Mir-143 - Mir-143
mir-143 | |
---|---|
![]() Sekundární struktura a zachování sekvence mikroRNA miR-143 | |
Identifikátory | |
Symbol | mir-143 |
Rfam | RF00683 |
rodina miRBase | MIPF0000094 |
NCBI Gene | 406935 |
HGNC | 31530 |
OMIM | 612117 |
Další údaje | |
RNA typ | mikroRNA |
Domény | Eukaryota; Obratlovců |
PDB struktur | PDBe |
V molekulární biologii mir-143 microRNA je krátký RNA molekula. MicroRNA funkce k regulaci úrovní exprese jiných genů několika mechanismy. mir – 143 je u obratlovců vysoce konzervovaný.[1] mir-143 je považován za zapojený do srdce morfogeneze ale také se podílí na rakovině.
Genomická poloha
mir– 143 se nachází na chromozomu 5 v poloze 33 v lidském genomu.[1] mir-143 se nachází velmi blízko k mir-145 v genomu a spekuluje se, že jsou přepsány jako bicistronická jednotka.[2] Jejich transkripce znamená, že jsou často studovány společně ve stejných buněčných drahách a nemocech.
Výraz
mir – 143 je přímým transkripčním cílem faktoru sérových odpovědí, myokardu a nkx2-5.[2] Mir-143 exprese je také považována za řízenou epigeneticky pomocí srdečního rytmu.[3]
Cíle
Toto jsou známé genetické cíle pro mir – 143 a jeho účinek na ně:
- Klf4 - Podporuje přepis.[2]
- ELK1 - Podporuje přepis.[2]
- PŘIDAT3 - Potlačí přepis. Protein zakončující F-aktin.[4]
- FNDC38 - potlačuje přepis. Metastáza nádoru.[5]
- HK2 - Potlačí přepis. Enzym katalyzující glukózu-6-fosfát.[6]
- Raldh2 / aldh1a2 - potlačuje přepis. Podílí se na organizaci srdeční trubice.[3]
- rxrab - potlačuje přepis. Podílí se na organizaci srdeční trubice.[3]
- KLF5 - Neznámý zachoval vazebné místo miR - 143.[1]
- MAP3K7 - Neznámý zachoval vazebné místo miR - 143.[1]
- TARDBP - Neznámý zachoval vazebné místo miR - 143.[1]
- UBE2E3 - Neznámý zachoval vazebné místo miR - 143.[1]
Kardiogeneze
Předpokládá se, že mir-143 hraje důležitou roli v morfogenezi srdce. mir – 143 bylo zjištěno, že je nejvíce obohacenou miRNA v myších embryonálních kmenových buňkách, které se diferencují na srdeční progenitorové buňky.[2] Jedná se o přímý transkripční cíl faktoru odezvy séra, myokardinu a nkx2-5.[2] Výzkum ukázal, že mir-143 hraje důležitou roli v osudu buněk hladkého svalstva. Je společně transkribován s miR-145 v srdečních předcích, než se stane buňkami hladkého svalstva cév (VSMC). VSMC jsou neobvyklé ve skutečnosti, že mohou přepínat mezi proliferativním nebo klidovým více diferencovaným stavem. Spolu s mir – 145, mir- 143 Bylo prokázáno, že cílí na síť transkripčních faktorů (včetně klf4 a elk-1), které podporují diferenciaci a potlačují proliferaci VSMC.[2]MiR-143 se také podílí na obecnější morfogenezi srdce. U zebrafish bylo prokázáno, že mir-143 je nutný pro komorovou morfogenezi prostřednictvím potlačení add3. Vyřazení mělo za následek komorový kolaps.[4] Rovněž bylo navrženo, že exprese mir-143 může být řízena srdečním rytmem. V zebrafish mir-143 exprese chyběla, když byl srdeční rytmus zastaven a obnoven, když byl srdeční rytmus znovu zahájen.[3]Pochopení mir– 143 může být důležité pro pochopení cévních onemocnění. Plastickost VSMC je považována za základ mnoha cévních onemocnění člověka, jako je ateroskleróza.[2] Rovněž bylo prokázáno, že v aneuryzmatech lidské aorty bylo zjištěno, že exprese mir-143 a mir-145 je významně snížena ve srovnání s kontrolami.[7]
Rakovina
Změny v expresi mir-143 byly často zapleteny do rakoviny. Přesná povaha tohoto vztahu však není plně pochopena. Up-regulace mir-143 byla pozorována na modelu hepatocelulárního karcinomu během nádoru metastáza represí FNDC38.[5] Ve vzorcích rakoviny však byla pozorována snížená exprese mir-143 a 145. Ukázalo se, že exprese je snížena v řadě stadií rakoviny, včetně velmi raných vzorků. To naznačuje, že se účastní tumorgeneze.[8] Ukázalo se, že modifikovaná verze mir-143 (mir-143BP) s větší aktivitou a odolností vůči nukleázám má tumor potlačující účinek na kolorektální rakovinné buňky. Nedávné studie s miR-143 v kombinaci s miR-506 se ukázaly jako účinné při blokování progrese buněčného cyklu buněčných linií rakoviny plic.[9] Navíc tato kombinovaná léčba snižuje angiogenezi.[9] Díky tomu je miR-143 kandidátem na RNA lék pro léčbu nádorů.[8]
Reference
- ^ A b C d E F Trakooljul N, Hicks JA, Liu HC (2010). "Identifikace cílových genů a drah spojených s kuřecí mikroRNA miR-143". Anim Genet. 41 (4): 357–64. doi:10.1111 / j.1365-2052.2009.02015.x. PMID 20064147.
