Rodina prekurzorů mikroRNA Mir-390 - Mir-390 microRNA precursor family

mir-390
Identifikátory
Symbolmir-390
RfamRF00689
rodina miRBaseMIPF0000101
Další údaje
RNA typmikroRNA
DoményEukaryota;
PDB strukturPDBe

v molekulární biologie mir-390 microRNA je krátký RNA molekula. MicroRNA funkce k regulaci úrovní exprese jiných genů několika mechanismy.

Viz také

Reference

  1. ^ Mendoza-Soto AB, Sánchez F, Hernández G (2012). „MicroRNA jako regulátory reakce na toxicitu rostlinných kovů“. Hranice ve vědě o rostlinách. 3: 105. doi:10.3389 / fpls.2012.00105. PMC  3356851. PMID  22661980.
  2. ^ Zhang J, Zhang S, Han S, Wu T, Li X, Li W, Qi L (srpen 2012). „Genome-wide identification of microRNAs in modre and stage-specific modulation of 11 Conserved microRNAs and their targets during somatic embryogenesis“. Planta. 236 (2): 647–57. doi:10.1007 / s00425-012-1643-9. PMID  22526500.
  3. ^ Jouannet V, Moreno AB, Elmayan T, Vaucheret H, Crespi MD, Maizel A (duben 2012). „Cytoplazmatická Arabidopsis AGO7 se hromadí v membránových siRNA tělech a je nezbytná pro biogenezi ta-siRNA“. Časopis EMBO. 31 (7): 1704–13. doi:10.1038 / emboj.2012.20. PMC  3321200. PMID  22327216.
  4. ^ Li F, Orban R, Baker B (červen 2012). „SoMART: webový server pro rostlinnou miRNA, tasiRNA a analýzu cílového genu“. The Plant Journal. 70 (5): 891–901. doi:10.1111 / j.1365-313X.2012.04922.x. PMID  22268718.
  5. ^ Maunoury N, Vaucheret H (2011). Bendahmane M (ed.). „AGO1 a AGO2 působí redundantně v regulaci plantacyaninu zprostředkované miR408“. PLOS ONE. 6 (12): e28729. doi:10.1371 / journal.pone.0028729. PMC  3236769. PMID  22174881.
  6. ^ Pérez-Quintero AL, Sablok G, Tatarinova TV, Conesa A, Kuo J, López C (duben 2012). „Těžba miRNA a potenciálních cílů z genově orientovaných shluků transkriptových sekvencí antimalarické rostliny, Artemisia annua“. Biotechnologické dopisy. 34 (4): 737–45. doi:10.1007 / s10529-011-0808-0. PMID  22160362.
  7. ^ Donaire L, Pedrola L, Rosa R, Llave C (2011). Baxter I (ed.). "Vysoce výkonné sekvenování malých RNA souvisejících s umlčováním RNA v olivách (Olea europaea L.)". PLOS ONE. 6 (11): e27916. doi:10.1371 / journal.pone.0027916. PMC  3225373. PMID  22140484.
  8. ^ Budak H, Akpinar A (listopad 2011). „Dehydratace miRNA reagující na stres v Brachypodium distachyon: evidentní skrz genomový screening exprese mikroRNA“. OMICS. 15 (11): 791–9. doi:10.1089 / omi.2011.0073. PMID  22122669.
  9. ^ Zhang L, Chao JT, Cui MM, Chen YQ, Zong P, Sun YH (červenec 2011). "[Bioinformatická predikce konzervovaných mikroRNA a jejich cílových genů v lilku (Solanum melongena L.)]" ". Yi Chuan = Hereditas. 33 (7): 776–84. doi:10.3724 / sp.j.1005.2011.00776. PMID  22049693.
  10. ^ Rajeswaran R, Pooggin MM (leden 2012). „RDR6 zprostředkovaná syntéza komplementární RNA je ukončena miRNA stabilně navázanou na templátovou RNA“. Výzkum nukleových kyselin. 40 (2): 594–9. doi:10.1093 / nar / gkr760. PMC  3258149. PMID  21930511.
