APPL1 - APPL1

APPL1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2EJ8, 2ELA, 2 ELB, 2Q12, 2Q13, 2Z0N, 2Z0O, 5C5B
Identifikátory
Aliasy	APPL1, APPL, DIP13alpha, MODY14, adaptační protein, fosfotyrosin interagující s doménou PH a leucinový zip 1
Externí ID	OMIM: 604299 MGI: 1920243 HomoloGene: 32143 Genové karty: APPL1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 3 (lidský)
Konec	57,278,105 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 14 (myš)
Konec	26,971,232 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba protein kinázy B.; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • identická vazba na protein; • vazba fosfatidylserinu; • vazba fosfatidylinositolu; • aktivita homodimerizace proteinu; • GO: 0032403 vazba makromolekulárního komplexu; • vazba beta-tubulinu;
Buněčná složka	• cytoplazma; • Komplex NuRD; • cytosol; • endozom; • časná endosomová membrána; • membrána; • vezikulární membrána; • endosomová membrána; • extracelulární exosom; • buněčné jádro; • časný endosom; • prohrábnout; • buněčná membrána; • cytoplazmatický váček; • časný fagozom; • makropinosom; • intracelulární vezikul; • buněčná projekce; • fagocytární váček;
Biologický proces	• regulace dovozu glukózy; • vnější apoptotická signální dráha v nepřítomnosti ligandu; • buněčný cyklus; • buněčná proliferace; • signální transdukce; • signální dráha inzulínového receptoru; • regulace lokalizace proteinu na plazmatickou membránu; • signální dráha transformujícího růstového faktoru beta receptoru; • regulace migrace fibroblastů; • signalizace; • signální dráha aktivovaná adiponektinem; • regulace signální dráhy podobného mýtnému receptoru 4; • buněčná odpověď na stimul růstového faktoru hepatocytů; • regulace vrozené imunitní odpovědi; • pozitivní regulace dovozu glukózy; • pozitivní regulace procesu biosyntézy melaninu; • pozitivní regulace produkce cytokinů podílející se na zánětlivé reakci; • pozitivní regulace makropinocytózy; • negativní regulace signální dráhy Fc-gama receptoru účastnící se fagocytózy; • import bílkovin do jádra;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	26060
	72993
	ENSG00000157500
	ENSMUSG00000040760
	Q9UKG1
	Q8K3H0
	NM_012096
	NM_145221
	NP_036228
	NP_660256
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Adaptační protein, fosfotyrosin interagující s doménou PH a leucinový zip 1 (APPL1), nebo DCC-interagující protein 13-alfa (DIP13alpha), je a protein že u lidí je kódován APPL1 gen.^[5]^[6]^[7] APPL1 obsahuje několik klíčových interaktivních domén: pleckstrinová homologická (PH) doména, doména vázající fosfotyrosin (PTB) a Bin – Amphiphysin – Rvs (BAR) doména.^[8]

Funkce

APPL1 je adaptační protein lokalizováno do podmnožiny Rab5 -positive ("early") endozomy, kde získává další závazné partnery a reguluje obchodování s vezikuly a endozomální signalizace. APPL1 je obohacen o velmi rané endosomy, které jsou negativní na EEA1, což naznačuje, že APPL1 ovlivňuje nejranější stádia endozomálního přenosu před převzetím EEA1. To je v souladu s pozorováním, že APPL1 a EEA1 soutěží o vazbu Rab5. APPL1 ovlivňuje rychlost internalizace klíčového endozomálního nákladu (např. EGF receptor ), který je závislý na aktivaci Rab5.^[8]

PTB doména APPL1 reguluje mnoho buněčných signalizačních událostí ve specifických endozomálních kompartmentech - někdy označovaných jako „signální endosomy“. To zahrnuje kyselina lysofosfatidová (LPA) indukovaná signalizace (společně s interagujícím proteinem GIPC1 ). Byly určeny další role pro APPL1 jádro kde APPL1 může lokalizovat, jakmile se oddělí od endosomů.^[8]

Mutantní studie

Myší mutované alely pro Appl1
Symbol značky pro gen myši. Tento symbol je přiřazen genomickému místu MGI	Appl1
Klony embryonálních kmenových buněk mutantní myši. Toto jsou známé cílené mutace tohoto genu u myši.	Appl1^{tm1a (KOMP) Wtsi}
Příklad struktury cílové podmíněné mutantní alely pro tento gen

