Alkohol dehydrogenáza - Alcohol dehydrogenase
Alkohol dehydrogenáza | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Identifikátory | |||||||||
EC číslo | 1.1.1.1 | ||||||||
Číslo CAS | 9031-72-5 | ||||||||
Databáze | |||||||||
IntEnz | IntEnz pohled | ||||||||
BRENDA | Vstup BRENDA | ||||||||
EXPASY | Pohled NiceZyme | ||||||||
KEGG | Vstup KEGG | ||||||||
MetaCyc | metabolická cesta | ||||||||
PRIAM | profil | ||||||||
PDB struktur | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||||||||
Genová ontologie | AmiGO / QuickGO | ||||||||
|
Alkohol dehydrogenázy (ADH) (ES 1.1.1.1 ) jsou skupina dehydrogenáza enzymy které se vyskytují v mnoha organismech a usnadňují vzájemnou přeměnu mezi alkoholy a aldehydy nebo ketony se snížením nikotinamid adenin dinukleotid (NAD+) do NADH. v lidé a mnoho dalších zvířata, slouží k rozkladu alkoholů, které jsou jinak toxické, a také se podílejí na tvorbě užitečných aldehydových, ketonových nebo alkoholových skupin během biosyntézy různých látek metabolity. v droždí, rostliny a mnoho dalších bakterie, některé alkoholové dehydrogenázy katalyzovat opačná reakce jako součást kvašení zajistit stálý přísun NAD+.
Vývoj
Genetické důkazy ze srovnání více organismů ukázaly, že a glutathion -závislý formaldehyddehydrogenáza, shodný s a alkoholová dehydrogenáza třídy III (ADH-3 / ADH5), se předpokládá, že je původním enzymem pro celou rodinu ADH.[2][3][4] Na začátku evoluce byla důležitá účinná metoda eliminace endogenního i exogenního formaldehydu a tato kapacita v průběhu času zachovala předky ADH-3. Genová duplikace ADH-3, následovaný řadou mutací, vedl k vývoji dalších ADH.[3][4]
Schopnost vyrábět ethanol Předpokládá se, že z cukru (který je základem výroby alkoholických nápojů) se původně vyvinul droždí. Ačkoli tato vlastnost není adaptivní z energetického hlediska, kvasinkové buňky by mohly účinně eliminovat jejich soutěž tím, že vyrábějí alkohol v tak vysokých koncentracích, aby byly toxické pro jiné organismy. Vzhledem k tomu, že hnijící ovoce může obsahovat více než 4% ethanolu, zvířata konzumující ovoce potřebovala systém pro metabolizaci exogenního ethanolu. Předpokládalo se, že to vysvětluje zachování ethanolu aktivního ADH u jiných druhů než kvasinek, ačkoli je nyní známo, že ADH-3 má také hlavní roli v signalizace oxidu dusnatého.[5][6]
U lidí, sekvenování ADH1B gen (odpovědný za produkci alkohol dehydrogenázy polypeptid ) ukazuje několik funkčních variant. V jednom je a SNP (polymorfismus s jedním nukleotidy), který vede k histidinovému nebo argininovému zbytku v poloze 47 ve zralém polypeptidu. Ve variantě histidinu je enzym mnohem účinnější při výše uvedené přeměně.[7] Enzym odpovědný za přeměnu acetaldehydu na octan však zůstává nedotčen, což vede k rozdílným rychlostem katalýzy substrátu a způsobuje hromadění toxického acetaldehydu, což způsobuje poškození buněk.[7] To poskytuje určitou ochranu před nadměrnou konzumací alkoholu a závislostí na alkoholu (alkoholismus).[8][9][10][11] Různé haplotypy vznikající z této mutace jsou koncentrovanější v oblastech poblíž východní Číny, oblasti známé také pro nízkou toleranci a závislost na alkoholu.
Byla provedena studie s cílem najít korelaci mezi alelickou distribucí a alkoholismem a výsledky naznačují, že alelická distribuce vznikla spolu s pěstováním rýže v oblasti před 12 000 až 6 000 lety.[12] V oblastech, kde se pěstovala rýže, byla rýže také fermentována na ethanol.[12] To vedlo ke spekulacím, že zvýšená dostupnost alkoholu vede k alkoholismu a zneužívání, což má za následek nižší reprodukční zdatnost.[12] Ti, kteří mají variantní alelu, mají malou toleranci k alkoholu, čímž snižují pravděpodobnost závislosti a zneužívání.[7][12] Hypotéza předpokládá, že ti jedinci s enzymem histidinové varianty byli dostatečně citliví na účinky alkoholu, že vznikl rozdílný reprodukční úspěch a odpovídající alely procházely generacemi. Klasický Darwinovská evoluce by jednal proti selekční formě enzymu (varianta Arg) kvůli sníženému reprodukčnímu úspěchu jedinců nesoucích alelu. Výsledkem by byla vyšší frekvence alely odpovědné za His-variantní enzym v oblastech, které byly pod selektivním tlakem nejdelší. Distribuce a frekvence His varianty sleduje šíření pěstování rýže do vnitrozemských oblastí Asie, s vyšší frekvencí His varianty v oblastech, které pěstují rýži nejdelší.[7] Zdá se tedy, že geografické rozložení alel je výsledkem přirozeného výběru proti jedincům s nižší reprodukční úspěšností, konkrétně těm, kteří nosili alelu varianty Arg a byli náchylnější k alkoholismu.[13] Avšak perzistence varianty Arg v jiných populacích tvrdí, že účinek nemohl být silný.
