ARF6 - ARF6

ARF6
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1E0S, 2A5D, 2A5F, 2A5G, 2BAO, 2BAU, 2J5X, 2W83, 3LVQ, 3LVR, 4FME, 3N5C, 3PCR, 4KAX
Identifikátory
Aliasy	ARF6, ADP-ribosylační faktor 6, ADP-ribosylační faktor 6
Externí ID	OMIM: 600464 MGI: 99435 HomoloGene: 1256 Genové karty: ARF6
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 14 (lidský)
Konec	49,897,054 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba nukleotidů; • vazba N-konce proteinu; • Vazba GTP; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • Aktivita GTPázy; • vazba thioesterázy;
Buněčná složka	• cytoplazma; • recyklace endosomu; • endozom; • Golgiho aparát; • buněčná projekce; • membrána; • ohnisková adheze; • prohrábnout; • myelin; • buněčná membrána; • endocytický váček; • intracelulární; • buněčná kůra; • časný endosom; • endosomová membrána; • extracelulární exosom; • filopodná membrána; • recyklace endosomové membrány; • dělící rýha; • cytosol; • Flemmingovo tělo; • časná endosomová membrána; • presynapse; • glutamátergická synapse;
Biologický proces	• stanovení polarity epiteliálních buněk; • diferenciace buněk; • regulace sestavy filopodia; • pohyb buňky nebo subcelulární složky; • pozitivní regulace polymerace aktinových vláken; • organizovat volánky; • malá transdukce signálu zprostředkovaná GTPázou; • regulace přenosu signálu proteinu Rac; • vývoj nervového systému; • negativní regulace vývoje dendritů; • buněčné dělení; • negativní regulace receptorem zprostředkované endocytózy; • buněčná adheze; • lokalizace proteinu na buněčný povrch; • transport bílkovin; • lokalizace proteinu do endosomu; • buněčný cyklus; • vývoj jater; • apoptotický proces myeloidních buněk; • GO: 0033109 organizace kortikálního aktinového cytoskeletu; • transport zprostředkovaný vezikuly; • regulace vývoje dendritické páteře; • apoptotický proces hepatocytů; • doprava; • pozitivní regulace lokalizace proteinu na plazmatickou membránu; • transport intracelulárních proteinů; • regulace vývoje neuronové projekce; • endocytová recyklace; • synaptická vezikulární endocytóza; • pozitivní regulace migrace keratinocytů; • sestavení volánku; • údržba struktury postsynaptické hustoty; • pozitivní regulace organizace spojení spojenců; • regulace sestavy presynapse; • buněčná odpověď na stimul nervového růstového faktoru; • negativní regulace lokalizace proteinu na buněčný povrch; • pozitivní regulace sekrece bílkovin; • pozitivní regulace aktivity homodimerizace proteinu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	382
	11845
	ENSG00000165527
	ENSMUSG00000044147
	P62330
	P62331
	NM_001663
	NM_007481
	NP_001654
	NP_031507
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Faktor ribosylace ADP 6 (ARF6) je členem Faktor ribosylace ADP rodina z GTP-vazebné proteiny. ARF6 má řadu buněčných funkcí, které se často podílejí na obchodování s nimi biologické membrány a transmembránový protein náklad. ARF6 byl konkrétně zapojen do endocytóza z plazmatická membrána proteiny a také v menší míře recyklaci proteinů plazmatické membrány.

Funkce

Tento gen kóduje člena rodiny lidských genů ARF, která je součástí Ras nadčeleď. Geny ARF kódují malé proteiny vázající guanin nukleotidy, které stimulují aktivitu ADP-ribosyltransferázy toxinu cholery a hrají roli ve vezikulárním obchodování a jako aktivátory fosfolipázy D. Produkt tohoto genu je lokalizován na plazmatické membráně a reguluje vezikulární obchodování , remodelace membránových lipidů a signální dráhy, které vedou k remodelaci aktinu. Pseudogen tohoto genu je lokalizován na chromozomu 7.^[4]

ARF6 může interagovat s βarrestin na receptor aktivace.