Tyto mutantní ES buňky lze studovat přímo nebo je použít ke generování myší s tímto genem vyřazeným. Studie těchto myší může osvětlit funkci Appl1: vidět Vyřazovací myš

Interakce

APPL1 bylo prokázáno komunikovat s Smazáno u rakoviny tlustého střeva a konečníku,^[9] AKT2,^[5] ale také Rab5, Rab21, OCRL a téměř 30 dalších proteinů.^[8]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000157500 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000040760 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b Mitsuuchi Y, Johnson SW, Sonoda G, Tanno S, Golemis EA, Testa JR (září 1999). „Identifikace genu chromozomu 3p14.3-21.1, APPL, kódujícího molekulu adaptéru, který interaguje s onkoprotein-serin / threonin kinázou AKT2“. Onkogen. 18 (35): 4891–8. doi:10.1038 / sj.onc.1203080. PMID 10490823.
^ Nechamen CA, Thomas RM, Dias JA (leden 2007). „APPL1, APPL2, Akt2 a FOXO1a interagují s FSHR v potenciálním signalizačním komplexu“. Molekulární a buněčná endokrinologie. 260-262: 93–9. doi:10.1016 / j.mce.2006.08.014. PMC 1782224. PMID 17030088.
^ „Entrez Gene: adaptační protein APPL1, interakce fosfotyrosinu, doména PH a leucinový zip obsahující 1“.
^ ^A ^b ^C ^d Diggins NL, Webb DJ (červen 2017). „APPL1 je multifunkční protein endosomálního signalizačního adaptéru“. Transakce s biochemickou společností. 45 (3): 771–779. doi:10.1042 / bst20160191. PMC 5844352. PMID 28620038.
^ Liu J, Yao F, Wu R, Morgan M, Thorburn A, Finley RL, Chen YQ (červenec 2002). "Zprostředkování apoptotického signálu DCC pomocí DIP13 alfa". The Journal of Biological Chemistry. 277 (29): 26281–5. doi:10,1074 / jbc.M204679200. PMID 12011067.

