Mir-433 - Mir-433

mir-433
MiR-433 sekundární struktura.png
Sekundární struktura a zachování sekvence mikroRNA miR-433
Identifikátory
Symbolmir-433
RfamRF00748
rodina miRBaseMIPF0000177
NCBI Gene574034
HGNC32026
OMIM611711
Další údaje
RNA typmikroRNA
DoményEukaryota; Eutheria;
PDB strukturPDBe

V molekulární biologii mir-433 je krátký nekódující RNA molekula. MicroRNA (miRNA) fungují jako posttranskripční regulátory úrovní exprese jiných genů několika mechanismy.[1] Hrají roli ve vývoji, metabolismu a karcinogenezi.[2]

Genomická struktura a regulace

Mir-433 je jednou z 21 miRNA nalezených v klastru na chromozomu 12.[3]

3 'kódující oblast mir-433 je také promotorem sousedního genu miRNA: mir-127.[3] Oba geny se překrývají a jsou přepisovány ve stejné orientaci.[2] Jedná se o metodu, pomocí které lze genetické informace ukládat kompaktně a efektivně.[2]

Mir-433 je spolu s dalšími dvaceti geny v klastru nadregulován malý heterodimerový partner (SHP) homozygotní knockoutované myši.[3]

SHP je jaderný receptor, o kterém je známo, že potlačuje transkripci, a hraje roli v některých metabolických onemocněních. Naopak se ukázalo, že transkripce mir-433 je aktivována receptor související s estrogenem (CHYBOVAT).[3]

Mir-433 je vysoce konzervovaný napříč druhy a je 95% podobný u člověka, šimpanze, koně, psa, opice, krysy, krávy a myši.[4] Vzdálenost mezi mir-433 a mir-127 byla u těchto druhů rovněž podobná; stejně jako umístění motivy vázající transkripční faktor, včetně toho pro ERR. To naznačuje, že regulace genů i primární sekvence je u těchto druhů savců zachována.

Rovněž se předpokládá, že mir-433 a mir-127 pravděpodobně pocházejí ze společného genu předků.[4]

Sdružení nemocí

Bylo zjištěno, že úrovně mir-433 jsou zvýšené v karcinom žaludku zkoumáním genem miRNA mikročipy. Mir-433 reguluje expresi GRB2, známý protein asociovaný s nádorem, který může být vysvětlením této asociace.[5]

Nebyla nalezena žádná taková souvislost mezi variantou mir-433 a Parkinsonova choroba [6] navzdory skutečnosti, že kolísání v regionu EU FGF20 gen, který se váže na mir-433, je spojen s Parkinsonovou chorobou.

Mir-433 byl také spojován s dominantně zděděnou formou x vázané chondrodysplazie.[7] Mir-433 normálně snižuje expresi výrazu HDAC6. A polymorfismus jednoho nukleotidu (SNP) na 3 ' nepřeložená oblast Bylo zjištěno, že (UTR) HDAC6 segreguje s chondrodysplazií. Toto SNP odstraňuje schopnost mir-433 downregulovat HDAC6, což vede k jeho nadměrné expresi. V důsledku toho je snížena acetylace svého cíle, alfa tubulin způsobující nemoc.[7]

Viz také

Reference

  1. ^ Cullen BR (prosinec 2004). "Transkripce a zpracování lidských prekurzorů microRNA". Mol. Buňka. 16 (6): 861–865. doi:10.1016 / j.molcel.2004.12.002. PMID  15610730.
  2. ^ A b C Song G, Wang L (2008). Volff J (ed.). „MiR-433 a miR-127 vznikají z nezávislých překrývajících se primárních transkriptů kódovaných lokusem miR-433-127“. PLOS ONE. 3 (10): e3574. doi:10,1371 / journal.pone.0003574. PMC  2570487. PMID  18974780.
  3. ^ A b C d Song G, Wang L (2008). „Transkripční mechanismus spárovaných genů miR-433 a miR-127 nukleárními receptory SHP a ERRgamma“. Nucleic Acids Res. 36 (18): 5727–5735. doi:10.1093 / nar / gkn567. PMC  2566885. PMID  18776219.
  4. ^ A b Song G, Wang L (2009). Tora L (ed.). „Konzervovaná genová struktura a regulace exprese miR-433 a miR-127 u savců“. PLOS ONE. 4 (11): e7829. doi:10.1371 / journal.pone.0007829. PMC  2778354. PMID  19946636.
  5. ^ Luo H, Zhang H, Zhang Z, Zhang X, Ning B, Guo J, Nie N, Liu B, Wu X (2009). „Down-regulované miR-9 a miR-433 u lidského karcinomu žaludku“. J Exp Clin Cancer Res. 28 (1): 82. doi:10.1186/1756-9966-28-82. PMC  2739520. PMID  19531230.
  6. ^ de Mena L, Cardo LF, Coto E, Miar A, DÃaz M, Corao AI, Alonso B, Ribacoba R, Salvador C, Menéndez M, MorÃs G, Alvarez V (2010). „Varianta FGF20 rs12720208 SNP a microRNA-433: žádná souvislost s Parkinsonovou chorobou u španělských pacientů“. Neurosci Lett. 479 (1): 22–25. doi:10.1016 / j.neulet.2010.05.019. PMID  20471450.
  7. ^ A b Simon D, Laloo B, Barillot M, Barnetche T, Blanchard C, Rooryck C, Marche M, Burgelin I, Coupry I, Chassaing N, Gilbert-Dussardier B, Lacombe D, Grosset C, Arveiler B (2010). „Mutace v 3′-UTR genu HDAC6, která ruší post-transkripční regulaci zprostředkovanou hsa-miR-433, je spojena s novou formou dominantní chondrodysplazie spojené s X“. Hum Mol Genet. 19 (10): 2015–2027. doi:10,1093 / hmg / ddq083. PMID  20181727.

externí odkazy