UBXD5 - UBXD5

UBXN11
Identifikátory
Aliasy	UBXN11, COA-1, SOC, SOCI, UBXD5, PP2243, protein domény UBX 11
Externí ID	OMIM: 609151 MGI: 1914836 HomoloGene: 12159 Genové karty: UBXN11
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 1 (lidský)
Konec	26,318,363 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 4 (myš)
Konec	134,127,593 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• ubikvitinová vazba; • GO: 0001948 vazba na proteiny;
Buněčná složka	• cytoplazma; • cytoskelet;
Biologický proces	• proteazomem zprostředkovaný katabolický proces proteinu závislý na ubikvitinu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	91544
	67586
	ENSG00000158062
	ENSMUSG00000012126
	Q5T124
	Q9D572
	NM_183008; NM_001077262; NM_145345
	NM_026257
	NP_001070730; NP_663320; NP_892120
	NP_080533
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Protein obsahující UBX doménu 11 je protein že u lidí je kódován UBXN11 gen.^[5]^[6]

Funkce

Tento gen kóduje protein s odlišnou C-koncovou doménou UBX. Homologní protein u krysy interaguje s členy Rnd podrodiny Rho GTPáz na periferii buňky prostřednictvím své C-koncové oblasti. Interaguje také s několika heterotrimerními G proteiny prostřednictvím svých G-alfa podjednotek a podporuje aktivaci Rho GTPázy. Navrhuje se, aby sloužil obousměrně při podpoře a inhibici aktivity Rho prostřednictvím signálních drah proti proudu. 3 'kódující sekvence tohoto genu obsahuje polymorfní oblast 24 nt tandemových opakování. Bylo popsáno několik přepisů obsahujících mezi 1,5 a pěti opakovanými jednotkami. Pro tento gen bylo nalezeno několik variant transkriptu kódujících různé izoformy.^[6]

Interakce

UBXD5 bylo prokázáno komunikovat s Rnd1,^[5] Rnd2^[5] a Rnd3.^[5]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000158062 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000012126 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b ^C ^d Katoh H, Harada A, Mori K, Negishi M (duben 2002). „Socius je nový protein interagující s Rnd GTPázou, který se podílí na rozkladu aktinových stresových vláken“. Mol. Buňka. Biol. 22 (9): 2952–64. doi:10.1128 / MCB.22.9.2952-2964.2002. PMC 133765. PMID 11940653.
^ ^A ^b „Entrez Gene: UBXD5 UBX doména obsahující 5“.

Další čtení

Andersson B, Wentland MA, Ricafrente JY, Liu W, Gibbs RA (1996). „Metoda„ dvojitého adaptéru “pro vylepšenou konstrukci knihovny brokovnic“. Anální. Biochem. 236 (1): 107–13. doi:10.1006 / abio.1996.0138. PMID 8619474.
Yu W, Andersson B, Worley KC, Muzny DM, Ding Y, Liu W, Ricafrente JY, Wentland MA, Lennon G, Gibbs RA (1997). "Velké zřetězení cDNA sekvenování". Genome Res. 7 (4): 353–8. doi:10,1101 / gr. 7.4.353. PMC 139146. PMID 9110174.
Maccalli C, Li YF, El-Gamil M, Rosenberg SA, Robbins PF (2003). „Identifikace antigenu spojeného s kolorektálním nádorem (COA-1) rozpoznaného CD4 (+) T lymfocyty“. Cancer Res. 63 (20): 6735–43. PMC 2275323. PMID 14583468.
Colland F, Jacq X, Trouplin V, Mougin C, Groizeleau C, Hamburger A, Meil A, Wojcik J, Legrain P, Gauthier JM (2004). "Funkční proteomické mapování lidské signální dráhy". Genome Res. 14 (7): 1324–32. doi:10,1101 / gr. 2334104. PMC 442148. PMID 15231748.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (2005). „Směrem k mapě interakční sítě lidský protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514.
Tateiwa K, Katoh H, Negishi M (2005). „Socius, nový vazebný partner Galpha12 / 13, podporuje aktivaci RhoA vyvolanou Galpha12“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 337 (2): 615–20. doi:10.1016 / j.bbrc.2005.09.097. PMID 16202387.
Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y, Ota T, Nishikawa T, Yamashita R, Yamamoto J, Sekine M, Tsuritani K, Wakaguri H, Ishii S, Sugiyama T, Saito K, Isono Y, Irie R, Kushida N, Yoneyama T , Otsuka R, Kanda K, Yokoi T, Kondo H, Wagatsuma M, Murakawa K, Ishida S, Ishibashi T, Takahashi-Fujii A, Tanase T, Nagai K, Kikuchi H, Nakai K, Isogai T, Sugano S (2006) . „Diverzifikace transkripční modulace: rozsáhlá identifikace a charakterizace domnělých alternativních promotorů lidských genů“. Genome Res. 16 (1): 55–65. doi:10,1101 / gr. 4039406. PMC 1356129. PMID 16344560.

Tento článek o gen na lidský chromozom 1 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000158062 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000012126 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid11940653-5] A ^b ^C ^d Katoh H, Harada A, Mori K, Negishi M (duben 2002). „Socius je nový protein interagující s Rnd GTPázou, který se podílí na rozkladu aktinových stresových vláken“. Mol. Buňka. Biol. 22 (9): 2952–64. doi:10.1128 / MCB.22.9.2952-2964.2002. PMC 133765. PMID 11940653.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: UBXD5 UBX doména obsahující 5“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]