ARHGAP5 - ARHGAP5

ARHGAP5
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2EE4, 2EE5
Identifikátory
Aliasy	ARHGAP5, GFI2, RhoGAP5, p190-B, p190BRhoGAP, protein aktivující Rho GTPázu 5
Externí ID	OMIM: 602680 MGI: 1332637 HomoloGene: 907 Genové karty: ARHGAP5
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 14 (lidský)
Konec	32,159,728 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 12 (myš)
Konec	52,571,975 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Vazba GTP; • Vazba domény SH2; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • GO: 0005097, GO: 0005099, GO: 0005100 Aktivátor aktivity GTPázy; • Aktivita GTPázy;
Buněčná složka	• endoplazmatické retikulum; • membrána; • cytoplazma; • cytosol; • buněčná membrána;
Biologický proces	• buněčná adheze; • regulace přenosu signálu zprostředkovaného malou GTPázou; • Rho proteinová signální transdukce; • signální transdukce; • vývoj mléčné žlázy; • GO: 0032320, GO: 0032321, GO: 0032855, GO: 0043089, GO: 0032854 pozitivní regulace aktivity GTPázy;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	394
	11855
	ENSG00000100852
	ENSMUSG00000035133
	Q13017
	P97393
	NM_001030055; NM_001173
	NM_009706
	NP_001025226; NP_001164
	NP_033836
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Rho protein aktivující GTPázu 5 je enzym že u lidí je kódován ARHGAP5 gen.^[5]^[6]

Funkce

Rho GTPáza aktivující protein 5 negativně reguluje RHO GTPasy, rodinu, která může zprostředkovat změny cytoskeletu stimulací hydrolýzy navázaného GTP. Pro tento gen byly nalezeny dvě varianty transkriptu kódující různé izoformy.^[6]

Interakce

ARHGAP5 bylo prokázáno komunikovat s Rnd1,^[7] Rnd2,^[7] Rnd3^[7] a RHOA.^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000100852 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000035133 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Burbelo PD, Miyamoto S, Utani A, Brill S, Yamada KM, hala A, Yamada Y (1995). „p190-B, nový člen rodiny Rho GAP, a Rho jsou indukovány klastrováním po zesíťování integrinu“. J. Biol. Chem. 270 (52): 30919–26. doi:10.1074 / jbc.270.52.30919. PMID 8537347.
^ ^A ^b "Entrez Gene: ARHGAP5 Rho GTPáza aktivující protein 5".
^ ^A ^b ^C ^d Wennerberg K, Forget MA, Ellerbroek SM, Arthur WT, Burridge K, Settleman J, Der CJ, Hansen SH (červenec 2003). "Rnd proteiny fungují jako antagonisté RhoA aktivací p190 RhoGAP". Curr. Biol. 13 (13): 1106–15. doi:10.1016 / S0960-9822 (03) 00418-4. PMC 6918695. PMID 12842009.

externí odkazy

Člověk ARHGAP5 umístění genomu a ARHGAP5 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