- ^ A b C d E F G h Cordes KR, Sheehy NT, White MP, Berry EC, Morton SU, Muth AN, Lee TH, Miano JM, Ivey KN, Srivastava D (2009). „miR-145 a miR-143 regulují osud a plasticitu buněk hladkého svalstva“. Příroda. 460 (7256): 705–10. doi:10.1038 / nature08195. PMC 2769203. PMID 19578358.
- ^ A b C d Miyasaka KY, Kida YS, Banjo T, Ueki Y, Nagayama K, Matsumoto T, Sato M, Ogura T (2010). „Heartbeat reguluje kardiogenezi potlačením signalizace kyseliny retinové prostřednictvím exprese miR-143“. Mech Dev. 128 (1–2): 18–28. doi:10.1016 / j.mod.2010.09.002. PMID 20869435. S2CID 18488540.
- ^ A b Deacon DC, Nevis KR, Cashman TJ, Zhou Y, Zhao L, Washko D, Guner-Ataman B, Burns CG, Burns CE (2010). „Cesta miR-143-adducin3 je nezbytná pro morfogenezi srdeční komory“. Rozvoj. 137 (11): 1887–96. doi:10,1242 / dev.050526. PMID 20460367.
- ^ A b Zhang H, Cai X, Wang Y, Tang H, Tong D, Ji F (2010). „mikroRNA-143, down-regulovaná v osteosarkomu, podporuje apoptózu a potlačuje tumorigenicitu cílením na Bcl-2“. Oncol Rep. 24 (5): 1363–9. doi:10,3892 / nebo_00000994. PMID 20878132.
- ^ Liu, Pei; Zhu, Lei; Zhang, Fan; Lin, Junhao; Du, Min; Cao, Zilong; Ma, Ling; Hu, Zhensheng (březen 2019). „Signální dráha LncRNA UCA1 / miR-143 miR-216b / HK2 / MAPK je zapojena do regulace proliferace endoteliálních buněk prostřednictvím modulace glykolýzy u melanomu“. European Journal of Inflammation. 17: 1–13. doi:10.1177/2058739219837050. ISSN 2058-7392.
- ^ Elia L, Quintavalle M, Zhang J, Contu R, Cossu L, Latronico MV, Peterson KL, Indolfi C, Catalucci D, Chen J, Courtneidge SA, Condorelli G (2009). „Vyřazení miR-143 a -145 mění údržbu buněk hladkého svalstva a vaskulární homeostázu u myší: koreluje s lidským onemocněním“. Buněčná smrt se liší. 16 (12): 1590–8. doi:10.1038 / cdd.2009.153. PMC 3014107. PMID 19816508.
- ^ A b Kitade Y, Akao Y (2010). „MicroRNA a jejich terapeutický potenciál pro lidská onemocnění: MicroRNA, miR-143 a -145, fungují jako protinádorové léky a aplikace chemicky upraveného miR-143 jako protinádorového léčiva“. J Pharmacol Sci. 114 (3): 276–80. doi:10,1254 / jphs.10R12FM. PMID 20953119.
- ^ A b Hossian, A. K. M. Nawshad; Sajib, Md. Sanaullah; Tullar, Paul E .; Mikelis, Constantinos M .; Mattheolabakis, George (12. července 2018). „Víceúčelová aktivita kombinatorických miR-143 a miR-506 inhibuje progresi buněčného cyklu rakoviny plic a angiogenezi in vitro“. Vědecké zprávy. 8 (1): 10495. doi:10.1038 / s41598-018-28872-2. PMC 6043488. PMID 30002440.
Další čtení
- Kulda V, Pesta M, Topolcan O, Liska V, Treska V, Sutnar A, Rupert K, Ludvíková M, Babuška V, Holubec L, Černý R (2010). „Relevance exprese miR-21 a miR-143 ve vzorcích tkáně kolorektálního karcinomu a jeho jaterních metastáz“. Cancer Genet Cytogenet. 200 (2): 154–60. doi:10.1016 / j.cancergencyto.2010.04.015. PMID 20620599.
