TLN2 - TLN2
TLN2 | |||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Identifikátory | |||||||||||||||||||||||||
Aliasy | TLN2, ILWEQ, talin 2 | ||||||||||||||||||||||||
Externí ID | OMIM: 607349 MGI: 1917799 HomoloGene: 56692 Genové karty: TLN2 | ||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
Ortology | |||||||||||||||||||||||||
Druh | Člověk | Myš | |||||||||||||||||||||||
Entrez | |||||||||||||||||||||||||
Ensembl | |||||||||||||||||||||||||
UniProt | |||||||||||||||||||||||||
RefSeq (mRNA) | |||||||||||||||||||||||||
RefSeq (protein) | |||||||||||||||||||||||||
Místo (UCSC) | Chr 15: 62,39 - 62,84 Mb | Chr 9: 67,22 - 67,56 Mb | |||||||||||||||||||||||
PubMed Vyhledávání | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
Wikidata | |||||||||||||||||||||||||
|
Talin 2 je protein u lidí, který je kódován TLN2 gen. Patří k talinový protein rodina. Tento gen kóduje protein související s talin 1, cytoskeletální protein, který hraje významnou roli při sestavování aktinová vlákna. Talin-2 je exprimován ve vysokých hladinách v srdeční sval a funkce zajišťující propojení mezi extracelulární matrix a aktin cytoskeleton ve společnosti costamere struktury pro boční přenos síly.[5]
Struktura
Lidský talin-2 má délku 271,4 kDa a 2542 aminokyselin.[6] Velikost talinu-2 protein je podobný talin-1, a je relativně podobný (74% identita, 86% podobnost); velikost genu pro talin-2 (200 kb) je však mnohem větší než velikost genu talin-1 (30 kb), kvůli rozdílům ve velikostech intronů.[7] Talin-2 mRNA je exprimován ve více tkáních, včetně srdeční sval, myš embryonální kmenové buňky, mozek, plíce, kosterní sval, ledviny a varle; výraz je však nejvyšší v srdeční sval.[7][8][9][10] Podrobná analýza TLN2 gen odhalil, že alternativní sestřih z TLN2 je komplexní a kóduje více mRNA přepisy a protein izoformy. Studie odhalily promotor spojený s a CpG ostrov který tvoří většinu z TLN2 exprese v dospělých tkáních. Tento promotor je oddělen od prvního kódujícího exonu přibližně> 200 kb alternativně sestříhané nekódující exony. The varle a ledviny talin-2 izoformy chybí N-terminál 50% z protein a důkazy naznačují, že se jedná o izoforma vyjádřeno prodloužením spermatidy.[11] Talin také je posttranslačně upraven přes calpain 2 zprostředkovaný výstřih, který jej může cílit ubikvitin -proteazom zprostředkovaná degradace a obrat přidružených struktur buněčné adheze.[12]
Funkce
Exprese talin-2 v pruhovaný sval je vývojově regulován. Nediferencované myoblasty primárně expresní talin-1 a obojí mRNA a protein exprese talinu-2 je během diferenciace upregulována; ektopická exprese talinu-2 v nediferencovaném myoblasty dysregulates the aktin cytoskelet, což ukazuje, že načasování exprese talin-2 během vývoje je kritické. V dospělosti kardiomyocyty a kosterní sval, talin-2 je exprimován při náklady a vložené disky, což dokazuje, že spojení talin2 integriny a aktin cytoskelet ve stabilních adhezních komplexech zahrnujících zralé sarkomery.[10][13] Zdá se, že Talin-2 hraje roli v kosterní sval rozvoj; konkrétně v myoblast fúze, sarkoméra shromáždění a integrita myotendinových spojů. Ablace obou izoforem talinu, talin-2 a talin-1 zabráněno normálu myoblast fúze a sarkoméra shromáždění, stejně jako shromáždění komplexů integrinové adheze, které bylo přičítáno narušeným interakcím mezi integriny a aktin cytoskelet.[14] The mRNA Ukázalo se, že exprese talinu-2 je regulována svalová specifická křehká X mentální retardace, autosomální homolog 1 (FXR1) protein, který váže talin2 mRNA přímo a potlačuje překlad. Vyřazení z FXR1 upregulates talin-2 protein, což narušuje architekturu desmosomy a náklady v srdeční sval.[15]
Talin-2, jako talin-1 Zdá se, že se připojil ligand -vázaný integriny a aktin cytoskelet, což zvyšuje afinitu k integriny pro extracelulární matrix a katalyzuje ohnisková adheze -závislé signální dráhy,[16] a také posiluje cytoskeletální -integrin konstrukce v reakci na aplikovanou sílu.[17] Síla interakce mezi talinem a integrin se zdá být doladěn pomocí diferenciálního vyjádření izoformy v různých tkáních. Talin-2 /p1D-integrin izoformy které jsou vyjádřeny a kolokalizovány v pruhovaný sval tvoří výrazně silnou interakci a několik aminokyselina vypuštění v p1-integrin ocas může tuto interakci změnit 1000krát.[18]
Talin-2 se nachází v neuronální synaptická oblast v mozek tkáně a hraje roli ve zprostředkování klatrinem endocytóza koordinační fosfatidylinositol syntéza a modulace aktin dynamika prostřednictvím interakcí s PIP kináza typu 1γ, hlavní fosfatidylinositol 4,5-bisfosfát -syntetizuje enzym z mozek.[19]
Klinický význam
U pacientů s epilepsie spánkového laloku, talin-2 protein byl zjištěn v mozkomíšní mok zatímco u neepileptických pacientů chyběla exprese.[20] Dále postencefalitický epilepsie pacienti, kteří byli refrakterní vůči léčbě drogami, vykazovali u pacientů výrazně zvýšené hladiny proteinu talin-2 mozkomíšní mok a vzájemně snížené hladiny v roce 2006 sérum.[21] Tyto údaje naznačují, že talin-2 se může ukázat jako užitečný jako biomarker pro epilepsie, a mohou být patologicky spojeny s touto chorobou.