Interakce

Bylo prokázáno, že Arf6 komunikovat s:

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000165527 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Entrez Gene: ARF6 ADP-ribosylační faktor 6“.
^ Claing A, Chen W, Miller WE, Vitale N, Moss J, Premont RT, Lefkowitz RJ (listopad 2001). "aktivace ADP-ribosylačního faktoru 6 zprostředkovaná beta-arrestinem a endocytóza beta 2-adrenergních receptorů". J. Biol. Chem. 276 (45): 42509–13. doi:10,1074 / jbc.M108399200. PMID 11533043.
^ D'Souza-Schorey C, Boshans RL, McDonough M, Stahl PD, Van Aelst L (září 1997). „Role POR1, proteinu interagujícího s Rac1, v přeskupení cytoskeletu zprostředkovaném ARF6“. EMBO J.. 16 (17): 5445–54. doi:10.1093 / emboj / 16.17.5445. PMC 1170175. PMID 9312003.
^ Shin OH, Exton JH (srpen 2001). "Diferenciální vazba arfaptinu 2 / POR1 na ADP-ribosylační faktory a Rac1". Biochem. Biophys. Res. Commun. 285 (5): 1267–73. doi:10.1006 / bbrc.2001.5330. PMID 11478794.
^ Mitchell R, Robertson DN, Holland PJ, Collins D, Lutz EM, Johnson MS (září 2003). „Aktivace fosfolipázy D závislá na ADP-ribosylačním faktoru muskarinovým receptorem M3“. J. Biol. Chem. 278 (36): 33818–30. doi:10,1074 / jbc.M305825200. PMID 12799371.
^ Prigent M, Dubois T, Raposo G, Derrien V, Tenza D, Rossé C, Camonis J, Chavrier P (prosinec 2003). „ARF6 řídí post-endocytickou recyklaci prostřednictvím svého následného exocystového komplexního efektoru“. J. Cell Biol. 163 (5): 1111–21. doi:10.1083 / jcb.200305029. PMC 2173613. PMID 14662749.
^ Prieto C, De Las Rivas J (červenec 2006). „APID: Agile Protein Interaction DataAnalyzer“. Nucleic Acids Res. 34 (Problém s webovým serverem): W298–302. doi:10.1093 / nar / gkl128. PMC 1538863. PMID 16845013. Archivovány od originál dne 2010-04-09.
^ Peru y Colón de Portugal RL, Acevedo SF, Rodan AR, Chang LY, Eaton BA, Rothenfluh A (prosinec 2012). „Dospělý neuronální Arf6 řídí chování vyvolané ethanolem s Arfaptinem za Rac1 a RhoGAP18B“. J. Neurosci. 32 (49): 17706–13. doi:10.1523 / JNEUROSCI.1944-12.2012. PMC 3535434. PMID 23223291.