Objev
Vůbec první izolovaná alkohol dehydrogenáza (ADH) byla čištěna v roce 1937 z Saccharomyces cerevisiae (pivovarské kvasnice).[14] Mnoho aspektů katalytické mechanismus pro enzym ADH z koňských jater zkoumali Hugo Theorell a spolupracovníci.[15] ADH byl také jedním z prvních oligomerních enzymů, u nichž byla určena jeho aminokyselinová sekvence a trojrozměrná struktura.[16][17][18]
Na začátku roku 1960 byl objeven u ovocných mušek rodu Drosophila.[19]
Vlastnosti
Alkohol dehydrogenázy obsahují skupinu několika isozymy které katalyzují oxidaci primárních a sekundárních alkoholů na aldehydy a ketony, v uvedeném pořadí, a také mohou katalyzovat reverzní reakci.[19] U savců se jedná o redox (redukční / oxidační) reakce zahrnující koenzym nikotinamid adenin dinukleotid (NAD+).
Oxidace alkoholu
Mechanismus účinku u lidí
Kroky
- Vazba koenzymu NAD+
- Vazba alkoholového substrátu koordinací na zinek
- Deprotonace His-51
- Deprotonace nikotinamid ribózy
- Deprotonace Thr-48
- Deprotonace alkoholu
- Hydridový přenos z alkoxid ion na NAD+, což vede k NADH a aldehydu nebo ketonu vázanému na zinek
- Uvolňování produktu aldehydu.
Mechanismus v kvasinkách a bakteriích je opakem této reakce. Tyto kroky jsou podporovány kinetickými studiemi.[20]
Zapojené podjednotky
Substrát je koordinován se zinkem a tento enzym má dva atomy zinku na podjednotku. Jedním z nich je aktivní místo, které se účastní katalýzy. V aktivním místě jsou ligandy Cys-46, Cys-174, His-67 a jedna molekula vody. Druhá podjednotka je zapojena do struktury. V tomto mechanismu jde hydrid z alkoholu do NAD+. Krystalové struktury naznačují, že His-51 deprotonuje nikotinamid ribózu, která deprotonuje Ser-48. Nakonec Ser-48 deprotonuje alkohol, což z něj činí aldehyd.[20] Z hlediska mechanismu, pokud enzym přidává hydrid do znovu tvář NAD+, výsledný vodík je inkorporován do polohy pro-R. Enzymy, které přidávají hydrid do obličeje, jsou považovány za dehydrogenázy třídy A.
Aktivní stránky
Aktivní místo lidského ADH1 (PDB: 1HSO) sestává z atomu zinku, His-67, Cys-174, Cys-46, Thr-48, His-51, Ile-269, Val-292, Ala-317 a Phe-319. V běžně studované izoformě koňských jater je Thr-48 Ser a Leu-319 Phe. Zinek koordinuje substrát (alkohol). Zinek je koordinován Cys-46, Cys-174 a His-67. Leu-319, Ala-317, His-51, Ile-269 a Val-292 stabilizují NAD+ formováním Vodíkové vazby. His-51 a Ile-269 tvoří vodíkové vazby s alkoholy na nikotinamid ribóze. Phe-319, Ala-317 a Val-292 tvoří vodíkové vazby s amidem na NAD+.[20]
Místo strukturního zinku
Savčí alkoholové dehydrogenázy mají také strukturní místo zinku. Tento ion Zn hraje strukturální roli a je zásadní pro stabilitu proteinu. Struktury katalytických a strukturních míst zinku v koňské játrové alkoholové dehydrogenáze (HLADH) odhalené v krystalografických strukturách, které byly studovány výpočetně jak kvantovou chemií, tak klasickými metodami molekulární dynamiky. Strukturní místo zinku je složeno ze čtyř blízko sebe umístěných cysteinových ligandů (Cys97, Cys100, Cys103 a Cys111 v aminokyselinové sekvenci) umístěných v téměř symetrickém čtyřstěnu kolem iontu Zn. Nedávná studie ukázala, že interakce mezi zinkem a cysteinem je řízena primárně elektrostatickým příspěvkem s dalším kovalentním příspěvkem k vazbě.[21]
Typy
Člověk
U lidí ADH existuje v několika formách jako dimer a je kódován nejméně sedmi různými geny. Existuje pět tříd (I-V) alkohol dehydrogenázy, ale jaterní formy, které se používají především u lidí, jsou třídy 1. Třída 1 se skládá z podjednotek α, β a γ, které jsou kódovány geny ADH1A, ADH1B, a ADH1C.[22][23] Enzym je přítomen ve vysokých hladinách v játra a podšívka žaludek.[24] Katalyzuje to oxidace z ethanol na acetaldehyd (ethanal):
- CH3CH2OH + NAD+ → CH3CHO + NADH + H+
To umožňuje spotřebu alkoholické nápoje, ale jeho evolučním účelem je pravděpodobně rozklad alkoholů přirozeně obsažených v potravinách nebo produkovaných bakterie v zažívací trakt.[25]
Dalším evolučním účelem může být metabolismus endogenního alkoholu vitamin A. (retinol ), který generuje hormon kyselina retinová i když zde může být primárně funkcí eliminace toxických hladin retinolu.[26][27]
|
|
|
Alkohol dehydrogenáza se také podílí na toxicitě jiných druhů alkoholu: například oxiduje methanolu k výrobě formaldehyd a nakonec kyselina mravenčí.[28] Lidé mají alespoň šest mírně odlišných alkohol dehydrogenáz. Každý je a dimer (tj. skládá se ze dvou polypeptidy ), přičemž každý dimer obsahuje dva zinek ionty Zn2+. Jeden z těchto iontů je zásadní pro činnost enzymu: Nachází se na katalytickém místě a drží hydroxyl skupina alkoholu na místě.
