Fosfotyrosinová vazebná doména - Phosphotyrosine-binding domain
| Fosfotyrosinová vazebná doména | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Struktura PTB domény tensinu1.[1] | |||||||||||
| Identifikátory | |||||||||||
| Symbol | PTB | ||||||||||
| Pfam | PF08416 | ||||||||||
| InterPro | IPR013625 | ||||||||||
| CDD | cd00934 | ||||||||||
| |||||||||||
| Doména PTB (typ IRS-1) | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 irs-1 ptb doména komplexovaná s foshopeptidem receptoru il-4, nmr, minimalizovala průměrnou strukturu | |||||||||
| Identifikátory | |||||||||
| Symbol | IRS | ||||||||
| Pfam | PF02174 | ||||||||
| InterPro | IPR002404 | ||||||||
| CHYTRÝ | PTBI | ||||||||
| SCOP2 | 1cli / Rozsah / SUPFAM | ||||||||
| CDD | cd01204 | ||||||||
| |||||||||
V molekulární biologii Fosfotyrosinové vazebné domény jsou proteinové domény které se vážou k fosfotyrosin.
Fosfotyrosinová vazebná doména (PTB, také fosfotyrosinová interakce nebo PI doména) v proteinu tensin bývá k nalezení na C-konec. Tensin je protein s více doménami, na který se váže aktinová vlákna a funguje jako ohnisková adheze molekula (fokální adheze jsou oblasti plazmatické membrány, kterými se buňky připojují k extracelulární matrici). Člověk tensin má aktin -vázací stránky, an SH2 (Pfam PF00017 ) doména a oblast podobná doméně supresor nádoru PTEN.[2] Doména PTB interaguje s doménou cytoplazmatický ocasy beta integrin vazbou na motiv NPXY.[3]
Fosfotyrosinová vazebná doména substrát inzulínového receptoru-1 nesouvisí s doménou tenzinu vázající fosfotyrosin. Substrát inzulínového receptoru-1 bílkoviny obsahovat jak a pleckstrinová homologická doména a doménu vázající fosfotyrosin (PTB). PTB domén usnadnit interakce s aktivovaným tyrosin -fosforylovaný inzulinový receptor. Doména PTB se nachází směrem k N konec. Dva argininy v této doméně jsou zodpovědní za vodíkové vazby fosfotyrosinové zbytky na an Ac -LYASSNPApY-NH2 peptid v juxtamembránové oblasti inzulínového receptoru. Další interakce prostřednictvím „přemostění“ molekuly vody jsou koordinovány zbytky zbytek Asn a Ser.[4] Doména PTB má kompaktní, 7vláknovou beta sendvič struktura, uzavřená C-terminálem spirála. Substrát peptid zapadá do rozštěpu povrchu ve tvaru písmene L vytvořeného z C-terminální šroubovice a pramenů 5 a 6.[5]
Lidské proteiny obsahující tyto domény
APBA1; APBA2; APBA3; APPL1; EPS8; EPS8L1; EPS8L2; EPS8L3; TENC1; TNS; TNS1; TNS3; TNS4; DOK1; DOK2; DOK3; DOK4; DOK5; DOK6; DOK7; FRS2; FRS3; IRS1; IRS2; IRS4; NOS1AP; TLN1; TLN2
Viz také
- SH2 domény také váží fosforylované tyrosiny
Reference
- ^ McCleverty CJ, Lin DC, Liddington RC (červen 2007). „Struktura PTB domény tensinu 1 a model jejího náboru do fibrilárních adhezí“. Protein Sci. 16 (6): 1223–9. doi:10.1110 / ps.072798707. PMC 2206669. PMID 17473008.
- ^ Chen H, Ishii A, Wong WK, Chen LB, Lo SH (říjen 2000). "Molekulární charakterizace lidského tenzinu". Biochem. J. 351 (2): 403–11. doi:10.1042/0264-6021:3510403. PMC 1221376. PMID 11023826.
- ^ Lo SH (leden 2004). „Tensin“. Int. J. Biochem. Cell Biol. 36 (1): 31–4. doi:10.1016 / S1357-2725 (03) 00171-7. PMID 14592531.
- ^ Eck MJ, Dhe-Paganon S, Trub T, Nolte RT, Shoelson SE (květen 1996). "Struktura IRS-1 PTB domény vázaná na juxtamembránovou oblast inzulínového receptoru". Buňka. 85 (5): 695–705. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 81236-2. PMID 8646778. S2CID 8896348.
- ^ Zhou MM, Huang B, Olejniczak ET, Meadows RP, Shuker SB, Miyazaki M, Trub T, Shoelson SE, Fesik SW (duben 1996). "Strukturální základna pro rozpoznávání fosfopeptidů receptoru IL-4 doménou IRB-1 PTB". Nat. Struct. Biol. 3 (4): 388–93. doi:10.1038 / nsb0496-388. PMID 8599766. S2CID 41440041.
externí odkazy
- Zdroj eukaryotického lineárního motivu třída motivů LIG_PTB_Phospho_1
 | Tento membránový protein –Příbuzný článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |