MiR-338 - MiR-338

miR-338
Mir-338 SS.png
Konzervované sekundární struktura prekurzoru mikroRNA miR-338
Identifikátory
SymbolmiR-338
Alt. SymbolyMIR338
RfamRF00686
miRBaseMI0000814
rodina miRBaseMIPF0000097
NCBI Gene442906
HGNC31775
OMIM614059
RefSeqNR_029897
Další údaje
RNA typmiRNA
DoményMammalia
JÍT0035195
TAK0001244
MístoChr. 17 q25.3
PDB strukturPDBe

miR-338 je rodina mozkových specifik mikroRNA prekurzory nalezené v savci, počítaje v to lidé.[1] ~ 22nukleotid zralá sekvence miRNA je vyříznuta z vlásenky předchůdce enzymem Hráč v kostky.[2] Tato posloupnost se poté přidruží k RISC které efekty Interference RNA.[3]

miR-338 se nachází v intronické oblasti uvnitř gen pro tyrosinkinázu spojenou s apoptózou (AATK ). Předpokládalo se, že může downregulovat geny, které mají downstream negativní účinek na expresi AATK.[4]

Funkce

miR-338 je mozek specifická miRNA, která reguluje expresi cytochrom c oxidáza IV (COX4).[1][5] Zralá miRNA sekvence miR-338 je komplementární s krátkou částí 3 'nepřekládaná oblast COX4 mRNA. Tato sekvence mRNA je prezentována na a kmenová smyčka struktura, což naznačuje, že je přístupná pro zpracování miRNA.[5]

Aplikace

miR-338 je dysregulován neuroblastom, a mohly by být potenciálně implementovány jako a biomarker nebo budoucí terapeutické činidlo.[6] miR-338 byl také spojen s hepatocelulární karcinom a byl navržen rozsáhlý diagnostický test zahrnující měření exprese miR-338 ve vzorcích tkáně.[7] MiR-338 je navíc jednou ze sedmi mikroRNA, jejichž profily exprese lze kombinovat za účelem předpovědi pravděpodobnosti přežití pacienta s rakovina žaludku.[8]

Reference

  1. ^ A b Aschrafi A, Schwechter AD, Mameza MG, Natera-Naranjo O, Gioio AE, Kaplan BB (listopad 2008). „MicroRNA-338 reguluje místní hladiny mRNA cytochrom c oxidázy IV a oxidační fosforylaci v axonech sympatických neuronů“. The Journal of Neuroscience. 28 (47): 12581–90. doi:10.1523 / JNEUROSCI.3338-08.2008. PMC  3496265. PMID  19020050.
  2. ^ Ambros V (prosinec 2001). „mikroRNA: malé regulátory s velkým potenciálem“. Buňka. 107 (7): 823–6. doi:10.1016 / S0092-8674 (01) 00616-X. PMID  11779458. S2CID  14574186.
  3. ^ Gregory RI, Chendrimada TP, Cooch N, Shiekhattar R (listopad 2005). „Lidský RISC spojuje biogenezi mikroRNA a potlačení posttranskripčního genu“. Buňka. 123 (4): 631–40. doi:10.1016 / j.cell.2005.10.022. PMID  16271387. S2CID  16973870.
  4. ^ Barik S (září 2008). „Intronická mikroRNA umlčuje geny, které jsou funkčně antagonistické vůči hostitelskému genu“. Výzkum nukleových kyselin. 36 (16): 5232–41. doi:10.1093 / nar / gkn513. PMC  2532712. PMID  18684991.
  5. ^ A b Kaplan BB, Gioio AE, Hillefors M, Aschrafi A (2009). "Axonální syntéza proteinů a regulace lokálních mitochondriálních funkcí". Buněčná biologie Axonu. Výsledky a problémy s diferenciací buněk. 48. str. 225–42. doi:10.1007/400_2009_1. ISBN  978-3-642-03018-5. PMC  2786086. PMID  19343315.
  6. ^ Ragusa M, Majorana A, Banelli B, Barbagallo D, Statello L, Casciano I, Guglielmino MR, Duro LR, Scalia M, Magro G, Di Pietro C, Romani M, Purrello M (říjen 2010). „MIR152, MIR200B a MIR338, kandidáti na lidský poziční a funkční neuroblastom, se účastní diferenciace a apoptózy neuroblastů.“ Journal of Molecular Medicine. 88 (10): 1041–53. doi:10.1007 / s00109-010-0643-0. PMID  20574809. S2CID  22215883.
  7. ^ Huang XH, Wang Q, Chen JS, Fu XH, Chen XL, Chen LZ, Li W, Bi J, Zhang LJ, Fu Q, Zeng WT, Cao LQ, Tan HX, Su Q (srpen 2009). „Perličková mikročipová analýza exprese microRNA v hepatocelulárním karcinomu: miR-338 je downregulován“. Hepatologický výzkum. 39 (8): 786–94. doi:10.1111 / j.1872-034X.2009.00502.x. PMID  19473441. S2CID  11863697.
  8. ^ Li X, Zhang Y, Zhang Y, Ding J, Wu K, Fan D (květen 2010). "Predikce přežití rakoviny žaludku podpisem se sedmi mikroRNA". Střevo. 59 (5): 579–85. doi:10.1136 / gut.2008.175497. PMID  19951901. S2CID  25196666.

Další čtení

externí odkazy