Aktivita alkohol dehydrogenázy se liší u mužů a žen, mezi mladými a starými a mezi populacemi z různých oblastí světa. Například mladé ženy nejsou schopny zpracovávat alkohol stejnou rychlostí jako mladí muži, protože alkoholdehydrogenázu nevyjadřují tak vysoko, i když u středního věku platí inverze.[29] Úroveň aktivity nemusí záviset pouze na úrovni vyjádření, ale také na alelický rozmanitost populace.
Lidské geny, které kódují alkoholové dehydrogenázy třídy II, III, IV a V, jsou ADH4, ADH5, ADH7, a ADH6, resp.
|
|
|
|
Kvasinky a bakterie
Na rozdíl od lidí, kvasinek a bakterií (kromě bakterie mléčného kvašení, a E-coli za určitých podmínek) nefermentujte glukózu na laktát. Místo toho to fermentují na ethanol a CO
2. Celková reakce je vidět níže:
- Glukóza + 2 ADP + 2 Pi → 2 ethanol + 2 CO2 + 2 ATP + 2 H2Ó[30]
v droždí[31] a mnoho bakterie, alkoholdehydrogenáza hraje důležitou roli při fermentaci: Pyruvát vyplývající z glykolýza se převádí na acetaldehyd a oxid uhličitý, a acetaldehyd se poté redukuje na ethanol pomocí alkoholohydrogenázy nazývané ADH1. Účelem tohoto druhého kroku je regenerace NAD+, aby mohla pokračovat glykolýza vytvářející energii. Lidé tento proces využívají k výrobě alkoholických nápojů tím, že nechávají kvasinky kvasit různé druhy ovoce nebo zrn. Kvasinky mohou vyrábět a konzumovat svůj vlastní alkohol.
Hlavní alkoholová dehydrogenáza v kvasnicích je větší než lidská a skládá se spíše ze čtyř než ze dvou podjednotek. Na svém katalytickém místě také obsahuje zinek. Spolu s alkoholovými dehydrogenázami obsahujícími zinek zvířat a lidí tvoří tyto enzymy z kvasinek a mnoha bakterií rodinu "alkoholových dehydrogenáz" s dlouhým řetězcem.
pivovarské kvasnice má také další alkohol dehydrogenázu, ADH2, který se vyvinul z duplikované verze chromozomu obsahujícího ADH1 gen. ADH2 je používán kvasinkami k přeměně ethanolu zpět na acetaldehyd a je vyjádřen pouze při nízké koncentraci cukru. Mít tyto dva enzymy umožňuje kvasinkám produkovat alkohol, když je jich dostatek (a tento alkohol pak zabíjí konkurenční mikroby) a poté pokračovat v oxidaci alkoholu, jakmile cukr zmizí, a konkurence je pryč.[32]
Rostliny
V rostlinách ADH katalyzuje stejnou reakci jako v kvasinkách a bakteriích, aby zajistil neustálý přísun NAD+. Kukuřice má dvě verze ADH - ADH1 a ADH2, Arabidopsis thaliana obsahuje pouze jeden gen ADH. Struktura Arabidopsis ADH je konzervován 47%, v porovnání s ADH z koňských jater. Strukturálně a funkčně důležité zbytky, jako je sedm zbytků, které poskytují ligandy pro katalytické a nekatalytické atomy zinku, jsou však zachovány, což naznačuje, že enzymy mají podobnou strukturu.[33] ADH je konstitutivně exprimován v nízkých hladinách v kořenech mladých rostlin pěstovaných na agaru. Pokud v kořenech chybí kyslík, projev ADH výrazně zvyšuje.[34] Jeho exprese se také zvyšuje v reakci na dehydrataci, na nízké teploty a na kyselina abscisová a hraje důležitou roli při dozrávání plodů, vývoji sazenic a vývoji pylu.[35] Rozdíly v posloupnosti ADH u různých druhů byly použity k vytvoření fylogeneze ukazuje, jak úzce souvisí různé druhy rostlin.[36] Je to ideální gen, který lze použít díky své pohodlné velikosti (2–3 kb na délku s ≈1 000 nukleotidovou kódující sekvencí) a nízkému počtu kopií.[35]
Obsahující železo
Alkohol dehydrogenáza obsahující železo | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
komplex bacillus stearothermophilus glycerol dehydrogenáza s glycerolem | |||||||||
Identifikátory | |||||||||
Symbol | Fe-ADH | ||||||||
Pfam | PF00465 | ||||||||
Pfam klan | CL0224 | ||||||||
InterPro | IPR001670 | ||||||||
STRÁNKA | PDOC00059 | ||||||||
SCOP2 | 1jqa / Rozsah / SUPFAM | ||||||||
|
Třetí rodina alkohol dehydrogenáz, která nesouvisí s výše uvedenými dvěma, je žehlička -obsahující. Vyskytují se v bakteriích a houbách. Ve srovnání s výše uvedenými enzymy jsou tyto enzymy citlivé na kyslík.[Citace je zapotřebí ]Členové rodiny dehydrogenázy obsahující železo zahrnují:
- Saccharomyces cerevisiae alkohol dehydrogenáza 4 (gen ADH4)[37]
- Zymomonas mobilis alkohol dehydrogenáza 2 (gen adhB)[38]
- Escherichia coli propandiol oxidoreduktáza ES 1.1.1.77 (gen fucO),[39] an enzym podílí se na metabolismus z fukóza a který také vypadá, že obsahuje železný ionty.
- Clostridium acetobutylicum NADPH - a NADH -závislé butanol dehydrogenázy ES 1.1.1.- (geny adh1, bdhA a bdhB),[40] enzymy, které mají aktivitu pomocí butanol a ethanol tak jako substráty.
- E-coli adhE,[41] enzym závislý na železu, který obsahuje tři různé aktivity: alkohol dehydrogenáza, acetaldehyddehydrogenáza (acetylace) ES 1.2.1.10 a pyruvát-formiát-lyáza deaktivovaná.
- Bakteriální glycerol dehydrogenáza ES 1.1.1.6 (gen gldA nebo dhaD).[42]
- Clostridium kluyveri Závisí na NAD 4-hydroxybutyrát dehydrogenáza (4 hbd) ES 1.1.1.61
- Citrobacter freundii a Klebsiella pneumoniae 1,3-propandiol dehydrogenáza ES 1.1.1.202 (gen dhaT)
- Bacillus methanolicus Závisí na NAD methanol dehydrogenáza ES 1.1.1.244[43]
- E-coli a Salmonella typhimurium ethanolamin využití protein eutG.
- E-coli hypotetický protein yiaY.
Jiné typy
Další třída alkohol dehydrogenáz patří do chinoenzymů a vyžaduje chinoidové kofaktory (např. Pyrrolochinolin chinon, PQQ) jako akceptory elektronů vázaných na enzym. Typickým příkladem pro tento typ enzymu je methyldehydrogenáza methylotrofních bakterií.
Aplikace
V biotransformaci se alkoholové dehydrogenázy často používají pro syntézu enantiomerně čistých stereoizomerů chirálních alkoholů. Často lze dosáhnout vysoké chemo- a enantioselektivity. Jedním příkladem je alkohol dehydrogenáza z Lactobacillus brevis (LbADH), který je popsán jako všestranný biokatalyzátor.[44] Vysoká chemospecificita byla potvrzena také v případě substrátů představujících dvě potenciálně redoxní místa. Například cinnamaldehyd představuje jak alifatickou dvojnou vazbu, tak aldehydovou funkci. Na rozdíl od běžných katalyzátorů jsou alkohol dehydrogenázy schopné selektivně působit pouze na druhé katalyzátory, čímž se získá výlučně skořicový alkohol.[45]
V palivových článcích mohou být použity alkohol dehydrogenázy ke katalyzování rozpadu paliva pro ethanol palivový článek. Vědci na Univerzita v Saint Louis použili alkoholovou dehydrogenázu na bázi uhlíku s poly (methylenová zeleň ) jako anoda, s a nafion membrány, aby bylo dosaženo asi 50 μA /cm2.[46]
V roce 1949 E. Racker definoval jednu jednotku aktivity alkohol dehydrogenázy jako množství, které způsobí změnu v optická hustota 0,001 za minutu za standardních podmínek test.[47] V poslední době je mezinárodní definice enzymatické jednotky (E.U.) běžnější: jedna jednotka alkoholdehydrogenázy převede 1,0 μmol ethanol na acetaldehyd za minutu při pH 8,8 při 25 ° C.[48]
Klinický význam
Alkoholismus
Byly provedeny studie, které ukazují, že změny v ADH mají vliv metabolismus ethanolu mít dopad na riziko závislosti na alkoholu.[8][9][10][11][49] Nejsilnější účinek je způsoben změnami v ADH1B, které zvyšují rychlost přeměny alkoholu na acetaldehyd. Jedna taková varianta je nejčastější u jedinců z východní Asie a Středního východu, další je nejčastější u jedinců z Afriky.[9] Obě varianty snižují riziko alkoholismu, ale jedinci se mohou stát alkoholikem i přes to. Vědci předběžně detekovali několik dalších genů, se kterými je spojeno alkoholismus, a vězte, že jich musí zůstat mnohem více.[50] Výzkum pokračuje s cílem identifikovat geny a jejich vliv na alkoholismus.
