Prekurzor mikroRNA Mir-7 - Mir-7 microRNA precursor

mir-7 prekurzor microRNA
RF00053.jpg
Identifikátory
Symbolmir-7
RfamRF00053
miRBaseMI0000263
rodina miRBaseMIPF0000022
Další údaje
RNA typGen; miRNA
DoményEukaryota
JÍTGO termín musí začínat GO: GO termín musí začínat GO:
TAKSO: 0001244
PDB strukturPDBe

Tato rodina představuje mikroRNA (miRNA) prekurzor mir-7. Tato miRNA byla předpovězena nebo experimentálně potvrzena u široké škály druhů.[1] miRNA se přepisují jako ~ 70 nukleotid prekurzory (zde modelované) a následně zpracované Hráč v kostky enzym za vzniku ~ 22 nukleotidového produktu. V tomto případě vyspělá sekvence pochází z 5' rameno předchůdce. Rozsahy sponka do vlasů prekurzory nejsou obecně známy a jsou odhadovány na základě vlásenky. Zapojení Dicera do zpracování miRNA naznačuje vztah k fenoménu interference RNA.

Zralá miRNA-7 je odvozena ze tří prekurzorů mikroRNA v lidském genomu, miR-7-1, miR-7-2 a miR-7-3. miRNA jsou číslovány na základě sekvence zralé RNA.

miR-7 je přímo regulován transkripčním faktorem HoxD10.[2]

Předpokládá se, že miRNA mají regulační role prostřednictvím komplementarity k mRNA. miR-7 je nezbytný pro udržení regulační stability v podmínkách environmentálního toku.[3] Hraje důležitou roli při kontrole exprese mRNA. Gen miR-7 se nachází ve většině sekvenovaných Urbilateria druh a sekvence jeho zralého produktu miRNA je dokonale zachována annelids lidem, což naznačuje silnou funkční konzervaci.[3]

Cíle miR-7

Bioinformatické předpovědi naznačují, že 3'-nepřekládaná oblast lidské EGFR mRNA obsahuje tři cílová místa microRNA-7 (miR-7), která nejsou u savců konzervována.[4] V fotoreceptorových buňkách Drosophila řídí miR-7 signalizaci receptoru epidermálního růstového faktoru (EGFR) a podporuje diferenciaci fotoreceptorů.[5] Mezi další cíle miR-7 patří receptor podobný růstovému faktoru 1 podobný inzulínu (IGF1R) a PIK3CD,[6] Rodina genů E. (spl) [7] a Pak1 (rakovinné buňky).[2] c-Fos je také cílem miR-7b u myší.[8] Pax6 překlad v boční stěně subventrikulární zóna vyvinutých myší je post-transkripčně regulováno umlčováním genů zprostředkovaným miRNA-7a, které je nezbytné pro kontrolu rychlosti dopaminergní neuron produkce v čichové baňce.[9]

Klinický význam

Několik rolí a cílů miR-7 a také jeho expresní vzorec byly spojeny s regulačními mechanismy a patogenezí v glioblastomu,[10] rakovina prsu[11] a další typy rakoviny,[4][6][12] stejně jako u schizofrenie[13] a vizuální abnormality.[14] Inhibice motility, invazivity, růstu nezávislého na ukotvení a tumorigenního potenciálu vysoce invazivních buněk rakoviny prsu zavedením miR-7 naznačuje silný terapeutický potenciál miR-7.[2][15]