Studie to také ukázaly TLN2 je přímým cílem miR -132, který je epigeneticky umlčen rakovina prostaty,[22] což naznačuje, že talin-2 může hrát roli v modulaci buněčná adheze v rakovina prostaty.
Interakce
Bylo prokázáno, že TLN2 komunikovat s:
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000171914 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000052698 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Entrez Gene: Talin 2“.
- ^ "Proteinová sekvence lidského TLN2 (Uniprot ID: Q9Y4G6)". Srdeční organelární proteinová atlasová znalostní databáze (COPaKB). Citováno 8. července 2015.
- ^ A b Monkley SJ, Pritchard CA, Critchley DR (září 2001). "Analýza savčího genu talin2 TLN2". Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 286 (5): 880–5. doi:10.1006 / bbrc.2001.5497. PMID 11527381.
- ^ Praekelt U, Kopp PM, Rehm K, Linder S, Bate N, Patel B, Debrand E, Manso AM, Ross RS, Conti F, Zhang MZ, Harris RC, Zent R, Critchley DR, Monkley SJ (březen 2012). „Nové monoklonální protilátky specifické pro izoformu odhalují různé subcelulární lokalizace pro talin1 a talin2“. European Journal of Cell Biology. 91 (3): 180–91. doi:10.1016 / j.ejcb.2011.12.003. PMC 3629562. PMID 22306379.
- ^ Chen NT, Lo SH (listopad 2005). „N-koncová polovina talinu 2 je dostatečná pro vývoj a přežití myší“. Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 337 (2): 670–6. doi:10.1016 / j.bbrc.2005.09.100. PMID 16202389.
- ^ A b Senetar MA, Moncman CL, McCann RO (březen 2007). „Talin2 je indukován během diferenciace pruhovaného svalu a je zaměřen na stabilní adhezní komplexy ve zralém svalu“. Motilita buněk a cytoskelet. 64 (3): 157–73. doi:10,1002 / cm.20173. PMID 17183545.
- ^ Debrand E, El Jai Y, Spence L, Bate N, Praekelt U, Pritchard CA, Monkley SJ, Critchley DR (březen 2009). „Talin 2 je velký a komplexní gen kódující více transkriptů a proteinových izoforem“. FEBS Journal. 276 (6): 1610–28. doi:10.1111 / j.1742-4658.2009.06893.x. PMC 2702505. PMID 19220457.
- ^ Bate N, Gingras AR, Bachir A, Horwitz R, Ye F, Patel B, Goult BT, Critchley DR (2012). „Talin obsahuje C-terminální štěpné místo calpain2 důležité v dynamice fokální adheze“. PLOS ONE. 7 (4): e34461. doi:10.1371 / journal.pone.0034461. PMC 3319578. PMID 22496808.
- ^ Manso AM, Li R, Monkley SJ, Cruz NM, Ong S, Lao DH, Koshman YE, Gu Y, Peterson KL, Chen J, Abel ED, Samarel AM, Critchley DR, Ross RS (únor 2013). „Talin1 má jedinečnou expresi oproti talinu 2 v srdci a upravuje hypertrofickou reakci na tlakové přetížení“. The Journal of Biological Chemistry. 288 (6): 4252–64. doi:10,1074 / jbc.M112.427484. PMC 3567677. PMID 23266827.