Drogová závislost
Drogová závislost je dalším problémem spojeným s ADH, o kterém si vědci myslí, že by mohl souviset s alkoholismem. Jedna konkrétní studie naznačuje, že drogová závislost je spojena se sedmi geny ADH, je však zapotřebí dalšího výzkumu.[51] Závislost na alkoholu a jiné drogové závislosti mohou sdílet některé rizikové faktory, ale protože alkoholová závislost je často doprovázena jinými drogovými závislostmi, nemusí být souvislost ADH s jinými drogovými závislostmi příčinná.
Otrava
Fomepizol lék, který kompetitivně inhibuje alkohol dehydrogenáza, lze použít při léčbě akutních methanolu[52] nebo ethylenglykol[53] toxicita. Tím se zabrání přeměně methanolu nebo ethylenglykolu na jeho toxické metabolity (např kyselina mravenčí, formaldehyd nebo glykolát ). Stejného efektu je někdy dosaženo také u ethanol, opět kompetitivní inhibicí ADH.
Metabolismus drog
Droga hydroxyzin je rozdělen na aktivní metabolit certizin alkohol dehydrogenázou. Jiné léky s alkoholovými skupinami mohou být metabolizovány podobným způsobem, pokud sterická zábrana nezabrání alkoholu v dosažení aktivního místa.[54]
Viz také
- Alkohol dehydrogenáza (NAD (P) +)
- Aldehyddehydrogenáza
- Oxidoreduktáza
- Obsah alkoholu v krvi pro rychlosti metabolismu
Reference
- ^ PDB: 1m6h; Sanghani PC, Robinson H, Bosron WF, Hurley TD (září 2002). "Lidská glutathion-dependentní formaldehyddehydrogenáza. Struktury apo, binárních a inhibičních ternárních komplexů". Biochemie. 41 (35): 10778–86. doi:10.1021 / bi0257639. PMID 12196016.
- ^ Gutheil WG, Holmquist B, Vallee BL (leden 1992). „Čištění, charakterizace a částečná sekvence na glutathion-dependentní formaldehyddehydrogenáze z Escherichia coli: alkoholová dehydrogenáza třídy III“. Biochemie. 31 (2): 475–81. doi:10.1021 / bi00117a025. PMID 1731906.
- ^ A b Danielsson O, Jörnvall H (říjen 1992). ""Enzymogenesis ": klasický původ jaterní alkoholové dehydrogenázy z linie formaldehyddehydrogenázy závislé na glutathionu". Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 89 (19): 9247–51. Bibcode:1992PNAS ... 89.9247D. doi:10.1073 / pnas.89.19.9247. PMC 50103. PMID 1409630.
- ^ A b Persson B, Hedlund J, Jörnvall H (prosinec 2008). „Rodiny genů a proteinů dehydrogenázy / reduktázy se středním a krátkým řetězcem: nadrodina MDR“. Buněčné a molekulární biologické vědy. 65 (24): 3879–94. doi:10.1007 / s00018-008-8587-z. PMC 2792335. PMID 19011751.
- ^ Staab CA, Hellgren M, Höög JO (prosinec 2008). „Skupiny genů a proteinů dehydrogenázy / reduktázy se středním a krátkým řetězcem: Duální funkce alkohol dehydrogenázy 3: důsledky se zaměřením na aktivity formaldehyddehydrogenázy a S-nitrosoglutathion reduktázy“. Buněčné a molekulární biologické vědy. 65 (24): 3950–60. doi:10.1007 / s00018-008-8592-2. PMID 19011746. S2CID 8574022.
- ^ Godoy L, Gonzàlez-Duarte R, Albalat R (2006). „S-nitrosogluthathionreduktázová aktivita amphioxu ADH3: pohledy na metabolismus oxidu dusnatého“. International Journal of Biological Sciences. 2 (3): 117–24. doi:10,7150 / ijbs.2.117. PMC 1458435. PMID 16763671.
- ^ A b C d Whitfield, John B (1994). „Genotypy ADH a ALDH ve vztahu k rychlosti a citlivosti metabolismu alkoholu“ (PDF). Alkohol a alkoholismus. 2: 59–65. PMID 8974317.[trvalý mrtvý odkaz ]
- ^ A b Thomasson HR, Edenberg HJ, Crabb DW, Mai XL, Jerome RE, Li TK, Wang SP, Lin YT, Lu RB, Yin SJ (duben 1991). „Genotypy alkoholu a aldehyde dehydrogenázy a alkoholismus u čínských mužů“. American Journal of Human Genetics. 48 (4): 677–81. PMC 1682953. PMID 2014795.
- ^ A b C Edenberg HJ, McClintick JN (říjen 2018). „Alkohol dehydrogenázy, aldehyddehydrogenázy a poruchy užívání alkoholu: kritický přehled“. Alkoholismus, klinický a experimentální výzkum. 42 (12): 2281–2297. doi:10,1111 / acer.13904. PMC 6286250. PMID 30320893.
- ^ A b Hurley TD, Edenberg HJ (2012). "Geny kódující enzymy podílející se na metabolismu ethanolu". Výzkum alkoholu. 34 (3): 339–44. PMC 3756590. PMID 23134050.