Reference

  1. ^ "rodina genů miRNA: mir-7 (92 sekvencí)". MiRBase. Archivovány od originál dne 29. 9. 2007.
  2. ^ A b C Reddy SD, Ohshiro K, Rayala SK, Kumar R (říjen 2008). „MicroRNA-7, cíl homeoboxu D10, inhibuje kinázu 1 aktivovanou p21 a reguluje její funkce“. Výzkum rakoviny. 68 (20): 8195–200. doi:10.1158 / 0008-5472.CAN-08-2103. PMC  3636563. PMID  18922890.
  3. ^ A b Li X, Cassidy JJ, Reinke CA, Fischboeck S, Carthew RW (duben 2009). „MicroRNA propůjčuje robustnost proti fluktuaci prostředí během vývoje“. Buňka. 137 (2): 273–82. doi:10.1016 / j.cell.2009.01.058. PMC  2674871. PMID  19379693.
  4. ^ A b Webster RJ, Giles KM, Price KJ, Zhang PM, Mattick JS, Leedman PJ (únor 2009). "Regulace signalizace receptoru epidermálního růstového faktoru v lidských rakovinných buňkách pomocí mikroRNA-7". The Journal of Biological Chemistry. 284 (9): 5731–41. doi:10,1074 / jbc.M804280200. PMID  19073608.
  5. ^ Li X, Carthew RW (prosinec 2005). „MikroRNA zprostředkovává signalizaci receptoru EGF a podporuje diferenciaci fotoreceptorů v oku Drosophila“. Buňka. 123 (7): 1267–77. doi:10.1016 / j.cell.2005.10.040. PMID  16377567.
  6. ^ A b Jiang L, Liu X, Chen Z, Jin Y, Heidbreder CE, Kolokythas A, Wang A, Dai Y, Zhou X (listopad 2010). „MicroRNA-7 cílí na IGF1R (receptor podobný růstovému faktoru 1 podobný inzulínu) v buňkách karcinomu dlaždicových buněk jazyka“. The Biochemical Journal. 432 (1): 199–205. doi:10.1042 / BJ20100859. PMC  3130335. PMID  20819078.
  7. ^ Stark A, Brennecke J, Russell RB, Cohen SM (prosinec 2003). "Identifikace cílů Drosophila MicroRNA". Biologie PLoS. 1 (3): E60. doi:10.1371 / journal.pbio.0000060. PMC  270017. PMID  14691535. otevřený přístup
  8. ^ Lee HJ, Palkovits M, Young WS (říjen 2006). „miR-7b, mikroRNA up-regulovaná v hypotalamu po chronické hyperosmolární stimulaci, inhibuje Fos překlad“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 103 (42): 15669–74. doi:10.1073 / pnas.0605781103. PMC  1622879. PMID  17028171.
  9. ^ de Chevigny A (2012). „regulace miR-7a Pax6 řídí prostorový původ dopaminergních neuronů předního mozku“. Přírodní neurovědy. 15: 1120–1126. doi:10.1038 / č. 3142.
  10. ^ Kefas B, Godlewski J, Comeau L, Li Y, Abounader R, Hawkinson M, Lee J, Fine H, Chiocca EA, Lawler S, Purow B (květen 2008). „microRNA-7 inhibuje receptor epidermálního růstového faktoru a dráhu Akt a je down-regulován v glioblastomu“. Výzkum rakoviny. 68 (10): 3566–72. doi:10.1158 / 0008-5472.CAN-07-6639. PMID  18483236.
  11. ^ Foekens JA, Sieuwerts AM, Smid M, Look MP, de Weerd V, Boersma AW, Klijn JG, Wiemer EA, Martens JW (září 2008). „Čtyři miRNA spojené s agresivitou lidské rakoviny prsu negativní na lymfatické uzliny a pozitivní na estrogenové receptory“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 105 (35): 13021–6. Bibcode:2008PNAS..10513021F. doi:10.1073 / pnas.0803304105. PMC  2529088. PMID  18755890.
  12. ^ Veerla S, Lindgren D, Kvist A, Frigyesi A, Staaf J, Persson H, Liedberg F, Chebil G, Gudjonsson S, Borg A, Månsson W, Rovira C, Höglund M (květen 2009). „Exprese MiRNA v uroteliálních karcinomech: důležité role miR-10a, miR-222, miR-125b, miR-7 a miR-452 pro stádium nádoru a metastázy a časté homozygotní ztráty miR-31.“ International Journal of Cancer. 124 (9): 2236–42. doi:10.1002 / ijc.24183. PMID  19127597.
  13. ^ Perkins DO, Jeffries CD, Jarskog LF, Thomson JM, Woods K, Newman MA, Parker JS, Jin J, Hammond SM (2007). "exprese microRNA v prefrontální kůře jedinců se schizofrenií a schizoafektivní poruchou". Genome Biology. 8 (2): R27. doi:10.1186 / gb-2007-8-2-r27. PMC  1852419. PMID  17326821.
  14. ^ Arora A, McKay GJ, Simpson DA (září 2007). „Predikce a ověření exprese miRNA v sítnicích lidí a potkanů“. Investigativní oftalmologie a vizuální věda. 48 (9): 3962–7. doi:10.1167 / iovs.06-1221. PMID  17724173.
  15. ^ Český poslanec (březen 2006). "MicroRNA jako terapeutické cíle". The New England Journal of Medicine. 354 (11): 1194–5. doi:10.1056 / NEJMcibr060065. PMID  16540623.

Další čtení

externí odkazy