Mir-96 microRNA - Mir-96 microRNA

mikroRNA mir-96
Sekundární struktura RNA a zachování sekvence pro miR-96.jpg
Identifikátory
Symbolmir-96
Alt. SymbolyMIR96
RfamRF00669
miRBaseMI0000098
rodina miRBaseMIPF0000072
Další údaje
RNA typGen; miRNA
DoményEukaryota
JÍTGO termín musí začínat GO: GO termín musí začínat GO:
TAKSO: 0001244
PDB strukturPDBe

Prekurzor mikroRNA miR-96 je malý nekódující RNA který reguluje genová exprese. mikroRNA jsou přepsány jako ~ 80 nukleotid prekurzory a následně zpracovány Hráč v kostky enzym za vzniku ~ 23 nukleotidových produktů. V tomto případě vyspělá sekvence pochází z 5 'ramene předchůdce.[1]Předpokládá se, že zralé produkty mají regulační role prostřednictvím komplementarity k mRNA.

miR-96 je považován za konzervovaný uvnitř Nephrozoa, tj Deuterostomy a Protostomy.[2]

Byla spojena variace v oblasti semen zralého miR-96 autosomálně dominantní, progresivní ztráta sluchu u lidí a myší. The homozygotní mutantní myši byly hluché hluché a nevykazovaly žádné kochleární odpovědi. Heterozygotní myši a lidé postupně ztrácejí schopnost slyšet.[3][4][5]Pět genů ze 132 předpovězených cílů bylo experimentálně ověřeno jako cíle miR-96: AQP5, Celsr2, Myrip, Odf2 a Ryk.[4]

Microarray analýza 4denních divokých a mutantních myší ukázala, že v 3 'UTR upregulovaných genů došlo k významnému obohacení heptamerů komplementárních k miR-96, což naznačuje, že miR-96 normálně ovlivňuje širokou škálu cílových genů a že mutace vede ke ztrátě normálních cílů. Mezi downregulovanými geny je významné obohacení heptamerů komplementárních k mutantnímu miR-96, takže mutantní miR-96 získal nové cíle.[4] Mezi downregulovanými geny bylo pět zvláště zajímavých; Ocm, Pitpnm1, Prestin, Ptprq a Gfi1, které jsou všechny silně a specificky exprimovány ve vlasových buňkách. Myší mutanti pro poslední tři vykazují hluchotu a degeneraci vlasových buněk.[6][7][8]

Několikanásobné seřazení sekvencí prekurzorových molekul miR-96. Vysoce konzervované nukleotidy jsou zbarveny červeně, méně konzervované nukleotidy jsou zbarveny oranžově a nekonzervované nukleotidy jsou zbarveny modře nebo bíle. Sloupce odpovídající zralé a naočkované sekvenci jsou označeny nad zarovnáním. Kanonická lidská sekvence a dvě lidské varianty sekvencí, které se podílejí na ztrátě sluchu (13G> A a 14C> A), jsou v první, druhé a třetí řadě.

Reference

  1. ^ Mourelatos Z, Dostie J, Paushkin S, Sharma A, Charroux B, Abel L, Rappsilber J, Mann M, Dreyfuss G (2002). „miRNPs: nová třída ribonukleoproteinů obsahujících četné mikroRNA“. Genes Dev. 16 (6): 720–728. doi:10,1101 / gad.974702. PMC  155365. PMID  11914277.
  2. ^ Wheeler BM, Heimberg AM, Moy VN, Sperling EA, Holstein TW, Heber S, Peterson KJ (2009). "Hluboký vývoj metazoanových mikroRNA". Evol Dev. 11 (1): 50–68. doi:10.1111 / j.1525-142X.2008.00302.x. PMID  19196333.
  3. ^ Mencía A, Modamio-Høybjør S, Redshaw N, Morín M, Mayo-Merino F, Olavarrieta L, Aguirre LA, del Castillo I, Steel KP, Dalmay T, Moreno F, Moreno-Pelayo MA (2009). „Mutace v oblasti semen lidského miR-96 jsou zodpovědné za nesyndromickou progresivní ztrátu sluchu“. Nat Genet. 41 (5): 609–613. doi:10,1038 / ng.355. PMID  19363479.
  4. ^ A b C Lewis MA, Quint E, Glazier AM, Fuchs H, De Angelis MH, Langford C, van Dongen S, Abreu-Goodger C, Piipari M, Redshaw N, Dalmay T, Moreno-Pelayo MA, Enright AJ, Steel KP (2009) . „Mutace miR-96 vyvolaná ENU spojená s progresivní ztrátou sluchu u myší“. Nat Genet. 41 (5): 614–618. doi:10,1038 / ng.369. PMC  2705913. PMID  19363478.
  5. ^ Soukup GA (2009). „Malý, ale hlasitý: Malé RNA mají výrazný vliv na vývoj uší“. Brain Res. 1277: 104–114. doi:10.1016 / j.brainres.2009.02.027. PMC  2700218. PMID  19245798.
  6. ^ Liberman MC, Gao J, He DZ, Wu X, Jia S, Zuo J (2002). "Prestin je vyžadován pro elektromotilitu vnější vlasové buňky a pro kochleární zesilovač". Příroda. 419 (6904): 300–304. doi:10.1038 / nature01059. PMID  12239568.
  7. ^ Goodyear RJ, Legan PK, Wright MB, Marcotti W, Oganesian A, Coats SA, Booth CJ, Kros CJ, Seifert RA, Bowen-Pope DF, Richardson GP (2003). „Pro zrání vyvíjejících se svazků kochleárních vlasů je nutná receptorová inositol lipidová fosfatáza.“. J. Neurosci. 23 (27): 9208–9219. doi:10.1523 / jneurosci.23-27-09208.2003. PMID  14534255.
  8. ^ Wallis D, Hamblen M, Zhou Y, Venken KJ, Schumacher A, Grimes HL, Zoghbi HY Orkin SH, Bellen HJ (2003). „Transkripční faktor se zinkovým prstem Gfi1, který se podílí na lymfomagenezi, je nutný pro diferenciaci a přežití vlasových buněk vnitřního ucha“. Rozvoj. 130 (1): 221–232. doi:10,1242 / dev.00190. PMID  12441305.

Mediální zprávy

Další čtení

externí odkazy