- ^ A b Walters RK, Polimanti R, Johnson EC, McClintick JN, Adams MJ, Adkins AE a kol. (Prosinec 2018). „Transancestrální GWAS závislosti na alkoholu odhaluje běžné genetické základy psychiatrických poruch“. Přírodní neurovědy. 21 (12): 1656–1669. doi:10.1038 / s41593-018-0275-1. PMC 6430207. PMID 30482948.
- ^ A b C d Peng Y, Shi H, Qi XB, Xiao CJ, Zhong H, Ma RL, Su B (leden 2010). „Polymorfismus ADH1B Arg47His ve východoasijských populacích a expanze domestikace rýže v historii“. BMC Evoluční biologie. 10: 15. doi:10.1186/1471-2148-10-15. PMC 2823730. PMID 20089146.
- ^ Eng MY (1. ledna 2007). "Výzkum alkoholu a zdraví". Svět zdraví a výzkumu alkoholu. Vládní tiskárna USA. ISSN 1535-7414.
- ^ Negelein E, Wulff HJ (1937). "Diphosphopyridinproteid ackohol, acetaldehyd". Biochem. Z. 293: 351.
- ^ Theorell H, McKEE JS (říjen 1961). "Mechanismus účinku jaterní alkohol dehydrogenázy". Příroda. 192 (4797): 47–50. Bibcode:1961Natur.192 ... 47T. doi:10.1038 / 192047a0. PMID 13920552. S2CID 19199733.
- ^ Jörnvall H, Harris JI (duben 1970). „Alkohol dehydrogenáza z koňských jater. O primární struktuře izoenzymu aktivního v ethanolu“. European Journal of Biochemistry. 13 (3): 565–76. doi:10.1111 / j.1432-1033.1970.tb00962.x. PMID 5462776.
- ^ Brändén CI, Eklund H, Nordström B, Boiwe T, Söderlund G, Zeppezauer E, Ohlsson I, Akeson A (srpen 1973). "Struktura jaterní alkohol dehydrogenázy při rozlišení 2,9 angstromu". Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 70 (8): 2439–42. Bibcode:1973PNAS ... 70,2439B. doi:10.1073 / pnas.70.8.2439. PMC 433752. PMID 4365379.
- ^ Hellgren M (2009). Enzymatické studie alkohol dehydrogenázy kombinací metod in vitro a in silico, disertační práce (PDF). Stockholm, Švédsko: Karolinska Institutet. str. 70. ISBN 978-91-7409-567-8.
- ^ A b Sofer W, Martin PF (1987). "Analýza exprese genu pro alkohol dehydrogenázu v Drosophila". Výroční přehled genetiky. 21: 203–25. doi:10.1146 / annurev.ge.21.120187.001223. PMID 3327463.
- ^ A b C Hammes-Schiffer S, Benkovic SJ (2006). "Souvisí pohyb bílkovin s katalýzou". Roční přehled biochemie. 75: 519–41. doi:10,1146 / annurev.biochem.75.103004.142800. PMID 16756501.
- ^ Brandt EG, Hellgren M, Brinck T, Bergman T, Edholm O (únor 2009). "Studium molekulární dynamiky vazby zinku na cysteiny v peptidové napodobenině strukturního místa zinku s alkohol dehydrogenázou". Fyzikální chemie Chemická fyzika. 11 (6): 975–83. Bibcode:2009PCCP ... 11..975B. doi:10.1039 / b815482a. PMID 19177216.
- ^ Sultatos LG, Pastino GM, Rosenfeld CA, Flynn EJ (březen 2004). „Začlenění genetické kontroly alkohol dehydrogenázy do fyziologicky založeného farmakokinetického modelu etanolu u lidí“. Toxikologické vědy. 78 (1): 20–31. doi:10.1093 / toxsci / kfh057. PMID 14718645.
- ^ Edenberg HJ, McClintick JN (prosinec 2018). „Alkoholdehydrogenázy, aldehyddehydrogenázy a poruchy užívání alkoholu: kritický přehled“. Alkoholismus, klinický a experimentální výzkum. 42 (12): 2281–2297. doi:10,1111 / acer.13904. PMC 6286250. PMID 30320893.
- ^ Farrés J, Moreno A, Crosas B, Peralba JM, Allali-Hassani A, Hjelmqvist L a kol. (Září 1994). "Alkohol dehydrogenáza třídy IV (sigma sigma-ADH) z lidského žaludku. CDNA sekvence a vztahy struktura / funkce". European Journal of Biochemistry. 224 (2): 549–57. doi:10.1111 / j.1432-1033.1994.00549.x. PMID 7925371.
- ^ Kovacs B, Stöppler MC. „Alkohol a výživa“. MedicineNet, Inc. Archivovány od originál dne 23. června 2011. Citováno 7. června 2011.
- ^ Duester G (září 2008). „Syntéza a signalizace kyseliny retinové během časné organogeneze“. Buňka. 134 (6): 921–31. doi:10.1016 / j.cell.2008.09.002. PMC 2632951. PMID 18805086.
- ^ Hellgren M, Strömberg P, Gallego O, Martras S, Farrés J, Persson B, Parés X, Höög JO (únor 2007). „Alkohol dehydrogenáza 2 je hlavním jaterním enzymem pro metabolismus lidského retinolu.“ Buněčné a molekulární biologické vědy. 64 (4): 498–505. doi:10.1007 / s00018-007-6449-8. PMID 17279314. S2CID 21612648.
