Rodina prekurzorů Mir-160 microRNA - Mir-160 microRNA precursor family
| rodina prekurzorů mir-160 microRNA | |
|---|---|
 Předpovězeno sekundární struktura a zachování sekvence mir-160 | |
| Identifikátory | |
| Symbol | mir-160 |
| Rfam | RF00247 |
| miRBase | MI0000190 |
| rodina miRBase | MIPF0000032 |
| Další údaje | |
| RNA typ | Gen; miRNA |
| Domény | Eukaryota |
| JÍT | GO termín musí začínat GO: GO termín musí začínat GO: |
| TAK | SO: 0001244 |
| PDB struktur | PDBe |
v molekulární biologie, mir-160 je mikroRNA která byla předpovězena nebo experimentálně potvrzena v rozmezí rostlina druhy včetně Arabidopsis thaliana (řeřicha ušní) a Oryza sativa (rýže).[1] Předpokládá se, že miR-160 váže komplementární místa v nepřekládaných oblastech auxin faktor odezvy geny regulovat jejich výraz.[2] Předpony vlásenky (zde představené) jsou předpovídány na základě párování bází a mezidruhové ochrany; jejich rozsah není znám. V tomto případě je zralá sekvence vyříznuta z 5 'ramene sponka do vlasů.
Konkrétně 3 z A. thaliana 'Předpokládá se, že 23 genů faktoru auxinové odezvy je post-transkripčně regulováno mir-160.[3][4] Když je jeden z těchto cílů (ARF17) manipulován, aby se stal rezistentním vůči miRNA, několik vývojový v hostitelské rostlině lze pozorovat defekty.[3] Tento experiment byl opakován s dalším cílem mir-160, ARF10, a výsledky zdůraznily regulační roli v postembryonálním vývoji a semenech klíčení.[5]
Reference
- ^ "rodina genů miRNA: MIR160". mirBASE. University of Manchester. Archivovány od originál dne 15. července 2012. Citováno 5. září 2011.
- ^ Rhoades MW, Reinhart BJ, Lim LP, Burge CB, Bartel B, Bartel DP (srpen 2002). "Predikce cílů rostlinné mikroRNA". Buňka. 110 (4): 513–20. doi:10.1016 / S0092-8674 (02) 00863-2. PMID 12202040.
- ^ A b Mallory AC, Bartel DP, Bartel B (květen 2005). „Regulace Arabidopsis zaměřená na mikroRNA AUXIN RESPONSE FACTOR17 je nezbytná pro správný vývoj a moduluje expresi genů časné reakce auxinu“. Rostlinná buňka. 17 (5): 1360–75. doi:10.1105 / tpc.105.031716. PMC 1091760. PMID 15829600.
- ^ Liu X, Huang J, Wang Y, Khanna K, Xie Z, Owen HA, Zhao D (květen 2010). „Role květních orgánů u plodolistů, mutace ztráty funkce Arabidopsis v MicroRNA160a, v organogenezi a mechanismus regulující jeho expresi“. The Plant Journal. 62 (3): 416–28. doi:10.1111 / j.1365-313X.2010.04164.x. PMID 20136729.
- ^ Liu PP, Montgomery TA, Fahlgren N, Kasschau KD, Nonogaki H, Carrington JC (říjen 2007). „Represe AUXIN RESPONSE FACTOR10 pomocí mikroRNA160 je zásadní pro fáze klíčení semen a po klíčení“. The Plant Journal. 52 (1): 133–46. doi:10.1111 / j.1365-313X.2007.03218.x. PMID 17672844.