Rodina prekurzorů mikroRNA Mir-129 - Mir-129 microRNA precursor family

mir-129 mikroRNA prekurzor rodina
RF00486.jpg
Identifikátory
Symbolmir-129
RfamRF00486
miRBaseMI0000252
rodina miRBaseMIPF0000073
Další údaje
RNA typGen; miRNA
DoményEukaryota
JÍTGO termín musí začínat GO: GO termín musí začínat GO:
TAKSO: 0001244
PDB strukturPDBe

The Prekurzor mikroRNA miR-129 je malý nekódující RNA molekula, která reguluje genová exprese. Tento mikroRNA byl poprvé experimentálně charakterizován u myší[1] a homology od té doby byly objeveny u několika dalších druhů, jako jsou lidé,[2] krysy[3] a zebrafish.[4] Zralá sekvence je vyříznuta Hráč v kostky enzym z 5 'ramene sponka do vlasů. Bylo to objasněno Calinem et al. že miR-129-1 se nachází v a křehké stránky oblast lidského genomu v blízkosti specifického místa, FRA7H v chromozomu 7q32, což je místo běžně deletované u mnoha druhů rakoviny. miR-129-2 se nachází v 11p11.2.[5]

Vzory výrazů

Zdá se, že miR-129 má tkáňový specifický expresní vzorec lokalizovaný v mozku u normálních lidí. Toto zjištění bylo původně identifikováno pomocí experimentů na mikročipech s myší tkání (a konkrétněji s mozečkem)[1] který byl následně ověřen profilováním exprese v lidské tkáni. Bylo však zjištěno, že exprese v normální mozkové tkáni je relativně nízká a různé experimentální metodiky profilování přinesly odlišné výsledky. Tyto rozdíly a nízké úrovně detekce lze připsat velikosti a složitosti lidského mozku a skutečnosti, že konkrétní oblasti mozku nebyly jednotlivě testovány.[6]

Cíle miR-129

CDK6

Stejně jako u mnoha jiných mikroRNA se profil exprese miR-129 mění s nástupem rakoviny. V mnoha různých nádorových buněčných liniích, jako je rakovina žaludku, meduloblastom a rakovina endometria, plicní andokarcinom a kolorektální karcinom, existují nižší hladiny miR-129, což naznačuje, že může hrát roli při potlačení buněčného růstu. Existují důkazy, které naznačují, že miR-129 přímo cílí CDK6, cyklin dependentní kináza 6- regulátor buněčné proliferace. To je způsobeno účinky down-regulace miR-129 v rakovinných buňkách, která vede k jejich množení. Naopak v nadměrné expresi miR-129 je proliferace nádorových buněk endometria významně snížena prostřednictvím regulace Cdk6 dolů.[7]

SOX4

SOX4, SRY-příbuzný HMG box 4 gen - onkogen, o kterém je známo, že je deregulován u řady rakovin, je dalším cílem miR-129, ve kterém aberantní regulace miR-129 přispívá k šíření rakovinných buněčných linií. SOX4 se účastní zprostředkování transkripční odpovědi na signalizaci Wnt. U rakoviny endometria a rakoviny žaludku existuje jasná souvislost mezi epigenetickou represí nebo ztrátou miR-129 a nadměrnou expresí SOX4. V experimentech, kde byly hladiny miR-129 vráceny do normálu v rakovinných buňkách, byla exprese SOX4 snížena. Dále bylo navrženo, že hypermethylace promotoru miR-129-2 je hlavním přispěvatelem SOX4 k expresi u některých typů rakoviny.[8][9]

GALNT1

GALNT1, N-acetylgalaktosaminyltransferáza 1 - podílí se na signalizaci TGF-β, je dalším cílem miR-129, který byl identifikován luciferázovým testem. Bylo pozorováno, že když byly rakovinné buňky podrobeny transfekci s prekurzorem miR-129, byl GALNT1 následně regulován přímým zaměřením miR-129. Pozorování cíle SOX4 bylo také potvrzeno v této studii. Tyto výsledky korelují s představou, že vysoké hladiny miR-129 a nízké hladiny SOX4 a GALNT1 korelují s progresí rakovinných buněk.[10]

APC a Rab11

Adenomatózní polypóza coli (APC), tumor potlačující gen řízený Wnt signalizací a zapojený do proliferace, a Rab11 byly také identifikovány jako cíle miR-129 z a RT-PCR experiment expresních profilů karcinomu spinocelulárních buněk lidského jícnu (ESCC). Tato studie ukazuje, že nadměrná exprese miR-129 může hrát roli ve vývoji ESCC. To může být způsobeno možným potlačením drah přenosu signálu prostřednictvím APC a Rab11.[11]

EIF2C3 a CAMTA1

miR-129 může také hrát roli ve vývoji hematopoetických kmenových buněk. Ukázalo se, že miR-129 se může účastnit vývojové sítě kmenových buněk s EIF2C3 (eukaryotický iniciační faktor translace 2C, 3) a CAMTA1 (transkripční aktivátor vázající kalmodulin 1) s indukcí buněčné diferenciace. Předpokládá se, že miR-129 může ovlivnit diferenciaci a regulaci buněčného cyklu[12] inhibicí translace CAMTA1.[13]

Klinická relevance miR-129

Biomarkery pro diagnostiku

MicroRNA poskytly výzkumníkům v oblasti rakoviny nový pohled na porozumění rakovině a boj proti ní. To je způsobeno jejich produkcí tkáňově specifickým způsobem a jejich rolí v mnoha aspektech buněčného procesu, jako je proliferace a apoptóza. Obrovské množství experimentálních dat umožnilo rozpoznat specifické podpisy a profily mikroRNA a použít je jako potenciální biomarkery v diagnostice rakoviny, predikci léčby a prognóze.