- ^ Ashurst, John V .; Nappe, Thomas M. (2020), „Toxicita methanolu“, StatPearls, Ostrov pokladů (FL): StatPearls Publishing, PMID 29489213, vyvoláno 6. listopadu 2020
- ^ Parlesak A, Billinger MH, Bode C, Bode JC (2002). „Žaludeční aktivita alkohol dehydrogenázy u člověka: vliv pohlaví, věku, konzumace alkoholu a kouření v kavkazské populaci“. Alkohol a alkoholismus. 37 (4): 388–93. doi:10.1093 / alcalc / 37.4.388. PMID 12107043.
- ^ Cox M, Nelson DR, Lehninger AL (2005). Lehningerovy principy biochemie. San Francisco: W. H. Freeman. str.180. ISBN 978-0-7167-4339-2.
- ^ Leskovac V, Trivić S, Pericin D (prosinec 2002). „Tři alkoholové dehydrogenázy obsahující zinek z pekařských kvasnic, Saccharomyces cerevisiae“. Výzkum kvasinek FEMS. 2 (4): 481–94. doi:10.1111 / j.1567-1364.2002.tb00116.x. PMID 12702265.
- ^ Coghlan A (23. prosince 2006). „Slavnostní speciál: Pivovarský příběh - život“. Nový vědec. Archivováno z původního dne 15. září 2008. Citováno 27. dubna 2009.
- ^ Chang C, Meyerowitz EM (březen 1986). "Molekulární klonování a sekvence DNA genu pro alkohol dehydrogenázu Arabidopsis thaliana". Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 83 (5): 1408–12. Bibcode:1986PNAS ... 83.1408C. doi:10.1073 / pnas.83.5.1408. PMC 323085. PMID 2937058.
- ^ Chung HJ, Ferl RJ (říjen 1999). „Exprese alkoholu dehydrogenázy Arabidopsis v výhoncích i kořenech je podmíněna růstovým prostředím kořenů“. Fyziologie rostlin. 121 (2): 429–36. doi:10.1104 / pp.121.2.429. PMC 59405. PMID 10517834.
- ^ A b Thompson CE, Fernandes CL, de Souza ON, de Freitas LB, Salzano FM (květen 2010). "Hodnocení dopadu funkční diverzifikace na enzymy Poaceae, Brassicaceae, Fabaceae a Pinaceae alkohol dehydrogenázy". Journal of Molecular Modeling. 16 (5): 919–28. doi:10.1007 / s00894-009-0576-0. PMID 19834749. S2CID 24730389.
- ^ Järvinen P, Palmé A, Orlando Morales L, Lännenpää M, Keinänen M, Sopanen T, Lascoux M (listopad 2004). "Fylogenetické vztahy druhů Betula (Betulaceae) na základě jaderných sekvencí ADH a chloroplastových matK". American Journal of Botany. 91 (11): 1834–45. doi:10.3732 / ajb.91.11.1834. PMID 21652331. Archivováno z původního dne 26. května 2010.
- ^ Williamson VM, Paquin CE (září 1987). „Homology of Saccharomyces cerevisiae ADH4 to an iron-activated alcohol dehydrogenase from Zymomonas mobilis“. Molekulární a obecná genetika. 209 (2): 374–81. doi:10.1007 / bf00329668. PMID 2823079. S2CID 22397371.
- ^ Conway T, Sewell GW, Osman YA, Ingram LO (červen 1987). „Klonování a sekvenování genu pro alkohol dehydrogenázu II ze Zymomonas mobilis“. Journal of Bacteriology. 169 (6): 2591–7. doi:10.1128 / jb.169.6.2591-2597.1987. PMC 212129. PMID 3584063.
- ^ Conway T, Ingram LO (červenec 1989). „Podobnost propandiol-oxidoreduktázy z Escherichia coli (produkt fucO) a neobvyklé alkoholové dehydrogenázy ze Zymomonas mobilis a Saccharomyces cerevisiae“. Journal of Bacteriology. 171 (7): 3754–9. doi:10.1128 / jb.171.7.3754-3759.1989. PMC 210121. PMID 2661535.
- ^ Walter KA, Bennett GN, Papoutsakis ET (listopad 1992). "Molekulární charakterizace dvou genů isozymu Clostridium acetobutylicum ATCC 824 butanol dehydrogenázy". Journal of Bacteriology. 174 (22): 7149–58. doi:10.1128 / jb.174.22.7149-7158.1992. PMC 207405. PMID 1385386.
- ^ Kessler D, Leibrecht I, Knappe J (duben 1991). „Pyruvát-formiát-lyázová-deaktivační a acetyl-CoA reduktázová aktivita Escherichia coli spočívá na polymerních proteinových částicích kódovaných adhE“. FEBS Dopisy. 281 (1–2): 59–63. doi:10.1016 / 0014-5793 (91) 80358-A. PMID 2015910. S2CID 22541869.
