Rodina předchůdců mikroRNA Mir-124 - Mir-124 microRNA precursor family

Rodina prekurzorů miR-124 microRNA
RF00239.jpg
Identifikátory
Symbolmir-124
RfamRF00239
miRBaseMI0000443
rodina miRBaseMIPF0000021
Další údaje
RNA typGen; miRNA
DoményEukaryota
JÍTGO termín musí začínat GO: GO termín musí začínat GO:
TAKSO: 0001244
PDB strukturPDBe

The Prekurzor mikroRNA miR-124 je malý nekódující RNA molekula, která byla identifikována u much (MI0000373 ),[1] hlístice červy (MI0000302 ),[2] myš (MI0000150 ) a člověk (MI0000443 ).[3] Zralý ~ 21 nukleotid mikroRNA jsou zpracovány z sponka do vlasů prekurzorové sekvence pomocí Hráč v kostky enzym, a v tomto případě pochází z 3 'paže. Bylo zjištěno, že miR-124 je nejhojnější mikroRNA exprimovanou v neuronální buňky. Nezdálo se, že by experimenty na změnu exprese miR-124 v nervových buňkách ovlivňovaly diferenciaci.[4] Tyto výsledky jsou však kontroverzní, protože jiné zprávy popisovaly roli miR-124 během neuronové diferenciace.[5]

Cíle miR-124

  • Visvanathan et al.. ukázaly, že miR-124 cílí na mRNA anti-neurální funkce protein SCP1 (malá C-koncová doména fosfatáza 1).[6]
  • Makeyev a kol. ukázal, že miR-124 cílí přímo PTBP1 (PTB / hnRNP I) mRNA, která kóduje globální represor alternativního sestřihu pre-mRNA v neuronálních buňkách.[7]
  • Arrant et al. napsal, že miR-124 se mění glutamátový receptor složení v prefrontální kůra a může snížit sociální dysfunkci v frontotemporální demence.[8]

Klinická medicína

Přítomnost alely G ve srovnání s alelou C v SNP rs531564 v pri-miR-124-1, měřeno pomocí PCR-RFLP v DNA leukocytů, je spojena se sníženým rizikem rakoviny žaludku (např. GG v CC NEBO 0,34 95 % CI 0,19-0,59, p <0,001).[9]

Reference

  1. ^ Lai, EC; Tomancak P; Williams RW; Rubin GM (2003). "Výpočetní identifikace genů microRNA Drosophila". Genome Biol. 4 (7): R42–. doi:10.1186 / gb-2003-4-7-r42. PMC  193629. PMID  12844358.CS1 maint: extra interpunkce (odkaz)
  2. ^ Lim, LP; Lau NC; Weinstein EG; Abdelhakim A; Yekta S; Rhoades MW; Burge CB; Bartel DP (2003). „MikroRNA Caenorhabditis elegans“. Genes Dev. 17 (8): 991–1008. doi:10.1101 / gad.1074403. PMC  196042. PMID  12672692.
  3. ^ Lagos-Quintana, M; Rauhut R; Yalcin A; Meyer J; Lendeckel W; Tuschl T (2002). "Identifikace tkáňově specifických mikroRNA z myši". Curr Biol. 12 (9): 735–739. doi:10.1016 / S0960-9822 (02) 00809-6. hdl:11858 / 00-001M-0000-0010-94EF-7. PMID  12007417.
  4. ^ Cao X, Pfaff SL, Gage FH (2007). „Funkční studie miR-124 ve vyvíjející se neurální trubici“. Genes Dev. 21 (5): 531–6. doi:10.1101 / gad.1519207. PMC  1820895. PMID  17344415.
  5. ^ Yoo AS, Staahl BT, Chen L, Crabtree GR (2009). "MikroRNA zprostředkovaná výměna komplexů remodelovajících chromatin v nervovém vývoji". Příroda. 460 (7255): 642–6. Bibcode:2009 Natur.460..642Y. doi:10.1038 / nature08139. PMC  2921580. PMID  19561591.
  6. ^ Visvanathan J, Lee S, Lee B, Lee JW, Lee SK (2007). „MicroRNA miR-124 antagonizuje anti-neurální dráhu REST / SCP1 během embryonálního vývoje CNS“. Genes Dev. 21 (7): 744–9. doi:10.1101 / gad.1519107. PMC  1838526. PMID  17403776.
  7. ^ Makeyev EV, Zhang J, Carrasco MA, Maniatis T (srpen 2007). „MicroRNA miR-124 podporuje neuronální diferenciaci spuštěním alternativního spojování pre-mRNA specifických pro mozek“. Mol. Buňka. 27 (3): 435–48. doi:10.1016 / j.molcel.2007.07.015. PMC  3139456. PMID  17679093.
  8. ^ Roberson, Erik (4. prosince 2014). „MicroRNA-124 moduluje sociální chování při frontotemporální demenci“. Přírodní medicína. 20 (12): 1381–1383. doi:10,1038 / nm. 3768. PMID  25473917.
  9. ^ Mirnoori SM, Shahangian SS, Salehi Z, Mashayekhi F, Sasani ST, Saedi HS (2018). "Vliv jedno-nukleotidových polymorfismů v genech pri-miR-124-1 a STAT3 na citlivost na rakovinu žaludku". Br J Biomed Sci. 75 (4): 182–186. doi:10.1080/09674845.2018.1492206. PMID  29938592.

externí odkazy