Další čtení

Sabe H (2004). "Požadavek na Arf6 v buněčné adhezi, migraci a invazi rakovinných buněk". J. Biochem. 134 (4): 485–9. doi:10.1093 / jb / mvg181. PMID 14607973.
Joseph AM, Kumar M, Mitra D (2005). „Nef:„ nezbytný a prosazující faktor “při infekci HIV“. Curr. HIV Res. 3 (1): 87–94. doi:10.2174/1570162052773013. PMID 15638726.
Tsuchiya M, Price SR, Tsai SC, Moss J, Vaughan M (1991). "Molekulární identifikace mRNA s ADP-ribosylačním faktorem a jejich exprese v savčích buňkách". J. Biol. Chem. 266 (5): 2772–7. PMID 1993656.
Stearns T, Willingham MC, Botstein D, Kahn RA (1990). „ADP-ribosylační faktor je funkčně a fyzicky spojen s komplexem Golgi“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 87 (3): 1238–42. Bibcode:1990PNAS ... 87.1238S. doi:10.1073 / pnas.87.3.1238. PMC 53446. PMID 2105501.
D'Souza-Schorey C, Stahl PD (1995). "Myristoylace je nutná pro intracelulární lokalizaci a endocytickou funkci ARF6." Exp. Cell Res. 221 (1): 153–9. doi:10.1006 / excr.1995.1362. PMID 7589240.
D'Souza-Schorey C, Li G, Colombo MI, Stahl PD (1995). "Regulační role pro ARF6 v endocytóze zprostředkované receptorem". Věda. 267 (5201): 1175–8. Bibcode:1995Sci ... 267.1175D. doi:10.1126 / science.7855600. PMID 7855600.
Welsh CF, Moss J, Vaughan M (1995). „ADP-ribosylační faktory: rodina přibližně 20-kDa proteinů vázajících nukleotidy na guanin, které aktivují toxin cholery“. Mol. Buňka. Biochem. 138 (1–2): 157–66. doi:10.1007 / BF00928458. PMID 7898460.
Amor JC, Harrison DH, Kahn RA, Ringe D (1995). "Struktura lidského ADP-ribosylačního faktoru 1 v komplexu s HDP". Příroda. 372 (6507): 704–8. doi:10.1038 / 372704a0. PMID 7990966.
Orcl L, Palmer DJ, Amherdt M, Rothman JE (1993). „Potažené seskupení vezikul v Golgi vyžaduje pouze coatomer a ARF proteiny z cytosolu“. Příroda. 364 (6439): 732–4. Bibcode:1993 Natur.364..732O. doi:10.1038 / 364732a0. PMID 8355790.
Helms JB, Palmer DJ, Rothman JE (1993). „Dvě odlišné populace ARF vázané na Golgiho membrány“. J. Cell Biol. 121 (4): 751–60. doi:10.1083 / jcb.121.4.751. PMC 2119793. PMID 8491770.
Cavenagh MM, Whitney JA, Carroll K, Zhang Cj, Boman AL, Rosenwald AG, Mellman I, Kahn RA (1996). „Intracelulární distribuce proteinů Arf v buňkách savců. Arf6 je jedinečně lokalizován do plazmatické membrány“. J. Biol. Chem. 271 (36): 21767–74. doi:10.1074 / jbc.271.36.21767. PMID 8702973.
D'Souza-Schorey C, Boshans RL, McDonough M, Stahl PD, Van Aelst L (1997). „Role POR1, proteinu interagujícího s Rac1, v přeskupení cytoskeletu zprostředkovaném ARF6“. EMBO J.. 16 (17): 5445–54. doi:10.1093 / emboj / 16.17.5445. PMC 1170175. PMID 9312003.
Frank S, Upender S, Hansen SH, Casanova JE (1998). „ARNO je faktor výměny guaninového nukleotidu pro ADP-ribosylační faktor 6“. J. Biol. Chem. 273 (1): 23–7. doi:10.1074 / jbc.273.1.23. PMID 9417041.
Yang CZ, Heimberg H, D'Souza-Schorey C, Mueckler MM, Stahl PD (1998). "Subcelulární distribuce a diferenciální exprese endogenního ADP-ribosylačního faktoru 6 v savčích buňkách". J. Biol. Chem. 273 (7): 4006–11. doi:10.1074 / jbc.273.7.4006. PMID 9461590.
Mao M, Fu G, Wu JS, Zhang QH, Zhou J, Kan LX, Huang QH, He KL, Gu BW, Han ZG, Shen Y, Gu J, Yu YP, Xu SH, Wang YX, Chen SJ, Chen Z (1998). "Identifikace genů exprimovaných v lidských CD34 (+) hematopoetických kmenových / progenitorových buňkách pomocí exprimovaných sekvenčních značek a účinného klonování cDNA v plné délce". Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 95 (14): 8175–80. Bibcode:1998PNAS ... 95,8175M. doi:10.1073 / pnas.95.14.8175. PMC 20949. PMID 9653160.
Andreev J, Simon JP, Sabatini DD, Kam J, Plowman G, Randazzo PA, Schlessinger J (1999). "Identifikace nového cílového proteinu Pyk2 s aktivitou Arf-GAP". Mol. Buňka. Biol. 19 (3): 2338–50. doi:10.1128 / MCB.19.3.2338. PMC 84026. PMID 10022920.
Radhakrishna H, Al-Awar O, Khachikian Z, Donaldson JG (1999). „Požadavek ARF6 na rozcuchání Rac naznačuje roli membránového obchodování v přesmycích kortikálních aktinů“. J. Cell Sci. 112 (6): 855–66. PMID 10036235.
Kim HS (1999). "Přiřazení lidského genu pro ADP-ribosylační faktor 6 (ARF6) k chromozomu 7q22.1 radiačním hybridním mapováním". Cytogenet. Cell Genet. 84 (1–2): 94. doi:10.1159/000015225. PMID 10343114.
Langille SE, Patki V, Klarlund JK, Buxton JM, Holik JJ, Chawla A, Corvera S, český poslanec (1999). "ADP-ribosylační faktor 6 jako cíl guaninového nukleotidového výměnného faktoru GRP1". J. Biol. Chem. 274 (38): 27099–104. doi:10.1074 / jbc.274.38.27099. PMID 10480924.
Honda A, Nogami M, Yokozeki T, Yamazaki M, Nakamura H, Watanabe H, Kawamoto K, Nakayama K, Morris AJ, Frohman MA, Kanaho Y (1999). „Fosfatidylinositol-4-fosfát-5-kináza alfa je následným efektorem malého G proteinu ARF6 při tvorbě membránového volánku“. Buňka. 99 (5): 521–32. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 81540-8. PMID 10589680.
Ikeda S, Ushio-Fukai M, Zuo L, Tojo T, Dikalov S, Patrushev NA, Alexander RW (2005). „Nová role ARF6 ve signalizaci a angiogenezi indukované vaskulárním endoteliálním růstovým faktorem“. Circ. Res. 96 (4): 467–75. doi:10.1161 / 01.RES.0000158286.51045.16. PMID 15692085.