- ^ Truniger V, Boos W (březen 1994). "Mapování a klonování gldA, strukturního genu glyceroldehydrogenázy z Escherichia coli". Journal of Bacteriology. 176 (6): 1796–800. doi:10.1128 / jb.176.6.1796-1800.1994. PMC 205274. PMID 8132480.
- ^ de Vries GE, Arfman N, Terpstra P, Dijkhuizen L (srpen 1992). „Klonování, exprese a sekvenční analýza genu Bacillus methanolicus C1 v methanolu dehydrogenáze“. Journal of Bacteriology. 174 (16): 5346–53. doi:10.1128 / jb.174.16.5346-5353.1992. PMC 206372. PMID 1644761.
- ^ Leuchs S, Greiner L (2011). "Alkohol dehydrogenáza z Lactobacillus brevis: Všestranný katalyzátor enenatioselektivní redukce " (PDF). CABEQ: 267–281.[trvalý mrtvý odkaz ]
- ^ Zucca P, Littarru M, Rescigno A, Sanjust E (květen 2009). „Kofaktorová recyklace pro selektivní enzymatickou biotransformaci cinnamaldehydu na cinnamylalkohol“. Bioscience, biotechnologie a biochemie. 73 (5): 1224–6. doi:10,1271 / bbb.90025. PMID 19420690. S2CID 28741979.
- ^ Moore CM, Minteer SD, Martin RS (únor 2005). „Mikročip na bázi ethanolu / kyslíku v biopalivu“. Laboratoř na čipu. 5 (2): 218–25. doi:10.1039 / b412719f. PMID 15672138.
- ^ Racker E (květen 1950). "Krystalický alkohol dehydrogenáza z pekařských kvasnic". The Journal of Biological Chemistry. 184 (1): 313–9. PMID 15443900.
- ^ „Enzymatická analýza alkoholdehydrogenázy (EC 1.1.1.1)“. Sigma Aldrich. Citováno 13. července 2015.
- ^ Sanchez-Roige, Sandra; Palmer, Abraham A .; Fontanillas, Pierre; Elson, Sarah L .; Adams, Mark J .; Howard, David M .; Edenberg, Howard J .; Davies, Gail; Crist, Richard C .; Deary, Ian J .; McIntosh, Andrew M. (1. února 2019). „Genomová asociační studie metaanalýza testu identifikace poruchy užívání alkoholu (AUDIT) ve dvou populačních kohortách“. American Journal of Psychiatry. 176 (2): 107–118. doi:10.1176 / appi.ajp.2018.18040369. ISSN 0002-953X. PMC 6365681. PMID 30336701.
- ^ Kranzler, Henry R .; Zhou, Hang; Kember, Rachel L .; Vickers Smith, Rachel; Justice, Amy C .; Damrauer, Scott; Tsao, Philip S .; Klarin, Derek; Baras, Aris; Reid, Jeffrey; Overton, John (2. dubna 2019). „Celomanomová asociační studie poruchy konzumace a užívání alkoholu u 274 424 jedinců z více populací“. Příroda komunikace. 10 (1): 1499. Bibcode:2019NatCo..10,1499 tis. doi:10.1038 / s41467-019-09480-8. ISSN 2041-1723. PMC 6445072. PMID 30940813.
- ^ Luo X, Kranzler HR, Zuo L, Wang S, Schork NJ, Gelernter J (únor 2007). „Více genů ADH moduluje riziko drogové závislosti u afroameričanů i Evropanů“. Lidská molekulární genetika. 16 (4): 380–90. doi:10,1093 / hmg / ddl460. PMC 1853246. PMID 17185388.
- ^ Mezinárodní program pro chemickou bezpečnost (IPCS): methanol (PIM 335), [1], získaný dne 1. března 2008
- ^ Velez LI, Shepherd G, Lee YC, Keyes DC (září 2007). „Požití ethylenglykolu léčeno pouze fomepizolem“. Journal of Medical Toxicology. 3 (3): 125–8. doi:10.1007 / BF03160922. PMC 3550067. PMID 18072148.
- ^ Nelson W (2013). „Kapitola 36: Nesteroidní protizánětlivé léky“. Ve Foye WO, Lemke TL, Williams DA (eds.). Foyeho principy léčivé chemie (7. vydání). Philadelphia: Wolters Kluwer Health / Lippincott Williams & Wilkins. ISBN 978-1-60913-345-0.
externí odkazy
- PDBsum má vazby na trojrozměrné struktury různých alkohol dehydrogenáz obsažených v Proteinová datová banka
- EXPASY obsahuje odkazy na sekvence alkohol dehydrogenázy v Swiss-Prot, do a Medline literární rešerše o enzymu a záznamy v jiných databázích.
- PDBe-KB poskytuje přehled všech strukturních informací dostupných v PDB pro alkohol dehydrogenázu 1A.
- PDBe-KB poskytuje přehled všech strukturních informací dostupných v PDB pro alkohol dehydrogenázu 1B.
- PDBe-KB poskytuje přehled všech strukturních informací dostupných v PDB pro alkohol dehydrogenázu 1C.
- PDBe-KB poskytuje přehled všech strukturních informací dostupných v PDB pro Alkohol dehydrogenázu 4.
- PDBe-KB poskytuje přehled všech strukturních informací dostupných v PDB pro alkohol-dehydrogenázu třídy-3.