miR-129 byl identifikován jako potenciální kandidát na vývoj diagnostického biomarkeru. Důvodem je jeho integrální role, kterou hraje při proliferaci buněk a mnoha rozpoznatelných, statisticky významných a nezávislých interakcí s jejími cíli, jak je pozorováno profily exprese ve studii prováděné Ogawou et al..[11]

Reference

  1. ^ A b Lagos-Quintana, M; Rauhut R; Yalcin A; Meyer J; Lendeckel W; Tuschl T (2002). "Identifikace tkáňově specifických mikroRNA z myši". Curr Biol. 12 (9): 735–739. doi:10.1016 / S0960-9822 (02) 00809-6. hdl:11858 / 00-001M-0000-0010-94EF-7. PMID  12007417. S2CID  7901788.
  2. ^ Lagos-Quintana M, Rauhut R, Meyer J, Borkhardt A, Tuschl T (2003). „Nové mikroRNA od myší a člověka“. RNA. 9 (2): 175–9. doi:10,1261 / rna.2146903. PMC  1370382. PMID  12554859.
  3. ^ He X, Zhang Q, Liu Y, Pan X (2007). "Klonování a identifikace nových mikroRNA z hipokampu potkanů". Acta Biochim Biophys Sin (Šanghaj). 39 (9): 708–14. doi:10.1111 / j.1745-7270.2007.00324.x. PMID  17805466.
  4. ^ Chen PY, Manninga H, Slanchev K, Chien M, Russo JJ, Ju J a kol. (2005). „Vývojové miRNA profily zebrafish, jak je určeno malým klonováním RNA“. Genes Dev. 19 (11): 1288–93. doi:10.1101 / gad.1310605. PMC  1142552. PMID  15937218.
  5. ^ Calin GA, Sevignani C, Dumitru CD, Hyslop T, Noch E, Yendamuri S a kol. (2004). „Lidské geny pro mikroRNA jsou často lokalizovány na křehkých místech a genomových oblastech podílejících se na rakovině“. Proc Natl Acad Sci U S A. 101 (9): 2999–3004. Bibcode:2004PNAS..101.2999C. doi:10.1073 / pnas.0307323101. PMC  365734. PMID  14973191.
  6. ^ Barad O, Meiri E, Avniel A, Aharonov R, Barzilai A, Bentwich I a kol. (2004). "Exprese MicroRNA detekována oligonukleotidovými mikročipy: Vytvoření systému a profilování exprese v lidských tkáních". Genome Res. 14 (12): 2486–94. doi:10,1101 / gr. 2845604. PMC  534673. PMID  15574827.
  7. ^ Wu J, Qian J, Li C, Kwok L, Cheng F, Liu P a kol. (2010). "miR-129 reguluje buněčnou proliferaci snížením regulace exprese Cdk6". Buněčný cyklus. 9 (9): 1809–18. doi:10,4161 / cc.9.9.11535. PMID  20404570.
  8. ^ Shen R, Pan S, Qi S, Lin X, Cheng S (2010). „Epigenetická represe mikroRNA-129-2 vede k nadměrné expresi SOX4 u rakoviny žaludku“. Biochem Biophys Res Commun. 394 (4): 1047–52. doi:10.1016 / j.bbrc.2010.03.121. PMID  20331975.
  9. ^ Huang YW, Liu JC, Deatherage DE, Luo J, Mutch DG, Goodfellow PJ a kol. (2009). „Epigenetická represe mikroRNA-129-2 vede k nadměrné expresi onkogenu SOX4 u rakoviny endometria“. Cancer Res. 69 (23): 9038–46. doi:10.1158 / 0008-5472.CAN-09-1499. PMC  2789184. PMID  19887623.
  10. ^ Dyrskjøt L, Ostenfeld MS, Bramsen JB, Silahtaroglu AN, Lamy P, Ramanathan R a kol. (2009). „Genomické profilování mikroRNA u rakoviny močového měchýře: miR-129 je spojen se špatným výsledkem a podporuje buněčnou smrt in vitro.“ Cancer Res. 69 (11): 4851–60. doi:10.1158 / 0008-5472.CAN-08-4043. PMID  19487295.
  11. ^ A b Ogawa R, Ishiguro H, Kuwabara Y, Kimura M, Mitsui A, Katada T a kol. (2009). "Profilování exprese mikro-RNA v karcinomu spinocelulárních buněk lidského jícnu pomocí RT-PCR". Med Mol Morphol. 42 (2): 102–9. doi:10.1007 / s00795-009-0443-1. PMID  19536617. S2CID  7362568.
  12. ^ Nakatani K, Nishioka J, Itakura T, Nakanishi Y, Horinouchi J, Abe Y a kol. (2004). "Regulace transkripce závislá na transkripčním aktivátoru transkripce vázajícího kalmodulin 1 v buňkách neuroblastomu". Int J Oncol. 24 (6): 1407–12. doi:10,3892 / ijo.24.6.1407 (neaktivní 10. 11. 2020). PMID  15138581.CS1 maint: DOI neaktivní od listopadu 2020 (odkaz)
  13. ^ Liao R, Sun J, Zhang L, Lou G, Chen M, Zhou D a kol. (2008). „MicroRNA hrají roli ve vývoji lidských hematopoetických kmenových buněk“. J Cell Biochem. 104 (3): 805–17. doi:10.1002 / jcb.21668. PMID  18189265. S2CID  23455398.

Další čtení

externí odkazy