravit člověka Zobrazit / upravit myš

Dihydrolipoamid dehydrogenáza (DLD), také známý jako dihydrolipoyl dehydrogenáza, mitochondriální, je enzym že u lidí je kódován DLD gen.^[4][5][6][7] DLD je a flavoprotein enzym, který oxiduje dihydrolipoamid na lipoamid.

Dihydrolipoamid dehydrogenáza (DLD) je mitochondriální enzym, který hraje zásadní roli v energetickém metabolismu u eukaryot. Tento enzym je nezbytný pro úplnou reakci alespoň pěti různých komplexů více enzymů.^[8] DLD je navíc flavoenzym oxidoreduktáza který obsahuje reaktivní disulfidový most a a FAD kofaktor, který se přímo účastní katalýzy. Enzym se asociuje do pevně vázaného homodimery potřebné pro jeho enzymatickou aktivitu.^[9]

• 

  Lipoamid

• 

  Dihydrolipoamid

Struktura

Protein kódovaný genem DLD přichází spolu s dalším proteinem a tvoří dimer v centrální metabolická cesta. Několik aminokyseliny v katalytické kapse byly identifikovány jako důležité pro funkci DLD, včetně R281 a N473.^[10][11] Ačkoli celkový záhyb člověka enzym je podobný tomu z droždí, lidská struktura se liší v tom, že má dvě smyčky, které sahají od obecné proteinové struktury a do FAD vazebná místa, když jsou navázána na molekulu NAD +, potřebná pro katalýzu, není blízká zbytku FAD. Kdy však NADH je místo toho svázán, je naskládán přímo proti horní části centrální struktury FAD. Současné struktury hE3 přímo ukazují, že způsobují onemocnění mutace se vyskytují na třech místech v lidském enzymu: dimer rozhraní, Aktivní stránky a vazebná místa FAD a NAD (+).^[12]

Funkce

DLD homodimer funguje jako složka E3 pyruvát, α-ketoglutarát a aminokyseliny s rozvětveným řetězcemdehydrogenáza komplexy a systém štěpení glycinu, vše v mitochondriální matrici. V těchto komplexech DLD převádí kyselinu dihydrolipoovou a NAD + na kyselinu lipoovou a NADH.^[13]DLD také má diaforáza aktivita, schopnost katalyzovat oxidaci NADH na NAD + pomocí různých akceptorů elektronů, jako je O₂labilní železitý žehlička, oxid dusnatý, a ubichinon.^[8] Předpokládá se, že DLD má prooxidační roli redukcí kyslíku na a superoxid nebo železitý železný železo, které pak katalyzuje produkci železa hydroxylové radikály.^[14][15]Diaforázová aktivita DLD může mít antioxidační roli díky své schopnosti zachytávat oxid dusnatý a redukovat ubichinon na ubichinol.^[16][17][18] Je známo, že gen dihyrolipamid dehydrogenázy má několik variant sestřihu.

Funkce měsíčního svitu

Některé mutace DLD mohou současně vyvolat ztrátu primární metabolické aktivity a zisk a měsíční svit proteolytická aktivita. Měsíční proteolytická aktivita DLD je odhalena podmínkami, které destabilizují DLD homodimer a snižují jeho DLD aktivitu.^[8] Okyselení mitochondriální matrice v důsledku ischemicko-reperfuzní poškození, může narušit kvartérní strukturu DLD, což vede ke snížení dehydrogenáza aktivita a zvýšila se diaforáza aktivita.^[19]Měsíční proteolytická aktivita DLD může také nastat za patologických podmínek. Proteolytická aktivita může dále komplikovat snížení energetického metabolismu a zvýšení oxidačního poškození v důsledku snížené aktivity DLD, respektive zvýšení aktivity diaforázy.^[18] Díky své proteolytické funkci odstraňuje DLD funkčně důležitou doménu z N-konce frataxinu, mitochondriálního proteinu podílejícího se na metabolismu železa a antioxidační ochraně.^[20][21]

Klinický význam

U lidí jsou mutace DLD spojeny se závažnou poruchou kojeneckého věku selhání prosperovat, hypotonie, a metabolická acidóza.^[8] Nedostatek DLD se projevuje velkou mírou variability, která se připisuje různým účinkům různých mutací DLD na stabilitu proteinu a jeho schopnost dimerizovat nebo interagovat s dalšími složkami tří komplexů α-ketoacid-dehydrogenázy.^[8]Díky své proteolytické funkci způsobuje DLD nedostatek frataxin, která vede k neurodegenerativnímu a srdečnímu onemocnění, Friedreichova ataxie.^[22] Budoucí výzkum doufá, že vyhodnotí, jak proteolytická aktivita DLD přispívá k příznakům deficitu DLD, Friedreichově ataxii a ischemickému reperfuznímu poškození a zda by tato aktivita mohla být cílem léčby těchto stavů.^[8]

Interaktivní mapa cest

Kliknutím na geny, proteiny a metabolity níže můžete odkazovat na příslušné články. [§ 1] [[Soubor: [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] | {{{{bSize}}} px | alt = TCACycle_WP78 Upravit ]] TCACycle_WP78 Upravit ^ Interaktivní mapu cest lze upravit na WikiPathways: „TCACycle_WP78“.

Kliknutím na geny, bílkoviny a metabolity níže zobrazíte odkazy na příslušné články.[§ 1] [[Soubor: [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] | {{{bSize}}} px | alt = Glykolýza a glukoneogeneze Upravit ]] Glykolýza a glukoneogeneze Upravit ^ Interaktivní mapu cest lze upravit na WikiPathways: „GlycolysisGluconeogenesis_WP534“.

Regulace enzymů

Tento protein může používat morpheein model alosterická regulace.^[23]

Viz také

• Kyselina lipoová

Reference

Další čtení

externí odkazy

• Dihydrolipoamid + dehydrogenáza v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.

proti t E Glykolýza metabolická cesta

Glukóza Hexokináza ATP ADP Glukóza 6-fosfát Glukóza-6-fosfát izomeráza Fruktóza 6-fosfát Fosfofruktokináza-1 ATP ADP Fruktóza 1,6-bisfosfát Fruktóza-bisfosfát aldoláza Dihydroxyaceton fosfát + + Glyceraldehyd-3-fosfát Triosefosfát izomeráza 2 × Glyceraldehyd-3-fosfát 2 ×  Glyceraldehyd-3-fosfát dehydrogenáza NAD++ Pi NADH + H+ NAD++ Pi NADH + H+ 2 × 1,3-bisfosfoglycerát 2 ×  Fosfoglycerátkináza ADP ATP ADP ATP 2 × 3-fosfoglycerát 2 ×  Fosfoglycerát mutáza 2 × 2-fosfoglycerát 2 ×  Fosfopyruvát hydratáza (enoláza )   H2Ó   H2Ó 2 × Fosfoenolpyruvát 2 ×  Pyruvátkináza ADP ATP 2 × Pyruvát 2 ×