Další čtení

Nakajima D, Okazaki N, Yamakawa H, Kikuno R, Ohara O, Nagase T (červen 2002). „Konstrukce klonů cDNA připravených na expresi pro geny KIAA: ruční kurace 330 klonů cDNA KIAA“. Výzkum DNA. 9 (3): 99–106. doi:10.1093 / dnares / 9.3.99. PMID 12168954.
Nagase T, Kikuno R, Ishikawa KI, Hirosawa M, Ohara O (únor 2000). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. XVI. Kompletní sekvence 150 nových cDNA klonů z mozku, které kódují velké proteiny in vitro“. Výzkum DNA. 7 (1): 65–73. doi:10.1093 / dnares / 7.1.65. PMID 10718198.
Liu J, Yao F, Wu R, Morgan M, Thorburn A, Finley RL, Chen YQ (červenec 2002). "Zprostředkování apoptotického signálu DCC pomocí DIP13 alfa". The Journal of Biological Chemistry. 277 (29): 26281–5. doi:10,1074 / jbc.M204679200. PMID 12011067.
Yang L, Lin HK, Altuwaijri S, Xie S, Wang L, Chang C (květen 2003). „APPL potlačuje transaktivaci androgenových receptorů prostřednictvím potenciace aktivity Akt“. The Journal of Biological Chemistry. 278 (19): 16820–7. doi:10,1074 / jbc.M213163200. PMID 12621049.
Miaczynska M, Christoforidis S, Giner A, Shevchenko A, Uttenweiler-Joseph S, Habermann B, Wilm M, Parton RG, Zerial M (únor 2004). "APPL proteiny spojují Rab5 s transdukcí jaderného signálu přes endozomální kompartment". Buňka. 116 (3): 445–56. doi:10.1016 / S0092-8674 (04) 00117-5. PMID 15016378. S2CID 18281503.
Nechamen CA, Thomas RM, Cohen BD, Acevedo G, Poulikakos PI, Testa JR, Dias JA (srpen 2004). „Receptor lidského folikuly stimulujícího hormonu (FSH) interaguje s adaptorovým proteinem APPL1 v buňkách HEK 293: potenciální zapojení dráhy PI3K do FSH signalizace“. Biologie reprodukce. 71 (2): 629–36. doi:10.1095 / biolreprod.103.025833. PMID 15070827.
Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D, Elias JE, Villén J, Li J, Cohn MA, Cantley LC, Gygi SP (srpen 2004). „Rozsáhlá charakterizace jaderných fosfoproteinů z buněk HeLa“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 101 (33): 12130–5. doi:10.1073 / pnas.0404720101. PMC 514446. PMID 15302935.
Ballif BA, Villén J, Beausoleil SA, Schwartz D, Gygi SP (listopad 2004). „Fosfoproteomická analýza vyvíjejícího se myšího mozku“. Molekulární a buněčná proteomika. 3 (11): 1093–101. doi:10,1074 / mcp.M400085-MCP200. PMID 15345747.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (říjen 2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Mao X, Kikani CK, Riojas RA, Langlais P, Wang L, Ramos FJ, Fang Q, Christ-Roberts CY, Hong JY, Kim RY, Liu F, Dong LQ (květen 2006). "APPL1 se váže na receptory adiponektinu a zprostředkovává signalizaci a funkci adiponektinu". Přírodní buněčná biologie. 8 (5): 516–23. doi:10.1038 / ncb1404. PMID 16622416. S2CID 21273764.
Cheng KK, Lam KS, Wang Y, Huang Y, Carling D, Wu D, Wong C, Xu A (květen 2007). "Adiponektinem indukovaná endoteliální syntáza oxidu dusnatého a produkce oxidu dusnatého jsou zprostředkovány APPL1 v endoteliálních buňkách". Cukrovka. 56 (5): 1387–94. doi:10 2337 / db06-1580. PMID 17287464.
Li J, Mao X, Dong LQ, Liu F, Tong L (květen 2007). "Krystalové struktury domén BAR-PH a PTB lidské APPL1". Struktura. 15 (5): 525–33. doi:10.1016 / j.str.2007.03.011. PMID 17502098.
Zhu G, Chen J, Liu J, Brunzelle JS, Huang B, Wakeham N, Terzyan S, Li X, Rao Z, Li G, Zhang XC (červenec 2007). "Struktura domény APPL1 BAR-PH a charakterizace její interakce s Rab5". Časopis EMBO. 26 (14): 3484–93. doi:10.1038 / sj.emboj.7601771. PMC 1933402. PMID 17581628.
Saito T, Jones CC, Huang S, český poslanec, Pilch PF (listopad 2007). „Interakce Akt s APPL1 je nutná pro translokaci Glut4 stimulovanou inzulínem“. The Journal of Biological Chemistry. 282 (44): 32280–7. doi:10,1074 / jbc.M704150200. PMID 17848569.

externí odkazy

Člověk APPL1 umístění genomu a APPL1 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

Tento článek o gen na lidský chromozom 3 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000157500 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000040760 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid10490823-5] A ^b Mitsuuchi Y, Johnson SW, Sonoda G, Tanno S, Golemis EA, Testa JR (září 1999). „Identifikace genu chromozomu 3p14.3-21.1, APPL, kódujícího molekulu adaptéru, který interaguje s onkoprotein-serin / threonin kinázou AKT2“. Onkogen. 18 (35): 4891–8. doi:10.1038 / sj.onc.1203080. PMID 10490823.

[pmid17030088-6] Nechamen CA, Thomas RM, Dias JA (leden 2007). „APPL1, APPL2, Akt2 a FOXO1a interagují s FSHR v potenciálním signalizačním komplexu“. Molekulární a buněčná endokrinologie. 260-262: 93–9. doi:10.1016 / j.mce.2006.08.014. PMC 1782224. PMID 17030088.

[entrez-7] „Entrez Gene: adaptační protein APPL1, interakce fosfotyrosinu, doména PH a leucinový zip obsahující 1“.

[Diggins_2017-8] A ^b ^C ^d Diggins NL, Webb DJ (červen 2017). „APPL1 je multifunkční protein endosomálního signalizačního adaptéru“. Transakce s biochemickou společností. 45 (3): 771–779. doi:10.1042 / bst20160191. PMC 5844352. PMID 28620038.

[pmid12011067-9] Liu J, Yao F, Wu R, Morgan M, Thorburn A, Finley RL, Chen YQ (červenec 2002). "Zprostředkování apoptotického signálu DCC pomocí DIP13 alfa". The Journal of Biological Chemistry. 277 (29): 26281–5. doi:10,1074 / jbc.M204679200. PMID 12011067.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]