Fosfoglukonátdehydrogenáza - Phosphogluconate dehydrogenase

6PGD
PDB 1pgq EBI.jpg
Krystalografická struktura ovčí 6-fosfoglukonátdehydrogenázy v komplexu s adenosin-2'-monofosfátem.[1]
Identifikátory
Symbol6PGD
PfamPF00393
Pfam klanCL0106
InterProIPR006114
STRÁNKAPDOC00390
SCOP22pgd / Rozsah / SUPFAM
Fosfoglukonátdehydrogenáza
Identifikátory
EC číslo1.1.1.44
Číslo CAS9001-82-5
Databáze
IntEnzIntEnz pohled
BRENDAVstup BRENDA
EXPASYPohled NiceZyme
KEGGVstup KEGG
MetaCycmetabolická cesta
PRIAMprofil
PDB strukturRCSB PDB PDBe PDBsum
Genová ontologieAmiGO / QuickGO
fosfoglukonátdehydrogenáza
Identifikátory
SymbolPGD
Gen NCBI5226
HGNC8891
OMIM172200
RefSeqNM_002631
UniProtP52209
Další údaje
EC číslo1.1.1.44
MístoChr. 1 p36.3-36.13

6-fosfoglukonátdehydrogenáza (6PGD) je enzym v pentóza fosfátová cesta. Tvoří se ribulosa 5-fosfát z 6-fosfoglukonát:

6-fosfo-D-glukonát + NAD (P)+ 6-fosfo-2-dehydro-D-glukonát + NAD (P) H + H+

Jedná se o oxidační karboxylázu katalýzy dekarboxylace snížení z 6-fosfoglukonát do ribulosa 5-fosfát v přítomnosti NADP. Tato reakce je součástí hexóza mono-fosfátový zkrat a dráhy pentózofosfátu (PPP).[2][3] Prokaryotický a eukaryotický 6PGD jsou bílkoviny asi 470 aminokyseliny jehož sekvence jsou vysoce konzervativní.[4] Protein je a homodimer ve kterém monomery jednat nezávisle:[3] každý obsahuje velký, hlavně alfa-šroubovice doména a menší beta-alfa-beta doména, obsahující smíšené paralelní a antiparalelní 6vláknové beta list.[3] NADP je vázán v rozštěpu v malé doméně, Podklad vazba v sousední kapse.[3]

Klinický význam

Výsledkem jsou mutace v genu kódujícím tento enzym Nedostatek 6-fosfoglukonátdehydrogenázy, an autosomální dědičné onemocnění postihující červené krvinky.

Jako možný lékový cíl

6PGD se podílí na metabolismu rakovinných buněk, takže byly hledány inhibitory 6PGD.[5]

Viz také

Reference

  1. ^ PDB: 1PGQ​; Adams MJ, Ellis GH, Gover S, Naylor CE, Phillips C (červenec 1994). „Krystalografická studie koenzymu, analogu koenzymu a vazby na substrát v 6-fosfoglukonátdehydrogenáze: důsledky pro specificitu NADP a mechanismus enzymu“. Struktura. 2 (7): 651–68. doi:10.1016 / s0969-2126 (00) 00066-6. PMID  7922042.
  2. ^ Broedel SE, Wolf RE (červenec 1990). „Genetické značení, klonování a DNA sekvence genu PCN 7942 (gnd) kmene Synechococcus sp. Kódujícího 6-fosfoglukonátdehydrogenázu“. J. Bacteriol. 172 (7): 4023–31. doi:10.1128 / jb.172.7.4023-4031.1990. PMC  213388. PMID  2113917.
  3. ^ A b C d Adams MJ, Archibald IG, Bugg CE, Carne A, Gover S, Helliwell JR, Pickersgill RW, White SW (1983). „Trojrozměrná struktura 6-fosfoglukonátdehydrogenázy z ovčích jater v rozlišení 2,6 A“. EMBO J.. 2 (6): 1009–14. doi:10.1002 / j.1460-2075.1983.tb01535.x. PMC  555222. PMID  6641716.
  4. ^ Reizer A, Deutscher J, Saier MH, Reizer J (květen 1991). "Analýza glukonátového (gnt) operonu Bacillus subtilis". Mol. Microbiol. 5 (5): 1081–9. doi:10.1111 / j.1365-2958.1991.tb01880.x. PMID  1659648.
  5. ^ 6-fosfoglukonátdehydrogenáza spojuje oxidační PPP, lipogenezi a růst nádoru inhibicí signalizace LKB1 – AMPK. 2015
  • Frampton EW, Wood WA (1961). "Oxidace sacharidů pomocí Pseudomonas fluorescens VI. Konverze 2-keto-6-fosfoglukonátu na pyruvát ". J. Biol. Chem. 236: 2571–2577. PMID  13894458.
Tento článek včlení text od public domain Pfam a InterPro: IPR006114