Fosfoglycerát mutáza - Phosphoglycerate mutase

Rodina fosfoglycerát mutáz | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Identifikátory | |||||||||||
Symbol | PGAM | ||||||||||
Pfam | PF00300 | ||||||||||
InterPro | IPR013078 | ||||||||||
STRÁNKA | PDOC00158 | ||||||||||
SCOP2 | 3pgm / Rozsah / SUPFAM | ||||||||||
|
fosfoglycerát mutáza 1 (mozek) | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
![]() | |||||||
Identifikátory | |||||||
Symbol | PGAM1 | ||||||
Alt. symboly | PGAMA | ||||||
Gen NCBI | 5223 | ||||||
HGNC | 8888 | ||||||
OMIM | 172250 | ||||||
RefSeq | NM_002629 | ||||||
UniProt | P18669 | ||||||
Další údaje | |||||||
EC číslo | 5.4.2.11 | ||||||
Místo | Chr. 10 q25.3 | ||||||
|
fosfoglycerát mutáza 2 (sval) | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
Identifikátory | |||||||
Symbol | PGAM2 | ||||||
Gen NCBI | 5224 | ||||||
HGNC | 8889 | ||||||
OMIM | 261670 | ||||||
RefSeq | NM_000290 | ||||||
UniProt | P15259 | ||||||
Další údaje | |||||||
EC číslo | 5.4.2.11 | ||||||
Místo | Chr. 7 p13-p12 | ||||||
|
- Tento enzym nelze zaměňovat Bisfosfoglycerát mutáza který katalyzuje přeměnu 1,3-bisfosfoglycerát na 2,3-bisfosfoglycerát.
Fosfoglycerát mutáza (PGM) je libovolný enzym který katalyzuje krok 8 z glykolýza. Katalyzují vnitřní přenos fosfátové skupiny z C-3 na C-2, což vede k přeměně 3-fosfoglycerát (3PG) do 2-fosfoglycerát (2PG) přes 2,3-bisfosfoglycerátový meziprodukt. Tyto enzymy jsou rozděleny do dvou odlišných tříd kofaktor -dependent (dPGM) nebo nezávislý na kofaktoru (iPGM).[1] Enzym dPGM (ES 5.4.2.11 ) se skládá z přibližně 250 aminokyselin a nachází se u všech obratlovců iu některých bezobratlých, plísní a bakterií. IPGM (ES 5.4.2.12 ) třída se vyskytuje u všech rostlin a řas, stejně jako u některých bezobratlých, plísní a grampozitivních bakterií.[2] Tato třída enzymu PGM sdílí stejnou nadrodinu jako alkalická fosfatáza.[3]
Mechanismus
PGM je izomeráza enzym, účinně přenášející a fosfátová skupina (PO43−) z uhlíku C-3 3-fosfoglycerát k tvorbě uhlíku C-2 2-fosfoglycerát. Existují celkem tři reakce, které dPGM může katalyzovat: mutázová reakce vedoucí k přeměně 3PG na 2PG a naopak,[4][5] fosfatázová reakce vytvářející fosfoglycerát z 2,3-bisfosfoglycerátu,[6][7] a syntázová reakce produkující 2,3-bisfosfoglycerát z 1,3-bisfosfoglycerátu podobný enzymu bisfosfoglycerát mutázy[Citace je zapotřebí ]. Kinetické a strukturní studie poskytly důkazy, které naznačují dPGM a bisfosfoglycerát mutáza jsou paralogní struktur.[6] Oba enzymy jsou obsaženy v nadčeleď který také obsahuje fosfatázovou část fosfofruktokináza 2 a kyselá fosfatáza prostaty.[8]
Katalyzovaná mutázová reakce zahrnuje dvě oddělené fosforylové skupiny a koncový fosfát na 2-uhlíku není stejný fosfát odstraněný z 3-uhlíku.
V závislosti na kofaktoru počáteční stav enzymu, Aktivní stránky obsahuje fosfohistidinový komplex tvořený fosforylace konkrétního histidin zbytek.[9] Když 3-fosfoglycerát vstupuje do Aktivní stránky, fosfohistidinový komplex je umístěn tak, aby usnadňoval přenos fosfátu z enzymu na substrát C-2 za vzniku a 2,3-bisfosfoglycerát středně pokročilí.