Další čtení

Ellis C, Moran M, McCormick F, Pawson T (1990). „Fosforylace GAP a proteinů asociovaných s GAP transformací a mitogenními tyrosinkinázami“. Příroda. 343 (6256): 377–81. doi:10.1038 / 343377a0. hdl:1807/9436. PMID 1689011.
Foster R, Hu KQ, Shaywitz DA, Settleman J (1994). „p190 RhoGAP, hlavní protein asociovaný s RasGAP, váže přímo GTP“. Mol. Buňka. Biol. 14 (11): 7173–81. doi:10,1128 / mcb.14.11.7173. PMC 359251. PMID 7935432.
McGlade J, Brunkhorst B, Anderson D, Mbamalu G, Settleman J, Dedhar S, Rozakis-Adcock M, Chen LB, Pawson T (1993). „N-koncová oblast GAP reguluje cytoskeletální strukturu a adhezi buněk“. EMBO J.. 12 (8): 3073–81. doi:10.1002 / j.1460-2075.1993.tb05976.x. PMC 413572. PMID 8344248.
Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (1996). „Normalizace a odčítání: dva přístupy k usnadnění objevování genů“. Genome Res. 6 (9): 791–806. doi:10,1101 / gr. 6.9.791. PMID 8889548.
Zrihan-Licht S, Fu Y, Settleman J, Schinkmann K, Shaw L, Keydar I, Avraham S, Avraham H (2000). „RAFTK / Pyk2 tyrosinkináza zprostředkovává asociaci p190 RhoGAP s RasGAP a podílí se na invazi buněk rakoviny prsu“. Onkogen. 19 (10): 1318–28. doi:10.1038 / sj.onc.1203422. PMID 10713673.
Kulkarni SV, Gish G, van der Geer P, Henkemeyer M, Pawson T (2000). "Role p120 Ras-GAP v řízeném pohybu buněk". J. Cell Biol. 149 (2): 457–70. doi:10.1083 / jcb.149.2.457. PMC 2175152. PMID 10769036.
Chakravarty G, Roy D, Gonzales M, Gay J, Contreras A, Rosen JM (2000). „P190-B, protein aktivující Rho-GTPázu, je odlišně exprimován v koncových pupenech a rakovině prsu“. Růst buněk se liší. 11 (7): 343–54. PMID 10939588.
Shiota M, Tanihiro T, Nakagawa Y, Aoki N, Ishida N, Miyazaki K, Ullrich A, Miyazaki H (2003). „Protein tyrosin fosfatáza PTP20 indukuje reorganizaci aktinového cytoskeletu defosforylací p190 RhoGAP v krysích ovariálních granulózních buňkách stimulovaných folikuly stimulujícím hormonem“. Mol. Endokrinol. 17 (4): 534–49. doi:10.1210 / me.2002-0187. PMID 12554790.
Wennerberg K, Forget MA, Ellerbroek SM, Arthur WT, Burridge K, Settleman J, Der CJ, Hansen SH (2003). "Rnd proteiny fungují jako antagonisté RhoA aktivací p190 RhoGAP". Curr. Biol. 13 (13): 1106–15. doi:10.1016 / S0960-9822 (03) 00418-4. PMC 6918695. PMID 12842009.
Su L, Agati JM, Parsons SJ (2003). „p190RhoGAP je regulován buněčným cyklem a ovlivňuje cytokinezi“. J. Cell Biol. 163 (3): 571–82. doi:10.1083 / jcb.200308007. PMC 2173658. PMID 14610059.
Colland F, Jacq X, Trouplin V, Mougin C, Groizeleau C, Hamburger A, Meil A, Wojcik J, Legrain P, Gauthier JM (2004). "Funkční proteomické mapování lidské signální dráhy". Genome Res. 14 (7): 1324–32. doi:10,1101 / gr. 2334104. PMC 442148. PMID 15231748.
Blanchetot C, Chagnon M, Dubé N, Hallé M, Tremblay ML (2005). "Techniky zachycování substrátů při identifikaci celulárních cílů PTP". Metody. 35 (1): 44–53. doi:10.1016 / j.ymeth.2004.07.007. PMID 15588985.
Vargo-Gogola T, Heckman BM, Gunther EJ, Chodosh LA, Rosen JM (2006). „Nadměrná exprese proteinu aktivujícího P190-B Rho GTPázu narušuje duktální morfogenezi a indukuje hyperplastické léze ve vyvíjející se mléčné žláze“. Mol. Endokrinol. 20 (6): 1391–405. doi:10.1210 / me.2005-0426. PMID 16469769.
Zhan X, Desiderio DM (2006). „Nitroproteiny z tkáně lidského adenomu hypofýzy objevené pomocí nitrotyrosinové afinitní kolony a tandemové hmotnostní spektrometrie“. Anální. Biochem. 354 (2): 279–89. doi:10.1016 / j.ab.2006.05.024. PMID 16777052.

Tento článek o gen na lidský chromozom 14 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000100852 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000035133 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid8537347-5] Burbelo PD, Miyamoto S, Utani A, Brill S, Yamada KM, hala A, Yamada Y (1995). „p190-B, nový člen rodiny Rho GAP, a Rho jsou indukovány klastrováním po zesíťování integrinu“. J. Biol. Chem. 270 (52): 30919–26. doi:10.1074 / jbc.270.52.30919. PMID 8537347.

[entrez-6] A ^b "Entrez Gene: ARHGAP5 Rho GTPáza aktivující protein 5".

[pmid12842009-7] A ^b ^C ^d Wennerberg K, Forget MA, Ellerbroek SM, Arthur WT, Burridge K, Settleman J, Der CJ, Hansen SH (červenec 2003). "Rnd proteiny fungují jako antagonisté RhoA aktivací p190 RhoGAP". Curr. Biol. 13 (13): 1106–15. doi:10.1016 / S0960-9822 (03) 00418-4. PMC 6918695. PMID 12842009.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]