externí odkazy

ARF6 + protein, + člověk v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)
Člověk ARF6 umístění genomu a ARF6 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000165527 - Ensembl, Květen 2017

[2] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[3] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Entrez Gene: ARF6 ADP-ribosylační faktor 6“.

[pmid11533043-5] Claing A, Chen W, Miller WE, Vitale N, Moss J, Premont RT, Lefkowitz RJ (listopad 2001). "aktivace ADP-ribosylačního faktoru 6 zprostředkovaná beta-arrestinem a endocytóza beta 2-adrenergních receptorů". J. Biol. Chem. 276 (45): 42509–13. doi:10,1074 / jbc.M108399200. PMID 11533043.

[pmid9312003-6] D'Souza-Schorey C, Boshans RL, McDonough M, Stahl PD, Van Aelst L (září 1997). „Role POR1, proteinu interagujícího s Rac1, v přeskupení cytoskeletu zprostředkovaném ARF6“. EMBO J.. 16 (17): 5445–54. doi:10.1093 / emboj / 16.17.5445. PMC 1170175. PMID 9312003.

[pmid11478794-7] Shin OH, Exton JH (srpen 2001). "Diferenciální vazba arfaptinu 2 / POR1 na ADP-ribosylační faktory a Rac1". Biochem. Biophys. Res. Commun. 285 (5): 1267–73. doi:10.1006 / bbrc.2001.5330. PMID 11478794.

[pmid12799371-8] Mitchell R, Robertson DN, Holland PJ, Collins D, Lutz EM, Johnson MS (září 2003). „Aktivace fosfolipázy D závislá na ADP-ribosylačním faktoru muskarinovým receptorem M3“. J. Biol. Chem. 278 (36): 33818–30. doi:10,1074 / jbc.M305825200. PMID 12799371.

[pmid14662749-9] Prigent M, Dubois T, Raposo G, Derrien V, Tenza D, Rossé C, Camonis J, Chavrier P (prosinec 2003). „ARF6 řídí post-endocytickou recyklaci prostřednictvím svého následného exocystového komplexního efektoru“. J. Cell Biol. 163 (5): 1111–21. doi:10.1083 / jcb.200305029. PMC 2173613. PMID 14662749.

[pmid16845013-10] Prieto C, De Las Rivas J (červenec 2006). „APID: Agile Protein Interaction DataAnalyzer“. Nucleic Acids Res. 34 (Problém s webovým serverem): W298–302. doi:10.1093 / nar / gkl128. PMC 1538863. PMID 16845013. Archivovány od originál dne 2010-04-09.

[pmid23223291-11] Peru y Colón de Portugal RL, Acevedo SF, Rodan AR, Chang LY, Eaton BA, Rothenfluh A (prosinec 2012). „Dospělý neuronální Arf6 řídí chování vyvolané ethanolem s Arfaptinem za Rac1 a RhoGAP18B“. J. Neurosci. 32 (49): 17706–13. doi:10.1523 / JNEUROSCI.1944-12.2012. PMC 3535434. PMID 23223291.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]