Defosforylace z enzym histidin aktivuje lokální alosterickou změnu v konfiguraci enzymu, která nyní srovnává substráty s 3-C fosfátovou skupinou enzym Aktivní stránky histidin a usnadňuje přenos fosfátů vracejícím enzym do původního fosforylovaného stavu a uvolňující produkt 2-fosfoglycerát. 2,3-bisfosfoglycerát je vyžadován jako kofaktor pro dPGM. Naproti tomu třída iPGM je nezávislá na 2,3-bisfosfoglycerátu a katalyzuje intramolekulární přenos fosfátové skupiny na monofosfoglyceráty za použití fosfoserinového meziproduktu.[10]
Souhrn reakce
3PG + P-enzym → 2,3BPG + enzym → 2PG + P-enzym
3-fosfoglycerátový meziprodukt 2-fosfoglycerát
ΔG ° ′ = + 1,1 kcal / mol
Isozymes
Fosfoglycerát mutáza existuje primárně jako dimer dvou buď identických, nebo blízce příbuzných podjednotek o velikosti asi 32 kDa. Enzym se nachází v organismech tak jednoduchých jako kvasinky Homo sapiens a jeho struktura je po celou dobu vysoce zachována. (Kvasinky PGM ≈ 74% konzervované vs. savčí forma).
U savců se zdá, že enzymové podjednotky jsou buď ze svalové formy (m-typ), nebo jiné tkáně (b-typ pro mozek, kde byl původně izolován b-izozym). Enzym, který existuje jako dimer, má 3 izoenzymy podle toho, která podjednotka tvoří celou molekulu (mm, bb nebo mb). Typ mm se vyskytuje téměř výhradně u hladkého svalstva. MB-izozym se nachází v srdečním a kosterním svalu a typ bb se nachází ve zbytku tkání.[11] Zatímco všechny tři isozymy lze nalézt v jakékoli tkáni, výše uvedená rozdělení jsou založena na prevalenci v každé z nich.
Interaktivní mapa cest
Kliknutím na geny, proteiny a metabolity níže můžete odkazovat na příslušné články.[§ 1]
- ^ Interaktivní mapu cest lze upravit na WikiPathways: „GlycolysisGluconeogenesis_WP534“.
Nařízení
Fosfoglycerát mutáza má malou pozitivní Gibbsovu volnou energii a tato reakce probíhá snadno v obou směrech. Jelikož se jedná o reverzibilní reakci, není místem hlavních regulačních mechanismů nebo regulačních schémat pro glykolytickou cestu.
Aniontový molekuly jako zmizet,[12] acetát, chloridový ion, fosfát, 2-fosfoglykolát a N- [tris (hydroxymethyl) methyl-2-amino] ethansulfonát jsou známé inhibitory aktivity mutázy dPGM. Studie prokázaly, že dPGM je citlivý na změny v iontové koncentraci, kde zvyšující se koncentrace solí vedou k aktivaci aktivity fosfatázy enzymu při inhibici jeho aktivity mutáz. O některých solích, jako je KCl, je známo, že jsou kompetitivními inhibitory, pokud jde o 2-fosfoglycerátovou a mutázovou aktivitu.[13] Fosfát i 2-fosfoglykolát jsou kompetitivní inhibitory aktivity mutázy, pokud jde o substráty 2-fosfoglycerát a 2,3-bisfosfoglycerát.[14]
Klinický význam
U lidí je gen PGAM2, který kóduje tento enzym, umístěn na krátkém rameni chromozomu 7.
Nedostatek fosfoglycerát mutázy způsobuje glykogenová skladovací choroba typu X vzácná autozomálně recesivní genetická porucha se symptomy v rozsahu od mírných po středně závažné; není považován za život ohrožující a lze jej zvládnout změnami životního stylu.[Citace je zapotřebí ] Toto se projevuje jako metabolická myopatie a je jednou z mnoha forem syndromů dříve označovaných jako svalová dystrofie.[Citace je zapotřebí ] Nedostatek PGAM1 ovlivňuje játra, zatímco nedostatek PGAM2 ovlivňuje svaly.
Nástup je obecně známý jako dětství až po rané dospělé, ačkoli někteří, kteří mohou být touto poruchou mírně ovlivněni, nemusí vědět, že ji mají. Pacienti s nedostatkem PGAM jsou obvykle bez příznaků, s výjimkou případů, kdy se věnují krátkému a namáhavému úsilí, které může vyvolat myalgii, křeče, svalovou nekrózu a myoglobinurii.[15] Neobvyklou patologickou vlastností nedostatku PGAM je asociace s tubulárními agregáty. Mezi příznaky patří nesnášenlivost fyzické námahy nebo činnosti, křeče a bolesti svalů. Trvalá slabost je vzácná. Nemoc není progresivní a má vynikající prognózu.[Citace je zapotřebí ]
Lidské proteiny obsahující tuto doménu
BPGM; PFKFB1; PFKFB2; PFKFB3; PFKFB4; PGAM1; PGAM2; PGAM4; PGAM5; STS1; UBASH3A;
Reference
- ^ Johnsen, U; Schönheit, P (září 2007). "Charakterizace na kofaktorech závislých a na kofaktorech nezávislých fosfoglycerátových mutáz z Archea". Extremophiles: Život v extrémních podmínkách. 11 (5): 647–57. doi:10.1007 / s00792-007-0094-x. PMID 17576516. S2CID 5836321.