  11. ^ Wong CE, Zhao YT, Wang XJ, Croft L, Wang ZH, Haerizadeh F, Mattick JS, Singh MB, Carroll BJ, Bhalla PL (květen 2011). "MicroRNA ve výhonku apikálního meristému sóji". Journal of Experimental Botany. 62 (8): 2495–506. doi:10.1093 / jxb / erq437. hdl:10536 / DRO / DU: 30106047. PMID  21504877.
  12. ^ Douglas RN, Wiley D, Sarkar A, Springer N, Timmermans MC, Scanlon MJ (květen 2010). „ragged seedling2 Encodes an ARGONAUTE7-like protein required for mediolateral expanzi, ale ne dorsiventrality, kukuřičných listů“. Rostlinná buňka. 22 (5): 1441–51. doi:10.1105 / tpc.109.071613. PMC  2899878. PMID  20453116.
  13. ^ Marin E, Jouannet V, Herz A, Lokerse AS, Weijers D, Vaucheret H, Nussaume L, Crespi MD, Maizel A (duben 2010). „miR390, tasiRNA Arabidopsis TAS3 a jejich cíle AUXIN RESPONSE FACTOR definují autoregulační síť kvantitativně regulující boční růst kořenů“. Rostlinná buňka. 22 (4): 1104–17. doi:10.1105 / tpc.109.072553. PMC  2879756. PMID  20363771.
  14. ^ Wang J, Gao X, Li L, Shi X, Zhang J, Shi Z (červen 2010). „Nadměrná exprese Osta-siR2141 způsobila vznik abnormální polarity a zpomalil růst rýže“. Journal of Experimental Botany. 61 (6): 1885–95. doi:10.1093 / jxb / erp378. PMC  2852654. PMID  20080824.
  15. ^ Cuperus JT, Montgomery TA, Fahlgren N, Burke RT, Townsend T, Sullivan CM, Carrington JC (leden 2010). "Identifikace mutantů s defektem zpracování prekurzoru MIR390a v Arabidopsis přímým sekvenováním genomu" (PDF). Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 107 (1): 466–71. doi:10.1073 / pnas.0913203107. PMC  2806713. PMID  20018656.
  16. ^ Yoon EK, Yang JH, Lim J, Kim SH, Kim SK, Lee WS (březen 2010). „Auxinová regulace mikroRNA390-závislé transakční malé interferující RNA dráhy v laterálním vývoji kořene Arabidopsis“. Výzkum nukleových kyselin. 38 (4): 1382–91. doi:10.1093 / nar / gkp1128. PMC  2831332. PMID  19969544.
  17. ^ Krasnikova MS, Milyutina IA, Bobrova VK, Ozerova LV, Troitsky AV, Solovyev AG, Morozov SY (2009). „Nové miR390-závislé transakční prekurzory siRNA v rostlinách odhalené experimentálním přístupem založeným na PCR a databázovou analýzou“. Journal of Biomedicine & Biotechnology. 2009: 952304. doi:10.1155/2009/952304. PMC  2762245. PMID  19859540.
  18. ^ Aly R, Cholakh H, Joel DM, Leibman D, Steinitz B, Zelcer A, Naglis A, Yarden O, Gal-On A (srpen 2009). „Ztlumení genů manózy 6-fosfátreduktázy v parazitické plevele Orobanche aegyptiaca produkcí homologních dsRNA sekvencí v hostitelské rostlině“. Plant Biotechnology Journal. 7 (6): 487–98. doi:10.1111 / j.1467-7652.2009.00418.x. PMID  19490480.
  19. ^ Tedder P, Zubko E, Westhead DR, Meyer P (červen 2009). „Malá analýza RNA u Petunia hybrida identifikuje neobvyklé tkáňové specifické expresní vzorce konzervovaných miRNA a 24merové RNA“. RNA. 15 (6): 1012–20. doi:10.1261 / rna.1517209. PMC  2685514. PMID  19369427.