- ^ Conti FJ, Monkley SJ, Wood MR, Critchley DR, Müller U (listopad 2009). „Talin 1 a 2 jsou vyžadovány pro fúzi myoblastů, shromáždění sarkomérů a údržbu myotendinových spojů.“. Rozvoj. 136 (21): 3597–606. doi:10,1242 / dev.035857. PMC 2761109. PMID 19793892.
- ^ Whitman SA, Cover C, Yu L, Nelson DL, Zarnescu DC, Gregorio CC (červenec 2011). „Desmoplakin a talin2 jsou nové cíle mRNA křehkého proteinu 1 souvisejícího s X v srdečním svalu“. Výzkum oběhu. 109 (3): 262–71. doi:10.1161 / CIRCRESAHA.111.244244. PMC 3163600. PMID 21659647.
- ^ Zhang X, Jiang G, Cai Y, Monkley SJ, Critchley DR, Sheetz MP (září 2008). „Vyčerpání talinu odhaluje nezávislost počátečního šíření buněk na aktivaci a trakci integrinu“. Přírodní buněčná biologie. 10 (9): 1062–8. doi:10.1038 / ncb1765. PMC 2746969. PMID 19160486.
- ^ Roca-Cusachs P, Gauthier NC, Del Rio A, Sheetz MP (září 2009). „Shlukování integrinů alfa (5) beta (1) určuje adhezní sílu, zatímco alfa (v) beta (3) a talin umožňují mechanickou transdukci“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 106 (38): 16245–50. doi:10.1073 / pnas.0902818106. PMC 2752568. PMID 19805288.
- ^ Anthis NJ, Wegener KL, Critchley DR, Campbell ID (prosinec 2010). „Strukturální rozmanitost v interakcích integrin / talin“. Struktura. 18 (12): 1654–66. doi:10.1016 / j.str.2010.09.018. PMC 3157975. PMID 21134644.
- ^ Morgan JR, Di Paolo G, Werner H, Shchedrina VA, Pypaert M, Pieribone VA, De Camilli P (říjen 2004). „Role talinu v presynaptické funkci“. The Journal of Cell Biology. 167 (1): 43–50. doi:10.1083 / jcb.200406020. PMC 2172527. PMID 15479735.
- ^ Xiao F, Chen D, Lu Y, Xiao Z, Guan LF, Yuan J, Wang L, Xi ZQ, Wang XF (únor 2009). "Proteomická analýza mozkomíšního moku od pacientů s idiopatickou epilepsií spánkového laloku". Výzkum mozku. 1255: 180–9. doi:10.1016 / j.brainres.2008.12.008. PMID 19109932.
- ^ Xiao Z, Shen L, Chen D, Wang L, Xi Z, Xiao F, Wang X (září 2010). "Koncentrace talinu 2 v mozkomíšním moku u pacientů s epilepsií". Klinická biochemie. 43 (13–14): 1129–32. doi:10.1016 / j.clinbiochem.2010.06.015. PMID 20620133.
- ^ Formosa A, Lena AM, Markert EK, Cortelli S, Miano R, Mauriello A, Croce N, Vandesompele J, Mestdagh P, Finazzi-Agrò E, Levine AJ, Melino G, Bernardini S, Candi E (leden 2013). „Methylace DNA umlčí miR-132 u rakoviny prostaty“. Onkogen. 32 (1): 127–34. doi:10.1038 / dne 2012.14. PMID 22310291.
- ^ Hemmings L, Rees DJ, Ohanian V, Bolton SJ, Gilmore AP, Patel B, Priddle H, Trevithick JE, Hynes RO, Critchley DR (listopad 1996). „Talin obsahuje tři vazebná místa pro aktin, z nichž každé sousedí s vazebným místem pro vinkulin.“. Journal of Cell Science. 109 (11): 2715–26. PMID 8937989.
- ^ Patil S, Jedsadayanmata A, Wencel-Drake JD, Wang W, Knezevic I, Lam SC (říjen 1999). „Identifikace místa vázajícího talin v podjednotce integrinu beta (3) odlišná od regulačního motivu NPLY vazebných funkcí po ligandu. N-terminální doména talinu interaguje s membránovou proximální oblastí cytoplazmatické beta (3) ocas". The Journal of Biological Chemistry. 274 (40): 28575–83. doi:10.1074 / jbc.274.40.28575. PMID 10497223.
- ^ Calderwood DA, Yan B, de Pereda JM, Alvarez BG, Fujioka Y, Liddington RC, Ginsberg MH (červen 2002). „Fosfotyrosinová vazebná doména talinu aktivuje integriny“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (24): 21749–58. doi:10,1074 / jbc.M111996200. PMID 11932255.