- ^ Jedrzejas, MJ (2000). "Struktura, funkce a vývoj fosfoglycerátových mutáz: srovnání s fruktóza-2,6-bisfosfatázou, kyselou fosfatázou a alkalickou fosfatázou". Pokrok v biofyzice a molekulární biologii. 73 (2–4): 263–87. doi:10.1016 / s0079-6107 (00) 00007-9. PMID 10958932.
- ^ Galperin, MY; Bairoch, A; Koonin, EV (srpen 1998). „Nadrodina metaloenzymů sjednocuje fosfopentomutázu a fosfoglycerát mutasu nezávislou na kofaktoru s alkalickými fosfatázami a sulfatázami“. Věda o bílkovinách. 7 (8): 1829–35. doi:10.1002 / pro.5560070819. PMC 2144072. PMID 10082381.
- ^ Sasaki, R; Utsumi, S; Sugimoto, E; Chiba, H (15. července 1976). "Struktura podjednotky a multifunkční vlastnosti kvasinkové fosfoglyceromutázy". European Journal of Biochemistry / FEBS. 66 (3): 523–33. doi:10.1111 / j.1432-1033.1976.tb10578.x. PMID 182494.
- ^ Rose, ZB; Dube, S (25. srpna 1976). "Sazby fosforylace a defosforylace fosfoglycerát mutázy a bisfosfoglycerát syntázy". The Journal of Biological Chemistry. 251 (16): 4817–22. PMID 8447.
- ^ A b Rose, ZB; Dube, S (10. prosince 1978). "Fosfoglycerát mutáza. Kinetika a účinky solí na aktivitu enzymu z mutace a bisfosfoglycerát fosfatázy z kuřecího svalu". The Journal of Biological Chemistry. 253 (23): 8583–92. PMID 213437.
- ^ Sasaki, R; Hirose, M; Sugimoto, E; Chiba, H (10. března 1971). „Studie o roli aktivity 2,3-difosfoglycerátfosfatázy v reakci s kvasinkovou fosfoglycerát mutázou“. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Enzymologie. 227 (3): 595–607. doi:10.1016/0005-2744(71)90010-6. PMID 4328052.
- ^ Wang, Y; Wei, Z; Liu, L; Cheng, Z; Lin, Y; Ji, F; Gong, W (17. června 2005). "Krystalová struktura lidské fosfoglycerátové mutázy typu B vázaná na citrát". Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 331 (4): 1207–15. doi:10.1016 / j.bbrc.2005.03.243. PMID 15883004.
- ^ Britton, HG; Clarke, JB (březen 1969). "Mechanismus reakce fosfoglycerát mutázy". The Biochemical Journal. 112 (1): 10P – 11P. doi:10.1042 / bj1120010pb. PMC 1187664. PMID 5774486.
- ^ Jedrzejas, MJ; Chander, M; Setlow, P; Krishnasamy, G (28. července 2000). "Mechanismus katalýzy fosfoglycerát mutázy nezávislé na kofaktoru z Bacillus stearothermophilus. Krystalová struktura komplexu s 2-fosfoglycerátem". The Journal of Biological Chemistry. 275 (30): 23146–53. doi:10.1074 / jbc.m002544200. PMID 10764795.
- ^ Omenn, GS; Cheung, SC (květen 1974). "Fosfoglycerát mutáza isozym marker pro diferenciaci tkáně u člověka". American Journal of Human Genetics. 26 (3): 393–9. PMC 1762627. PMID 4827367.
- ^ Píseň, L; Xu, Z; Yu, X (srpen 2007). "Molekulární klonování a charakterizace genu pro fosfoglycerát mutasu z Clonorchis sinensis". Parazitologický výzkum. 101 (3): 709–14. doi:10.1007 / s00436-007-0540-9. PMID 17468884. S2CID 104159.
- ^ Grisolia, S; Tecson, J (11. ledna 1967). „Rtuťem indukované reverzibilní zvýšení 2,3-difosfoglycerátfosfatázy a současné snížení aktivity mutáz zvířecích fosfoglycerát mutáz“. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Enzymologie. 132 (1): 56–67. doi:10.1016 / 0005-2744 (67) 90191-x. PMID 4291574.
- ^ Grisolia, S; Cleland, WW (březen 1968). "Vliv koncentrací solí, substrátů a kofaktorů na kinetické a mechanické chování fosfoglycerát mutázy". Biochemie. 7 (3): 1115–21. doi:10.1021 / bi00843a032. PMID 5690561.
- ^ Salameh J, Goyal N, Choudry R, Camelo-Piragua S, Chong PS (červenec 2012). „Nedostatek fosfoglycerát mutázy s tubulárními agregáty u pacienta z Panamy“ (PDF). Svalový nerv. 47 (1): 138–40. doi:10,1002 / mus.23527. hdl:2027.42/95158. PMID 23169535. S2CID 34151935.
externí odkazy
- Fosfoglycerát + mutáza v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)
- PDBe-KB poskytuje přehled všech strukturních informací dostupných v PDB pro lidskou fosfoglycerát mutasu 1