  20. ^ Li H, Zhang Z, Huang F, Chang L, Ma Y (červen 2009). "Profily exprese MicroRNA v konvenčních a mikropropagovaných rostlinách jahod (Fragaria x ananassa Duch.)". Zprávy rostlinných buněk. 28 (6): 891–902. doi:10.1007 / s00299-009-0693-3. PMID  19277667.
  21. ^ Felippes FF, Weigel D (březen 2009). „Spouštění tvorby tasiRNA u Arabidopsis thaliana: role mikroRNA miR173“. Zprávy EMBO. 10 (3): 264–70. doi:10.1038 / embor.2008.247. PMC  2658565. PMID  19180117.
  22. ^ Nogueira FT, Chitwood DH, Madi S, Ohtsu K, Schnable PS, Scanlon MJ, Timmermans MC (leden 2009). Copenhaver GP (ed.). „Regulace akumulace malé RNA ve vrcholu kukuřičných výhonků“. Genetika PLoS. 5 (1): e1000320. doi:10.1371 / journal.pgen.1000320. PMC  2602737. PMID  19119413.
  23. ^ Abdurakhmonov IY, Devor EJ, Buriev ZT, Huang L, Makamov A, Shermatov SE, Bozorov T, Kushanov FN, Mavlonov GT, Abdukarimov A (září 2008). „Malá regulace RNA vývoje vajíček v rostlině bavlny, G. hirsutum L“. Biologie rostlin BMC. 8: 93. doi:10.1186/1471-2229-8-93. PMC  2564936. PMID  18793449.
  24. ^ Takeda A, Iwasaki S, Watanabe T, Utsumi M, Watanabe Y (duben 2008). „Mechanismus výběru naváděcího řetězce z malých duplexů RNA se mezi proteiny argonaute liší.“. Fyziologie rostlin a buněk. 49 (4): 493–500. doi:10.1093 / pcp / pcn043. PMID  18344228.
  25. ^ Montgomery TA, Howell MD, Cuperus JT, Li D, Hansen JE, Alexander AL, Chapman EJ, Fahlgren N, Allen E, Carrington JC (duben 2008). "Specifičnost interakce ARGONAUTE7-miR390 a dvojí funkce při tvorbě transcexní siRNA TAS3". Buňka. 133 (1): 128–41. doi:10.1016 / j.cell.2008.02.033. PMID  18342362.
  26. ^ Axtell MJ, Snyder JA, Bartel DP (červen 2007). „Společné funkce pro různé malé RNA suchozemských rostlin“. Rostlinná buňka. 19 (6): 1750–69. doi:10.1105 / tpc.107.051706. PMC  1955733. PMID  17601824.
  27. ^ Axtell MJ, Jan C, Rajagopalan R, Bartel DP (listopad 2006). „Spoušť biogeneze siRNA v rostlinách dvěma zásahy“. Buňka. 127 (3): 565–77. doi:10.1016 / j.cell.2006.09.032. PMID  17081978.
  28. ^ Talmor-Neiman M, Stav R, Klipcan L, Buxdorf K, Baulcombe DC, Arazi T (listopad 2006). „Identifikace trans-působících siRNA v mechu a RNA-dependentní RNA polymerázy nutná pro jejich biogenezi“. The Plant Journal. 48 (4): 511–21. doi:10.1111 / j.1365-313X.2006.02895.x. PMID  17076803.
  29. ^ Fahlgren N, Montgomery TA, Howell MD, Allen E, Dvořák SK, Alexander AL, Carrington JC (květen 2006). "Regulace AUXIN RESPONSE FACTOR3 pomocí TAS3 ta-siRNA ovlivňuje vývojové načasování a vzorování v Arabidopsis". Aktuální biologie. 16 (9): 939–44. doi:10.1016 / j.cub.2006.03.065. PMID  16682356.
  30. ^ Allen E, Xie Z, Gustafson AM, Carrington JC (duben 2005). "fázování zaměřené na mikroRNA během trans-působící biogeneze siRNA v rostlinách". Buňka. 121 (2): 207–21. doi:10.1016 / j.cell.2005.04.004. PMID  15851028.

externí odkazy