- Yang Y, Chaerkady R, Kandasamy K, Huang TC, Selvan LD, Dwivedi SB, Kent OA, Mendell JT, Pandey A (2010). „Identifikace cílů miR-143 pomocí proteomického přístupu založeného na SILAC“. Mol Biosyst. 6 (10): 1873–82. doi:10.1039 / c004401f. PMC 3812686. PMID 20544124.
- Iio A, Nakagawa Y, Hirata I, Naoe T, Akao Y (2010). „Identifikace nekódujících RNA zahrnujících shluk microRNA-143/145“. Mol Cancer. 9: 136. doi:10.1186/1476-4598-9-136. PMC 2903500. PMID 20525177.
- Wang X, Hu G, Zhou J (2010). "Represe versikánské exprese pomocí mikroRNA-143". J Biol Chem. 285 (30): 23241–50. doi:10.1074 / jbc.M109.084673. PMC 2906317. PMID 20489207.
- Gao W, Yu Y, Cao H, Shen H, Li X, Pan S, Shu Y (2010). „Deregulovaná exprese miR-21, miR-143 a miR-181a u nemalobuněčného karcinomu plic souvisí s klinicko-patologickými charakteristikami nebo s prognózou pacienta.“ Biomed Pharmacother. 64 (6): 399–408. doi:10.1016 / j.biopha.2010.01.018. PMID 20363096.
- Akao Y, Nakagawa Y, Hirata I, Iio A, Itoh T, Kojima K, Nakashima R, Kitade Y, Naoe T (2010). "Role anti-oncomirů miR-143 a -145 v lidských kolorektálních nádorech". Cancer Gene Ther. 17 (6): 398–408. doi:10.1038 / cgt.2009,88. PMID 20094072.
- Clapé C, Fritz V, Henriquet C, Apparailly F, Fernandez PL, Iborra F, Avancès C, Villalba M, Culine S, Fajas L (2009). Creighton C (ed.). „miR-143 interferuje se signalizací ERK5 a ruší progresi rakoviny prostaty u myší“. PLOS ONE. 4 (10): e7542. doi:10.1371 / journal.pone.0007542. PMC 2763222. PMID 19855844.
- Borralho PM, Kren BT, Castro RE, da Silva IB, Steer CJ, Rodrigues CM (2009). „MicroRNA-143 snižuje životaschopnost a zvyšuje citlivost na 5-fluorouracil v lidských buňkách kolorektálního karcinomu HCT116“. FEBS J. 276 (22): 6689–700. doi:10.1111 / j.1742-4658.2009.07383.x. PMID 19843160. S2CID 205881537.
- Xin M, Small EM, Sutherland LB, Qi X, McAnally J, Plato CF, Richardson JA, Bassel-Duby R, Olson EN (2009). „MicroRNA miR-143 a miR-145 modulují cytoskeletální dynamiku a citlivost buněk hladkého svalstva na poranění“. Genes Dev. 23 (18): 2166–78. doi:10.1101 / gad.1842409. PMC 2751981. PMID 19720868.
- Zhang R, Wang L, Yang AG (2009). „Je microRNA-143 skutečně přebalovacím materiálem supresorové mikroRNA u hepatocelulárního karcinomu souvisejícího s virem hepatitidy B?“. Hepatologie. 50 (3): 987, odpověď autora 987–8. doi:10,1002 / hep. 23124. PMID 19670426. S2CID 2177122.
- Ng EK, Tsang WP, Ng SS, Jin HC, Yu J, Li JJ, Röcken C, Ebert MP, Kwok TT, Sung JJ (2009). „MicroRNA-143 cílí na DNA methyltransferázy 3A u kolorektálního karcinomu“. Br J Cancer. 101 (4): 699–706. doi:10.1038 / sj.bjc.6605195. PMC 2736825. PMID 19638978.
- Zhang X, Liu S, Hu T, Liu S, He Y, Sun S (2009). „Up-regulovaná mikroRNA-143 transkribovaná nukleárním faktorem kappa B zvyšuje metastázy hepatocarcinomu potlačováním exprese fibronektinu“. Hepatologie. 50 (2): 490–9. doi:10,1002 / hep. 23008. PMID 19472311. S2CID 32196346.
- Akao Y, Nakagawa Y, Iio A, Naoe T (2009). "Role microRNA-143 ve Fas zprostředkované apoptóze v lidských Jurk buňkách leukémie T-buněk". Leuk Res. 33 (11): 1530–8. doi:10.1016 / j.leukres.2009.04.019. PMID 19464056.