- ^ Calderwood DA, Zent R, Grant R, Rees DJ, Hynes RO, Ginsberg MH (říjen 1999). „Talinová hlavová doména se váže na cytoplazmatické ocasy podjednotky integrinu beta a reguluje aktivaci integrinu“. The Journal of Biological Chemistry. 274 (40): 28071–4. doi:10.1074 / jbc.274.40.28071. PMID 10497155.
- ^ Borowsky ML, Hynes RO (říjen 1998). „Layilin, nový transmembránový protein vázající na talin homologní s lektiny typu C, je lokalizován v membránových voláncích“. The Journal of Cell Biology. 143 (2): 429–42. doi:10.1083 / jcb.143.2.429. PMC 2132847. PMID 9786953.
- ^ Wegener KL, Basran J, Bagshaw CR, Campbell ID, Roberts GC, Critchley DR, Barsukov IL (září 2008). "Strukturální základ pro interakci mezi cytoplazmatickou doménou hyaluronátového receptoru layilinu a talinem F3 subdomény". Journal of Molecular Biology. 382 (1): 112–26. doi:10.1016 / j.jmb.2008.06.087. PMID 18638481.
- ^ Chen HC, Appeddu PA, Parsons JT, Hildebrand JD, Schaller MD, Guan JL (červenec 1995). „Interakce kinázy fokální adheze s cytoskeletálním proteinem talinem“. The Journal of Biological Chemistry. 270 (28): 16995–9. doi:10.1074 / jbc.270.28.16995. PMID 7622520.
- ^ Zheng C, Xing Z, Bian ZC, Guo C, Akbay A, Warner L, Guan JL (leden 1998). „Diferenciální regulace Pyk2 a kinázy fokální adheze (FAK). C-koncová doména FAK poskytuje reakci na buněčnou adhezi“. The Journal of Biological Chemistry. 273 (4): 2384–9. doi:10.1074 / jbc.273.4.2384. PMID 9442086.
Další čtení
- Anthis NJ, Wegener KL, Critchley DR, Campbell ID (prosinec 2010). „Strukturální rozmanitost v interakcích integrin / talin“. Struktura. 18 (12): 1654–66. doi:10.1016 / j.str.2010.09.018. PMC 3157975. PMID 21134644.
- Shoeman RL, Hartig R, Hauses C, Traub P (2002). „Organizace plaků fokální adheze je narušena působením proteázy HIV-1“. Cell Biology International. 26 (6): 529–39. doi:10.1006 / cbir.2002.0895. PMID 12119179.
- Critchley DR, Holt MR, Barry ST, Priddle H, Hemmings L, Norman J (1999). "Integrinem zprostředkovaná buněčná adheze: cytoskeletální spojení". Sympozium o biochemické společnosti. 65: 79–99. PMID 10320934.
- Di Paolo G, Pellegrini L, Letinic K, Cestra G, Zoncu R, Voronov S, Chang S, Guo J, Wenk MR, De Camilli P (listopad 2002). "Nábor a regulace fosfatidylinositol fosfát kinázy typu 1 gama doménou FERM talinu". Příroda. 420 (6911): 85–9. doi:10.1038 / nature01147. PMID 12422219.
- Zemljic-Harpf A, Manso AM, Ross RS (prosinec 2009). „Vinculin a talin: zaměřte se na myokard“. Journal of Investigative Medicine. 57 (8): 849–55. doi:10.2310 / jim.0b013e3181c5e074. PMC 2810504. PMID 19952892.
- Ling K, Doughman RL, Firestone AJ, Bunce MW, Anderson RA (listopad 2002). "Typ I gama fosfatidylinositol fosfát kináza cílí a reguluje fokální adheze". Příroda. 420 (6911): 89–93. doi:10.1038 / nature01082. PMID 12422220.
- Xiao F, Chen D, Lu Y, Xiao Z, Guan LF, Yuan J, Wang L, Xi ZQ, Wang XF (únor 2009). "Proteomická analýza mozkomíšního moku od pacientů s idiopatickou epilepsií spánkového laloku". Výzkum mozku. 1255: 180–9. doi:10.1016 / j.brainres.2008.12.008. PMID 19109932.
- Critchley DR (listopad 2004). "Cytoskeletální proteiny talin a vinkulin v integrinu zprostředkované adhezi". Transakce s biochemickou společností. 32 (Pt 5): 831–6. doi:10.1042 / BST0320831. PMID 15494027.
- Vyas YM, Maniar H, Dupont B (duben 2002). „Špička: diferenciální segregace proteinu tyrosin fosfatázy-1 obsahujícího SRC homologii 2 v časné imunitní synapse NK buněk odlišuje necytolytické od cytolytických interakcí“. Journal of Immunology. 168 (7): 3150–4. doi:10,4049 / jimmunol.168.7.3150. PMID 11907066.